Doublet Group info: classifier/stacking/<>/UU
distance statistics members distance graph (clans) superimpose clusterDetails
N. type:
None
Program used:
None
Category:
classifier
SubCategory:
stacking
Desc:
<>/UU
Sub-clusters:
count: 17
show
Members:
count: 199
download members
3Q3Z:V25:A25
3U5D:12668:12687
3U5H:52669:52688
2Z2Q:R5:R6
3PU4:R26:R27
2BX2:R9:R10
3KNK:A623:A624
3U5F:61252:61253
3U5F:61554:61555
3PU4:R35:R36
2GIC:R33:R34
3U5B:21542:21543
3U5B:21240:21241
3KNI:A623:A624
3PU4:R33:R34
3U5H:53094:53108
3U5D:1710:1711
1YJW:02565:02588
3U5H:5716:5717
3CCE:02565:02588
3CPW:02565:02588
3CMA:02565:02588
1VQ9:02565:02588
1VQK:02565:02588
3CCV:02565:02588
3CCM:02565:02588
3CCR:02565:02588
1VQ8:02565:02588
1M90:A2565:A2588
3CXC:01680:01682
1FFK:01633:01635
3CCU:02565:02588
3G71:02565:02588
3CD6:02565:02588
1VQ7:01680:01682
1VQL:02565:02588
1VQ5:01680:01682
2OTJ:02565:02588
1VQO:02565:02588
1VQ6:01680:01682
3CXC:02565:02588
3G6E:02565:02588
1VQM:02565:02588
3CC7:02565:02588
1YIJ:02565:02588
1YI2:02565:02588
1K8A:A1680:A1682
1QVG:01680:01682
1VQP:02565:02588
1Q81:A1680:A1682
1S72:01680:01682
1VQ7:02565:02588
1JJ2:01680:01682
1VQN:02565:02588
3CC4:02565:02588
1VQ5:02565:02588
3CC2:01680:01682
1YHQ:02565:02588
1K9M:A1680:A1682
1NJI:A1680:A1682
1YTY:D6:D8
1Q86:A1680:A1682
1FFK:02517:02540
1KD1:A1680:A1682
1S72:02565:02588
1JJ2:02565:02588
3CC2:02565:02588
1YHQ:01680:01682
1Q82:A1680:A1682
1VQ4:01680:01682
1YIJ:01680:01682
1YI2:01680:01682
3CCM:01680:01682
2OTL:01680:01682
1VQM:01680:01682
1N8R:A1680:A1682
1ZH5:D6:D8
1VQO:01680:01682
1VQL:01680:01682
1YJ9:01680:01682
1M90:A1680:A1682
3CME:01680:01682
3G6E:01680:01682
3G71:01680:01682
3CD6:01680:01682
1VQP:01680:01682
1VQ8:01680:01682
2HOO:A45:A70
3CCE:01680:01682
3I56:01680:01682
1YIT:01680:01682
3CPW:01680:01682
1VQK:01680:01682
1VQN:01680:01682
3CCJ:01680:01682
3CCS:01680:01682
1YJN:01680:01682
3CCU:01680:01682
3CC7:01680:01682
3CC4:01680:01682
3CCQ:01680:01682
2GDI:X44:X69
2QEX:01680:01682
3U5D:10:4156
1VQ9:01680:01682
2OTJ:01680:01682
3CCV:01680:01682
3CMA:01680:01682
3CCL:01680:01682
1YJW:01680:01682
3CCR:01680:01682
3R2D:R6:S3
3U5H:52990:53004
3U5B:21502:21504
2PN4:A9:B8
2PN4:C9:D8
3U5D:12989:13003
3U5F:6705:6722
3U5F:61514:61516
3U5B:21329:21499
3G9C:P33:P58
3G9C:S33:S58
3U5H:51504:51505
3CME:01931:01942
1N8R:A1931:A1942
3G9C:R33:R58
3CCV:01931:01942
3CCL:01931:01942
3CCE:01931:01942
1YJW:01931:01942
3CCU:01931:01942
2OTL:01931:01942
1VQ9:01931:01942
1YJN:01931:01942
2OTJ:01931:01942
1YIT:01931:01942
3I56:01931:01942
3CMA:01931:01942
1YIJ:01931:01942
1NJI:A1931:A1942
3CC7:01931:01942
1K8A:A1931:A1942
1Q82:A1931:A1942
2QEX:01931:01942
3U5F:61341:61511
3CCS:01931:01942
1QVG:01931:01942
1YHQ:01931:01942
3CCR:01931:01942
1KD1:A1931:A1942
3L3C:Q33:Q58
2VOD:C4:C6
3CC4:01931:01942
3CPW:01931:01942
3CCQ:01931:01942
1VQ8:01931:01942
1VQN:01931:01942
3CD6:01931:01942
1VQK:01931:01942
3L3C:P33:P58
1Q86:A1931:A1942
1VQM:01931:01942
1YI2:01931:01942
3CC2:01931:01942
1M90:A1931:A1942
1VQL:01931:01942
3G9C:Q33:Q58
1S72:01931:01942
2VOD:D4:D6
2NZ4:R33:R58
3CXC:01931:01942
3CCM:01931:01942
2NZ4:S33:S58
1K9M:A1931:A1942
3G6E:01931:01942
1VQ4:01931:01942
1JJ2:01931:01942
1YJ9:01931:01942
1VQP:01931:01942
2NZ4:P33:P58
1VQO:01931:01942
3G71:01931:01942
2NZ4:Q33:Q58
1VQ7:01931:01942
1Q81:A1931:A1942
3CCJ:01931:01942
1VQ6:01931:01942
3G8T:R33:R58
1FFK:01884:01895
2ZJR:X1809:X1820
1VQ5:01931:01942
3R8S:A1937:A1948
3R8T:A1936:A1947
2VON:D4:D6
2VON:C4:C6
3G8T:Q33:Q58
3G8T:P33:P58
3G8T:S33:S58
2VOP:B1:B4
3Q3Z:V25:A25
3U5D:12668:12687
3U5H:52669:52688
2Z2Q:R5:R6
3PU4:R26:R27
2BX2:R9:R10
3KNK:A623:A624
3U5F:61252:61253
3U5F:61554:61555
3PU4:R35:R36
2GIC:R33:R34
3U5B:21542:21543
3U5B:21240:21241
3KNI:A623:A624
3PU4:R33:R34
3U5H:53094:53108
3U5D:1710:1711
1YJW:02565:02588
3U5H:5716:5717
3CCE:02565:02588
3CPW:02565:02588
3CMA:02565:02588
1VQ9:02565:02588
1VQK:02565:02588
3CCV:02565:02588
3CCM:02565:02588
3CCR:02565:02588
1VQ8:02565:02588
1M90:A2565:A2588
3CXC:01680:01682
1FFK:01633:01635
3CCU:02565:02588
3G71:02565:02588
3CD6:02565:02588
1VQ7:01680:01682
1VQL:02565:02588
1VQ5:01680:01682
2OTJ:02565:02588
1VQO:02565:02588
1VQ6:01680:01682
3CXC:02565:02588
3G6E:02565:02588
1VQM:02565:02588
3CC7:02565:02588
1YIJ:02565:02588
1YI2:02565:02588
1K8A:A1680:A1682
1QVG:01680:01682
1VQP:02565:02588
1Q81:A1680:A1682
1S72:01680:01682
1VQ7:02565:02588
1JJ2:01680:01682
1VQN:02565:02588
3CC4:02565:02588
1VQ5:02565:02588
3CC2:01680:01682
1YHQ:02565:02588
1K9M:A1680:A1682
1NJI:A1680:A1682
1YTY:D6:D8
1Q86:A1680:A1682
1FFK:02517:02540
1KD1:A1680:A1682
1S72:02565:02588
1JJ2:02565:02588
3CC2:02565:02588
1YHQ:01680:01682
1Q82:A1680:A1682
1VQ4:01680:01682
1YIJ:01680:01682
1YI2:01680:01682
3CCM:01680:01682
2OTL:01680:01682
1VQM:01680:01682
1N8R:A1680:A1682
1ZH5:D6:D8
1VQO:01680:01682
1VQL:01680:01682
1YJ9:01680:01682
1M90:A1680:A1682
3CME:01680:01682
3G6E:01680:01682
3G71:01680:01682
3CD6:01680:01682
1VQP:01680:01682
1VQ8:01680:01682
2HOO:A45:A70
3CCE:01680:01682
3I56:01680:01682
1YIT:01680:01682
3CPW:01680:01682
1VQK:01680:01682
1VQN:01680:01682
3CCJ:01680:01682
3CCS:01680:01682
1YJN:01680:01682
3CCU:01680:01682
3CC7:01680:01682
3CC4:01680:01682
3CCQ:01680:01682
2GDI:X44:X69
2QEX:01680:01682
3U5D:10:4156
1VQ9:01680:01682
2OTJ:01680:01682
3CCV:01680:01682
3CMA:01680:01682
3CCL:01680:01682
1YJW:01680:01682
3CCR:01680:01682
3R2D:R6:S3
3U5H:52990:53004
3U5B:21502:21504
2PN4:A9:B8
2PN4:C9:D8
3U5D:12989:13003
3U5F:6705:6722
3U5F:61514:61516
3U5B:21329:21499
3G9C:P33:P58
3G9C:S33:S58
3U5H:51504:51505
3CME:01931:01942
1N8R:A1931:A1942
3G9C:R33:R58
3CCV:01931:01942
3CCL:01931:01942
3CCE:01931:01942
1YJW:01931:01942
3CCU:01931:01942
2OTL:01931:01942
1VQ9:01931:01942
1YJN:01931:01942
2OTJ:01931:01942
1YIT:01931:01942
3I56:01931:01942
3CMA:01931:01942
1YIJ:01931:01942
1NJI:A1931:A1942
3CC7:01931:01942
1K8A:A1931:A1942
1Q82:A1931:A1942
2QEX:01931:01942
3U5F:61341:61511
3CCS:01931:01942
1QVG:01931:01942
1YHQ:01931:01942
3CCR:01931:01942
1KD1:A1931:A1942
3L3C:Q33:Q58
2VOD:C4:C6
3CC4:01931:01942
3CPW:01931:01942
3CCQ:01931:01942
1VQ8:01931:01942
1VQN:01931:01942
3CD6:01931:01942
1VQK:01931:01942
3L3C:P33:P58
1Q86:A1931:A1942
1VQM:01931:01942
1YI2:01931:01942
3CC2:01931:01942
1M90:A1931:A1942
1VQL:01931:01942
3G9C:Q33:Q58
1S72:01931:01942
2VOD:D4:D6
2NZ4:R33:R58
3CXC:01931:01942
3CCM:01931:01942
2NZ4:S33:S58
1K9M:A1931:A1942
3G6E:01931:01942
1VQ4:01931:01942
1JJ2:01931:01942
1YJ9:01931:01942
1VQP:01931:01942
2NZ4:P33:P58
1VQO:01931:01942
3G71:01931:01942
2NZ4:Q33:Q58
1VQ7:01931:01942
1Q81:A1931:A1942
3CCJ:01931:01942
1VQ6:01931:01942
3G8T:R33:R58
1FFK:01884:01895
2ZJR:X1809:X1820
1VQ5:01931:01942
3R8S:A1937:A1948
3R8T:A1936:A1947
2VON:D4:D6
2VON:C4:C6
3G8T:Q33:Q58
3G8T:P33:P58
3G8T:S33:S58
2VOP:B1:B4
Closest classifer groups:
show all
show selected
Group | Members | RMSD | |
---|---|---|---|
stacking/<< | 8910 | 0.245 | |
stacking/>> | 4035 | 0.428 | |
stacking/<> | 984 | 0.553 | |
base-phosphate/H_9BPh | 376 | 0.821 | |
previously-uncategorized/neighbours-0024 | 212 | 1.142 | |
base-phosphate/H_7BPh | 346 | 1.217 | |
base-phosphate/H_8BPh | 1074 | 1.265 | |
base-ribose/W_5BR | 216 | 1.491 | |
previously-uncategorized/neighbours-0021 | 217 | 1.691 | |
base-ribose/H_0BR | 623 | 1.735 |
Extra
PDB:download
Reference image (generated by PyMOL):
All members (generated by PyMOL):