Doublet Group distance statistics: 43565

back

Distances from reference structure (by RMSD)

36, 23, 28, 53, 15, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	B	0, 0.046, 0.135, 0.224, 0.388 max_d=0.388 avg_d=0.135 std_dev=0.089
C4	A	0, 0.066, 0.158, 0.251, 0.391 max_d=0.391 avg_d=0.158 std_dev=0.092
N9	B	0, 0.086, 0.198, 0.310, 0.493 max_d=0.493 avg_d=0.198 std_dev=0.112
C1'	B	0, 0.099, 0.214, 0.330, 0.563 max_d=0.563 avg_d=0.214 std_dev=0.116
N9	A	0, 0.115, 0.243, 0.371, 0.570 max_d=0.570 avg_d=0.243 std_dev=0.128
N3	B	0, 0.077, 0.217, 0.356, 0.537 max_d=0.537 avg_d=0.217 std_dev=0.139
C5	B	0, 0.037, 0.177, 0.316, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.177 std_dev=0.140
O4'	A	0, 0.093, 0.239, 0.384, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.239 std_dev=0.146
N3	A	0, 0.067, 0.214, 0.360, 0.685 max_d=0.685 avg_d=0.214 std_dev=0.147
C2'	B	0, 0.105, 0.269, 0.434, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.269 std_dev=0.165
C6	B	0, 0.047, 0.212, 0.378, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.212 std_dev=0.166
C1'	A	0, 0.056, 0.222, 0.388, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.222 std_dev=0.166
O2'	B	0, 0.121, 0.290, 0.460, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.290 std_dev=0.169
N6	B	0, 0.023, 0.195, 0.367, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.195 std_dev=0.172
C2	A	0, 0.088, 0.273, 0.458, 0.862 max_d=0.862 avg_d=0.273 std_dev=0.185
N1	B	0, 0.080, 0.273, 0.467, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.273 std_dev=0.193
C4'	A	0, 0.165, 0.359, 0.552, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.359 std_dev=0.193
C2	B	0, 0.099, 0.299, 0.500, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.299 std_dev=0.201
O4'	B	0, 0.051, 0.254, 0.458, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.254 std_dev=0.203
C8	B	0, 0.126, 0.329, 0.533, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.329 std_dev=0.204
C5	A	0, 0.110, 0.314, 0.518, 0.757 max_d=0.757 avg_d=0.314 std_dev=0.204
N1	A	0, 0.029, 0.234, 0.439, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.234 std_dev=0.205
N7	B	0, 0.116, 0.321, 0.526, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.321 std_dev=0.205
C6	A	0, 0.120, 0.339, 0.558, 0.728 max_d=0.728 avg_d=0.339 std_dev=0.219
C3'	B	0, 0.083, 0.328, 0.572, 1.263 max_d=1.263 avg_d=0.328 std_dev=0.244
C3'	A	0, 0.130, 0.394, 0.658, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.394 std_dev=0.264
C4'	B	0, 0.047, 0.311, 0.575, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.311 std_dev=0.264
C8	A	0, 0.177, 0.443, 0.710, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.443 std_dev=0.266
N6	A	0, 0.028, 0.312, 0.596, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.312 std_dev=0.284
C2'	A	0, -0.022, 0.265, 0.552, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.265 std_dev=0.287
N7	A	0, 0.163, 0.495, 0.828, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.495 std_dev=0.333
O2'	A	0, 0.074, 0.408, 0.742, 1.738 max_d=1.738 avg_d=0.408 std_dev=0.334
O3'	B	0, 0.102, 0.450, 0.798, 1.676 max_d=1.676 avg_d=0.450 std_dev=0.348
O3'	A	0, 0.212, 0.573, 0.933, 1.802 max_d=1.802 avg_d=0.573 std_dev=0.361
C5'	A	0, 0.211, 0.599, 0.987, 1.915 max_d=1.915 avg_d=0.599 std_dev=0.388
C5'	B	0, -0.014, 0.392, 0.799, 2.100 max_d=2.100 avg_d=0.392 std_dev=0.406
O5'	B	0, -0.078, 0.399, 0.875, 2.401 max_d=2.401 avg_d=0.399 std_dev=0.477
P	B	0, 0.005, 0.517, 1.030, 3.750 max_d=3.750 avg_d=0.517 std_dev=0.512
O5'	A	0, 0.406, 1.072, 1.738, 2.144 max_d=2.144 avg_d=1.072 std_dev=0.666
OP1	B	0, 0.050, 0.916, 1.783, 5.357 max_d=5.357 avg_d=0.916 std_dev=0.866
OP2	A	0, 0.371, 1.247, 2.122, 2.710 max_d=2.710 avg_d=1.247 std_dev=0.876
P	A	0, 0.317, 1.244, 2.171, 2.738 max_d=2.738 avg_d=1.244 std_dev=0.927
OP2	B	0, -0.350, 0.628, 1.606, 5.371 max_d=5.371 avg_d=0.628 std_dev=0.978
OP1	A	0, 0.350, 1.543, 2.736, 3.573 max_d=3.573 avg_d=1.543 std_dev=1.193

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.05	0.05	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.19	0.26	0.29	0.11
C2	0.05	0.00	0.15	0.22	0.01	0.10	0.03	0.21	0.07	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.15	0.25	0.04	0.35	0.43	0.35	0.25
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.04	0.08	0.08	0.11	0.15	0.07	0.07	0.02	0.00	0.03	0.01	0.27	0.46	0.22	0.23
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.14	0.01	0.11	0.05	0.15	0.12	0.19	0.21	0.16	0.11	0.06	0.01	0.01	0.01	0.37	0.56	0.22	0.34
C4	0.02	0.01	0.08	0.14	0.00	0.08	0.01	0.19	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.13	0.02	0.35	0.39	0.32	0.23
C4'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.08	0.00	0.09	0.01	0.11	0.11	0.09	0.09	0.12	0.12	0.06	0.05	0.03	0.00	0.02	0.19	0.33	0.04
C5	0.02	0.03	0.05	0.11	0.01	0.09	0.00	0.24	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.12	0.02	0.43	0.44	0.36	0.28
C5'	0.05	0.21	0.04	0.05	0.19	0.01	0.24	0.00	0.27	0.23	0.24	0.18	0.30	0.26	0.15	0.05	0.09	0.02	0.01	0.19	0.43	0.02
C6	0.02	0.07	0.08	0.15	0.02	0.11	0.01	0.27	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.02	0.10	0.17	0.03	0.44	0.48	0.39	0.31
C8	0.02	0.02	0.08	0.12	0.01	0.11	0.01	0.23	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.06	0.13	0.04	0.42	0.39	0.31	0.25
N1	0.05	0.02	0.11	0.19	0.03	0.09	0.02	0.24	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.14	0.21	0.04	0.42	0.49	0.38	0.30
N3	0.05	0.01	0.15	0.21	0.01	0.09	0.01	0.18	0.04	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.14	0.22	0.04	0.32	0.40	0.32	0.22
N6	0.03	0.01	0.07	0.16	0.02	0.12	0.02	0.30	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.09	0.19	0.03	0.41	0.52	0.44	0.33
N7	0.01	0.03	0.07	0.11	0.01	0.12	0.00	0.26	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.06	0.12	0.04	0.46	0.45	0.36	0.30
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.06	0.01	0.15	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.33	0.34	0.29	0.19
O2'	0.02	0.15	0.00	0.01	0.08	0.05	0.07	0.05	0.10	0.06	0.14	0.14	0.09	0.06	0.03	0.00	0.05	0.05	0.09	0.36	0.23	0.12
O3'	0.02	0.25	0.03	0.01	0.13	0.03	0.12	0.09	0.17	0.13	0.21	0.22	0.19	0.12	0.06	0.05	0.00	0.02	0.34	0.66	0.25	0.38
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.19	0.20	0.40	0.20
O5'	0.19	0.35	0.27	0.37	0.35	0.02	0.43	0.01	0.44	0.42	0.42	0.32	0.41	0.46	0.33	0.09	0.34	0.19	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.26	0.43	0.46	0.56	0.39	0.19	0.44	0.19	0.48	0.39	0.49	0.40	0.52	0.45	0.34	0.36	0.66	0.20	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.35	0.22	0.22	0.32	0.33	0.36	0.43	0.39	0.31	0.38	0.32	0.44	0.36	0.29	0.23	0.25	0.40	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.25	0.23	0.34	0.23	0.04	0.28	0.02	0.31	0.25	0.30	0.22	0.33	0.30	0.19	0.12	0.38	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.29	0.12	0.17	0.21	0.24	0.20	0.36	0.23	0.19	0.26	0.27	0.17	0.20	0.16	0.19	0.22	0.18	0.35	0.58	0.34	0.39
C2	0.21	0.43	0.18	0.18	0.34	0.23	0.40	0.37	0.44	0.38	0.45	0.37	0.38	0.43	0.28	0.22	0.23	0.17	0.42	0.77	0.36	0.50
C2'	0.21	0.25	0.18	0.27	0.22	0.35	0.24	0.51	0.24	0.30	0.24	0.24	0.22	0.29	0.23	0.20	0.28	0.30	0.42	0.68	0.50	0.52
C3'	0.22	0.26	0.20	0.25	0.21	0.34	0.22	0.47	0.22	0.28	0.24	0.24	0.16	0.26	0.23	0.23	0.25	0.30	0.38	0.64	0.50	0.49
C4	0.18	0.43	0.18	0.17	0.30	0.23	0.30	0.36	0.36	0.24	0.41	0.38	0.23	0.28	0.22	0.23	0.22	0.16	0.39	0.67	0.27	0.40
C4'	0.25	0.28	0.21	0.21	0.25	0.29	0.25	0.36	0.25	0.29	0.27	0.26	0.22	0.28	0.25	0.23	0.19	0.30	0.31	0.52	0.44	0.40
C5	0.25	0.57	0.25	0.22	0.41	0.26	0.41	0.36	0.49	0.30	0.55	0.50	0.28	0.35	0.30	0.27	0.24	0.22	0.42	0.67	0.27	0.38
C5'	0.33	0.41	0.35	0.31	0.35	0.32	0.35	0.35	0.36	0.34	0.40	0.38	0.43	0.34	0.33	0.38	0.32	0.31	0.32	0.51	0.45	0.39
C6	0.28	0.60	0.26	0.23	0.45	0.26	0.47	0.36	0.55	0.35	0.60	0.52	0.36	0.41	0.34	0.28	0.25	0.23	0.43	0.69	0.28	0.39
C8	0.27	0.59	0.27	0.25	0.43	0.28	0.41	0.36	0.50	0.28	0.56	0.53	0.23	0.32	0.32	0.29	0.27	0.27	0.40	0.60	0.29	0.35
N1	0.23	0.50	0.21	0.19	0.38	0.24	0.42	0.37	0.49	0.37	0.52	0.43	0.39	0.42	0.30	0.24	0.23	0.18	0.43	0.75	0.31	0.45
N3	0.18	0.37	0.15	0.16	0.30	0.22	0.34	0.37	0.37	0.34	0.39	0.33	0.31	0.38	0.25	0.21	0.22	0.15	0.40	0.74	0.35	0.47
N6	0.25	0.48	0.25	0.21	0.38	0.28	0.43	0.42	0.49	0.35	0.52	0.41	0.43	0.41	0.31	0.27	0.24	0.22	0.49	0.88	0.32	0.43
N7	0.31	0.67	0.30	0.26	0.49	0.29	0.49	0.36	0.59	0.34	0.65	0.59	0.30	0.40	0.37	0.31	0.27	0.28	0.42	0.63	0.29	0.36
N9	0.17	0.42	0.18	0.18	0.29	0.24	0.26	0.35	0.33	0.18	0.38	0.38	0.16	0.21	0.19	0.23	0.23	0.18	0.37	0.62	0.28	0.37
O2'	0.34	0.31	0.33	0.41	0.35	0.48	0.39	0.63	0.36	0.45	0.33	0.31	0.36	0.44	0.38	0.29	0.41	0.43	0.51	0.73	0.63	0.61
O3'	0.30	0.28	0.32	0.38	0.28	0.45	0.29	0.58	0.27	0.36	0.28	0.27	0.19	0.35	0.31	0.32	0.39	0.38	0.47	0.74	0.64	0.58
O4'	0.13	0.28	0.14	0.15	0.20	0.22	0.20	0.29	0.22	0.20	0.25	0.26	0.16	0.20	0.16	0.20	0.21	0.19	0.31	0.52	0.35	0.36
O5'	0.47	0.80	0.51	0.42	0.63	0.37	0.58	0.37	0.69	0.41	0.75	0.76	0.34	0.46	0.50	0.54	0.43	0.38	0.33	0.47	0.36	0.34
OP1	0.46	1.08	0.48	0.36	0.77	0.35	0.74	0.43	0.92	0.46	1.04	0.95	0.24	0.56	0.55	0.49	0.37	0.35	0.31	0.53	0.38	0.40
OP2	0.57	1.07	0.55	0.47	0.82	0.44	0.80	0.43	0.95	0.55	1.04	0.97	0.19	0.64	0.64	0.54	0.44	0.48	0.45	0.52	0.44	0.40
P	0.50	1.05	0.50	0.37	0.79	0.32	0.76	0.33	0.92	0.50	1.02	0.96	0.24	0.59	0.59	0.48	0.35	0.37	0.30	0.45	0.36	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.33	0.18	0.10
C2	0.03	0.00	0.16	0.20	0.01	0.09	0.03	0.12	0.07	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.13	0.25	0.03	0.23	0.52	0.46	0.25
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.01	0.06	0.02	0.07	0.05	0.15	0.16	0.05	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.15	0.30	0.15	0.13
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.11	0.00	0.10	0.02	0.12	0.09	0.19	0.18	0.07	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.20	0.36	0.11	0.18
C4	0.02	0.01	0.08	0.11	0.00	0.06	0.01	0.09	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.12	0.02	0.23	0.54	0.44	0.25
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.07	0.06	0.11	0.08	0.06	0.07	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.12	0.21	0.03
C5	0.01	0.03	0.06	0.10	0.01	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.02	0.29	0.65	0.58	0.33
C5'	0.02	0.12	0.02	0.02	0.09	0.01	0.11	0.00	0.12	0.10	0.14	0.10	0.12	0.12	0.07	0.05	0.04	0.01	0.01	0.18	0.32	0.01
C6	0.02	0.07	0.07	0.12	0.02	0.07	0.01	0.12	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.01	0.07	0.15	0.02	0.30	0.67	0.64	0.35
C8	0.01	0.02	0.05	0.09	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.10	0.04	0.29	0.64	0.49	0.30
N1	0.04	0.02	0.15	0.19	0.03	0.11	0.02	0.14	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.12	0.24	0.03	0.28	0.61	0.57	0.32
N3	0.03	0.01	0.16	0.18	0.01	0.08	0.01	0.10	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.21	0.03	0.20	0.48	0.38	0.22
N6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.09	0.02	0.35	0.42	0.78	0.45
N7	0.02	0.03	0.04	0.08	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.10	0.03	0.32	0.73	0.63	0.37
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.21	0.50	0.35	0.21
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.07	0.03	0.12	0.12	0.06	0.03	0.02	0.00	0.04	0.04	0.07	0.23	0.14	0.08
O3'	0.01	0.25	0.01	0.01	0.12	0.02	0.12	0.04	0.15	0.10	0.24	0.21	0.09	0.10	0.05	0.04	0.00	0.02	0.19	0.52	0.15	0.21
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.03	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.08	0.29	0.19	0.10
O5'	0.10	0.23	0.15	0.20	0.23	0.01	0.29	0.01	0.30	0.29	0.28	0.20	0.35	0.32	0.21	0.07	0.19	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.33	0.52	0.30	0.36	0.54	0.12	0.65	0.18	0.67	0.64	0.61	0.48	0.42	0.73	0.50	0.23	0.52	0.29	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.46	0.15	0.11	0.44	0.21	0.58	0.32	0.64	0.49	0.57	0.38	0.78	0.63	0.35	0.14	0.15	0.19	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.25	0.13	0.18	0.25	0.03	0.33	0.01	0.35	0.30	0.32	0.22	0.45	0.37	0.21	0.08	0.21	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00