Doublet Group distance statistics: 34081

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	B	0, 0.005, 0.084, 0.164, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.084 std_dev=0.079
N1	A	0, 0.006, 0.093, 0.181, 0.189 max_d=0.189 avg_d=0.093 std_dev=0.088
C4	A	0, 0.007, 0.113, 0.219, 0.225 max_d=0.225 avg_d=0.113 std_dev=0.106
C5	B	0, 0.002, 0.118, 0.235, 0.267 max_d=0.267 avg_d=0.118 std_dev=0.117
N9	B	0, 0.004, 0.136, 0.269, 0.291 max_d=0.291 avg_d=0.136 std_dev=0.133
O4	A	0, 0.013, 0.150, 0.287, 0.291 max_d=0.291 avg_d=0.150 std_dev=0.137
C1'	A	0, 0.003, 0.141, 0.278, 0.302 max_d=0.302 avg_d=0.141 std_dev=0.137
N3	B	0, -0.001, 0.139, 0.279, 0.338 max_d=0.338 avg_d=0.139 std_dev=0.140
N3	A	0, 0.008, 0.182, 0.355, 0.381 max_d=0.381 avg_d=0.182 std_dev=0.174
C2	A	0, 0.004, 0.188, 0.373, 0.423 max_d=0.423 avg_d=0.188 std_dev=0.184
C6	A	0, 0.003, 0.193, 0.382, 0.410 max_d=0.410 avg_d=0.193 std_dev=0.190
N7	B	0, -0.042, 0.152, 0.345, 0.477 max_d=0.477 avg_d=0.152 std_dev=0.193
C6	B	0, 0.006, 0.207, 0.408, 0.409 max_d=0.409 avg_d=0.207 std_dev=0.201
C1'	B	0, 0.002, 0.207, 0.412, 0.446 max_d=0.446 avg_d=0.207 std_dev=0.205
C5	A	0, 0.002, 0.209, 0.415, 0.461 max_d=0.461 avg_d=0.209 std_dev=0.207
C8	B	0, -0.028, 0.182, 0.392, 0.521 max_d=0.521 avg_d=0.182 std_dev=0.210
C2	B	0, -0.005, 0.219, 0.443, 0.535 max_d=0.535 avg_d=0.219 std_dev=0.224
N1	B	0, 0.005, 0.263, 0.522, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.263 std_dev=0.258
N6	B	0, 0.006, 0.282, 0.558, 0.568 max_d=0.568 avg_d=0.282 std_dev=0.276
O2	A	0, -0.001, 0.326, 0.653, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.326 std_dev=0.327
C2'	B	0, -0.068, 0.433, 0.935, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.433 std_dev=0.502
C2'	A	0, -0.001, 0.529, 1.059, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.529 std_dev=0.530
O2'	A	0, -0.003, 0.571, 1.146, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.571 std_dev=0.575
O4'	B	0, 0.001, 0.620, 1.240, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.620 std_dev=0.620
O4'	A	0, -0.006, 0.635, 1.277, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.635 std_dev=0.642
C3'	B	0, -0.011, 0.709, 1.428, 1.637 max_d=1.637 avg_d=0.709 std_dev=0.720
C4'	B	0, -0.013, 0.757, 1.527, 1.747 max_d=1.747 avg_d=0.757 std_dev=0.770
O2'	B	0, -0.183, 0.653, 1.489, 2.057 max_d=2.057 avg_d=0.653 std_dev=0.836
C4'	A	0, -0.004, 0.863, 1.730, 2.028 max_d=2.028 avg_d=0.863 std_dev=0.867
C3'	A	0, -0.002, 0.892, 1.787, 2.083 max_d=2.083 avg_d=0.892 std_dev=0.895
O3'	B	0, 0.012, 1.010, 2.008, 2.098 max_d=2.098 avg_d=1.010 std_dev=0.998
OP2	B	0, 0.024, 1.113, 2.202, 2.319 max_d=2.319 avg_d=1.113 std_dev=1.089
O5'	A	0, 0.040, 1.224, 2.408, 2.443 max_d=2.443 avg_d=1.224 std_dev=1.184
O3'	A	0, 0.000, 1.298, 2.595, 3.007 max_d=3.007 avg_d=1.298 std_dev=1.297
C5'	B	0, -0.062, 1.328, 2.717, 3.294 max_d=3.294 avg_d=1.328 std_dev=1.389
C5'	A	0, -0.030, 1.474, 2.979, 3.536 max_d=3.536 avg_d=1.474 std_dev=1.504
P	A	0, 0.022, 1.570, 3.117, 3.439 max_d=3.439 avg_d=1.570 std_dev=1.547
P	B	0, 0.022, 1.576, 3.130, 3.260 max_d=3.260 avg_d=1.576 std_dev=1.554
O5'	B	0, -0.056, 1.510, 3.077, 3.688 max_d=3.688 avg_d=1.510 std_dev=1.566
OP1	A	0, 0.042, 1.616, 3.191, 3.202 max_d=3.202 avg_d=1.616 std_dev=1.575
OP1	B	0, 0.044, 2.037, 4.030, 4.208 max_d=4.208 avg_d=2.037 std_dev=1.993
OP2	A	0, 0.000, 2.755, 5.510, 6.149 max_d=6.149 avg_d=2.755 std_dev=2.755

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.07	0.24	0.28	0.10
C2	0.02	0.00	0.16	0.20	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.25	0.00	0.05	0.19	0.53	0.37	0.07
C2'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.02	0.02	0.09	0.01	0.13	0.02	0.12	0.28	0.00	0.06	0.02	0.01	0.22	0.40	0.30	0.08
C3'	0.02	0.20	0.01	0.00	0.10	0.00	0.02	0.01	0.07	0.07	0.18	0.28	0.03	0.02	0.10	0.01	0.30	0.41	0.32	0.16
C4	0.02	0.00	0.02	0.10	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.12	0.00	0.03	0.26	0.76	0.57	0.07
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.04	0.04	0.06	0.05	0.10	0.03	0.06	0.00	0.01	0.11	0.30	0.05
C5	0.02	0.00	0.09	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.04	0.00	0.10	0.26	0.74	0.63	0.09
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.04	0.03	0.10	0.05	0.05	0.01	0.01	0.25	0.36	0.01
C6	0.01	0.00	0.13	0.07	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.07	0.00	0.12	0.22	0.57	0.52	0.11
N1	0.01	0.00	0.02	0.07	0.00	0.04	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.00	0.02	0.17	0.45	0.38	0.09
N3	0.02	0.00	0.12	0.18	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.23	0.00	0.03	0.24	0.66	0.45	0.06
O2	0.02	0.00	0.28	0.28	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.17	0.36	0.00	0.11	0.16	0.46	0.31	0.06
O2'	0.01	0.08	0.00	0.03	0.03	0.10	0.08	0.10	0.09	0.01	0.05	0.17	0.00	0.10	0.04	0.07	0.02	0.18	0.34	0.06
O3'	0.05	0.25	0.06	0.02	0.12	0.03	0.04	0.05	0.07	0.09	0.23	0.36	0.10	0.00	0.13	0.03	0.27	0.43	0.34	0.24
O4	0.02	0.00	0.02	0.10	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.13	0.00	0.03	0.27	0.83	0.60	0.05
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.10	0.01	0.12	0.02	0.03	0.11	0.07	0.03	0.03	0.00	0.12	0.08	0.25	0.21
O5'	0.07	0.19	0.22	0.30	0.26	0.01	0.26	0.01	0.22	0.17	0.24	0.16	0.02	0.27	0.27	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.24	0.53	0.40	0.41	0.76	0.11	0.74	0.25	0.57	0.45	0.66	0.46	0.18	0.43	0.83	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.28	0.37	0.30	0.32	0.57	0.30	0.63	0.36	0.52	0.38	0.45	0.31	0.34	0.34	0.60	0.25	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.07	0.08	0.16	0.07	0.05	0.09	0.01	0.11	0.09	0.06	0.06	0.06	0.24	0.05	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.25	0.11	0.09	0.17	0.17	0.14	0.46	0.17	0.11	0.24	0.22	0.13	0.11	0.14	0.26	0.16	0.19	0.34	1.59	0.33	0.69
C2	0.10	0.21	0.08	0.16	0.10	0.14	0.06	0.41	0.08	0.06	0.17	0.17	0.05	0.07	0.07	0.12	0.22	0.19	0.37	1.61	0.32	0.68
C2'	0.07	0.23	0.13	0.27	0.07	0.20	0.05	0.46	0.08	0.16	0.22	0.16	0.05	0.16	0.07	0.09	0.31	0.08	0.45	1.87	0.02	0.91
C3'	0.04	0.26	0.11	0.24	0.09	0.20	0.04	0.47	0.13	0.11	0.25	0.19	0.10	0.10	0.03	0.11	0.29	0.07	0.42	1.80	0.06	0.87
C4	0.08	0.22	0.10	0.17	0.09	0.13	0.03	0.40	0.06	0.06	0.20	0.17	0.06	0.08	0.05	0.08	0.23	0.19	0.38	1.60	0.32	0.67
C4'	0.17	0.26	0.11	0.09	0.20	0.20	0.18	0.51	0.22	0.14	0.26	0.23	0.21	0.14	0.17	0.26	0.17	0.20	0.30	1.51	0.33	0.65
C5	0.11	0.25	0.07	0.13	0.14	0.15	0.10	0.43	0.15	0.06	0.25	0.21	0.10	0.06	0.09	0.17	0.19	0.18	0.36	1.60	0.31	0.69
C5'	0.18	0.23	0.11	0.09	0.20	0.22	0.21	0.53	0.23	0.18	0.24	0.21	0.24	0.19	0.19	0.24	0.18	0.21	0.27	1.39	0.39	0.59
C6	0.13	0.25	0.09	0.11	0.16	0.16	0.13	0.45	0.17	0.09	0.25	0.21	0.13	0.09	0.12	0.22	0.17	0.17	0.35	1.60	0.32	0.69
N1	0.13	0.24	0.08	0.12	0.14	0.16	0.10	0.44	0.13	0.08	0.22	0.20	0.10	0.08	0.11	0.20	0.18	0.18	0.35	1.61	0.32	0.69
N3	0.07	0.20	0.11	0.18	0.08	0.13	0.03	0.39	0.04	0.06	0.16	0.16	0.06	0.09	0.04	0.07	0.24	0.19	0.38	1.60	0.32	0.67
O2	0.09	0.19	0.09	0.17	0.09	0.13	0.04	0.40	0.06	0.06	0.15	0.15	0.05	0.07	0.06	0.11	0.23	0.19	0.38	1.61	0.32	0.68
O2'	0.04	0.22	0.12	0.24	0.05	0.17	0.04	0.44	0.07	0.14	0.20	0.15	0.03	0.14	0.05	0.14	0.27	0.06	0.44	1.86	0.06	0.89
O3'	0.10	0.25	0.18	0.33	0.05	0.24	0.05	0.47	0.09	0.23	0.25	0.16	0.06	0.21	0.11	0.11	0.38	0.10	0.52	1.95	0.15	1.01
O4	0.06	0.22	0.14	0.20	0.06	0.12	0.03	0.37	0.01	0.08	0.17	0.16	0.14	0.12	0.01	0.04	0.25	0.19	0.39	1.58	0.32	0.65
O4'	0.28	0.28	0.21	0.05	0.28	0.27	0.27	0.54	0.27	0.28	0.28	0.28	0.26	0.27	0.28	0.37	0.10	0.31	0.28	1.38	0.51	0.54
O5'	0.18	0.32	0.06	0.26	0.23	0.37	0.22	0.69	0.28	0.14	0.33	0.28	0.29	0.15	0.18	0.09	0.30	0.24	0.33	1.51	0.30	0.71
OP1	0.65	0.68	0.72	0.82	0.66	0.66	0.65	0.68	0.66	0.62	0.67	0.68	0.65	0.63	0.65	0.69	0.88	0.65	0.92	1.96	0.19	1.21
OP2	0.85	0.84	0.62	0.53	0.89	0.88	0.93	1.17	0.94	0.90	0.87	0.85	0.99	0.94	0.88	0.66	0.42	0.90	0.36	0.76	0.98	0.26
P	0.23	0.27	0.16	0.06	0.26	0.28	0.28	0.61	0.30	0.26	0.29	0.25	0.33	0.28	0.25	0.30	0.15	0.23	0.22	1.30	0.42	0.56

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.12	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.24	0.87	0.40	0.37
C2	0.03	0.00	0.35	0.28	0.00	0.13	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.30	0.37	0.30	0.39	1.14	0.44	0.44
C2'	0.00	0.35	0.00	0.00	0.20	0.03	0.11	0.07	0.18	0.16	0.29	0.35	0.14	0.08	0.03	0.00	0.04	0.01	0.16	0.73	0.70	0.45
C3'	0.01	0.28	0.00	0.00	0.18	0.00	0.16	0.02	0.21	0.05	0.26	0.25	0.19	0.06	0.07	0.03	0.01	0.02	0.05	0.77	0.57	0.44
C4	0.02	0.00	0.20	0.18	0.00	0.07	0.00	0.29	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.22	0.17	0.33	1.17	0.42	0.46
C4'	0.01	0.13	0.03	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.10	0.20	0.10	0.12	0.12	0.18	0.09	0.14	0.03	0.01	0.03	0.43	0.06	0.11
C5	0.01	0.00	0.11	0.16	0.00	0.11	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.19	0.10	0.31	1.34	0.40	0.53
C5'	0.12	0.32	0.07	0.02	0.29	0.01	0.38	0.00	0.38	0.46	0.35	0.28	0.43	0.47	0.29	0.10	0.10	0.04	0.01	0.35	0.28	0.01
C6	0.02	0.00	0.18	0.21	0.01	0.10	0.00	0.38	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.26	0.17	0.33	1.35	0.41	0.52
C8	0.01	0.00	0.16	0.05	0.00	0.20	0.00	0.46	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.04	0.14	0.26	1.34	0.39	0.56
N1	0.03	0.00	0.29	0.26	0.01	0.10	0.00	0.35	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.35	0.25	0.37	1.26	0.43	0.48
N3	0.03	0.00	0.35	0.25	0.00	0.12	0.00	0.28	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.29	0.32	0.29	0.37	1.07	0.43	0.42
N6	0.02	0.01	0.14	0.19	0.01	0.12	0.01	0.43	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.25	0.13	0.31	1.44	0.39	0.56
N7	0.00	0.00	0.08	0.06	0.00	0.18	0.00	0.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.05	0.05	0.28	1.45	0.38	0.60
N9	0.00	0.01	0.03	0.07	0.00	0.09	0.01	0.29	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.07	0.02	0.28	1.11	0.41	0.45
O2'	0.01	0.30	0.00	0.03	0.12	0.14	0.09	0.10	0.12	0.21	0.21	0.29	0.11	0.17	0.06	0.00	0.07	0.10	0.08	0.71	0.62	0.39
O3'	0.03	0.37	0.04	0.01	0.22	0.03	0.19	0.10	0.26	0.04	0.35	0.32	0.25	0.05	0.07	0.07	0.00	0.07	0.12	1.08	0.59	0.54
O4'	0.01	0.30	0.01	0.02	0.17	0.01	0.10	0.04	0.17	0.14	0.25	0.29	0.13	0.05	0.02	0.10	0.07	0.00	0.29	0.88	0.23	0.36
O5'	0.24	0.39	0.16	0.05	0.33	0.03	0.31	0.01	0.33	0.26	0.37	0.37	0.31	0.28	0.28	0.08	0.12	0.29	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.87	1.14	0.73	0.77	1.17	0.43	1.34	0.35	1.35	1.34	1.26	1.07	1.44	1.45	1.11	0.71	1.08	0.88	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.40	0.44	0.70	0.57	0.42	0.06	0.40	0.28	0.41	0.39	0.43	0.43	0.39	0.38	0.41	0.62	0.59	0.23	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.37	0.44	0.45	0.44	0.46	0.11	0.53	0.01	0.52	0.56	0.48	0.42	0.56	0.60	0.45	0.39	0.54	0.36	0.01	0.00	0.00	0.00