Doublet Group distance statistics: 25967

back

Distances from reference structure (by RMSD)

7, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	B	0, 0.013, 0.048, 0.083, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.048 std_dev=0.035
C4	A	0, 0.005, 0.041, 0.076, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.041 std_dev=0.035
C5	B	0, 0.047, 0.088, 0.128, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.088 std_dev=0.041
C5	A	0, 0.017, 0.058, 0.100, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.058 std_dev=0.041
N1	B	0, 0.026, 0.072, 0.119, 0.169 max_d=0.169 avg_d=0.072 std_dev=0.046
C2	B	0, 0.016, 0.069, 0.122, 0.205 max_d=0.205 avg_d=0.069 std_dev=0.053
O2	B	0, 0.045, 0.099, 0.152, 0.228 max_d=0.228 avg_d=0.099 std_dev=0.054
C6	A	0, 0.056, 0.114, 0.173, 0.209 max_d=0.209 avg_d=0.114 std_dev=0.058
N3	A	0, 0.030, 0.095, 0.160, 0.256 max_d=0.256 avg_d=0.095 std_dev=0.065
C4	B	0, 0.047, 0.128, 0.210, 0.281 max_d=0.281 avg_d=0.128 std_dev=0.082
O4'	A	0, 0.035, 0.119, 0.203, 0.297 max_d=0.297 avg_d=0.119 std_dev=0.084
N7	A	0, 0.031, 0.117, 0.203, 0.301 max_d=0.301 avg_d=0.117 std_dev=0.086
O6	A	0, 0.075, 0.164, 0.254, 0.321 max_d=0.321 avg_d=0.164 std_dev=0.090
N9	A	0, -0.012, 0.081, 0.173, 0.321 max_d=0.321 avg_d=0.081 std_dev=0.093
N3	B	0, 0.016, 0.113, 0.210, 0.350 max_d=0.350 avg_d=0.113 std_dev=0.097
C8	A	0, 0.016, 0.131, 0.245, 0.426 max_d=0.426 avg_d=0.131 std_dev=0.114
C2	A	0, 0.017, 0.132, 0.248, 0.423 max_d=0.423 avg_d=0.132 std_dev=0.116
N1	A	0, 0.019, 0.137, 0.255, 0.410 max_d=0.410 avg_d=0.137 std_dev=0.118
N4	B	0, 0.067, 0.194, 0.320, 0.376 max_d=0.376 avg_d=0.194 std_dev=0.127
C1'	B	0, 0.027, 0.160, 0.293, 0.467 max_d=0.467 avg_d=0.160 std_dev=0.133
O2'	B	0, 0.092, 0.228, 0.365, 0.512 max_d=0.512 avg_d=0.228 std_dev=0.136
C2'	B	0, 0.035, 0.173, 0.311, 0.500 max_d=0.500 avg_d=0.173 std_dev=0.138
C1'	A	0, -0.010, 0.139, 0.287, 0.490 max_d=0.490 avg_d=0.139 std_dev=0.148
N2	A	0, 0.037, 0.216, 0.395, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.216 std_dev=0.179
C4'	A	0, 0.002, 0.222, 0.442, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.222 std_dev=0.220
C5'	A	0, -0.008, 0.281, 0.570, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.281 std_dev=0.289
O4'	B	0, 0.015, 0.306, 0.597, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.306 std_dev=0.291
C2'	A	0, -0.049, 0.252, 0.553, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.252 std_dev=0.301
C3'	B	0, -0.020, 0.293, 0.607, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.293 std_dev=0.314
O5'	A	0, 0.029, 0.355, 0.680, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.355 std_dev=0.325
C3'	A	0, -0.045, 0.289, 0.624, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.289 std_dev=0.335
O3'	B	0, -0.001, 0.375, 0.751, 1.205 max_d=1.205 avg_d=0.375 std_dev=0.376
C4'	B	0, -0.026, 0.350, 0.726, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.350 std_dev=0.376
O2'	A	0, -0.058, 0.334, 0.726, 1.246 max_d=1.246 avg_d=0.334 std_dev=0.392
O5'	B	0, 0.025, 0.482, 0.938, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.482 std_dev=0.457
O3'	A	0, -0.073, 0.402, 0.876, 1.396 max_d=1.396 avg_d=0.402 std_dev=0.474
C5'	B	0, 0.022, 0.528, 1.033, 1.583 max_d=1.583 avg_d=0.528 std_dev=0.506
P	A	0, -0.099, 0.568, 1.234, 1.744 max_d=1.744 avg_d=0.568 std_dev=0.667
P	B	0, -0.127, 0.780, 1.687, 2.729 max_d=2.729 avg_d=0.780 std_dev=0.907
OP2	A	0, -0.186, 0.947, 2.080, 2.811 max_d=2.811 avg_d=0.947 std_dev=1.133
OP2	B	0, -0.150, 1.036, 2.222, 3.178 max_d=3.178 avg_d=1.036 std_dev=1.186
OP1	B	0, -0.284, 1.500, 3.285, 5.133 max_d=5.133 avg_d=1.500 std_dev=1.784
OP1	A	0, -0.483, 1.418, 3.318, 4.404 max_d=4.404 avg_d=1.418 std_dev=1.900

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.02	0.20	0.23	0.07
C2	0.02	0.00	0.13	0.12	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.18	0.04	0.08	0.02	0.41	0.71	0.12
C2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.04	0.08	0.09	0.16	0.13	0.05	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.18	0.20	0.07
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.06	0.00	0.04	0.01	0.05	0.12	0.09	0.16	0.12	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.06	0.05	0.38	0.10	0.09
C4	0.01	0.00	0.06	0.06	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.08	0.02	0.08	0.01	0.46	0.62	0.12
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.07	0.03	0.06	0.03	0.06	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.04	0.20	0.20	0.04
C5	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.02	0.10	0.01	0.64	0.75	0.15
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.05	0.07	0.04	0.05	0.03	0.07	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.07	0.23	0.40	0.02
C6	0.01	0.02	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.08	0.03	0.11	0.00	0.67	0.85	0.16
C8	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.07	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.13	0.03	0.12	0.02	0.65	0.54	0.17
N1	0.01	0.01	0.09	0.09	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.14	0.04	0.10	0.02	0.55	0.82	0.15
N2	0.03	0.01	0.16	0.16	0.01	0.06	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.15	0.23	0.05	0.08	0.04	0.34	0.70	0.11
N3	0.02	0.00	0.13	0.12	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.11	0.16	0.04	0.07	0.02	0.35	0.60	0.11
N7	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.03	0.12	0.02	0.78	0.72	0.19
N9	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.07	0.02	0.42	0.47	0.11
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.04	0.06	0.07	0.15	0.11	0.04	0.02	0.00	0.04	0.03	0.02	0.03	0.28	0.10	0.08
O3'	0.02	0.18	0.03	0.01	0.08	0.02	0.06	0.03	0.08	0.13	0.14	0.23	0.16	0.11	0.05	0.04	0.00	0.02	0.09	0.08	0.71	0.12	0.13
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.05	0.04	0.03	0.02	0.03	0.02	0.00	0.08	0.03	0.23	0.12	0.07
O5'	0.05	0.08	0.03	0.06	0.08	0.01	0.10	0.01	0.11	0.12	0.10	0.08	0.07	0.12	0.07	0.02	0.09	0.08	0.00	0.12	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.03	0.08	0.03	0.12	0.00	0.77	0.93	0.18
OP1	0.20	0.41	0.18	0.38	0.46	0.20	0.64	0.23	0.67	0.65	0.55	0.34	0.35	0.78	0.42	0.28	0.71	0.23	0.01	0.77	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.71	0.20	0.10	0.62	0.20	0.75	0.40	0.85	0.54	0.82	0.70	0.60	0.72	0.47	0.10	0.12	0.12	0.02	0.93	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.12	0.07	0.09	0.12	0.04	0.15	0.02	0.16	0.17	0.15	0.11	0.11	0.19	0.11	0.08	0.13	0.07	0.01	0.18	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.16	0.05	0.04	0.12	0.18	0.15	0.21	0.17	0.18	0.12	0.09	0.16	0.04	0.10	0.30	0.16	0.44	0.39	0.17
C2	0.12	0.10	0.07	0.06	0.13	0.16	0.10	0.18	0.08	0.08	0.14	0.15	0.09	0.07	0.05	0.22	0.11	0.38	0.27	0.14
C2'	0.35	0.33	0.17	0.13	0.31	0.27	0.33	0.28	0.33	0.34	0.31	0.28	0.33	0.15	0.05	0.40	0.26	0.40	0.32	0.22
C3'	0.35	0.32	0.19	0.15	0.30	0.28	0.32	0.29	0.33	0.33	0.31	0.28	0.32	0.17	0.05	0.40	0.26	0.39	0.31	0.22
C4	0.16	0.07	0.05	0.04	0.07	0.17	0.08	0.20	0.09	0.10	0.06	0.08	0.07	0.04	0.08	0.26	0.14	0.44	0.31	0.16
C4'	0.26	0.22	0.10	0.08	0.18	0.21	0.20	0.23	0.21	0.23	0.19	0.15	0.22	0.09	0.06	0.32	0.19	0.43	0.40	0.18
C5	0.13	0.06	0.06	0.04	0.09	0.16	0.08	0.20	0.08	0.08	0.08	0.11	0.06	0.05	0.09	0.24	0.13	0.46	0.26	0.17
C5'	0.24	0.18	0.09	0.08	0.14	0.21	0.16	0.23	0.18	0.20	0.15	0.11	0.20	0.09	0.06	0.31	0.18	0.44	0.40	0.18
C6	0.10	0.09	0.08	0.05	0.13	0.16	0.11	0.20	0.09	0.08	0.13	0.15	0.08	0.08	0.08	0.21	0.12	0.45	0.21	0.17
C8	0.18	0.09	0.04	0.03	0.08	0.18	0.10	0.22	0.12	0.12	0.07	0.08	0.09	0.03	0.11	0.28	0.15	0.49	0.31	0.19
N1	0.10	0.12	0.09	0.06	0.16	0.15	0.13	0.18	0.11	0.09	0.16	0.18	0.11	0.08	0.07	0.20	0.11	0.41	0.22	0.15
N2	0.11	0.16	0.09	0.08	0.19	0.15	0.15	0.16	0.11	0.11	0.20	0.20	0.17	0.10	0.06	0.18	0.10	0.32	0.28	0.11
N3	0.17	0.06	0.05	0.05	0.07	0.17	0.08	0.19	0.09	0.10	0.07	0.09	0.07	0.05	0.07	0.25	0.13	0.39	0.32	0.14
N7	0.15	0.06	0.05	0.03	0.08	0.17	0.09	0.21	0.09	0.09	0.07	0.09	0.06	0.05	0.11	0.26	0.14	0.49	0.26	0.19
N9	0.19	0.10	0.04	0.04	0.08	0.18	0.10	0.21	0.12	0.13	0.07	0.06	0.11	0.03	0.10	0.28	0.15	0.45	0.34	0.17
O2'	0.38	0.40	0.18	0.13	0.39	0.27	0.40	0.28	0.39	0.39	0.40	0.38	0.38	0.16	0.08	0.41	0.27	0.37	0.36	0.22
O3'	0.42	0.42	0.27	0.22	0.41	0.33	0.42	0.33	0.42	0.42	0.41	0.39	0.40	0.25	0.11	0.45	0.31	0.37	0.29	0.24
O4'	0.18	0.11	0.03	0.03	0.07	0.16	0.09	0.19	0.11	0.13	0.07	0.04	0.12	0.03	0.11	0.26	0.14	0.46	0.43	0.16
O5'	0.25	0.19	0.12	0.11	0.14	0.22	0.16	0.25	0.19	0.20	0.15	0.12	0.20	0.11	0.08	0.32	0.20	0.42	0.35	0.19
O6	0.08	0.11	0.07	0.04	0.15	0.15	0.13	0.20	0.10	0.09	0.15	0.17	0.10	0.08	0.08	0.20	0.12	0.46	0.19	0.18
OP1	0.18	0.13	0.16	0.15	0.15	0.19	0.18	0.18	0.19	0.16	0.13	0.15	0.12	0.21	0.18	0.20	0.17	0.14	0.58	0.15
OP2	0.74	0.49	0.65	0.64	0.30	0.79	0.38	0.78	0.50	0.57	0.34	0.19	0.56	0.74	0.60	0.83	0.64	0.81	0.26	0.58
P	0.24	0.16	0.15	0.15	0.10	0.24	0.12	0.26	0.15	0.18	0.12	0.08	0.18	0.16	0.10	0.31	0.20	0.38	0.36	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.03	0.07	0.01	0.01	0.01	0.03	0.24	0.30	0.07
C2	0.03	0.00	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.05	0.05	0.07	0.30	0.49	0.11
C2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.08	0.02	0.03	0.03	0.09	0.01	0.02	0.01	0.06	0.18	0.29	0.08
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.06	0.01	0.12	0.02	0.14	0.05	0.04	0.06	0.07	0.01	0.01	0.01	0.08	0.28	0.20	0.10
C4	0.03	0.01	0.03	0.06	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.04	0.10	0.40	0.54	0.17
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.09	0.04	0.03	0.06	0.05	0.05	0.02	0.01	0.01	0.11	0.12	0.04
C5	0.03	0.01	0.07	0.12	0.01	0.08	0.00	0.13	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.15	0.04	0.12	0.43	0.45	0.20
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.10	0.00	0.13	0.00	0.12	0.07	0.07	0.11	0.07	0.05	0.02	0.01	0.01	0.05	0.14	0.02
C6	0.03	0.01	0.08	0.14	0.01	0.09	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.06	0.16	0.04	0.11	0.39	0.37	0.16
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.04	0.02	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.30	0.40	0.09
N3	0.03	0.00	0.03	0.04	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.04	0.04	0.09	0.34	0.55	0.14
N4	0.03	0.01	0.03	0.06	0.01	0.06	0.02	0.11	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.08	0.04	0.12	0.43	0.57	0.21
O2	0.07	0.01	0.09	0.07	0.01	0.05	0.02	0.07	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.10	0.11	0.10	0.07	0.26	0.48	0.09
O2'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.05	0.05	0.05	0.06	0.01	0.05	0.03	0.10	0.00	0.05	0.04	0.02	0.19	0.21	0.07
O3'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.07	0.02	0.15	0.02	0.16	0.04	0.04	0.08	0.11	0.05	0.00	0.01	0.11	0.45	0.12	0.12
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.04	0.10	0.04	0.01	0.00	0.07	0.31	0.22	0.09
O5'	0.03	0.07	0.06	0.08	0.10	0.01	0.12	0.01	0.11	0.05	0.09	0.12	0.07	0.02	0.11	0.07	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.24	0.30	0.18	0.28	0.40	0.11	0.43	0.05	0.39	0.30	0.34	0.43	0.26	0.19	0.45	0.31	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.30	0.49	0.29	0.20	0.54	0.12	0.45	0.14	0.37	0.40	0.55	0.57	0.48	0.21	0.12	0.22	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.11	0.08	0.10	0.17	0.04	0.20	0.02	0.16	0.09	0.14	0.21	0.09	0.07	0.12	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00