Doublet Group distance statistics: 43086

back

Distances from reference structure (by RMSD)

7, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.020, 0.057, 0.093, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.057 std_dev=0.036
C2	A	0, 0.029, 0.078, 0.126, 0.177 max_d=0.177 avg_d=0.078 std_dev=0.049
C2	B	0, 0.017, 0.068, 0.118, 0.211 max_d=0.211 avg_d=0.068 std_dev=0.051
C6	A	0, 0.018, 0.070, 0.121, 0.150 max_d=0.150 avg_d=0.070 std_dev=0.051
C5	A	0, 0.019, 0.071, 0.122, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.071 std_dev=0.052
N1	B	0, 0.006, 0.058, 0.110, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.058 std_dev=0.052
C4	A	0, 0.018, 0.079, 0.139, 0.186 max_d=0.186 avg_d=0.079 std_dev=0.060
N3	B	0, 0.028, 0.090, 0.152, 0.187 max_d=0.187 avg_d=0.090 std_dev=0.062
N3	A	0, 0.023, 0.087, 0.152, 0.208 max_d=0.208 avg_d=0.087 std_dev=0.065
O2	A	0, 0.056, 0.137, 0.218, 0.264 max_d=0.264 avg_d=0.137 std_dev=0.081
C6	B	0, 0.016, 0.098, 0.181, 0.242 max_d=0.242 avg_d=0.098 std_dev=0.082
C4	B	0, 0.025, 0.110, 0.194, 0.266 max_d=0.266 avg_d=0.110 std_dev=0.085
O4	A	0, 0.030, 0.119, 0.208, 0.260 max_d=0.260 avg_d=0.119 std_dev=0.089
C1'	A	0, 0.017, 0.110, 0.204, 0.343 max_d=0.343 avg_d=0.110 std_dev=0.093
C5	B	0, 0.021, 0.115, 0.209, 0.285 max_d=0.285 avg_d=0.115 std_dev=0.094
O2	B	0, 0.023, 0.143, 0.263, 0.434 max_d=0.434 avg_d=0.143 std_dev=0.120
C1'	B	0, 0.003, 0.126, 0.248, 0.351 max_d=0.351 avg_d=0.126 std_dev=0.122
O4	B	0, 0.101, 0.247, 0.394, 0.447 max_d=0.447 avg_d=0.247 std_dev=0.147
O4'	A	0, 0.025, 0.176, 0.326, 0.511 max_d=0.511 avg_d=0.176 std_dev=0.151
C2'	A	0, -0.002, 0.191, 0.385, 0.673 max_d=0.673 avg_d=0.191 std_dev=0.194
C3'	A	0, 0.010, 0.210, 0.409, 0.554 max_d=0.554 avg_d=0.210 std_dev=0.199
C4'	A	0, 0.018, 0.228, 0.439, 0.624 max_d=0.624 avg_d=0.228 std_dev=0.210
O3'	A	0, 0.067, 0.290, 0.513, 0.647 max_d=0.647 avg_d=0.290 std_dev=0.223
O4'	B	0, -0.017, 0.207, 0.430, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.207 std_dev=0.224
O5'	B	0, 0.016, 0.258, 0.500, 0.880 max_d=0.880 avg_d=0.258 std_dev=0.242
C5'	A	0, -0.022, 0.272, 0.566, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.272 std_dev=0.294
O2'	A	0, 0.020, 0.319, 0.618, 1.096 max_d=1.096 avg_d=0.319 std_dev=0.299
P	B	0, -0.065, 0.241, 0.546, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.241 std_dev=0.306
C5'	B	0, -0.045, 0.304, 0.654, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.304 std_dev=0.349
C2'	B	0, -0.092, 0.286, 0.664, 1.079 max_d=1.079 avg_d=0.286 std_dev=0.378
C4'	B	0, -0.097, 0.326, 0.749, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.326 std_dev=0.423
O2'	B	0, -0.111, 0.442, 0.995, 1.501 max_d=1.501 avg_d=0.442 std_dev=0.553
O5'	A	0, -0.223, 0.352, 0.927, 2.225 max_d=2.225 avg_d=0.352 std_dev=0.575
C3'	B	0, -0.183, 0.403, 0.988, 1.634 max_d=1.634 avg_d=0.403 std_dev=0.586
OP2	B	0, -0.109, 0.521, 1.151, 1.926 max_d=1.926 avg_d=0.521 std_dev=0.630
OP1	B	0, -0.130, 0.508, 1.146, 2.103 max_d=2.103 avg_d=0.508 std_dev=0.638
P	A	0, -0.366, 0.399, 1.164, 2.906 max_d=2.906 avg_d=0.399 std_dev=0.765
OP1	A	0, -0.219, 0.890, 1.999, 3.323 max_d=3.323 avg_d=0.890 std_dev=1.109
O3'	B	0, -0.386, 0.737, 1.861, 2.957 max_d=2.957 avg_d=0.737 std_dev=1.124
OP2	A	0, -0.214, 0.983, 2.180, 2.761 max_d=2.761 avg_d=0.983 std_dev=1.197

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.01	0.30	0.38	0.12	0.22
C2	0.01	0.00	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.01	0.04	0.42	0.70	0.30	0.36
C2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.00	0.04	0.03	0.05	0.01	0.04	0.09	0.00	0.03	0.04	0.01	0.24	0.29	0.29	0.14
C3'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.02	0.00	0.05	0.09	0.25	0.10
C4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.08	0.00	0.03	0.52	1.00	0.49	0.51
C4'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.03	0.00	0.01	0.19	0.25	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.06	0.01	0.03	0.54	1.02	0.52	0.54
C5'	0.01	0.03	0.03	0.03	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.04	0.02	0.02	0.05	0.07	0.01	0.01	0.37	0.36	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.05	0.01	0.04	0.52	0.85	0.40	0.48
N1	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.02	0.43	0.66	0.27	0.37
N3	0.01	0.00	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.01	0.04	0.47	0.86	0.40	0.43
O2	0.02	0.01	0.09	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.11	0.01	0.06	0.36	0.58	0.24	0.29
O2'	0.01	0.06	0.00	0.03	0.09	0.03	0.11	0.02	0.10	0.04	0.07	0.12	0.00	0.09	0.10	0.02	0.21	0.33	0.39	0.14
O3'	0.08	0.10	0.03	0.01	0.08	0.02	0.06	0.05	0.05	0.07	0.10	0.11	0.09	0.00	0.09	0.05	0.12	0.19	0.26	0.16
O4	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.09	0.00	0.03	0.53	1.08	0.53	0.54
O4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.06	0.02	0.05	0.03	0.00	0.24	0.28	0.20	0.21
O5'	0.30	0.42	0.24	0.05	0.52	0.01	0.54	0.01	0.52	0.43	0.47	0.36	0.21	0.12	0.53	0.24	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.38	0.70	0.29	0.09	1.00	0.19	1.02	0.37	0.85	0.66	0.86	0.58	0.33	0.19	1.08	0.28	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.30	0.29	0.25	0.49	0.25	0.52	0.36	0.40	0.27	0.40	0.24	0.39	0.26	0.53	0.20	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.22	0.36	0.14	0.10	0.51	0.02	0.54	0.01	0.48	0.37	0.43	0.29	0.14	0.16	0.54	0.21	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.10	0.34	0.11	0.08	0.18	0.06	0.22	0.13	0.14	0.07	0.11	0.38	0.15	0.13	0.23	0.11	0.19	0.27	0.04
C2	0.15	0.07	0.21	0.25	0.08	0.15	0.08	0.18	0.12	0.10	0.08	0.07	0.35	0.22	0.13	0.20	0.17	0.14	0.44	0.09
C2'	0.30	0.20	0.44	0.14	0.17	0.24	0.18	0.29	0.23	0.24	0.17	0.20	0.49	0.26	0.19	0.29	0.13	0.08	0.38	0.15
C3'	0.28	0.16	0.47	0.03	0.11	0.22	0.11	0.27	0.16	0.19	0.11	0.18	0.42	0.18	0.15	0.25	0.02	0.10	0.11	0.02
C4	0.15	0.08	0.22	0.22	0.09	0.16	0.08	0.20	0.11	0.10	0.10	0.08	0.35	0.21	0.14	0.21	0.15	0.13	0.44	0.08
C4'	0.27	0.19	0.45	0.12	0.15	0.28	0.15	0.29	0.17	0.21	0.16	0.22	0.33	0.08	0.17	0.27	0.14	0.38	0.10	0.17
C5	0.17	0.06	0.29	0.14	0.07	0.19	0.06	0.24	0.11	0.10	0.07	0.05	0.37	0.17	0.13	0.23	0.10	0.15	0.37	0.06
C5'	0.27	0.19	0.47	0.17	0.12	0.32	0.12	0.33	0.17	0.21	0.14	0.22	0.33	0.09	0.14	0.28	0.13	0.35	0.14	0.15
C6	0.19	0.06	0.33	0.11	0.06	0.20	0.05	0.25	0.12	0.12	0.05	0.06	0.38	0.14	0.13	0.24	0.09	0.16	0.33	0.04
N1	0.18	0.06	0.29	0.16	0.06	0.17	0.05	0.21	0.12	0.11	0.05	0.06	0.37	0.17	0.12	0.22	0.12	0.16	0.36	0.06
N3	0.14	0.09	0.19	0.27	0.10	0.15	0.09	0.18	0.12	0.11	0.11	0.10	0.34	0.23	0.14	0.20	0.17	0.13	0.47	0.10
O2	0.14	0.08	0.17	0.31	0.08	0.15	0.09	0.16	0.12	0.11	0.09	0.08	0.34	0.25	0.13	0.19	0.20	0.15	0.47	0.11
O2'	0.40	0.33	0.49	0.31	0.30	0.32	0.33	0.36	0.37	0.36	0.30	0.33	0.60	0.43	0.29	0.37	0.29	0.23	0.58	0.30
O3'	0.27	0.15	0.47	0.04	0.15	0.22	0.14	0.28	0.15	0.18	0.13	0.18	0.42	0.17	0.19	0.24	0.02	0.02	0.02	0.01
O4	0.14	0.10	0.20	0.25	0.11	0.16	0.09	0.20	0.12	0.10	0.12	0.11	0.34	0.22	0.15	0.21	0.15	0.12	0.45	0.09
O4'	0.22	0.16	0.38	0.08	0.14	0.25	0.13	0.25	0.15	0.17	0.14	0.17	0.32	0.09	0.17	0.25	0.15	0.36	0.11	0.13
O5'	0.25	0.18	0.45	0.14	0.23	0.33	0.20	0.38	0.17	0.19	0.20	0.19	0.39	0.22	0.30	0.28	0.13	0.17	0.22	0.16
OP1	0.14	0.18	0.33	0.31	0.27	0.26	0.24	0.30	0.17	0.15	0.23	0.17	0.30	0.56	0.34	0.15	0.33	0.49	0.38	0.36
OP2	0.42	0.20	0.53	0.32	0.13	0.56	0.10	0.59	0.20	0.27	0.11	0.24	0.50	0.35	0.23	0.52	0.31	0.33	0.58	0.37
P	0.25	0.15	0.45	0.19	0.17	0.35	0.14	0.39	0.14	0.17	0.15	0.16	0.39	0.28	0.23	0.28	0.18	0.22	0.34	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.04	0.03	0.31	0.01	0.01	0.13	0.10	0.31	0.19
C2	0.02	0.00	0.12	0.22	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.22	0.16	0.01	0.04	0.09	0.13	0.36	0.12
C2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.04	0.01	0.06	0.20	0.09	0.02	0.10	0.19	0.01	0.03	0.05	0.02	0.42	0.38	0.55	0.47
C3'	0.01	0.22	0.01	0.00	0.37	0.01	0.36	0.02	0.30	0.21	0.31	0.13	0.02	0.01	0.40	0.02	0.05	0.10	0.16	0.04
C4	0.01	0.01	0.04	0.37	0.00	0.13	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.30	0.15	0.00	0.03	0.22	0.21	0.42	0.13
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.13	0.00	0.14	0.01	0.12	0.07	0.09	0.03	0.29	0.01	0.13	0.01	0.02	0.06	0.15	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.36	0.00	0.14	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.28	0.20	0.00	0.04	0.24	0.22	0.41	0.13
C5'	0.07	0.05	0.20	0.02	0.11	0.01	0.12	0.00	0.09	0.05	0.08	0.05	0.09	0.23	0.12	0.01	0.01	0.06	0.21	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.30	0.01	0.12	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.23	0.12	0.01	0.05	0.17	0.18	0.36	0.12
N1	0.01	0.01	0.02	0.21	0.01	0.07	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.09	0.01	0.01	0.08	0.13	0.34	0.13
N3	0.01	0.00	0.10	0.31	0.01	0.09	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.27	0.07	0.01	0.03	0.15	0.16	0.39	0.11
O2	0.04	0.01	0.19	0.13	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.16	0.33	0.02	0.07	0.08	0.11	0.36	0.15
O2'	0.03	0.22	0.01	0.02	0.30	0.29	0.28	0.09	0.23	0.18	0.27	0.16	0.00	0.07	0.32	0.20	0.31	0.22	0.58	0.39
O3'	0.31	0.16	0.03	0.01	0.15	0.01	0.20	0.23	0.12	0.09	0.07	0.33	0.07	0.00	0.19	0.21	0.24	0.30	0.59	0.34
O4	0.01	0.01	0.05	0.40	0.00	0.13	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.32	0.19	0.00	0.03	0.25	0.23	0.46	0.16
O4'	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.07	0.20	0.21	0.03	0.00	0.08	0.18	0.09	0.04
O5'	0.13	0.09	0.42	0.05	0.22	0.02	0.24	0.01	0.17	0.08	0.15	0.08	0.31	0.24	0.25	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.10	0.13	0.38	0.10	0.21	0.06	0.22	0.06	0.18	0.13	0.16	0.11	0.22	0.30	0.23	0.18	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.31	0.36	0.55	0.16	0.42	0.15	0.41	0.21	0.36	0.34	0.39	0.36	0.58	0.59	0.46	0.09	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.19	0.12	0.47	0.04	0.13	0.02	0.13	0.02	0.12	0.13	0.11	0.15	0.39	0.34	0.16	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00