Doublet Group distance statistics: 14029

back

Distances from reference structure (by RMSD)

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N9	A	max_d=0.206 avg_d=0.138 std_dev=0.070
C2	A	max_d=0.239 avg_d=0.137 std_dev=0.079
C4	A	max_d=0.254 avg_d=0.124 std_dev=0.085
C4	B	max_d=0.315 avg_d=0.143 std_dev=0.111
N3	A	max_d=0.364 avg_d=0.179 std_dev=0.135
O4'	B	max_d=0.403 avg_d=0.257 std_dev=0.153
N9	B	max_d=0.457 avg_d=0.231 std_dev=0.170
N1	B	max_d=0.559 avg_d=0.259 std_dev=0.190
C8	A	max_d=0.646 avg_d=0.308 std_dev=0.237
C1'	A	max_d=0.627 avg_d=0.303 std_dev=0.239
N1	A	max_d=0.610 avg_d=0.253 std_dev=0.241
C4'	A	max_d=0.823 avg_d=0.335 std_dev=0.263
C1'	B	max_d=0.813 avg_d=0.354 std_dev=0.312
O4'	A	max_d=0.875 avg_d=0.375 std_dev=0.314
C5	A	max_d=0.765 avg_d=0.306 std_dev=0.325
C2	B	max_d=0.829 avg_d=0.374 std_dev=0.326
C5'	A	max_d=1.181 avg_d=0.444 std_dev=0.386
N3	B	max_d=0.939 avg_d=0.388 std_dev=0.390
C6	A	max_d=0.976 avg_d=0.384 std_dev=0.421
N7	A	max_d=1.075 avg_d=0.437 std_dev=0.434
C2'	A	max_d=1.146 avg_d=0.469 std_dev=0.438
C5	B	max_d=1.328 avg_d=0.525 std_dev=0.571
C4'	B	max_d=1.443 avg_d=0.557 std_dev=0.608
C6	B	max_d=1.481 avg_d=0.586 std_dev=0.625
O2'	A	max_d=1.613 avg_d=0.687 std_dev=0.649
N6	A	max_d=1.567 avg_d=0.627 std_dev=0.658
C8	B	max_d=1.608 avg_d=0.652 std_dev=0.682
N2	B	max_d=1.744 avg_d=0.748 std_dev=0.716
N7	B	max_d=2.192 avg_d=0.866 std_dev=0.946
C3'	A	max_d=2.342 avg_d=0.866 std_dev=0.986
C5'	B	max_d=2.339 avg_d=0.923 std_dev=0.998
O5'	A	max_d=2.603 avg_d=1.052 std_dev=1.001
O6	B	max_d=2.386 avg_d=0.944 std_dev=1.018
C2'	B	max_d=2.417 avg_d=0.888 std_dev=1.053
C3'	B	max_d=2.628 avg_d=0.954 std_dev=1.172
O5'	B	max_d=3.440 avg_d=1.362 std_dev=1.469
O2'	B	max_d=3.453 avg_d=1.275 std_dev=1.497
OP1	A	max_d=3.991 avg_d=1.598 std_dev=1.628
O3'	B	max_d=3.740 avg_d=1.360 std_dev=1.678
P	A	max_d=4.304 avg_d=1.689 std_dev=1.768
O3'	A	max_d=4.426 avg_d=1.583 std_dev=1.952
P	B	max_d=4.839 avg_d=1.791 std_dev=2.114
OP2	A	max_d=5.974 avg_d=2.348 std_dev=2.527
OP2	B	max_d=6.258 avg_d=2.265 std_dev=2.803
OP1	B	max_d=7.145 avg_d=2.610 std_dev=3.143

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.31	0.01	0.12	0.16	0.12	0.17
C2	0.03	0.00	0.08	0.04	0.02	0.05	0.02	0.08	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.55	0.45	0.08	0.09	0.11	0.20	0.11
C2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.21	0.04	0.08	0.05	0.08	0.06	0.07	0.02	0.01	0.02	0.01	0.46	0.42	0.64	0.54
C3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.17	0.00	0.33	0.02	0.30	0.50	0.17	0.04	0.39	0.49	0.25	0.02	0.01	0.02	0.10	0.05	0.15	0.10
C4	0.01	0.02	0.04	0.17	0.00	0.08	0.01	0.08	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.40	0.19	0.04	0.12	0.09	0.18	0.09
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.14	0.18	0.10	0.03	0.18	0.18	0.10	0.33	0.02	0.01	0.02	0.09	0.04	0.03
C5	0.02	0.02	0.04	0.33	0.01	0.14	0.00	0.13	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.39	0.06	0.04	0.25	0.16	0.33	0.13
C5'	0.07	0.08	0.21	0.02	0.08	0.01	0.13	0.00	0.15	0.14	0.12	0.06	0.20	0.16	0.06	0.10	0.21	0.01	0.01	0.10	0.02	0.02
C6	0.03	0.01	0.04	0.30	0.02	0.14	0.02	0.15	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.47	0.02	0.06	0.26	0.19	0.37	0.17
C8	0.03	0.02	0.08	0.50	0.01	0.18	0.01	0.14	0.03	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.16	0.34	0.07	0.29	0.13	0.29	0.10
N1	0.03	0.01	0.05	0.17	0.03	0.10	0.02	0.12	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.53	0.24	0.08	0.18	0.16	0.29	0.15
N3	0.02	0.01	0.08	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.49	0.49	0.07	0.06	0.09	0.15	0.11
N6	0.04	0.01	0.06	0.39	0.03	0.18	0.03	0.20	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.05	0.04	0.45	0.14	0.07	0.33	0.27	0.49	0.24
N7	0.02	0.02	0.07	0.49	0.00	0.18	0.01	0.16	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.27	0.33	0.06	0.34	0.19	0.42	0.15
N9	0.01	0.02	0.02	0.25	0.01	0.10	0.01	0.06	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.00	0.22	0.05	0.02	0.12	0.08	0.12	0.08
O2'	0.02	0.55	0.01	0.02	0.40	0.33	0.39	0.10	0.47	0.16	0.53	0.49	0.45	0.27	0.22	0.00	0.02	0.24	0.35	0.26	0.74	0.46
O3'	0.31	0.45	0.02	0.01	0.19	0.02	0.06	0.21	0.02	0.34	0.24	0.49	0.14	0.33	0.05	0.02	0.00	0.22	0.20	0.40	0.20	0.24
O4'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.06	0.07	0.08	0.07	0.07	0.06	0.02	0.24	0.22	0.00	0.14	0.12	0.18	0.11
O5'	0.12	0.09	0.46	0.10	0.12	0.02	0.25	0.01	0.26	0.29	0.18	0.06	0.33	0.34	0.12	0.35	0.20	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.16	0.11	0.42	0.05	0.09	0.09	0.16	0.10	0.19	0.13	0.16	0.09	0.27	0.19	0.08	0.26	0.40	0.12	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.12	0.20	0.64	0.15	0.18	0.04	0.33	0.02	0.37	0.29	0.29	0.15	0.49	0.42	0.12	0.74	0.20	0.18	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.17	0.11	0.54	0.10	0.09	0.03	0.13	0.02	0.17	0.10	0.15	0.11	0.24	0.15	0.08	0.46	0.24	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.29	0.26	0.37	0.22	0.10	0.22	0.07	0.25	0.19	0.29	0.36	0.26	0.21	0.20	0.23	0.57	0.22	0.09	0.27	0.47	0.72	0.12
C2	0.28	0.14	0.31	0.28	0.25	0.30	0.26	0.33	0.19	0.33	0.10	0.14	0.20	0.32	0.29	0.35	0.27	0.30	0.36	0.20	1.26	0.52	0.39
C2'	0.34	0.24	0.72	0.77	0.19	0.45	0.08	0.36	0.14	0.10	0.10	0.40	0.30	0.09	0.21	0.74	1.00	0.22	0.30	0.27	0.33	0.78	0.27
C3'	0.77	0.49	1.21	1.29	0.52	0.95	0.33	0.87	0.19	0.46	0.25	0.60	0.63	0.31	0.59	1.24	1.57	0.66	0.80	0.14	0.28	1.24	0.77
C4	0.28	0.28	0.16	0.08	0.27	0.19	0.25	0.19	0.22	0.28	0.24	0.31	0.29	0.27	0.28	0.26	0.09	0.29	0.20	0.21	0.92	0.63	0.19
C4'	0.20	0.24	0.55	0.70	0.16	0.34	0.13	0.32	0.17	0.11	0.22	0.33	0.22	0.10	0.17	0.49	0.97	0.17	0.35	0.21	0.11	0.91	0.39
C5	0.37	0.32	0.35	0.25	0.32	0.32	0.27	0.30	0.21	0.32	0.23	0.36	0.36	0.29	0.35	0.45	0.21	0.37	0.29	0.17	1.06	0.63	0.28
C5'	0.28	0.37	0.27	0.40	0.29	0.15	0.24	0.13	0.25	0.23	0.31	0.46	0.35	0.22	0.27	0.26	0.63	0.30	0.15	0.24	0.26	0.74	0.20
C6	0.42	0.29	0.50	0.44	0.34	0.43	0.28	0.42	0.19	0.37	0.18	0.29	0.35	0.33	0.39	0.58	0.44	0.41	0.42	0.17	1.29	0.56	0.42
C8	0.33	0.38	0.16	0.03	0.31	0.19	0.25	0.15	0.23	0.27	0.29	0.46	0.38	0.24	0.31	0.31	0.13	0.34	0.12	0.19	0.74	0.72	0.10
N1	0.39	0.20	0.49	0.46	0.30	0.42	0.28	0.44	0.18	0.38	0.12	0.19	0.28	0.34	0.36	0.54	0.47	0.37	0.46	0.17	1.40	0.51	0.48
N3	0.21	0.18	0.12	0.09	0.22	0.16	0.24	0.19	0.23	0.27	0.18	0.18	0.19	0.28	0.24	0.18	0.13	0.24	0.22	0.24	0.99	0.58	0.23
N6	0.49	0.31	0.63	0.58	0.37	0.52	0.29	0.50	0.18	0.41	0.18	0.33	0.39	0.34	0.43	0.72	0.61	0.46	0.50	0.16	1.40	0.56	0.50
N7	0.40	0.38	0.32	0.20	0.34	0.30	0.27	0.27	0.22	0.32	0.27	0.44	0.40	0.28	0.36	0.46	0.14	0.39	0.24	0.18	0.94	0.68	0.22
N9	0.26	0.33	0.08	0.11	0.27	0.11	0.24	0.09	0.24	0.24	0.28	0.39	0.32	0.24	0.26	0.18	0.25	0.28	0.08	0.22	0.70	0.69	0.08
O2'	0.53	0.55	0.91	0.92	0.43	0.58	0.30	0.48	0.25	0.31	0.37	0.74	0.56	0.24	0.42	0.92	1.11	0.37	0.43	0.19	0.21	0.83	0.39
O3'	1.74	1.35	2.28	2.36	1.43	1.97	1.16	1.87	0.92	1.36	0.99	1.44	1.56	1.15	1.53	2.31	2.67	1.62	1.78	0.66	1.28	2.13	1.74
O4'	0.42	0.57	0.16	0.22	0.44	0.18	0.36	0.13	0.35	0.34	0.46	0.73	0.54	0.32	0.41	0.28	0.43	0.45	0.09	0.29	0.42	0.68	0.11
O5'	0.25	0.29	0.15	0.23	0.26	0.11	0.24	0.07	0.24	0.24	0.26	0.34	0.29	0.23	0.26	0.21	0.40	0.27	0.06	0.22	0.46	0.64	0.08
OP1	0.42	0.40	0.19	0.13	0.37	0.26	0.29	0.21	0.26	0.33	0.30	0.46	0.43	0.28	0.38	0.35	0.23	0.44	0.14	0.21	0.50	0.57	0.10
OP2	0.56	0.45	0.47	0.40	0.50	0.49	0.47	0.48	0.42	0.52	0.41	0.44	0.50	0.49	0.53	0.60	0.34	0.57	0.46	0.39	1.00	0.29	0.46
P	0.53	0.47	0.34	0.21	0.46	0.40	0.38	0.36	0.33	0.43	0.37	0.52	0.51	0.38	0.48	0.52	0.12	0.55	0.30	0.28	0.72	0.42	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.05	0.05	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.26	0.11	0.07
C2	0.05	0.00	0.21	0.25	0.02	0.10	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.16	0.31	0.06	0.08	0.03	0.52	0.54	0.08
C2'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.11	0.01	0.06	0.02	0.09	0.07	0.16	0.25	0.21	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.07	0.18	0.16	0.10
C3'	0.02	0.25	0.00	0.00	0.15	0.01	0.11	0.02	0.14	0.04	0.21	0.28	0.23	0.04	0.07	0.01	0.00	0.01	0.08	0.11	0.14	0.15	0.10
C4	0.03	0.02	0.11	0.15	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.18	0.04	0.08	0.04	0.56	0.47	0.08
C4'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.07	0.11	0.09	0.04	0.02	0.05	0.02	0.01	0.03	0.03	0.20	0.19	0.04
C5	0.02	0.02	0.06	0.11	0.01	0.03	0.00	0.06	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.14	0.04	0.12	0.03	0.77	0.60	0.11
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.05	0.01	0.06	0.00	0.06	0.08	0.06	0.09	0.07	0.08	0.04	0.04	0.03	0.02	0.01	0.07	0.35	0.36	0.02
C6	0.04	0.02	0.09	0.14	0.03	0.04	0.02	0.06	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.08	0.20	0.06	0.11	0.01	0.82	0.67	0.11
C8	0.02	0.02	0.07	0.04	0.01	0.05	0.02	0.08	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.03	0.17	0.06	0.75	0.44	0.14
N1	0.05	0.01	0.16	0.21	0.02	0.07	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.03	0.12	0.28	0.06	0.08	0.02	0.69	0.63	0.09
N2	0.05	0.01	0.25	0.28	0.02	0.11	0.02	0.09	0.03	0.02	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.20	0.36	0.07	0.08	0.04	0.44	0.52	0.08
N3	0.05	0.01	0.21	0.23	0.01	0.09	0.02	0.07	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.27	0.05	0.06	0.04	0.44	0.44	0.07
N7	0.02	0.02	0.04	0.04	0.00	0.04	0.01	0.08	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.03	0.16	0.06	0.90	0.61	0.14
N9	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.10	0.05	0.51	0.35	0.09
O2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.08	0.05	0.06	0.04	0.08	0.05	0.12	0.20	0.16	0.05	0.02	0.00	0.05	0.05	0.05	0.08	0.13	0.10	0.07
O3'	0.01	0.31	0.01	0.00	0.18	0.02	0.14	0.03	0.20	0.04	0.28	0.36	0.27	0.06	0.07	0.05	0.00	0.02	0.14	0.17	0.37	0.18	0.13
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.06	0.03	0.06	0.07	0.05	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.09	0.07	0.13	0.13	0.08
O5'	0.07	0.08	0.06	0.08	0.08	0.03	0.12	0.01	0.11	0.17	0.08	0.08	0.06	0.16	0.10	0.05	0.14	0.09	0.00	0.13	0.02	0.01	0.01
O6	0.05	0.03	0.07	0.11	0.04	0.03	0.03	0.07	0.01	0.06	0.02	0.04	0.04	0.06	0.05	0.08	0.17	0.07	0.13	0.00	0.97	0.71	0.14
OP1	0.26	0.52	0.18	0.14	0.56	0.20	0.77	0.35	0.82	0.75	0.69	0.44	0.44	0.90	0.51	0.13	0.37	0.13	0.02	0.97	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.54	0.16	0.15	0.47	0.19	0.60	0.36	0.67	0.44	0.63	0.52	0.44	0.61	0.35	0.10	0.18	0.13	0.01	0.71	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.08	0.10	0.10	0.08	0.04	0.11	0.02	0.11	0.14	0.09	0.08	0.07	0.14	0.09	0.07	0.13	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00