Doublet Group distance statistics: 43631

back

Distances from reference structure (by RMSD)

49, 26, 47, 0, 48, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C1'	B	0, 0.063, 0.154, 0.245, 0.345 max_d=0.345 avg_d=0.154 std_dev=0.091
N3	B	0, 0.041, 0.132, 0.223, 0.400 max_d=0.400 avg_d=0.132 std_dev=0.091
C2'	B	0, 0.105, 0.201, 0.296, 0.416 max_d=0.416 avg_d=0.201 std_dev=0.096
N9	B	0, 0.077, 0.180, 0.283, 0.413 max_d=0.413 avg_d=0.180 std_dev=0.103
N7	A	0, 0.082, 0.201, 0.320, 0.473 max_d=0.473 avg_d=0.201 std_dev=0.119
C6	A	0, 0.084, 0.210, 0.336, 0.446 max_d=0.446 avg_d=0.210 std_dev=0.126
O6	A	0, 0.124, 0.250, 0.375, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.250 std_dev=0.126
O6	B	0, 0.084, 0.213, 0.341, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.213 std_dev=0.129
C8	A	0, 0.106, 0.238, 0.371, 0.499 max_d=0.499 avg_d=0.238 std_dev=0.133
N2	B	0, 0.089, 0.222, 0.356, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.222 std_dev=0.133
C2	B	0, 0.060, 0.196, 0.331, 0.566 max_d=0.566 avg_d=0.196 std_dev=0.135
O4'	A	0, 0.141, 0.277, 0.413, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.277 std_dev=0.136
C5	A	0, 0.017, 0.155, 0.294, 0.440 max_d=0.440 avg_d=0.155 std_dev=0.139
C4	B	0, 0.036, 0.175, 0.315, 0.445 max_d=0.445 avg_d=0.175 std_dev=0.140
N1	A	0, 0.117, 0.263, 0.408, 0.481 max_d=0.481 avg_d=0.263 std_dev=0.146
N9	A	0, 0.071, 0.218, 0.364, 0.521 max_d=0.521 avg_d=0.218 std_dev=0.146
C2	A	0, 0.118, 0.268, 0.419, 0.577 max_d=0.577 avg_d=0.268 std_dev=0.151
N3	A	0, 0.064, 0.221, 0.379, 0.598 max_d=0.598 avg_d=0.221 std_dev=0.157
C4	A	0, 0.005, 0.163, 0.321, 0.480 max_d=0.480 avg_d=0.163 std_dev=0.158
C3'	B	0, 0.166, 0.328, 0.490, 0.590 max_d=0.590 avg_d=0.328 std_dev=0.162
C1'	A	0, 0.116, 0.284, 0.452, 0.575 max_d=0.575 avg_d=0.284 std_dev=0.168
C2'	A	0, 0.144, 0.315, 0.485, 0.592 max_d=0.592 avg_d=0.315 std_dev=0.170
C3'	A	0, 0.143, 0.317, 0.490, 0.593 max_d=0.593 avg_d=0.317 std_dev=0.174
C8	B	0, 0.138, 0.314, 0.490, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.314 std_dev=0.176
N2	A	0, 0.174, 0.352, 0.530, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.352 std_dev=0.178
O3'	A	0, 0.175, 0.393, 0.611, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.393 std_dev=0.218
C4'	A	0, 0.156, 0.378, 0.600, 0.787 max_d=0.787 avg_d=0.378 std_dev=0.222
O2'	B	0, 0.128, 0.354, 0.579, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.354 std_dev=0.225
C5	B	0, 0.070, 0.314, 0.557, 0.715 max_d=0.715 avg_d=0.314 std_dev=0.244
N7	B	0, 0.147, 0.404, 0.661, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.404 std_dev=0.257
O2'	A	0, 0.184, 0.444, 0.704, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.444 std_dev=0.260
O4'	B	0, 0.048, 0.308, 0.569, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.308 std_dev=0.260
N1	B	0, 0.021, 0.290, 0.559, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.290 std_dev=0.269
O3'	B	0, 0.207, 0.504, 0.801, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.504 std_dev=0.297
C4'	B	0, 0.155, 0.484, 0.813, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.484 std_dev=0.329
C6	B	0, 0.038, 0.373, 0.708, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.373 std_dev=0.335
O5'	A	0, 0.128, 0.525, 0.922, 1.218 max_d=1.218 avg_d=0.525 std_dev=0.397
P	A	0, 0.139, 0.550, 0.961, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.550 std_dev=0.411
C5'	A	0, 0.120, 0.571, 1.022, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.571 std_dev=0.451
C5'	B	0, 0.219, 0.749, 1.280, 1.617 max_d=1.617 avg_d=0.749 std_dev=0.530
O5'	B	0, 0.322, 0.856, 1.391, 1.630 max_d=1.630 avg_d=0.856 std_dev=0.535
OP1	A	0, 0.050, 0.772, 1.494, 2.131 max_d=2.131 avg_d=0.772 std_dev=0.722
P	B	0, 0.451, 1.256, 2.060, 2.206 max_d=2.206 avg_d=1.256 std_dev=0.805
OP1	B	0, 0.662, 1.475, 2.287, 2.410 max_d=2.410 avg_d=1.475 std_dev=0.813
OP2	A	0, 0.007, 0.945, 1.882, 2.502 max_d=2.502 avg_d=0.945 std_dev=0.938
OP2	B	0, 0.523, 2.397, 4.271, 5.112 max_d=5.112 avg_d=2.397 std_dev=1.874

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.29	0.02	0.06	0.44	0.19
C2	0.03	0.00	0.08	0.10	0.01	0.06	0.01	0.25	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.11	0.03	0.27	0.01	0.17	0.64	0.14
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.03	0.05	0.03	0.07	0.10	0.08	0.03	0.02	0.00	0.01	0.02	0.12	0.05	0.14	0.19	0.08
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.12	0.11	0.11	0.10	0.09	0.12	0.08	0.01	0.01	0.02	0.04	0.12	0.20	0.06	0.05
C4	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.09	0.00	0.29	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.08	0.02	0.30	0.01	0.18	0.66	0.16
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.09	0.00	0.15	0.00	0.14	0.19	0.10	0.05	0.05	0.20	0.11	0.04	0.01	0.00	0.01	0.17	0.05	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.15	0.00	0.39	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.10	0.02	0.30	0.01	0.28	0.78	0.15
C5'	0.09	0.25	0.03	0.01	0.29	0.00	0.39	0.00	0.40	0.42	0.33	0.21	0.21	0.46	0.28	0.04	0.07	0.02	0.01	0.44	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.14	0.01	0.40	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.10	0.02	0.28	0.00	0.30	0.80	0.14
C8	0.01	0.01	0.03	0.11	0.01	0.19	0.00	0.42	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.11	0.03	0.34	0.02	0.27	0.78	0.19
N1	0.02	0.00	0.07	0.11	0.01	0.10	0.01	0.33	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.10	0.02	0.27	0.01	0.24	0.72	0.13
N2	0.04	0.00	0.10	0.10	0.01	0.05	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.19	0.13	0.04	0.27	0.01	0.14	0.59	0.14
N3	0.03	0.00	0.08	0.09	0.00	0.05	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.09	0.03	0.28	0.01	0.13	0.59	0.15
N7	0.01	0.01	0.03	0.12	0.00	0.20	0.00	0.46	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.12	0.02	0.31	0.02	0.35	0.86	0.17
N9	0.00	0.01	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.31	0.01	0.15	0.62	0.18
O2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.09	0.04	0.07	0.04	0.10	0.02	0.14	0.19	0.15	0.03	0.03	0.00	0.03	0.09	0.04	0.10	0.13	0.06	0.04
O3'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.08	0.01	0.10	0.07	0.10	0.11	0.10	0.13	0.09	0.12	0.06	0.03	0.00	0.02	0.24	0.12	0.30	0.38	0.20
O4'	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.02	0.01	0.09	0.02	0.00	0.34	0.02	0.07	0.44	0.27
O5'	0.29	0.27	0.12	0.04	0.30	0.01	0.30	0.01	0.28	0.34	0.27	0.27	0.28	0.31	0.31	0.04	0.24	0.34	0.00	0.27	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.05	0.12	0.01	0.17	0.01	0.44	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.10	0.12	0.02	0.27	0.00	0.37	0.86	0.14
OP1	0.06	0.17	0.14	0.20	0.18	0.05	0.28	0.05	0.30	0.27	0.24	0.14	0.13	0.35	0.15	0.13	0.30	0.07	0.01	0.37	0.00	0.01	0.00
OP2	0.44	0.64	0.19	0.06	0.66	0.03	0.78	0.02	0.80	0.78	0.72	0.59	0.59	0.86	0.62	0.06	0.38	0.44	0.02	0.86	0.01	0.00	0.00
P	0.19	0.14	0.08	0.05	0.16	0.01	0.15	0.01	0.14	0.19	0.13	0.14	0.15	0.17	0.18	0.04	0.20	0.27	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.34	0.22	0.21	0.37	0.28	0.49	0.58	0.54	0.45	0.44	0.20	0.29	0.53	0.34	0.15	0.31	0.28	0.64	0.14	0.57	1.20	0.65
C2	0.24	0.46	0.21	0.16	0.47	0.24	0.62	0.43	0.72	0.54	0.62	0.18	0.37	0.65	0.41	0.15	0.24	0.30	0.50	0.27	0.43	0.81	0.46
C2'	0.14	0.26	0.17	0.14	0.32	0.19	0.45	0.48	0.49	0.44	0.36	0.19	0.21	0.52	0.30	0.11	0.32	0.19	0.59	0.14	0.52	1.01	0.57
C3'	0.13	0.17	0.12	0.26	0.18	0.23	0.32	0.27	0.37	0.29	0.26	0.18	0.13	0.39	0.15	0.17	0.51	0.13	0.44	0.16	0.47	0.93	0.44
C4	0.18	0.37	0.18	0.15	0.40	0.22	0.55	0.45	0.62	0.48	0.51	0.15	0.30	0.59	0.35	0.11	0.27	0.24	0.54	0.13	0.50	0.97	0.51
C4'	0.19	0.17	0.21	0.34	0.16	0.27	0.27	0.39	0.32	0.24	0.23	0.20	0.15	0.33	0.14	0.28	0.61	0.17	0.52	0.18	0.57	1.21	0.59
C5	0.16	0.36	0.16	0.14	0.38	0.18	0.53	0.41	0.61	0.47	0.51	0.15	0.28	0.58	0.33	0.11	0.28	0.20	0.51	0.16	0.52	0.95	0.47
C5'	0.32	0.16	0.37	0.54	0.13	0.45	0.19	0.32	0.26	0.15	0.20	0.19	0.17	0.22	0.16	0.45	0.80	0.30	0.36	0.19	0.60	1.02	0.49
C6	0.19	0.39	0.17	0.14	0.40	0.18	0.57	0.38	0.66	0.49	0.55	0.16	0.30	0.61	0.35	0.12	0.27	0.22	0.48	0.24	0.50	0.86	0.43
C8	0.15	0.31	0.18	0.18	0.33	0.20	0.47	0.45	0.54	0.42	0.43	0.18	0.25	0.52	0.29	0.13	0.33	0.19	0.56	0.12	0.59	1.13	0.56
N1	0.22	0.44	0.20	0.15	0.45	0.21	0.61	0.40	0.71	0.53	0.60	0.18	0.35	0.65	0.39	0.15	0.25	0.26	0.49	0.29	0.46	0.81	0.44
N2	0.29	0.51	0.24	0.19	0.52	0.28	0.67	0.44	0.77	0.57	0.68	0.23	0.43	0.68	0.45	0.19	0.23	0.34	0.50	0.35	0.38	0.75	0.45
N3	0.23	0.43	0.20	0.16	0.45	0.25	0.59	0.47	0.67	0.52	0.57	0.15	0.35	0.62	0.39	0.13	0.25	0.30	0.53	0.19	0.44	0.89	0.49
N7	0.14	0.32	0.16	0.16	0.34	0.18	0.49	0.40	0.56	0.43	0.46	0.16	0.25	0.54	0.29	0.11	0.31	0.17	0.52	0.12	0.57	1.03	0.50
N9	0.17	0.34	0.19	0.17	0.37	0.23	0.50	0.49	0.57	0.45	0.46	0.18	0.28	0.55	0.33	0.12	0.30	0.23	0.58	0.11	0.55	1.10	0.57
O2'	0.19	0.22	0.23	0.19	0.30	0.32	0.41	0.68	0.41	0.45	0.29	0.22	0.20	0.49	0.32	0.13	0.28	0.31	0.73	0.21	0.56	1.14	0.73
O3'	0.24	0.16	0.17	0.36	0.11	0.39	0.21	0.18	0.25	0.20	0.17	0.18	0.18	0.29	0.10	0.22	0.60	0.30	0.34	0.19	0.46	0.76	0.35
O4'	0.20	0.31	0.23	0.23	0.34	0.29	0.44	0.61	0.49	0.41	0.39	0.22	0.27	0.48	0.31	0.19	0.35	0.27	0.69	0.17	0.64	1.40	0.73
O5'	0.12	0.19	0.17	0.18	0.25	0.16	0.41	0.37	0.44	0.43	0.30	0.19	0.15	0.52	0.25	0.14	0.44	0.11	0.67	0.15	0.77	1.46	0.74
O6	0.18	0.38	0.17	0.13	0.39	0.16	0.56	0.35	0.65	0.49	0.55	0.17	0.29	0.61	0.34	0.13	0.28	0.20	0.47	0.27	0.51	0.84	0.41
OP1	0.55	0.30	0.56	0.71	0.35	0.67	0.27	0.50	0.21	0.38	0.24	0.18	0.37	0.29	0.42	0.61	0.89	0.56	0.35	0.18	0.59	0.69	0.47
OP2	0.26	0.26	0.42	0.22	0.41	0.17	0.60	0.49	0.60	0.69	0.40	0.18	0.22	0.77	0.45	0.37	0.23	0.19	0.91	0.14	1.25	1.73	1.03
P	0.13	0.19	0.14	0.29	0.21	0.26	0.37	0.21	0.43	0.34	0.30	0.18	0.13	0.46	0.18	0.17	0.56	0.15	0.48	0.14	0.63	1.25	0.54

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.11	0.02	0.19	0.27	0.13
C2	0.02	0.00	0.06	0.04	0.01	0.09	0.03	0.07	0.06	0.02	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.12	0.12	0.09	0.19	0.01	0.20	0.65	0.25
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.04	0.03	0.07	0.06	0.05	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.04	0.28	0.22	0.16
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.06	0.03	0.06	0.05	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.03	0.54	0.37	0.18
C4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.07	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.08	0.05	0.22	0.01	0.25	0.71	0.28
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.10	0.05	0.10	0.09	0.08	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.44	0.39	0.08
C5	0.01	0.03	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.12	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.03	0.29	0.01	0.39	0.99	0.39
C5'	0.03	0.07	0.04	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.10	0.21	0.08	0.07	0.06	0.20	0.10	0.03	0.02	0.01	0.01	0.12	0.36	0.45	0.01
C6	0.02	0.06	0.04	0.02	0.02	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.06	0.09	0.06	0.28	0.00	0.41	1.03	0.41
C8	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.10	0.01	0.21	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.03	0.05	0.33	0.02	0.41	0.99	0.41
N1	0.03	0.02	0.07	0.03	0.03	0.05	0.02	0.08	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.11	0.10	0.06	0.25	0.01	0.29	0.88	0.34
N2	0.03	0.00	0.06	0.06	0.01	0.10	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.15	0.09	0.18	0.02	0.18	0.46	0.26
N3	0.02	0.00	0.05	0.05	0.00	0.09	0.01	0.06	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.11	0.09	0.17	0.01	0.17	0.54	0.21
N7	0.01	0.03	0.04	0.05	0.00	0.08	0.00	0.20	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.04	0.03	0.35	0.02	0.50	1.17	0.47
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.22	0.01	0.23	0.64	0.26
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.05	0.01	0.04	0.03	0.06	0.08	0.11	0.12	0.11	0.06	0.03	0.00	0.04	0.01	0.07	0.06	0.32	0.27	0.19
O3'	0.05	0.12	0.02	0.00	0.08	0.01	0.06	0.02	0.09	0.03	0.10	0.15	0.11	0.04	0.05	0.04	0.00	0.03	0.05	0.08	0.65	0.48	0.20
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.06	0.05	0.06	0.09	0.09	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.08	0.04	0.18	0.15	0.09
O5'	0.11	0.19	0.06	0.06	0.22	0.01	0.29	0.01	0.28	0.33	0.25	0.18	0.17	0.35	0.22	0.07	0.05	0.08	0.00	0.32	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.08	0.04	0.32	0.00	0.44	0.72	0.51
OP1	0.19	0.20	0.28	0.54	0.25	0.44	0.39	0.36	0.41	0.41	0.29	0.18	0.17	0.50	0.23	0.32	0.65	0.18	0.02	0.44	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.65	0.22	0.37	0.71	0.39	0.99	0.45	1.03	0.99	0.88	0.46	0.54	1.17	0.64	0.27	0.48	0.15	0.02	0.72	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.25	0.16	0.18	0.28	0.08	0.39	0.01	0.41	0.41	0.34	0.26	0.21	0.47	0.26	0.19	0.20	0.09	0.00	0.51	0.01	0.00	0.00