Doublet Group distance statistics: 14698

back

Distances from reference structure (by RMSD)

58, 72, 7, 3, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.016, 0.063, 0.110, 0.413 max_d=0.413 avg_d=0.063 std_dev=0.047
N1	B	0, 0.017, 0.064, 0.111, 0.359 max_d=0.359 avg_d=0.064 std_dev=0.047
N3	A	0, 0.027, 0.077, 0.128, 0.418 max_d=0.418 avg_d=0.077 std_dev=0.051
C4	B	0, 0.072, 0.146, 0.220, 0.447 max_d=0.447 avg_d=0.146 std_dev=0.074
C6	B	0, 0.009, 0.085, 0.160, 0.489 max_d=0.489 avg_d=0.085 std_dev=0.075
C5	B	0, 0.027, 0.103, 0.178, 0.381 max_d=0.381 avg_d=0.103 std_dev=0.076
C2	B	0, 0.024, 0.109, 0.193, 0.534 max_d=0.534 avg_d=0.109 std_dev=0.084
C1'	B	0, 0.043, 0.134, 0.225, 0.513 max_d=0.513 avg_d=0.134 std_dev=0.091
C2	A	0, -0.003, 0.095, 0.192, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.095 std_dev=0.097
N9	A	0, -0.017, 0.081, 0.179, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.081 std_dev=0.098
C5	A	0, 0.006, 0.106, 0.206, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.106 std_dev=0.100
N3	B	0, 0.054, 0.155, 0.256, 0.595 max_d=0.595 avg_d=0.155 std_dev=0.101
O4	B	0, 0.111, 0.224, 0.337, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.224 std_dev=0.113
N1	A	0, -0.017, 0.110, 0.236, 1.331 max_d=1.331 avg_d=0.110 std_dev=0.126
C1'	A	0, -0.020, 0.112, 0.245, 1.465 max_d=1.465 avg_d=0.112 std_dev=0.132
C6	A	0, -0.001, 0.131, 0.264, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.131 std_dev=0.132
O2	B	0, 0.027, 0.164, 0.301, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.164 std_dev=0.137
C8	A	0, -0.027, 0.124, 0.275, 1.625 max_d=1.625 avg_d=0.124 std_dev=0.151
N7	A	0, -0.011, 0.145, 0.301, 1.640 max_d=1.640 avg_d=0.145 std_dev=0.156
N2	A	0, -0.021, 0.139, 0.299, 1.645 max_d=1.645 avg_d=0.139 std_dev=0.160
O4'	B	0, 0.078, 0.238, 0.398, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.238 std_dev=0.160
C2'	B	0, 0.068, 0.245, 0.422, 0.575 max_d=0.575 avg_d=0.245 std_dev=0.177
O6	A	0, -0.002, 0.191, 0.385, 2.080 max_d=2.080 avg_d=0.191 std_dev=0.194
O2'	B	0, 0.110, 0.311, 0.511, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.311 std_dev=0.201
O2'	A	0, 0.005, 0.241, 0.476, 2.585 max_d=2.585 avg_d=0.241 std_dev=0.236
P	B	0, 0.130, 0.367, 0.603, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.367 std_dev=0.237
C4'	B	0, 0.109, 0.357, 0.604, 0.724 max_d=0.724 avg_d=0.357 std_dev=0.248
C3'	B	0, 0.108, 0.361, 0.615, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.361 std_dev=0.254
O5'	B	0, 0.127, 0.382, 0.637, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.382 std_dev=0.255
C2'	A	0, -0.035, 0.227, 0.489, 2.856 max_d=2.856 avg_d=0.227 std_dev=0.262
OP2	B	0, 0.096, 0.377, 0.658, 1.996 max_d=1.996 avg_d=0.377 std_dev=0.281
C5'	B	0, 0.146, 0.473, 0.800, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.473 std_dev=0.327
O4'	A	0, -0.063, 0.281, 0.625, 3.727 max_d=3.727 avg_d=0.281 std_dev=0.344
OP1	B	0, 0.162, 0.506, 0.851, 1.948 max_d=1.948 avg_d=0.506 std_dev=0.344
O3'	B	0, 0.148, 0.516, 0.884, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.516 std_dev=0.368
C3'	A	0, -0.062, 0.394, 0.849, 5.007 max_d=5.007 avg_d=0.394 std_dev=0.455
C4'	A	0, -0.077, 0.395, 0.867, 5.173 max_d=5.173 avg_d=0.395 std_dev=0.472
O3'	A	0, -0.086, 0.535, 1.155, 6.841 max_d=6.841 avg_d=0.535 std_dev=0.621
C5'	A	0, -0.121, 0.572, 1.266, 7.533 max_d=7.533 avg_d=0.572 std_dev=0.693
O5'	A	0, -0.080, 0.783, 1.646, 8.198 max_d=8.198 avg_d=0.783 std_dev=0.863
P	A	0, -0.056, 1.120, 2.296, 10.161 max_d=10.161 avg_d=1.120 std_dev=1.176
OP2	A	0, -0.094, 1.140, 2.373, 11.442 max_d=11.442 avg_d=1.140 std_dev=1.234
OP1	A	0, 0.042, 1.353, 2.664, 10.430 max_d=10.430 avg_d=1.353 std_dev=1.311

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.25	0.02	0.29	0.17	0.23
C2	0.04	0.00	0.12	0.20	0.01	0.16	0.01	0.28	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.23	0.09	0.48	0.02	0.47	0.42	0.49
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.02	0.03	0.01	0.05	0.06	0.09	0.14	0.12	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.12	0.04	0.20	0.29	0.16
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.10	0.00	0.07	0.01	0.10	0.12	0.16	0.25	0.19	0.09	0.05	0.02	0.01	0.01	0.32	0.09	0.33	0.44	0.36
C4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.11	0.05	0.39	0.01	0.39	0.25	0.37
C4'	0.01	0.16	0.02	0.00	0.08	0.00	0.05	0.01	0.08	0.10	0.13	0.20	0.16	0.07	0.03	0.06	0.02	0.00	0.02	0.07	0.14	0.12	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.03	0.39	0.01	0.40	0.26	0.38
C5'	0.02	0.28	0.01	0.01	0.15	0.01	0.12	0.00	0.16	0.15	0.23	0.35	0.25	0.13	0.07	0.07	0.03	0.01	0.01	0.15	0.19	0.10	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.04	0.43	0.01	0.44	0.31	0.43
C8	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.10	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.06	0.36	0.02	0.35	0.29	0.33
N1	0.03	0.01	0.09	0.16	0.01	0.13	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.18	0.07	0.47	0.01	0.47	0.39	0.48
N2	0.05	0.01	0.14	0.25	0.02	0.20	0.01	0.35	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.30	0.11	0.52	0.02	0.50	0.51	0.54
N3	0.03	0.01	0.12	0.19	0.01	0.16	0.01	0.25	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.21	0.09	0.44	0.02	0.43	0.35	0.43
N7	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.11	0.04	0.38	0.02	0.38	0.28	0.35
N9	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.32	0.02	0.34	0.20	0.30
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.05	0.06	0.04	0.07	0.06	0.04	0.09	0.14	0.10	0.03	0.02	0.00	0.04	0.04	0.13	0.05	0.21	0.28	0.16
O3'	0.02	0.23	0.02	0.01	0.11	0.02	0.08	0.03	0.11	0.13	0.18	0.30	0.21	0.11	0.05	0.04	0.00	0.02	0.63	0.10	0.71	0.73	0.70
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.06	0.07	0.11	0.09	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.40	0.04	0.45	0.30	0.38
O5'	0.25	0.48	0.12	0.32	0.39	0.02	0.39	0.01	0.43	0.36	0.47	0.52	0.44	0.38	0.32	0.13	0.63	0.40	0.00	0.43	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.04	0.09	0.01	0.07	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.10	0.04	0.43	0.00	0.44	0.30	0.43
OP1	0.29	0.47	0.20	0.33	0.39	0.14	0.40	0.19	0.44	0.35	0.47	0.50	0.43	0.38	0.34	0.21	0.71	0.45	0.02	0.44	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.42	0.29	0.44	0.25	0.12	0.26	0.10	0.31	0.29	0.39	0.51	0.35	0.28	0.20	0.28	0.73	0.30	0.02	0.30	0.01	0.00	0.01
P	0.23	0.49	0.16	0.36	0.37	0.03	0.38	0.01	0.43	0.33	0.48	0.54	0.43	0.35	0.30	0.16	0.70	0.38	0.01	0.43	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.17	0.23	0.24	0.18	0.20	0.17	0.20	0.17	0.17	0.17	0.18	0.25	0.28	0.19	0.19	0.26	0.22	0.22	0.17
C2	0.15	0.13	0.21	0.22	0.16	0.16	0.16	0.17	0.15	0.14	0.13	0.15	0.21	0.27	0.19	0.14	0.22	0.23	0.35	0.22
C2'	0.28	0.21	0.37	0.39	0.19	0.33	0.20	0.32	0.22	0.23	0.18	0.23	0.41	0.46	0.21	0.27	0.36	0.34	0.27	0.27
C3'	0.45	0.33	0.54	0.55	0.27	0.51	0.31	0.49	0.35	0.37	0.27	0.36	0.60	0.62	0.26	0.45	0.50	0.48	0.33	0.40
C4	0.13	0.11	0.20	0.21	0.13	0.14	0.12	0.15	0.11	0.11	0.11	0.13	0.20	0.26	0.17	0.12	0.22	0.19	0.28	0.16
C4'	0.44	0.33	0.48	0.47	0.26	0.47	0.30	0.45	0.34	0.37	0.27	0.36	0.54	0.51	0.24	0.45	0.45	0.43	0.28	0.35
C5	0.14	0.13	0.21	0.22	0.14	0.15	0.13	0.16	0.12	0.13	0.12	0.15	0.20	0.26	0.17	0.13	0.21	0.20	0.30	0.18
C5'	0.59	0.41	0.62	0.60	0.31	0.63	0.37	0.60	0.44	0.48	0.32	0.45	0.72	0.65	0.27	0.60	0.56	0.53	0.36	0.46
C6	0.19	0.18	0.23	0.24	0.18	0.19	0.18	0.20	0.18	0.18	0.17	0.20	0.23	0.28	0.19	0.18	0.23	0.26	0.37	0.24
C8	0.15	0.15	0.20	0.21	0.18	0.16	0.17	0.16	0.15	0.15	0.17	0.14	0.20	0.25	0.21	0.14	0.24	0.20	0.24	0.16
N1	0.18	0.17	0.23	0.24	0.19	0.19	0.19	0.20	0.19	0.18	0.17	0.18	0.22	0.28	0.21	0.18	0.24	0.27	0.38	0.26
N2	0.15	0.14	0.21	0.22	0.18	0.16	0.18	0.18	0.16	0.15	0.14	0.15	0.21	0.27	0.21	0.15	0.23	0.25	0.37	0.24
N3	0.13	0.11	0.20	0.21	0.14	0.14	0.13	0.15	0.11	0.11	0.11	0.13	0.21	0.26	0.17	0.12	0.21	0.20	0.30	0.18
N7	0.13	0.12	0.20	0.21	0.15	0.14	0.14	0.15	0.12	0.12	0.13	0.14	0.20	0.25	0.19	0.12	0.21	0.18	0.27	0.16
N9	0.15	0.14	0.21	0.22	0.16	0.16	0.15	0.16	0.14	0.14	0.15	0.15	0.21	0.26	0.19	0.15	0.23	0.19	0.24	0.15
O2'	0.25	0.18	0.32	0.34	0.18	0.28	0.18	0.27	0.19	0.20	0.17	0.20	0.35	0.41	0.20	0.24	0.33	0.31	0.24	0.24
O3'	0.53	0.37	0.64	0.67	0.30	0.62	0.35	0.60	0.41	0.43	0.30	0.39	0.72	0.77	0.29	0.53	0.60	0.60	0.41	0.50
O4'	0.32	0.27	0.32	0.31	0.23	0.32	0.24	0.31	0.27	0.29	0.25	0.30	0.36	0.33	0.22	0.33	0.33	0.30	0.23	0.24
O5'	0.56	0.51	0.53	0.51	0.43	0.55	0.43	0.51	0.47	0.51	0.46	0.56	0.62	0.56	0.43	0.56	0.45	0.44	0.35	0.37
O6	0.24	0.24	0.27	0.28	0.23	0.25	0.23	0.25	0.24	0.24	0.23	0.25	0.26	0.31	0.22	0.24	0.26	0.31	0.41	0.29
OP1	0.71	0.57	0.66	0.61	0.44	0.70	0.46	0.65	0.53	0.60	0.49	0.64	0.81	0.65	0.43	0.73	0.54	0.54	0.45	0.49
OP2	0.93	0.73	0.92	0.86	0.51	0.90	0.58	0.84	0.70	0.79	0.57	0.80	1.04	0.89	0.43	0.91	0.74	0.70	0.57	0.66
P	0.72	0.59	0.67	0.62	0.44	0.69	0.46	0.64	0.53	0.61	0.49	0.67	0.80	0.67	0.42	0.72	0.54	0.53	0.41	0.47

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.00	0.07	0.06	0.29	0.10
C2	0.02	0.00	0.08	0.07	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.09	0.02	0.04	0.15	0.11	0.28	0.12
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.07	0.14	0.00	0.02	0.06	0.01	0.11	0.13	0.20	0.06
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.09	0.01	0.12	0.02	0.12	0.05	0.07	0.11	0.02	0.01	0.10	0.01	0.17	0.18	0.14	0.10
C4	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.03	0.25	0.17	0.25	0.16
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.04	0.05	0.04	0.02	0.06	0.00	0.02	0.10	0.21	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.14	0.01	0.03	0.26	0.17	0.25	0.16
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.09	0.01	0.11	0.00	0.09	0.05	0.07	0.06	0.04	0.04	0.11	0.02	0.01	0.11	0.18	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.13	0.02	0.04	0.23	0.13	0.27	0.13
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.05	0.02	0.01	0.15	0.10	0.28	0.11
N3	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.09	0.02	0.03	0.20	0.14	0.27	0.13
O2	0.04	0.01	0.14	0.11	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.15	0.14	0.02	0.06	0.12	0.10	0.29	0.12
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.05	0.04	0.04	0.04	0.04	0.03	0.08	0.15	0.00	0.04	0.05	0.04	0.06	0.15	0.21	0.06
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.11	0.02	0.14	0.04	0.13	0.05	0.09	0.14	0.04	0.00	0.13	0.02	0.17	0.26	0.16	0.16
O4	0.03	0.02	0.06	0.10	0.01	0.06	0.01	0.11	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.13	0.00	0.03	0.27	0.19	0.25	0.18
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.03	0.06	0.04	0.02	0.03	0.00	0.08	0.07	0.33	0.14
O5'	0.07	0.15	0.11	0.17	0.25	0.02	0.26	0.01	0.23	0.15	0.20	0.12	0.06	0.17	0.27	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.06	0.11	0.13	0.18	0.17	0.10	0.17	0.11	0.13	0.10	0.14	0.10	0.15	0.26	0.19	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.28	0.20	0.14	0.25	0.21	0.25	0.18	0.27	0.28	0.27	0.29	0.21	0.16	0.25	0.33	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.12	0.06	0.10	0.16	0.05	0.16	0.02	0.13	0.11	0.13	0.12	0.06	0.16	0.18	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00