Doublet Group distance statistics: 13843

back

Distances from reference structure (by RMSD)

45, 12, 31, 13, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.028, 0.070, 0.112, 0.219 max_d=0.219 avg_d=0.070 std_dev=0.042
N1	B	0, 0.022, 0.074, 0.127, 0.237 max_d=0.237 avg_d=0.074 std_dev=0.053
N3	A	0, 0.051, 0.128, 0.205, 0.276 max_d=0.276 avg_d=0.128 std_dev=0.077
N9	A	0, 0.040, 0.117, 0.195, 0.271 max_d=0.271 avg_d=0.117 std_dev=0.078
C2	A	0, 0.056, 0.147, 0.238, 0.360 max_d=0.360 avg_d=0.147 std_dev=0.091
C5	A	0, 0.038, 0.139, 0.239, 0.344 max_d=0.344 avg_d=0.139 std_dev=0.100
N1	A	0, 0.037, 0.143, 0.250, 0.384 max_d=0.384 avg_d=0.143 std_dev=0.107
C2	B	0, 0.047, 0.160, 0.273, 0.500 max_d=0.500 avg_d=0.160 std_dev=0.113
C6	A	0, 0.045, 0.164, 0.284, 0.391 max_d=0.391 avg_d=0.164 std_dev=0.119
N3	B	0, 0.058, 0.183, 0.308, 0.559 max_d=0.559 avg_d=0.183 std_dev=0.125
C1'	B	0, 0.018, 0.150, 0.281, 0.539 max_d=0.539 avg_d=0.150 std_dev=0.132
C8	A	0, 0.058, 0.194, 0.331, 0.515 max_d=0.515 avg_d=0.194 std_dev=0.136
O4'	A	0, 0.040, 0.183, 0.327, 0.587 max_d=0.587 avg_d=0.183 std_dev=0.144
C6	B	0, 0.049, 0.194, 0.339, 0.538 max_d=0.538 avg_d=0.194 std_dev=0.145
C1'	A	0, 0.034, 0.181, 0.327, 0.460 max_d=0.460 avg_d=0.181 std_dev=0.147
O4'	B	0, 0.058, 0.211, 0.364, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.211 std_dev=0.153
C4	B	0, 0.007, 0.166, 0.325, 0.674 max_d=0.674 avg_d=0.166 std_dev=0.159
N7	A	0, 0.058, 0.224, 0.389, 0.561 max_d=0.561 avg_d=0.224 std_dev=0.165
C5	B	0, 0.073, 0.249, 0.426, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.249 std_dev=0.176
N6	A	0, 0.090, 0.268, 0.446, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.268 std_dev=0.178
O2	B	0, 0.097, 0.303, 0.509, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.303 std_dev=0.206
O4	B	0, 0.030, 0.241, 0.451, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.241 std_dev=0.211
C2'	B	0, 0.014, 0.255, 0.496, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.255 std_dev=0.241
C4'	B	0, 0.054, 0.302, 0.551, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.302 std_dev=0.249
C4'	A	0, 0.029, 0.301, 0.573, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.301 std_dev=0.272
C3'	B	0, 0.042, 0.324, 0.606, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.324 std_dev=0.282
O2'	B	0, 0.018, 0.310, 0.602, 1.136 max_d=1.136 avg_d=0.310 std_dev=0.292
C5'	B	0, 0.094, 0.400, 0.706, 1.525 max_d=1.525 avg_d=0.400 std_dev=0.306
C2'	A	0, 0.019, 0.349, 0.680, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.349 std_dev=0.331
C5'	A	0, 0.061, 0.425, 0.788, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.425 std_dev=0.364
O3'	B	0, 0.037, 0.420, 0.803, 1.537 max_d=1.537 avg_d=0.420 std_dev=0.383
C3'	A	0, 0.010, 0.411, 0.813, 1.371 max_d=1.371 avg_d=0.411 std_dev=0.402
O2'	A	0, 0.034, 0.451, 0.868, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.451 std_dev=0.417
O5'	A	0, 0.058, 0.522, 0.986, 1.475 max_d=1.475 avg_d=0.522 std_dev=0.464
O5'	B	0, -0.067, 0.405, 0.877, 3.042 max_d=3.042 avg_d=0.405 std_dev=0.472
O3'	A	0, 0.016, 0.595, 1.174, 1.946 max_d=1.946 avg_d=0.595 std_dev=0.579
P	B	0, -0.252, 0.450, 1.153, 4.423 max_d=4.423 avg_d=0.450 std_dev=0.703
P	A	0, 0.017, 0.728, 1.438, 2.349 max_d=2.349 avg_d=0.728 std_dev=0.710
OP1	A	0, 0.038, 0.810, 1.583, 2.866 max_d=2.866 avg_d=0.810 std_dev=0.773
OP2	B	0, -0.201, 0.610, 1.422, 5.057 max_d=5.057 avg_d=0.610 std_dev=0.812
OP1	B	0, -0.142, 0.727, 1.595, 5.036 max_d=5.036 avg_d=0.727 std_dev=0.869
OP2	A	0, 0.018, 0.941, 1.864, 2.709 max_d=2.709 avg_d=0.941 std_dev=0.923

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.07	0.10	0.08	0.07
C2	0.03	0.00	0.09	0.09	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.10	0.12	0.04	0.15	0.17	0.17	0.15
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.05	0.07	0.09	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.12	0.10	0.07
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.06	0.07	0.08	0.09	0.07	0.07	0.03	0.02	0.01	0.01	0.06	0.13	0.10	0.08
C4	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.06	0.02	0.14	0.15	0.14	0.14
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.03	0.03	0.05	0.05	0.03	0.04	0.02	0.00	0.02	0.09	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.02	0.17	0.18	0.18	0.19
C5'	0.03	0.07	0.02	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.10	0.11	0.09	0.06	0.12	0.12	0.07	0.04	0.03	0.02	0.01	0.09	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.08	0.03	0.17	0.19	0.20	0.20
C8	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.07	0.04	0.16	0.15	0.12	0.16
N1	0.02	0.01	0.07	0.08	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.10	0.03	0.16	0.18	0.20	0.18
N3	0.03	0.00	0.09	0.09	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.09	0.11	0.05	0.13	0.15	0.15	0.13
N6	0.02	0.01	0.06	0.07	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.07	0.08	0.04	0.18	0.20	0.22	0.23
N7	0.02	0.02	0.05	0.07	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.05	0.08	0.04	0.18	0.18	0.18	0.20
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.12	0.13	0.10	0.12
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.06	0.04	0.06	0.04	0.07	0.04	0.09	0.09	0.07	0.05	0.03	0.00	0.05	0.03	0.05	0.12	0.08	0.05
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.06	0.02	0.06	0.03	0.08	0.07	0.10	0.11	0.08	0.08	0.03	0.05	0.00	0.02	0.07	0.17	0.13	0.10
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.05	0.04	0.04	0.01	0.03	0.02	0.00	0.06	0.09	0.11	0.08
O5'	0.07	0.15	0.06	0.06	0.14	0.02	0.17	0.01	0.17	0.16	0.16	0.13	0.18	0.18	0.12	0.05	0.07	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.10	0.17	0.12	0.13	0.15	0.09	0.18	0.09	0.19	0.15	0.18	0.15	0.20	0.18	0.13	0.12	0.17	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.17	0.10	0.10	0.14	0.04	0.18	0.02	0.20	0.12	0.20	0.15	0.22	0.18	0.10	0.08	0.13	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.15	0.07	0.08	0.14	0.02	0.19	0.01	0.20	0.16	0.18	0.13	0.23	0.20	0.12	0.05	0.10	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.24	0.21	0.25	0.23	0.24	0.23	0.30	0.22	0.21	0.24	0.27	0.20	0.28	0.24	0.21	0.53	0.77	0.90	0.71
C2	0.14	0.14	0.19	0.21	0.11	0.18	0.14	0.25	0.14	0.13	0.14	0.16	0.19	0.24	0.12	0.15	0.51	0.76	0.91	0.72
C2'	0.36	0.41	0.37	0.39	0.35	0.36	0.31	0.41	0.32	0.36	0.41	0.46	0.36	0.42	0.35	0.34	0.60	0.79	0.96	0.75
C3'	0.37	0.42	0.36	0.37	0.35	0.35	0.30	0.38	0.31	0.36	0.42	0.48	0.36	0.39	0.35	0.33	0.58	0.78	0.95	0.75
C4	0.14	0.15	0.17	0.20	0.14	0.18	0.16	0.25	0.15	0.14	0.16	0.18	0.17	0.25	0.15	0.15	0.51	0.77	0.90	0.72
C4'	0.25	0.29	0.24	0.26	0.26	0.25	0.25	0.31	0.24	0.26	0.29	0.33	0.23	0.28	0.26	0.24	0.53	0.75	0.89	0.71
C5	0.15	0.14	0.23	0.26	0.12	0.21	0.14	0.25	0.16	0.14	0.15	0.17	0.23	0.32	0.13	0.17	0.52	0.79	0.89	0.74
C5'	0.23	0.27	0.21	0.22	0.25	0.23	0.23	0.28	0.22	0.24	0.28	0.31	0.20	0.24	0.25	0.22	0.51	0.76	0.88	0.70
C6	0.20	0.17	0.30	0.33	0.13	0.26	0.17	0.29	0.20	0.18	0.16	0.18	0.29	0.38	0.14	0.21	0.53	0.80	0.89	0.75
C8	0.14	0.16	0.18	0.22	0.15	0.19	0.15	0.24	0.15	0.14	0.17	0.20	0.18	0.28	0.17	0.15	0.51	0.78	0.89	0.73
N1	0.20	0.18	0.28	0.29	0.15	0.24	0.17	0.27	0.19	0.18	0.17	0.19	0.27	0.34	0.15	0.20	0.51	0.78	0.89	0.74
N3	0.14	0.15	0.16	0.20	0.15	0.19	0.18	0.27	0.17	0.14	0.16	0.18	0.16	0.23	0.15	0.16	0.52	0.76	0.91	0.72
N6	0.27	0.20	0.38	0.42	0.17	0.35	0.21	0.36	0.25	0.24	0.18	0.21	0.36	0.48	0.16	0.28	0.58	0.84	0.89	0.79
N7	0.15	0.14	0.23	0.27	0.12	0.22	0.14	0.26	0.16	0.14	0.15	0.17	0.23	0.33	0.14	0.17	0.52	0.80	0.89	0.75
N9	0.15	0.18	0.17	0.21	0.17	0.19	0.18	0.26	0.17	0.16	0.19	0.21	0.17	0.25	0.19	0.16	0.51	0.77	0.90	0.72
O2'	0.42	0.45	0.44	0.46	0.38	0.43	0.36	0.47	0.37	0.41	0.43	0.49	0.42	0.49	0.37	0.39	0.63	0.79	0.96	0.76
O3'	0.47	0.54	0.48	0.47	0.42	0.44	0.35	0.45	0.38	0.46	0.52	0.61	0.49	0.49	0.41	0.43	0.62	0.78	0.96	0.76
O4'	0.18	0.20	0.16	0.19	0.21	0.19	0.22	0.26	0.20	0.19	0.21	0.23	0.16	0.22	0.23	0.18	0.49	0.74	0.86	0.69
O5'	0.26	0.32	0.24	0.25	0.28	0.25	0.24	0.30	0.24	0.27	0.33	0.36	0.23	0.27	0.30	0.25	0.52	0.79	0.89	0.72
OP1	0.29	0.35	0.25	0.25	0.31	0.26	0.25	0.30	0.25	0.29	0.36	0.41	0.25	0.26	0.32	0.26	0.52	0.79	0.89	0.73
OP2	0.22	0.29	0.21	0.23	0.27	0.22	0.21	0.26	0.21	0.23	0.31	0.33	0.20	0.27	0.30	0.21	0.52	0.80	0.88	0.74
P	0.22	0.28	0.18	0.20	0.26	0.21	0.22	0.26	0.21	0.23	0.29	0.32	0.18	0.21	0.28	0.21	0.51	0.80	0.89	0.73

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.10	0.06	0.21	0.12
C2	0.02	0.00	0.07	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.07	0.02	0.02	0.21	0.20	0.42	0.27
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.05	0.02	0.07	0.11	0.00	0.02	0.06	0.01	0.09	0.08	0.12	0.08
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.07	0.01	0.10	0.02	0.11	0.05	0.06	0.10	0.02	0.01	0.08	0.01	0.14	0.12	0.14	0.12
C4	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.01	0.03	0.33	0.42	0.63	0.44
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.04	0.05	0.05	0.01	0.06	0.00	0.02	0.09	0.06	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.08	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.01	0.03	0.36	0.46	0.65	0.47
C5'	0.03	0.07	0.02	0.02	0.14	0.01	0.17	0.00	0.15	0.09	0.10	0.05	0.06	0.03	0.14	0.02	0.01	0.08	0.10	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.08	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.01	0.03	0.32	0.35	0.51	0.38
N1	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.01	0.22	0.20	0.38	0.26
N3	0.02	0.00	0.07	0.06	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.08	0.01	0.02	0.27	0.31	0.53	0.36
O2	0.03	0.01	0.11	0.10	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.12	0.02	0.04	0.15	0.13	0.35	0.21
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.07	0.05	0.04	0.06	0.04	0.03	0.10	0.14	0.00	0.04	0.08	0.04	0.06	0.17	0.07	0.08
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.08	0.01	0.12	0.03	0.12	0.05	0.08	0.12	0.04	0.00	0.10	0.01	0.15	0.19	0.22	0.15
O4	0.02	0.02	0.06	0.08	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.08	0.10	0.00	0.03	0.34	0.47	0.69	0.48
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.04	0.01	0.03	0.00	0.10	0.06	0.18	0.11
O5'	0.10	0.21	0.09	0.14	0.33	0.02	0.36	0.01	0.32	0.22	0.27	0.15	0.06	0.15	0.34	0.10	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.06	0.20	0.08	0.12	0.42	0.09	0.46	0.08	0.35	0.20	0.31	0.13	0.17	0.19	0.47	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.42	0.12	0.14	0.63	0.06	0.65	0.10	0.51	0.38	0.53	0.35	0.07	0.22	0.69	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.27	0.08	0.12	0.44	0.03	0.47	0.01	0.38	0.26	0.36	0.21	0.08	0.15	0.48	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00