Doublet Group distance statistics: 15981

back

Distances from reference structure (by RMSD)

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	B	max_d=0.234 avg_d=0.051 std_dev=0.039
C4	A	max_d=0.389 avg_d=0.059 std_dev=0.053
C5	A	max_d=0.339 avg_d=0.081 std_dev=0.068
C6	B	max_d=0.418 avg_d=0.123 std_dev=0.080
C6	A	max_d=0.477 avg_d=0.123 std_dev=0.092
N9	A	max_d=0.780 avg_d=0.076 std_dev=0.107
N3	A	max_d=0.854 avg_d=0.110 std_dev=0.116
N1	A	max_d=1.011 avg_d=0.130 std_dev=0.141
C1'	A	max_d=1.064 avg_d=0.106 std_dev=0.149
N6	A	max_d=0.711 avg_d=0.208 std_dev=0.153
N6	B	max_d=0.894 avg_d=0.200 std_dev=0.153
C2	A	max_d=1.144 avg_d=0.128 std_dev=0.154
N7	A	max_d=0.973 avg_d=0.132 std_dev=0.157
C5	B	max_d=1.265 avg_d=0.123 std_dev=0.168
C8	A	max_d=1.162 avg_d=0.124 std_dev=0.168
O4'	A	max_d=1.326 avg_d=0.151 std_dev=0.184
C1'	B	max_d=1.460 avg_d=0.130 std_dev=0.190
N9	B	max_d=1.795 avg_d=0.117 std_dev=0.230
C2'	A	max_d=1.749 avg_d=0.194 std_dev=0.256
N3	B	max_d=2.054 avg_d=0.140 std_dev=0.263
O2'	B	max_d=1.836 avg_d=0.216 std_dev=0.278
C4'	A	max_d=1.992 avg_d=0.238 std_dev=0.291
N1	B	max_d=2.265 avg_d=0.163 std_dev=0.291
C2'	B	max_d=2.165 avg_d=0.163 std_dev=0.296
O2'	A	max_d=2.208 avg_d=0.235 std_dev=0.329
C3'	A	max_d=2.298 avg_d=0.265 std_dev=0.339
C5'	A	max_d=2.410 avg_d=0.325 std_dev=0.346
C2	B	max_d=3.097 avg_d=0.190 std_dev=0.396
O4'	B	max_d=3.483 avg_d=0.193 std_dev=0.450
N7	B	max_d=3.512 avg_d=0.231 std_dev=0.455
O3'	A	max_d=3.051 avg_d=0.375 std_dev=0.472
C8	B	max_d=3.738 avg_d=0.219 std_dev=0.481
C4'	B	max_d=4.258 avg_d=0.209 std_dev=0.553
C3'	B	max_d=4.194 avg_d=0.208 std_dev=0.554
O5'	A	max_d=3.472 avg_d=0.389 std_dev=0.568
OP1	A	max_d=4.884 avg_d=0.481 std_dev=0.687
P	A	max_d=4.075 avg_d=0.461 std_dev=0.701
O3'	B	max_d=5.499 avg_d=0.275 std_dev=0.735
C5'	B	max_d=6.680 avg_d=0.305 std_dev=0.874
O5'	B	max_d=7.964 avg_d=0.410 std_dev=1.071
P	B	max_d=8.913 avg_d=0.519 std_dev=1.209
OP2	B	max_d=8.603 avg_d=0.482 std_dev=1.216
OP2	A	max_d=6.476 avg_d=0.637 std_dev=1.269
OP1	B	max_d=9.689 avg_d=0.706 std_dev=1.311

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.15	0.07	0.25	0.16
C2	0.03	0.00	0.07	0.11	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.03	0.29	0.16	0.59	0.35
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.08	0.05	0.08	0.06	0.10	0.07	0.03	0.01	0.02	0.01	0.15	0.10	0.22	0.13
C3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.09	0.01	0.12	0.01	0.14	0.09	0.13	0.09	0.16	0.12	0.06	0.01	0.01	0.01	0.19	0.14	0.23	0.14
C4	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.10	0.02	0.32	0.16	0.60	0.36
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.07	0.07	0.06	0.03	0.09	0.08	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.12	0.01	0.07	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.14	0.02	0.41	0.22	0.80	0.48
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.11	0.11	0.09	0.05	0.14	0.13	0.06	0.05	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.14	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.17	0.02	0.41	0.24	0.85	0.50
C8	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.10	0.03	0.42	0.20	0.75	0.47
N1	0.03	0.00	0.08	0.13	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.16	0.03	0.36	0.21	0.75	0.44
N3	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.10	0.03	0.25	0.13	0.49	0.30
N6	0.02	0.01	0.10	0.16	0.01	0.09	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.20	0.03	0.46	0.27	0.98	0.57
N7	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.06	0.14	0.03	0.46	0.25	0.91	0.55
N9	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.30	0.14	0.53	0.33
O2'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.03	0.04	0.05	0.05	0.07	0.04	0.06	0.04	0.09	0.06	0.02	0.00	0.05	0.03	0.07	0.08	0.09	0.07
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.10	0.01	0.14	0.02	0.17	0.10	0.16	0.10	0.20	0.14	0.06	0.05	0.00	0.01	0.14	0.18	0.14	0.12
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.10	0.08	0.16	0.11
O5'	0.15	0.29	0.15	0.19	0.32	0.01	0.41	0.01	0.41	0.42	0.36	0.25	0.46	0.46	0.30	0.07	0.14	0.10	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.07	0.16	0.10	0.14	0.16	0.05	0.22	0.06	0.24	0.20	0.21	0.13	0.27	0.25	0.14	0.08	0.18	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.25	0.59	0.22	0.23	0.60	0.05	0.80	0.02	0.85	0.75	0.75	0.49	0.98	0.91	0.53	0.09	0.14	0.16	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.35	0.13	0.14	0.36	0.02	0.48	0.01	0.50	0.47	0.44	0.30	0.57	0.55	0.33	0.07	0.12	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.26	0.17	0.15	0.19	0.14	0.16	0.12	0.19	0.14	0.26	0.23	0.16	0.13	0.16	0.19	0.16	0.16	0.19	0.40	0.38	0.22
C2	0.12	0.30	0.13	0.11	0.12	0.14	0.12	0.20	0.14	0.19	0.29	0.21	0.15	0.20	0.13	0.17	0.11	0.17	0.27	0.44	0.49	0.36
C2'	0.27	0.40	0.25	0.20	0.29	0.22	0.25	0.20	0.28	0.22	0.38	0.36	0.24	0.22	0.26	0.28	0.19	0.25	0.25	0.50	0.30	0.28
C3'	0.29	0.43	0.27	0.21	0.30	0.23	0.25	0.22	0.28	0.23	0.40	0.39	0.23	0.22	0.27	0.31	0.21	0.26	0.27	0.53	0.26	0.30
C4	0.11	0.15	0.09	0.09	0.10	0.12	0.10	0.14	0.08	0.14	0.13	0.13	0.09	0.14	0.11	0.11	0.09	0.13	0.22	0.41	0.44	0.28
C4'	0.24	0.39	0.25	0.19	0.26	0.18	0.21	0.16	0.25	0.19	0.37	0.34	0.20	0.18	0.22	0.28	0.21	0.21	0.23	0.46	0.31	0.25
C5	0.11	0.18	0.10	0.10	0.10	0.12	0.10	0.16	0.09	0.15	0.16	0.15	0.10	0.16	0.11	0.13	0.09	0.14	0.23	0.43	0.46	0.31
C5'	0.23	0.38	0.24	0.19	0.24	0.17	0.19	0.16	0.23	0.18	0.35	0.32	0.18	0.17	0.21	0.28	0.22	0.20	0.23	0.46	0.31	0.25
C6	0.14	0.29	0.15	0.12	0.13	0.15	0.12	0.20	0.13	0.18	0.25	0.22	0.13	0.19	0.13	0.19	0.12	0.17	0.27	0.45	0.49	0.36
C8	0.12	0.15	0.11	0.11	0.12	0.11	0.11	0.12	0.11	0.12	0.14	0.14	0.11	0.13	0.12	0.12	0.12	0.12	0.20	0.41	0.41	0.25
N1	0.15	0.35	0.17	0.13	0.16	0.16	0.14	0.22	0.17	0.20	0.32	0.27	0.16	0.21	0.15	0.22	0.14	0.19	0.29	0.46	0.51	0.39
N3	0.11	0.17	0.09	0.09	0.09	0.12	0.10	0.15	0.08	0.15	0.16	0.13	0.10	0.16	0.11	0.11	0.08	0.14	0.23	0.41	0.45	0.30
N6	0.16	0.33	0.18	0.14	0.16	0.17	0.14	0.22	0.15	0.20	0.28	0.26	0.14	0.21	0.15	0.24	0.15	0.19	0.29	0.47	0.51	0.38
N7	0.11	0.15	0.10	0.10	0.10	0.12	0.10	0.14	0.09	0.13	0.13	0.13	0.10	0.14	0.11	0.12	0.10	0.13	0.21	0.42	0.43	0.28
N9	0.13	0.16	0.12	0.12	0.13	0.12	0.12	0.12	0.12	0.13	0.15	0.15	0.12	0.13	0.13	0.13	0.12	0.13	0.20	0.41	0.40	0.24
O2'	0.34	0.53	0.31	0.23	0.37	0.26	0.32	0.24	0.36	0.28	0.51	0.46	0.30	0.28	0.32	0.35	0.23	0.31	0.27	0.53	0.27	0.30
O3'	0.38	0.55	0.35	0.29	0.39	0.32	0.33	0.32	0.35	0.31	0.49	0.50	0.28	0.30	0.35	0.41	0.28	0.36	0.35	0.64	0.23	0.40
O4'	0.18	0.29	0.19	0.16	0.19	0.13	0.16	0.10	0.19	0.14	0.28	0.25	0.16	0.13	0.16	0.21	0.19	0.15	0.19	0.38	0.39	0.21
O5'	0.19	0.41	0.21	0.15	0.23	0.13	0.18	0.15	0.25	0.15	0.39	0.34	0.21	0.14	0.17	0.24	0.17	0.16	0.30	0.43	0.49	0.35
OP1	0.20	0.39	0.23	0.17	0.22	0.15	0.17	0.15	0.22	0.15	0.35	0.32	0.18	0.15	0.18	0.27	0.20	0.17	0.29	0.46	0.41	0.34
OP2	0.16	0.47	0.17	0.15	0.23	0.17	0.18	0.26	0.29	0.17	0.46	0.37	0.26	0.15	0.15	0.21	0.16	0.16	0.42	0.52	0.71	0.52
P	0.18	0.42	0.20	0.14	0.23	0.13	0.18	0.15	0.26	0.14	0.40	0.35	0.22	0.13	0.17	0.24	0.17	0.15	0.30	0.43	0.53	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.18	0.19	0.11
C2	0.05	0.00	0.10	0.10	0.02	0.07	0.02	0.08	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.12	0.12	0.05	0.14	0.30	0.30	0.17
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.03	0.08	0.10	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.16	0.19	0.10
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.06	0.08	0.09	0.06	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.12	0.18	0.17	0.11
C4	0.02	0.02	0.06	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.02	0.13	0.28	0.29	0.15
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.05	0.06	0.05	0.05	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.10	0.12	0.06
C5	0.02	0.02	0.04	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.06	0.02	0.16	0.32	0.33	0.18
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.09	0.09	0.08	0.07	0.10	0.10	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.07	0.14	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.02	0.17	0.35	0.34	0.19
C8	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.07	0.03	0.15	0.28	0.29	0.16
N1	0.04	0.01	0.08	0.08	0.02	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.10	0.03	0.16	0.33	0.33	0.18
N3	0.05	0.01	0.10	0.09	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.11	0.11	0.05	0.12	0.27	0.28	0.16
N6	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.05	0.02	0.10	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.07	0.08	0.03	0.19	0.38	0.37	0.21
N7	0.01	0.02	0.04	0.06	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.07	0.03	0.17	0.33	0.33	0.18
N9	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.11	0.24	0.25	0.14
O2'	0.01	0.12	0.01	0.02	0.06	0.04	0.05	0.04	0.07	0.02	0.10	0.11	0.07	0.03	0.02	0.00	0.05	0.03	0.03	0.15	0.17	0.09
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.07	0.02	0.06	0.02	0.08	0.07	0.10	0.11	0.08	0.07	0.03	0.05	0.00	0.02	0.12	0.24	0.18	0.13
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.07	0.18	0.15	0.13
O5'	0.05	0.14	0.08	0.12	0.13	0.01	0.16	0.01	0.17	0.15	0.16	0.12	0.19	0.17	0.11	0.03	0.12	0.07	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.18	0.30	0.16	0.18	0.28	0.10	0.32	0.07	0.35	0.28	0.33	0.27	0.38	0.33	0.24	0.15	0.24	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.30	0.19	0.17	0.29	0.12	0.33	0.14	0.34	0.29	0.33	0.28	0.37	0.33	0.25	0.17	0.18	0.15	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.17	0.10	0.11	0.15	0.06	0.18	0.02	0.19	0.16	0.18	0.16	0.21	0.18	0.14	0.09	0.13	0.13	0.00	0.01	0.01	0.00