Doublet Group distance statistics: 43521

back

Distances from reference structure (by RMSD)

20, 197, 186, 76, 20, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	B	0, 0.058, 0.122, 0.186, 0.303 max_d=0.303 avg_d=0.122 std_dev=0.064
N9	B	0, 0.089, 0.163, 0.237, 0.564 max_d=0.564 avg_d=0.163 std_dev=0.074
C4	A	0, 0.054, 0.135, 0.216, 0.378 max_d=0.378 avg_d=0.135 std_dev=0.081
N3	A	0, 0.105, 0.188, 0.271, 0.569 max_d=0.569 avg_d=0.188 std_dev=0.083
C1'	B	0, 0.105, 0.197, 0.290, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.197 std_dev=0.092
C5	A	0, 0.092, 0.193, 0.293, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.193 std_dev=0.100
N9	A	0, 0.094, 0.200, 0.307, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.200 std_dev=0.107
C5	B	0, 0.078, 0.185, 0.293, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.185 std_dev=0.108
C2	A	0, 0.121, 0.230, 0.340, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.230 std_dev=0.109
C6	A	0, 0.100, 0.214, 0.329, 0.571 max_d=0.571 avg_d=0.214 std_dev=0.115
N1	A	0, 0.090, 0.211, 0.333, 0.658 max_d=0.658 avg_d=0.211 std_dev=0.122
C1'	A	0, 0.120, 0.244, 0.367, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.244 std_dev=0.123
C2'	A	0, 0.138, 0.262, 0.386, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.262 std_dev=0.124
C6	B	0, 0.111, 0.238, 0.365, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.238 std_dev=0.127
C3'	A	0, 0.110, 0.243, 0.376, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.243 std_dev=0.133
N3	B	0, 0.069, 0.205, 0.341, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.205 std_dev=0.136
O4'	B	0, 0.135, 0.280, 0.426, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.280 std_dev=0.146
C8	B	0, 0.118, 0.276, 0.434, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.276 std_dev=0.158
P	B	0, 0.207, 0.366, 0.525, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.366 std_dev=0.159
O4'	A	0, 0.101, 0.261, 0.421, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.261 std_dev=0.160
N1	B	0, 0.114, 0.275, 0.436, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.275 std_dev=0.161
O3'	A	0, 0.146, 0.310, 0.474, 1.429 max_d=1.429 avg_d=0.310 std_dev=0.164
N7	A	0, 0.136, 0.301, 0.465, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.301 std_dev=0.164
O6	A	0, 0.143, 0.308, 0.472, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.308 std_dev=0.164
C8	A	0, 0.129, 0.294, 0.459, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.294 std_dev=0.165
C4'	A	0, 0.091, 0.259, 0.428, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.259 std_dev=0.168
N2	A	0, 0.184, 0.357, 0.530, 1.345 max_d=1.345 avg_d=0.357 std_dev=0.173
O2'	A	0, 0.171, 0.346, 0.520, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.346 std_dev=0.175
C2	B	0, 0.104, 0.279, 0.454, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.279 std_dev=0.175
N7	B	0, 0.102, 0.287, 0.472, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.287 std_dev=0.185
N6	B	0, 0.152, 0.340, 0.528, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.340 std_dev=0.188
C2'	B	0, 0.112, 0.311, 0.509, 1.624 max_d=1.624 avg_d=0.311 std_dev=0.198
C4'	B	0, 0.146, 0.367, 0.589, 1.550 max_d=1.550 avg_d=0.367 std_dev=0.222
C3'	B	0, 0.152, 0.380, 0.608, 1.715 max_d=1.715 avg_d=0.380 std_dev=0.228
O5'	B	0, 0.190, 0.424, 0.658, 1.658 max_d=1.658 avg_d=0.424 std_dev=0.234
OP2	B	0, 0.177, 0.418, 0.658, 2.270 max_d=2.270 avg_d=0.418 std_dev=0.241
C5'	A	0, 0.131, 0.376, 0.621, 1.688 max_d=1.688 avg_d=0.376 std_dev=0.245
O5'	A	0, 0.207, 0.456, 0.704, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.456 std_dev=0.249
C5'	B	0, 0.189, 0.465, 0.742, 1.978 max_d=1.978 avg_d=0.465 std_dev=0.276
O2'	B	0, 0.068, 0.375, 0.682, 2.994 max_d=2.994 avg_d=0.375 std_dev=0.307
OP1	B	0, 0.246, 0.578, 0.910, 2.921 max_d=2.921 avg_d=0.578 std_dev=0.332
P	A	0, 0.347, 0.716, 1.084, 1.955 max_d=1.955 avg_d=0.716 std_dev=0.369
O3'	B	0, 0.154, 0.529, 0.903, 2.892 max_d=2.892 avg_d=0.529 std_dev=0.374
OP2	A	0, 0.366, 0.797, 1.228, 2.286 max_d=2.286 avg_d=0.797 std_dev=0.431
OP1	A	0, 0.392, 0.852, 1.311, 2.863 max_d=2.863 avg_d=0.852 std_dev=0.460

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.10	0.03	0.10	0.16	0.11
C2	0.04	0.00	0.14	0.15	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.19	0.06	0.17	0.02	0.18	0.29	0.20
C2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.08	0.02	0.06	0.03	0.08	0.07	0.11	0.16	0.13	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.08	0.08	0.12	0.12	0.07
C3'	0.02	0.15	0.01	0.00	0.10	0.00	0.11	0.02	0.12	0.11	0.14	0.17	0.13	0.11	0.07	0.02	0.01	0.02	0.10	0.13	0.15	0.12	0.09
C4	0.02	0.01	0.08	0.10	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.12	0.03	0.18	0.02	0.18	0.26	0.20
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.06	0.09	0.05	0.07	0.05	0.09	0.04	0.07	0.03	0.00	0.02	0.08	0.09	0.11	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.13	0.03	0.22	0.02	0.24	0.32	0.25
C5'	0.03	0.09	0.03	0.02	0.10	0.01	0.14	0.00	0.15	0.16	0.12	0.08	0.07	0.18	0.10	0.06	0.04	0.02	0.01	0.17	0.11	0.12	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.16	0.03	0.23	0.01	0.27	0.35	0.27
C8	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.09	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.13	0.05	0.22	0.03	0.22	0.27	0.23
N1	0.03	0.01	0.11	0.14	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.19	0.04	0.21	0.01	0.23	0.33	0.24
N2	0.05	0.01	0.16	0.17	0.01	0.07	0.01	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.19	0.23	0.07	0.16	0.02	0.17	0.28	0.19
N3	0.04	0.01	0.13	0.13	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.17	0.06	0.15	0.02	0.16	0.25	0.17
N7	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.09	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.14	0.04	0.25	0.03	0.27	0.34	0.28
N9	0.01	0.02	0.03	0.07	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.02	0.16	0.02	0.16	0.22	0.17
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.08	0.07	0.07	0.06	0.10	0.06	0.14	0.19	0.14	0.06	0.03	0.00	0.06	0.06	0.05	0.10	0.12	0.12	0.06
O3'	0.02	0.19	0.02	0.01	0.12	0.03	0.13	0.04	0.16	0.13	0.19	0.23	0.17	0.14	0.07	0.06	0.00	0.02	0.13	0.17	0.23	0.19	0.15
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.04	0.07	0.06	0.04	0.02	0.06	0.02	0.00	0.11	0.04	0.13	0.17	0.13
O5'	0.10	0.17	0.08	0.10	0.18	0.02	0.22	0.01	0.23	0.22	0.21	0.16	0.15	0.25	0.16	0.05	0.13	0.11	0.00	0.25	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.08	0.13	0.02	0.08	0.02	0.17	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.10	0.17	0.04	0.25	0.00	0.31	0.39	0.31
OP1	0.10	0.18	0.12	0.15	0.18	0.09	0.24	0.11	0.27	0.22	0.23	0.17	0.16	0.27	0.16	0.12	0.23	0.13	0.02	0.31	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.29	0.12	0.12	0.26	0.11	0.32	0.12	0.35	0.27	0.33	0.28	0.25	0.34	0.22	0.12	0.19	0.17	0.02	0.39	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.20	0.07	0.09	0.20	0.03	0.25	0.02	0.27	0.23	0.24	0.19	0.17	0.28	0.17	0.06	0.15	0.13	0.01	0.31	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.40	0.33	0.22	0.30	0.17	0.33	0.19	0.39	0.29	0.42	0.36	0.43	0.34	0.25	0.44	0.30	0.18	0.18	0.08	0.15	0.05
C2	0.20	0.44	0.21	0.33	0.28	0.36	0.32	0.45	0.38	0.32	0.44	0.37	0.41	0.36	0.23	0.33	0.46	0.27	0.40	0.30	0.32	0.26
C2'	0.21	0.33	0.32	0.21	0.26	0.17	0.29	0.19	0.33	0.27	0.35	0.30	0.38	0.32	0.22	0.42	0.27	0.18	0.18	0.11	0.15	0.08
C3'	0.17	0.29	0.30	0.15	0.23	0.10	0.28	0.13	0.32	0.24	0.32	0.25	0.39	0.31	0.19	0.35	0.22	0.14	0.11	0.07	0.11	0.03
C4	0.16	0.41	0.23	0.20	0.26	0.23	0.30	0.33	0.35	0.28	0.40	0.35	0.39	0.33	0.20	0.38	0.34	0.18	0.30	0.19	0.29	0.18
C4'	0.17	0.33	0.30	0.16	0.25	0.10	0.31	0.13	0.37	0.24	0.37	0.28	0.45	0.32	0.20	0.37	0.23	0.14	0.09	0.12	0.14	0.06
C5	0.19	0.41	0.26	0.23	0.28	0.26	0.30	0.37	0.35	0.28	0.41	0.36	0.38	0.32	0.21	0.37	0.39	0.21	0.33	0.21	0.34	0.20
C5'	0.18	0.31	0.30	0.18	0.24	0.15	0.31	0.18	0.37	0.25	0.36	0.26	0.46	0.32	0.20	0.36	0.26	0.18	0.14	0.20	0.22	0.12
C6	0.20	0.44	0.23	0.27	0.29	0.33	0.31	0.44	0.36	0.30	0.43	0.38	0.39	0.33	0.23	0.33	0.43	0.25	0.38	0.26	0.37	0.24
C8	0.25	0.40	0.36	0.28	0.30	0.24	0.32	0.28	0.36	0.28	0.40	0.37	0.40	0.33	0.25	0.46	0.40	0.22	0.27	0.19	0.31	0.17
N1	0.21	0.45	0.21	0.32	0.29	0.37	0.32	0.48	0.38	0.32	0.45	0.38	0.41	0.35	0.24	0.30	0.47	0.28	0.41	0.30	0.36	0.27
N2	0.27	0.47	0.28	0.42	0.31	0.42	0.36	0.49	0.42	0.36	0.47	0.39	0.45	0.39	0.28	0.36	0.54	0.33	0.43	0.36	0.33	0.30
N3	0.17	0.42	0.20	0.26	0.27	0.28	0.31	0.38	0.37	0.30	0.42	0.35	0.40	0.34	0.21	0.36	0.38	0.22	0.34	0.25	0.28	0.22
N7	0.24	0.41	0.34	0.27	0.29	0.26	0.30	0.34	0.35	0.28	0.40	0.37	0.38	0.32	0.24	0.43	0.42	0.23	0.31	0.21	0.35	0.20
N9	0.20	0.40	0.31	0.21	0.28	0.18	0.31	0.25	0.36	0.27	0.40	0.35	0.40	0.33	0.22	0.43	0.33	0.17	0.24	0.12	0.24	0.11
O2'	0.30	0.38	0.36	0.28	0.33	0.25	0.34	0.23	0.37	0.33	0.39	0.35	0.41	0.36	0.30	0.46	0.29	0.27	0.21	0.17	0.12	0.12
O3'	0.19	0.29	0.28	0.13	0.26	0.09	0.31	0.08	0.34	0.27	0.33	0.26	0.40	0.33	0.22	0.30	0.17	0.16	0.03	0.04	0.05	0.04
O4'	0.20	0.39	0.31	0.18	0.28	0.13	0.33	0.16	0.40	0.26	0.42	0.33	0.46	0.33	0.22	0.41	0.28	0.15	0.14	0.09	0.14	0.04
O5'	0.24	0.30	0.34	0.22	0.25	0.22	0.30	0.26	0.35	0.28	0.34	0.27	0.43	0.33	0.23	0.38	0.29	0.25	0.25	0.23	0.27	0.18
O6	0.23	0.46	0.27	0.29	0.31	0.36	0.32	0.47	0.37	0.31	0.44	0.40	0.39	0.34	0.25	0.34	0.46	0.29	0.39	0.28	0.40	0.26
OP1	0.38	0.38	0.39	0.30	0.38	0.36	0.42	0.39	0.45	0.43	0.42	0.36	0.54	0.46	0.38	0.41	0.31	0.43	0.35	0.38	0.42	0.32
OP2	0.34	0.33	0.38	0.31	0.31	0.37	0.33	0.43	0.36	0.36	0.35	0.31	0.43	0.37	0.32	0.42	0.36	0.40	0.38	0.32	0.38	0.28
P	0.28	0.30	0.35	0.25	0.28	0.29	0.32	0.34	0.36	0.32	0.34	0.28	0.45	0.36	0.27	0.38	0.30	0.33	0.31	0.29	0.34	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.04	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.10	0.01	0.09	0.42	0.13	0.17
C2	0.04	0.00	0.16	0.17	0.01	0.07	0.03	0.10	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.18	0.20	0.05	0.17	0.49	0.20	0.25
C2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.08	0.01	0.05	0.07	0.08	0.08	0.13	0.16	0.07	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.17	0.34	0.23	0.21
C3'	0.01	0.17	0.01	0.00	0.12	0.01	0.15	0.02	0.16	0.17	0.17	0.16	0.18	0.17	0.10	0.02	0.01	0.02	0.10	0.23	0.19	0.09
C4	0.02	0.01	0.08	0.12	0.00	0.05	0.00	0.10	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.10	0.03	0.16	0.49	0.19	0.24
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.07	0.11	0.08	0.07	0.09	0.11	0.05	0.12	0.02	0.00	0.02	0.23	0.09	0.07
C5	0.02	0.03	0.05	0.15	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.11	0.03	0.21	0.50	0.25	0.28
C5'	0.04	0.10	0.07	0.02	0.10	0.01	0.15	0.00	0.15	0.17	0.13	0.09	0.18	0.18	0.10	0.06	0.09	0.02	0.01	0.12	0.10	0.02
C6	0.02	0.06	0.08	0.16	0.02	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.02	0.14	0.12	0.04	0.22	0.51	0.27	0.30
C8	0.02	0.02	0.08	0.17	0.01	0.11	0.01	0.17	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.10	0.15	0.05	0.23	0.50	0.24	0.27
N1	0.04	0.01	0.13	0.17	0.03	0.08	0.02	0.13	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.17	0.17	0.04	0.20	0.51	0.25	0.28
N3	0.04	0.01	0.16	0.16	0.01	0.07	0.01	0.09	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.18	0.04	0.15	0.48	0.17	0.23
N6	0.03	0.01	0.07	0.18	0.01	0.09	0.01	0.18	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.16	0.14	0.05	0.25	0.54	0.34	0.35
N7	0.02	0.03	0.06	0.17	0.01	0.11	0.00	0.18	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.12	0.15	0.04	0.25	0.51	0.29	0.31
N9	0.01	0.02	0.02	0.10	0.01	0.05	0.01	0.10	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.07	0.07	0.02	0.15	0.47	0.17	0.22
O2'	0.02	0.18	0.00	0.02	0.12	0.12	0.12	0.06	0.14	0.10	0.17	0.17	0.16	0.12	0.07	0.00	0.05	0.09	0.13	0.32	0.22	0.17
O3'	0.10	0.20	0.02	0.01	0.10	0.02	0.11	0.09	0.12	0.15	0.17	0.18	0.14	0.15	0.07	0.05	0.00	0.07	0.15	0.19	0.30	0.15
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.05	0.04	0.04	0.05	0.04	0.02	0.09	0.07	0.00	0.09	0.41	0.17	0.19
O5'	0.09	0.17	0.17	0.10	0.16	0.02	0.21	0.01	0.22	0.23	0.20	0.15	0.25	0.25	0.15	0.13	0.15	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.42	0.49	0.34	0.23	0.49	0.23	0.50	0.12	0.51	0.50	0.51	0.48	0.54	0.51	0.47	0.32	0.19	0.41	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.13	0.20	0.23	0.19	0.19	0.09	0.25	0.10	0.27	0.24	0.25	0.17	0.34	0.29	0.17	0.22	0.30	0.17	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.17	0.25	0.21	0.09	0.24	0.07	0.28	0.02	0.30	0.27	0.28	0.23	0.35	0.31	0.22	0.17	0.15	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00