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1........10........20........30........40........50........60........70 |
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ATGAAATAAGATCACTACCGGGCGTATTTTTTGAGTTATCGAGATTTTCAGGAGCTAAGGAAGCTAAAATG |
| Afold | ((((((...(((.(((.(..((......))..)))).))).....)))))..((((.....)))).....) | Program output |
| PknotsRG | .(((((...(((.(((.................))).))).....)))))..((((.....))))...... |
| RNAfold | .(((((...(((.(((.(..((......))..)))).))).....)))))..((((.....))))...... |
| Contrafold | .(((((...(((.(((.................))).))).....)))))..((((.....))))...... |
| RNAsubopt | .................((.........((((((....))))))......))((((.....))))...... | Other predicted ss |
| RNAshapes | .(((((.........(((.....)))..((((((....)))))).)))))..((((.....))))...... | Other predicted ss |
| Mfold | .(((((...(((.(((..((((.......))))))).))).....)))))..((((.....))))...... | Other predicted ss |
| RDfolder | ....................................................((((.....))))...... |
| consensus1 | ....................................................((((.....))))...... |
| consensus0.75 | .(((((.......................................)))))..((((.....))))...... |
| consensus0.5 | .(((((...(((.(((.................))).))).....)))))..((((.....))))...... |
