Doublet Group distance statistics: 43505

back

Distances from reference structure (by RMSD)

17, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.014, 0.039, 0.064, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.039 std_dev=0.025
C2	B	0, 0.026, 0.056, 0.087, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.056 std_dev=0.030
N3	B	0, 0.025, 0.060, 0.095, 0.156 max_d=0.156 avg_d=0.060 std_dev=0.035
C6	B	0, 0.025, 0.061, 0.097, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.061 std_dev=0.036
N1	B	0, 0.020, 0.056, 0.092, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.056 std_dev=0.036
C1'	A	0, 0.040, 0.077, 0.114, 0.165 max_d=0.165 avg_d=0.077 std_dev=0.037
C6	A	0, 0.027, 0.069, 0.111, 0.177 max_d=0.177 avg_d=0.069 std_dev=0.042
C5	A	0, 0.026, 0.072, 0.118, 0.173 max_d=0.173 avg_d=0.072 std_dev=0.046
C4	A	0, 0.027, 0.075, 0.122, 0.191 max_d=0.191 avg_d=0.075 std_dev=0.048
C2	A	0, 0.034, 0.081, 0.129, 0.211 max_d=0.211 avg_d=0.081 std_dev=0.048
C4	B	0, 0.020, 0.071, 0.123, 0.241 max_d=0.241 avg_d=0.071 std_dev=0.051
C2'	A	0, 0.059, 0.111, 0.164, 0.219 max_d=0.219 avg_d=0.111 std_dev=0.053
N3	A	0, 0.041, 0.098, 0.155, 0.244 max_d=0.244 avg_d=0.098 std_dev=0.057
C5	B	0, 0.023, 0.080, 0.137, 0.255 max_d=0.255 avg_d=0.080 std_dev=0.057
O2	B	0, 0.038, 0.099, 0.161, 0.280 max_d=0.280 avg_d=0.099 std_dev=0.062
C1'	B	0, 0.028, 0.093, 0.158, 0.288 max_d=0.288 avg_d=0.093 std_dev=0.065
C3'	A	0, 0.059, 0.127, 0.196, 0.301 max_d=0.301 avg_d=0.127 std_dev=0.068
O4'	B	0, 0.050, 0.120, 0.191, 0.296 max_d=0.296 avg_d=0.120 std_dev=0.071
O3'	A	0, 0.056, 0.131, 0.206, 0.304 max_d=0.304 avg_d=0.131 std_dev=0.075
C3'	B	0, 0.075, 0.150, 0.225, 0.310 max_d=0.310 avg_d=0.150 std_dev=0.075
C4'	B	0, 0.064, 0.141, 0.217, 0.319 max_d=0.319 avg_d=0.141 std_dev=0.076
C4'	A	0, 0.057, 0.136, 0.215, 0.367 max_d=0.367 avg_d=0.136 std_dev=0.079
C5'	B	0, 0.106, 0.192, 0.277, 0.341 max_d=0.341 avg_d=0.192 std_dev=0.086
O4	A	0, 0.028, 0.114, 0.200, 0.331 max_d=0.331 avg_d=0.114 std_dev=0.086
O2	A	0, 0.042, 0.132, 0.223, 0.368 max_d=0.368 avg_d=0.132 std_dev=0.091
C2'	B	0, 0.026, 0.118, 0.210, 0.407 max_d=0.407 avg_d=0.118 std_dev=0.092
N4	B	0, 0.027, 0.120, 0.213, 0.422 max_d=0.422 avg_d=0.120 std_dev=0.093
O4'	A	0, 0.018, 0.116, 0.214, 0.408 max_d=0.408 avg_d=0.116 std_dev=0.098
P	A	0, 0.086, 0.191, 0.295, 0.375 max_d=0.375 avg_d=0.191 std_dev=0.105
O3'	B	0, 0.096, 0.207, 0.318, 0.454 max_d=0.454 avg_d=0.207 std_dev=0.111
OP2	B	0, 0.094, 0.214, 0.333, 0.455 max_d=0.455 avg_d=0.214 std_dev=0.120
P	B	0, 0.071, 0.194, 0.317, 0.507 max_d=0.507 avg_d=0.194 std_dev=0.123
O2'	A	0, 0.066, 0.190, 0.314, 0.555 max_d=0.555 avg_d=0.190 std_dev=0.124
O2'	B	0, 0.061, 0.185, 0.309, 0.545 max_d=0.545 avg_d=0.185 std_dev=0.124
O5'	B	0, 0.068, 0.196, 0.324, 0.627 max_d=0.627 avg_d=0.196 std_dev=0.128
OP1	B	0, 0.093, 0.234, 0.375, 0.476 max_d=0.476 avg_d=0.234 std_dev=0.141
OP2	A	0, 0.118, 0.289, 0.461, 0.611 max_d=0.611 avg_d=0.289 std_dev=0.172
OP1	A	0, 0.098, 0.296, 0.493, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.296 std_dev=0.198
C5'	A	0, -0.002, 0.244, 0.489, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.244 std_dev=0.246
O5'	A	0, -0.019, 0.281, 0.581, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.281 std_dev=0.300

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.25	0.16	0.26	0.08
C2	0.01	0.00	0.05	0.02	0.01	0.05	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.05	0.01	0.03	0.27	0.15	0.26	0.08
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.02	0.04	0.11	0.05	0.01	0.04	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01	0.20	0.08	0.34	0.12
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.02	0.06	0.02	0.02	0.06	0.02	0.01	0.04	0.02	0.06	0.08	0.30	0.13
C4	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.10	0.01	0.31	0.02	0.01	0.01	0.02	0.06	0.06	0.01	0.02	0.25	0.16	0.19	0.07
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.10	0.00	0.12	0.00	0.10	0.06	0.07	0.04	0.01	0.02	0.11	0.01	0.01	0.12	0.20	0.07
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.12	0.00	0.33	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.07	0.01	0.03	0.24	0.18	0.17	0.07
C5'	0.11	0.22	0.11	0.02	0.31	0.00	0.33	0.00	0.29	0.22	0.27	0.18	0.10	0.04	0.33	0.03	0.02	0.24	0.07	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.06	0.02	0.10	0.01	0.29	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.07	0.02	0.04	0.26	0.18	0.18	0.06
N1	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.22	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.05	0.01	0.01	0.27	0.17	0.23	0.07
N3	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.07	0.01	0.27	0.01	0.01	0.00	0.02	0.09	0.05	0.01	0.03	0.28	0.16	0.23	0.08
O2	0.03	0.01	0.08	0.06	0.02	0.04	0.02	0.18	0.02	0.02	0.02	0.00	0.15	0.07	0.02	0.06	0.27	0.14	0.29	0.09
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.06	0.01	0.06	0.10	0.06	0.04	0.09	0.15	0.00	0.05	0.07	0.01	0.18	0.12	0.41	0.16
O3'	0.06	0.05	0.02	0.01	0.06	0.02	0.07	0.04	0.07	0.05	0.05	0.07	0.05	0.00	0.06	0.10	0.05	0.08	0.29	0.12
O4	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.11	0.01	0.33	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.06	0.00	0.03	0.25	0.16	0.17	0.08
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.01	0.03	0.06	0.01	0.10	0.03	0.00	0.23	0.27	0.17	0.10
O5'	0.25	0.27	0.20	0.06	0.25	0.01	0.24	0.02	0.26	0.27	0.28	0.27	0.18	0.05	0.25	0.23	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.16	0.15	0.08	0.08	0.16	0.12	0.18	0.24	0.18	0.17	0.16	0.14	0.12	0.08	0.16	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.26	0.26	0.34	0.30	0.19	0.20	0.17	0.07	0.18	0.23	0.23	0.29	0.41	0.29	0.17	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.08	0.12	0.13	0.07	0.07	0.07	0.02	0.06	0.07	0.08	0.09	0.16	0.12	0.08	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.06	0.13	0.12	0.08	0.11	0.11	0.13	0.11	0.08	0.06	0.08	0.07	0.18	0.16	0.13	0.11	0.12	0.13	0.12
C2	0.09	0.05	0.10	0.08	0.05	0.09	0.08	0.10	0.09	0.07	0.04	0.05	0.07	0.11	0.09	0.13	0.10	0.09	0.12	0.10
C2'	0.12	0.08	0.14	0.13	0.08	0.13	0.10	0.14	0.11	0.10	0.08	0.08	0.10	0.17	0.15	0.15	0.14	0.15	0.15	0.14
C3'	0.09	0.06	0.12	0.12	0.07	0.12	0.10	0.14	0.10	0.08	0.06	0.07	0.08	0.16	0.15	0.13	0.11	0.13	0.13	0.12
C4	0.09	0.07	0.07	0.08	0.08	0.09	0.07	0.09	0.07	0.07	0.09	0.10	0.08	0.10	0.09	0.11	0.09	0.08	0.10	0.09
C4'	0.09	0.07	0.10	0.12	0.09	0.13	0.13	0.15	0.13	0.09	0.07	0.09	0.07	0.13	0.16	0.13	0.12	0.12	0.14	0.12
C5	0.08	0.06	0.09	0.10	0.07	0.10	0.06	0.10	0.07	0.06	0.08	0.08	0.07	0.11	0.13	0.10	0.09	0.09	0.11	0.09
C5'	0.24	0.24	0.21	0.24	0.25	0.25	0.27	0.26	0.27	0.25	0.23	0.24	0.23	0.21	0.25	0.25	0.24	0.19	0.26	0.23
C6	0.08	0.05	0.10	0.11	0.05	0.10	0.07	0.11	0.08	0.06	0.05	0.05	0.06	0.13	0.15	0.11	0.09	0.09	0.12	0.10
N1	0.08	0.05	0.10	0.09	0.06	0.09	0.08	0.10	0.09	0.07	0.05	0.05	0.06	0.14	0.12	0.12	0.09	0.09	0.12	0.10
N3	0.10	0.05	0.08	0.08	0.05	0.10	0.06	0.10	0.08	0.07	0.05	0.06	0.06	0.07	0.08	0.12	0.10	0.10	0.12	0.10
O2	0.13	0.07	0.13	0.12	0.09	0.13	0.11	0.14	0.12	0.10	0.07	0.08	0.09	0.15	0.12	0.16	0.14	0.14	0.14	0.13
O2'	0.19	0.14	0.20	0.19	0.13	0.20	0.14	0.21	0.16	0.16	0.13	0.13	0.15	0.23	0.20	0.22	0.22	0.25	0.22	0.23
O3'	0.07	0.06	0.11	0.10	0.08	0.10	0.10	0.13	0.10	0.06	0.07	0.09	0.08	0.17	0.14	0.10	0.10	0.12	0.11	0.10
O4	0.11	0.10	0.10	0.11	0.12	0.12	0.10	0.12	0.09	0.10	0.13	0.14	0.10	0.15	0.12	0.12	0.11	0.11	0.11	0.10
O4'	0.10	0.07	0.10	0.12	0.11	0.14	0.15	0.17	0.15	0.10	0.07	0.11	0.07	0.15	0.16	0.16	0.15	0.13	0.18	0.16
O5'	0.22	0.28	0.26	0.20	0.26	0.14	0.21	0.12	0.20	0.23	0.30	0.28	0.31	0.27	0.23	0.17	0.14	0.14	0.16	0.14
OP1	0.20	0.17	0.25	0.23	0.15	0.19	0.15	0.18	0.16	0.17	0.16	0.15	0.18	0.26	0.26	0.20	0.18	0.22	0.18	0.18
OP2	0.23	0.24	0.21	0.24	0.25	0.26	0.27	0.28	0.26	0.24	0.24	0.25	0.23	0.22	0.25	0.25	0.26	0.25	0.28	0.27
P	0.07	0.09	0.10	0.09	0.08	0.08	0.07	0.10	0.07	0.07	0.10	0.10	0.11	0.11	0.13	0.09	0.08	0.09	0.10	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.07	0.04
C2	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.08	0.07	0.09	0.06
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.08	0.04
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.06	0.04	0.06	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.05	0.05	0.08	0.06
C4	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.03	0.11	0.11	0.14	0.11
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.04	0.06	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.02
C5	0.02	0.01	0.03	0.07	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.08	0.04	0.12	0.12	0.13	0.11
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.08	0.01	0.10	0.00	0.08	0.04	0.06	0.09	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.07	0.04	0.10	0.08	0.09	0.08
N1	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.07	0.06	0.08	0.05
N3	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.06	0.02	0.09	0.09	0.12	0.09
N4	0.02	0.01	0.03	0.08	0.01	0.06	0.02	0.09	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.09	0.04	0.12	0.14	0.17	0.13
O2	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.07	0.05	0.02	0.06	0.06	0.09	0.05
O2'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.02	0.04	0.03	0.07	0.00	0.03	0.04	0.04	0.07	0.06	0.05
O3'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.08	0.01	0.08	0.02	0.07	0.04	0.06	0.09	0.05	0.03	0.00	0.01	0.08	0.07	0.09	0.07
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.04	0.02	0.04	0.01	0.00	0.06	0.07	0.07	0.06
O5'	0.04	0.08	0.03	0.05	0.11	0.01	0.12	0.01	0.10	0.07	0.09	0.12	0.06	0.04	0.08	0.06	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.04	0.07	0.04	0.05	0.11	0.05	0.12	0.06	0.08	0.06	0.09	0.14	0.06	0.07	0.07	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.09	0.08	0.08	0.14	0.04	0.13	0.02	0.09	0.08	0.12	0.17	0.09	0.06	0.09	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.06	0.04	0.06	0.11	0.02	0.11	0.01	0.08	0.05	0.09	0.13	0.05	0.05	0.07	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00