Doublet Group distance statistics: 1478

back

Distances from reference structure (by RMSD)

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	B	max_d=0.428 avg_d=0.080 std_dev=0.054
N1	A	max_d=0.565 avg_d=0.084 std_dev=0.062
N9	B	max_d=0.668 avg_d=0.135 std_dev=0.087
N3	B	max_d=0.887 avg_d=0.141 std_dev=0.095
C1'	A	max_d=0.832 avg_d=0.142 std_dev=0.107
C6	A	max_d=1.023 avg_d=0.175 std_dev=0.115
C4	A	max_d=0.984 avg_d=0.170 std_dev=0.117
C2	A	max_d=0.729 avg_d=0.200 std_dev=0.119
C5	B	max_d=1.108 avg_d=0.164 std_dev=0.123
C1'	B	max_d=1.188 avg_d=0.199 std_dev=0.131
C5	A	max_d=1.114 avg_d=0.209 std_dev=0.137
N3	A	max_d=0.908 avg_d=0.214 std_dev=0.139
C2	B	max_d=1.174 avg_d=0.211 std_dev=0.143
N1	B	max_d=1.216 avg_d=0.230 std_dev=0.155
C6	B	max_d=1.293 avg_d=0.222 std_dev=0.163
C8	B	max_d=1.622 avg_d=0.236 std_dev=0.170
N4	A	max_d=1.547 avg_d=0.261 std_dev=0.178
N7	B	max_d=1.972 avg_d=0.257 std_dev=0.191
O2	A	max_d=1.445 avg_d=0.347 std_dev=0.214
N2	B	max_d=1.732 avg_d=0.329 std_dev=0.229
O4'	A	max_d=2.252 avg_d=0.286 std_dev=0.234
O6	B	max_d=1.792 avg_d=0.314 std_dev=0.237
C2'	A	max_d=2.874 avg_d=0.350 std_dev=0.262
C2'	B	max_d=2.846 avg_d=0.359 std_dev=0.305
O4'	B	max_d=2.557 avg_d=0.361 std_dev=0.308
C4'	A	max_d=3.035 avg_d=0.440 std_dev=0.342
C3'	A	max_d=3.544 avg_d=0.513 std_dev=0.377
O2'	A	max_d=4.436 avg_d=0.507 std_dev=0.403
C3'	B	max_d=4.054 avg_d=0.519 std_dev=0.425
C4'	B	max_d=3.563 avg_d=0.508 std_dev=0.430
O2'	B	max_d=3.449 avg_d=0.511 std_dev=0.436
O3'	A	max_d=3.958 avg_d=0.804 std_dev=0.545
C5'	A	max_d=6.021 avg_d=0.671 std_dev=0.559
O3'	B	max_d=5.445 avg_d=0.729 std_dev=0.570
C5'	B	max_d=5.730 avg_d=0.758 std_dev=0.676
O5'	A	max_d=7.728 avg_d=0.785 std_dev=0.787
O5'	B	max_d=6.691 avg_d=0.919 std_dev=0.861
P	A	max_d=10.679 avg_d=1.035 std_dev=1.094
P	B	max_d=9.150 avg_d=1.241 std_dev=1.184
OP1	A	max_d=11.001 avg_d=1.233 std_dev=1.243
OP1	B	max_d=11.251 avg_d=1.495 std_dev=1.398
OP2	A	max_d=12.350 avg_d=1.236 std_dev=1.444
OP2	B	max_d=9.817 avg_d=1.501 std_dev=1.486

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.11	0.01	0.18	0.24	0.26	0.16
C2	0.02	0.00	0.10	0.13	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.12	0.07	0.32	0.34	0.50	0.31
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.05	0.02	0.08	0.07	0.09	0.03	0.09	0.06	0.18	0.01	0.02	0.01	0.23	0.31	0.26	0.21
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.18	0.01	0.20	0.02	0.19	0.11	0.16	0.20	0.16	0.02	0.01	0.02	0.24	0.33	0.20	0.20
C4	0.02	0.01	0.05	0.18	0.00	0.10	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.15	0.04	0.48	0.50	0.83	0.54
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.10	0.00	0.14	0.01	0.13	0.06	0.07	0.11	0.12	0.13	0.03	0.01	0.02	0.19	0.23	0.07
C5	0.02	0.01	0.08	0.20	0.01	0.14	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.19	0.06	0.54	0.55	0.90	0.61
C5'	0.04	0.14	0.07	0.02	0.18	0.01	0.22	0.00	0.21	0.11	0.16	0.20	0.21	0.07	0.09	0.02	0.01	0.20	0.27	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.19	0.01	0.13	0.01	0.21	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.16	0.08	0.49	0.44	0.70	0.50
N1	0.01	0.01	0.03	0.11	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.08	0.07	0.02	0.33	0.31	0.47	0.31
N3	0.02	0.01	0.09	0.16	0.00	0.07	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.13	0.06	0.40	0.41	0.66	0.42
N4	0.02	0.01	0.06	0.20	0.01	0.11	0.01	0.20	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.15	0.18	0.04	0.51	0.56	0.95	0.60
O2	0.04	0.01	0.18	0.16	0.01	0.12	0.02	0.21	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.16	0.21	0.12	0.28	0.36	0.39	0.28
O2'	0.02	0.11	0.01	0.02	0.14	0.13	0.16	0.07	0.14	0.08	0.13	0.15	0.16	0.00	0.05	0.09	0.12	0.30	0.29	0.18
O3'	0.11	0.12	0.02	0.01	0.15	0.03	0.19	0.09	0.16	0.07	0.13	0.18	0.21	0.05	0.00	0.08	0.24	0.43	0.32	0.25
O4'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.04	0.01	0.06	0.02	0.08	0.02	0.06	0.04	0.12	0.09	0.08	0.00	0.15	0.24	0.27	0.18
O5'	0.18	0.32	0.23	0.24	0.48	0.02	0.54	0.01	0.49	0.33	0.40	0.51	0.28	0.12	0.24	0.15	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.24	0.34	0.31	0.33	0.50	0.19	0.55	0.20	0.44	0.31	0.41	0.56	0.36	0.30	0.43	0.24	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.26	0.50	0.26	0.20	0.83	0.23	0.90	0.27	0.70	0.47	0.66	0.95	0.39	0.29	0.32	0.27	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.31	0.21	0.20	0.54	0.07	0.61	0.02	0.50	0.31	0.42	0.60	0.28	0.18	0.25	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.19	0.31	0.35	0.20	0.27	0.23	0.39	0.27	0.21	0.23	0.22	0.19	0.25	0.19	0.34	0.40	0.26	0.54	0.34	0.84	0.73	0.62
C2	0.16	0.16	0.26	0.30	0.17	0.22	0.22	0.34	0.27	0.20	0.21	0.23	0.16	0.24	0.16	0.29	0.33	0.22	0.53	0.35	0.80	0.73	0.60
C2'	0.32	0.28	0.42	0.44	0.28	0.38	0.29	0.46	0.31	0.29	0.29	0.31	0.29	0.30	0.29	0.45	0.48	0.36	0.55	0.36	0.82	0.70	0.60
C3'	0.34	0.29	0.42	0.43	0.30	0.39	0.31	0.47	0.31	0.32	0.29	0.31	0.30	0.32	0.31	0.45	0.48	0.38	0.56	0.36	0.82	0.72	0.61
C4	0.19	0.24	0.24	0.29	0.18	0.22	0.20	0.34	0.20	0.20	0.20	0.33	0.22	0.23	0.18	0.28	0.32	0.22	0.56	0.28	0.83	0.84	0.64
C4'	0.24	0.22	0.34	0.38	0.22	0.31	0.24	0.41	0.26	0.23	0.23	0.25	0.23	0.25	0.22	0.38	0.44	0.30	0.54	0.32	0.85	0.74	0.62
C5	0.18	0.22	0.24	0.29	0.18	0.23	0.19	0.35	0.20	0.20	0.18	0.30	0.20	0.23	0.18	0.27	0.33	0.23	0.56	0.27	0.86	0.86	0.66
C5'	0.33	0.30	0.40	0.43	0.30	0.38	0.29	0.46	0.29	0.30	0.28	0.34	0.31	0.31	0.31	0.44	0.49	0.37	0.59	0.33	0.88	0.80	0.66
C6	0.16	0.17	0.24	0.29	0.15	0.22	0.18	0.35	0.20	0.18	0.16	0.25	0.17	0.22	0.15	0.27	0.34	0.21	0.55	0.28	0.85	0.81	0.63
N1	0.16	0.16	0.26	0.30	0.16	0.23	0.20	0.35	0.24	0.19	0.18	0.22	0.16	0.23	0.16	0.29	0.35	0.22	0.53	0.32	0.83	0.75	0.61
N3	0.16	0.20	0.24	0.28	0.16	0.21	0.20	0.32	0.23	0.19	0.17	0.30	0.18	0.23	0.16	0.27	0.31	0.20	0.53	0.33	0.80	0.77	0.60
N4	0.25	0.32	0.28	0.32	0.25	0.27	0.25	0.37	0.25	0.25	0.29	0.38	0.29	0.27	0.25	0.31	0.35	0.27	0.60	0.28	0.86	0.91	0.68
O2	0.21	0.22	0.31	0.33	0.23	0.27	0.28	0.37	0.33	0.25	0.30	0.23	0.21	0.29	0.22	0.34	0.37	0.26	0.53	0.39	0.80	0.70	0.60
O2'	0.34	0.31	0.45	0.46	0.31	0.41	0.33	0.49	0.36	0.32	0.33	0.32	0.31	0.34	0.32	0.49	0.53	0.39	0.57	0.41	0.85	0.71	0.64
O3'	0.41	0.32	0.49	0.50	0.35	0.47	0.34	0.53	0.34	0.36	0.31	0.34	0.35	0.36	0.37	0.53	0.56	0.45	0.58	0.37	0.82	0.72	0.63
O4'	0.21	0.20	0.31	0.35	0.20	0.28	0.23	0.39	0.25	0.22	0.22	0.23	0.20	0.25	0.20	0.35	0.42	0.27	0.56	0.32	0.87	0.77	0.65
O5'	0.43	0.40	0.47	0.50	0.42	0.47	0.45	0.55	0.46	0.46	0.42	0.41	0.41	0.48	0.43	0.49	0.53	0.47	0.67	0.52	0.92	0.89	0.74
OP1	0.58	0.51	0.62	0.64	0.53	0.62	0.53	0.68	0.52	0.56	0.49	0.53	0.54	0.56	0.55	0.66	0.70	0.61	0.76	0.55	0.99	0.97	0.82
OP2	0.65	0.59	0.64	0.67	0.67	0.68	0.74	0.77	0.75	0.75	0.66	0.55	0.61	0.80	0.68	0.63	0.65	0.70	0.92	0.85	1.10	1.18	0.99
P	0.49	0.43	0.51	0.53	0.46	0.52	0.49	0.59	0.49	0.51	0.44	0.44	0.45	0.52	0.48	0.54	0.56	0.52	0.72	0.55	0.95	0.96	0.79

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.20	0.02	0.31	0.32	0.19
C2	0.04	0.00	0.20	0.23	0.01	0.15	0.01	0.26	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.20	0.25	0.15	0.43	0.02	0.65	0.57	0.46
C2'	0.01	0.20	0.00	0.01	0.11	0.02	0.07	0.08	0.10	0.10	0.16	0.24	0.20	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.23	0.09	0.35	0.33	0.23
C3'	0.02	0.23	0.01	0.00	0.15	0.01	0.16	0.03	0.19	0.18	0.21	0.27	0.21	0.18	0.10	0.02	0.01	0.02	0.30	0.19	0.39	0.31	0.26
C4	0.02	0.01	0.11	0.15	0.00	0.08	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.13	0.08	0.42	0.01	0.55	0.55	0.41
C4'	0.01	0.15	0.02	0.01	0.08	0.00	0.09	0.01	0.10	0.13	0.12	0.18	0.14	0.12	0.06	0.12	0.03	0.00	0.02	0.11	0.22	0.30	0.10
C5	0.01	0.01	0.07	0.16	0.00	0.09	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.11	0.15	0.04	0.51	0.01	0.66	0.74	0.54
C5'	0.05	0.26	0.08	0.03	0.18	0.01	0.21	0.00	0.23	0.23	0.25	0.30	0.23	0.24	0.14	0.07	0.09	0.02	0.01	0.25	0.23	0.33	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.19	0.01	0.10	0.01	0.23	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.13	0.18	0.07	0.53	0.01	0.73	0.79	0.58
C8	0.01	0.02	0.10	0.18	0.01	0.13	0.01	0.23	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.14	0.18	0.09	0.54	0.02	0.58	0.72	0.54
N1	0.03	0.01	0.16	0.21	0.01	0.12	0.01	0.25	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.17	0.22	0.11	0.49	0.01	0.70	0.69	0.53
N2	0.05	0.01	0.24	0.27	0.02	0.18	0.02	0.30	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.26	0.32	0.18	0.43	0.02	0.68	0.56	0.48
N3	0.04	0.01	0.20	0.21	0.01	0.14	0.01	0.23	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.23	0.14	0.38	0.02	0.56	0.49	0.39
N7	0.01	0.01	0.07	0.18	0.01	0.12	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.14	0.18	0.05	0.59	0.02	0.70	0.87	0.63
N9	0.01	0.02	0.03	0.10	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.08	0.01	0.39	0.02	0.45	0.49	0.36
O2'	0.02	0.20	0.00	0.02	0.11	0.12	0.11	0.07	0.13	0.14	0.17	0.26	0.19	0.14	0.07	0.00	0.05	0.09	0.10	0.13	0.32	0.38	0.20
O3'	0.09	0.25	0.02	0.01	0.13	0.03	0.15	0.09	0.18	0.18	0.22	0.32	0.23	0.18	0.08	0.05	0.00	0.08	0.29	0.20	0.48	0.41	0.30
O4'	0.01	0.15	0.01	0.02	0.08	0.00	0.04	0.02	0.07	0.09	0.11	0.18	0.14	0.05	0.01	0.09	0.08	0.00	0.18	0.06	0.28	0.35	0.21
O5'	0.20	0.43	0.23	0.30	0.42	0.02	0.51	0.01	0.53	0.54	0.49	0.43	0.38	0.59	0.39	0.10	0.29	0.18	0.00	0.57	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.09	0.19	0.01	0.11	0.01	0.25	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.13	0.20	0.06	0.57	0.00	0.80	0.91	0.65
OP1	0.31	0.65	0.35	0.39	0.55	0.22	0.66	0.23	0.73	0.58	0.70	0.68	0.56	0.70	0.45	0.32	0.48	0.28	0.02	0.80	0.00	0.01	0.01
OP2	0.32	0.57	0.33	0.31	0.55	0.30	0.74	0.33	0.79	0.72	0.69	0.56	0.49	0.87	0.49	0.38	0.41	0.35	0.02	0.91	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.46	0.23	0.26	0.41	0.10	0.54	0.02	0.58	0.54	0.53	0.48	0.39	0.63	0.36	0.20	0.30	0.21	0.01	0.65	0.01	0.01	0.00