Doublet Group distance statistics: 43647

back

Distances from reference structure (by RMSD)

22, 67, 37, 85, 6, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.040, 0.141, 0.241, 0.684 max_d=0.684 avg_d=0.141 std_dev=0.101
N3	B	0, 0.079, 0.181, 0.283, 0.536 max_d=0.536 avg_d=0.181 std_dev=0.102
C4	B	0, 0.039, 0.148, 0.257, 0.722 max_d=0.722 avg_d=0.148 std_dev=0.109
C2'	A	0, 0.137, 0.249, 0.362, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.249 std_dev=0.113
N3	A	0, 0.074, 0.193, 0.311, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.193 std_dev=0.118
N9	A	0, 0.040, 0.158, 0.276, 1.096 max_d=1.096 avg_d=0.158 std_dev=0.118
C5	A	0, 0.083, 0.204, 0.326, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.204 std_dev=0.121
C1'	A	0, 0.076, 0.205, 0.334, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.205 std_dev=0.129
C2	B	0, 0.124, 0.255, 0.387, 0.625 max_d=0.625 avg_d=0.255 std_dev=0.132
C6	A	0, 0.127, 0.269, 0.412, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.269 std_dev=0.143
O2'	A	0, 0.170, 0.324, 0.478, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.324 std_dev=0.154
N9	B	0, 0.026, 0.181, 0.337, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.181 std_dev=0.155
C5	B	0, 0.088, 0.253, 0.418, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.253 std_dev=0.165
C8	A	0, 0.048, 0.220, 0.392, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.220 std_dev=0.172
N7	A	0, 0.076, 0.249, 0.423, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.249 std_dev=0.174
N1	A	0, 0.114, 0.288, 0.462, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.288 std_dev=0.174
C2	A	0, 0.089, 0.265, 0.441, 1.377 max_d=1.377 avg_d=0.265 std_dev=0.176
C1'	B	0, 0.086, 0.262, 0.438, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.262 std_dev=0.176
N1	B	0, 0.134, 0.323, 0.511, 0.666 max_d=0.666 avg_d=0.323 std_dev=0.189
N6	A	0, -0.003, 0.196, 0.394, 1.289 max_d=1.289 avg_d=0.196 std_dev=0.198
C3'	A	0, 0.097, 0.296, 0.495, 1.591 max_d=1.591 avg_d=0.296 std_dev=0.199
C6	B	0, 0.127, 0.331, 0.536, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.331 std_dev=0.205
C8	B	0, 0.056, 0.274, 0.493, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.274 std_dev=0.218
N7	B	0, 0.106, 0.331, 0.557, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.331 std_dev=0.226
O4'	A	0, 0.046, 0.272, 0.499, 1.978 max_d=1.978 avg_d=0.272 std_dev=0.226
O4'	B	0, 0.238, 0.472, 0.707, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.472 std_dev=0.234
C4'	A	0, 0.061, 0.319, 0.577, 2.016 max_d=2.016 avg_d=0.319 std_dev=0.258
P	B	0, 0.084, 0.352, 0.620, 2.616 max_d=2.616 avg_d=0.352 std_dev=0.268
O3'	A	0, 0.091, 0.359, 0.627, 2.181 max_d=2.181 avg_d=0.359 std_dev=0.268
N6	B	0, 0.176, 0.466, 0.756, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.466 std_dev=0.290
C2'	B	0, 0.072, 0.400, 0.728, 3.121 max_d=3.121 avg_d=0.400 std_dev=0.328
C4'	B	0, 0.241, 0.579, 0.917, 1.877 max_d=1.877 avg_d=0.579 std_dev=0.338
C3'	B	0, 0.179, 0.521, 0.864, 2.526 max_d=2.526 avg_d=0.521 std_dev=0.342
O5'	A	0, 0.091, 0.457, 0.822, 2.731 max_d=2.731 avg_d=0.457 std_dev=0.365
C5'	A	0, 0.081, 0.469, 0.857, 3.035 max_d=3.035 avg_d=0.469 std_dev=0.388
O5'	B	0, 0.407, 0.832, 1.257, 2.496 max_d=2.496 avg_d=0.832 std_dev=0.425
OP1	B	0, 0.223, 0.678, 1.132, 3.449 max_d=3.449 avg_d=0.678 std_dev=0.455
O3'	B	0, 0.285, 0.786, 1.287, 2.290 max_d=2.290 avg_d=0.786 std_dev=0.501
O2'	B	0, 0.017, 0.521, 1.025, 4.317 max_d=4.317 avg_d=0.521 std_dev=0.504
C5'	B	0, 0.435, 0.941, 1.446, 2.956 max_d=2.956 avg_d=0.941 std_dev=0.505
P	A	0, 0.155, 0.665, 1.174, 3.525 max_d=3.525 avg_d=0.665 std_dev=0.510
OP2	B	0, 0.284, 0.804, 1.324, 3.909 max_d=3.909 avg_d=0.804 std_dev=0.520
OP2	A	0, 0.193, 0.718, 1.243, 3.743 max_d=3.743 avg_d=0.718 std_dev=0.525
OP1	A	0, 0.145, 0.824, 1.504, 5.609 max_d=5.609 avg_d=0.824 std_dev=0.679

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.06	0.07	0.12	0.06
C2	0.03	0.00	0.12	0.11	0.01	0.05	0.03	0.09	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.13	0.15	0.08	0.11	0.16	0.20	0.13
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.02	0.07	0.08	0.11	0.12	0.05	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.08	0.11	0.12	0.07
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.08	0.01	0.09	0.02	0.10	0.10	0.12	0.10	0.06	0.10	0.05	0.02	0.01	0.01	0.10	0.13	0.12	0.09
C4	0.01	0.01	0.07	0.08	0.00	0.04	0.01	0.08	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.04	0.11	0.13	0.19	0.12
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.06	0.04	0.06	0.08	0.04	0.05	0.02	0.00	0.02	0.07	0.07	0.02
C5	0.01	0.03	0.05	0.09	0.01	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.03	0.14	0.17	0.23	0.16
C5'	0.02	0.09	0.02	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.12	0.11	0.11	0.08	0.13	0.13	0.06	0.05	0.04	0.01	0.01	0.07	0.08	0.02
C6	0.02	0.06	0.07	0.10	0.02	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.07	0.13	0.04	0.15	0.19	0.26	0.18
C8	0.01	0.02	0.08	0.10	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.12	0.06	0.14	0.15	0.19	0.14
N1	0.03	0.02	0.11	0.12	0.03	0.06	0.02	0.11	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.11	0.15	0.06	0.14	0.19	0.24	0.17
N3	0.03	0.01	0.12	0.10	0.01	0.04	0.01	0.08	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.13	0.08	0.10	0.13	0.18	0.11
N6	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.08	0.04	0.15	0.22	0.26	0.21
N7	0.01	0.03	0.06	0.10	0.01	0.08	0.01	0.13	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.12	0.04	0.16	0.18	0.24	0.18
N9	0.00	0.02	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.10	0.10	0.16	0.09
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.07	0.05	0.05	0.05	0.07	0.06	0.11	0.13	0.06	0.05	0.02	0.00	0.05	0.04	0.06	0.12	0.10	0.06
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.09	0.02	0.10	0.04	0.13	0.12	0.15	0.13	0.08	0.12	0.05	0.05	0.00	0.02	0.12	0.18	0.16	0.13
O4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.06	0.06	0.08	0.04	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.08	0.07	0.11	0.07
O5'	0.06	0.11	0.08	0.10	0.11	0.02	0.14	0.01	0.15	0.14	0.14	0.10	0.15	0.16	0.10	0.06	0.12	0.08	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.07	0.16	0.11	0.13	0.13	0.07	0.17	0.07	0.19	0.15	0.19	0.13	0.22	0.18	0.10	0.12	0.18	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.20	0.12	0.12	0.19	0.07	0.23	0.08	0.26	0.19	0.24	0.18	0.26	0.24	0.16	0.10	0.16	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.13	0.07	0.09	0.12	0.02	0.16	0.02	0.18	0.14	0.17	0.11	0.21	0.18	0.09	0.06	0.13	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.34	0.31	0.37	0.28	0.25	0.29	0.25	0.26	0.32	0.31	0.35	0.27	0.40	0.26	0.29	0.38	0.29	0.35	0.26	0.17	0.14	0.04
C2	0.36	0.45	0.42	0.37	0.38	0.34	0.42	0.37	0.50	0.41	0.52	0.39	0.60	0.43	0.37	0.47	0.39	0.33	0.50	0.19	0.33	0.21
C2'	0.29	0.28	0.33	0.27	0.18	0.29	0.21	0.27	0.31	0.25	0.33	0.21	0.39	0.20	0.22	0.33	0.28	0.33	0.30	0.10	0.18	0.09
C3'	0.21	0.28	0.23	0.23	0.20	0.18	0.28	0.18	0.37	0.23	0.35	0.21	0.45	0.30	0.17	0.21	0.22	0.26	0.14	0.16	0.10	0.02
C4	0.33	0.39	0.40	0.32	0.32	0.30	0.36	0.30	0.45	0.36	0.46	0.32	0.55	0.36	0.32	0.44	0.33	0.32	0.41	0.21	0.27	0.15
C4'	0.26	0.25	0.26	0.28	0.17	0.24	0.21	0.30	0.29	0.22	0.30	0.20	0.38	0.23	0.19	0.26	0.28	0.30	0.07	0.29	0.23	0.12
C5	0.36	0.42	0.46	0.39	0.36	0.34	0.40	0.35	0.49	0.38	0.49	0.36	0.59	0.40	0.35	0.50	0.40	0.34	0.44	0.28	0.32	0.19
C5'	0.23	0.26	0.24	0.32	0.18	0.22	0.26	0.32	0.33	0.24	0.32	0.20	0.43	0.29	0.18	0.23	0.33	0.28	0.13	0.42	0.42	0.20
C6	0.37	0.46	0.48	0.43	0.39	0.36	0.43	0.39	0.52	0.41	0.52	0.40	0.61	0.43	0.38	0.53	0.45	0.34	0.49	0.28	0.35	0.22
C8	0.36	0.37	0.45	0.37	0.32	0.34	0.35	0.30	0.43	0.35	0.43	0.32	0.52	0.35	0.33	0.48	0.37	0.37	0.35	0.33	0.29	0.18
N1	0.37	0.48	0.47	0.42	0.40	0.36	0.44	0.40	0.52	0.42	0.54	0.41	0.62	0.44	0.39	0.52	0.44	0.34	0.53	0.22	0.35	0.23
N3	0.33	0.40	0.38	0.32	0.33	0.31	0.37	0.33	0.45	0.38	0.47	0.33	0.54	0.39	0.34	0.43	0.34	0.32	0.44	0.17	0.29	0.17
N6	0.44	0.19	0.63	0.45	0.30	0.36	0.27	0.27	0.19	0.43	0.17	0.25	0.17	0.36	0.39	0.76	0.45	0.38	0.27	0.24	0.21	0.14
N7	0.38	0.41	0.49	0.41	0.36	0.36	0.40	0.35	0.47	0.38	0.47	0.36	0.57	0.39	0.36	0.52	0.43	0.37	0.41	0.35	0.33	0.21
N9	0.33	0.35	0.39	0.31	0.29	0.29	0.32	0.26	0.40	0.33	0.41	0.30	0.49	0.31	0.30	0.42	0.31	0.34	0.33	0.23	0.22	0.11
O2'	0.40	0.23	0.40	0.34	0.22	0.37	0.16	0.36	0.20	0.36	0.25	0.23	0.26	0.24	0.33	0.40	0.38	0.40	0.26	0.14	0.20	0.10
O3'	0.23	0.29	0.23	0.28	0.26	0.18	0.35	0.24	0.39	0.33	0.36	0.24	0.45	0.38	0.24	0.22	0.27	0.26	0.02	0.02	0.02	0.01
O4'	0.30	0.30	0.31	0.26	0.22	0.26	0.23	0.26	0.32	0.25	0.34	0.26	0.40	0.24	0.25	0.32	0.26	0.33	0.13	0.27	0.18	0.07
O5'	0.19	0.29	0.23	0.29	0.21	0.17	0.30	0.18	0.39	0.23	0.37	0.22	0.50	0.32	0.17	0.22	0.30	0.26	0.12	0.47	0.38	0.16
OP1	0.26	0.32	0.33	0.48	0.29	0.30	0.38	0.40	0.44	0.36	0.39	0.26	0.54	0.44	0.27	0.31	0.53	0.30	0.30	0.62	0.57	0.32
OP2	0.23	0.37	0.33	0.40	0.31	0.22	0.42	0.23	0.50	0.33	0.46	0.29	0.62	0.44	0.26	0.30	0.44	0.27	0.21	0.56	0.49	0.24
P	0.20	0.30	0.27	0.36	0.24	0.20	0.34	0.24	0.42	0.28	0.38	0.23	0.53	0.37	0.20	0.24	0.40	0.26	0.17	0.55	0.48	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.15	0.01	0.15	0.28	0.43	0.12
C2	0.03	0.00	0.16	0.11	0.01	0.09	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.26	0.23	0.15	0.35	0.28	0.48	0.24
C2'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.09	0.01	0.06	0.10	0.09	0.09	0.13	0.15	0.08	0.06	0.03	0.00	0.05	0.01	0.30	0.36	0.32	0.14
C3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.11	0.00	0.15	0.02	0.15	0.21	0.12	0.10	0.17	0.20	0.11	0.02	0.01	0.01	0.41	0.41	0.33	0.21
C4	0.01	0.01	0.09	0.11	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.18	0.13	0.08	0.35	0.24	0.48	0.21
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.14	0.08	0.08	0.10	0.13	0.06	0.15	0.04	0.00	0.02	0.34	0.41	0.10
C5	0.01	0.01	0.06	0.15	0.00	0.09	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.19	0.12	0.06	0.44	0.28	0.53	0.30
C5'	0.05	0.18	0.10	0.02	0.15	0.01	0.20	0.00	0.21	0.23	0.19	0.15	0.23	0.24	0.13	0.07	0.12	0.02	0.01	0.30	0.43	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.15	0.01	0.09	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.14	0.09	0.46	0.31	0.55	0.34
C8	0.01	0.01	0.09	0.21	0.01	0.14	0.01	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.15	0.17	0.08	0.44	0.25	0.52	0.26
N1	0.02	0.00	0.13	0.12	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.26	0.18	0.13	0.41	0.30	0.52	0.31
N3	0.03	0.00	0.15	0.10	0.00	0.08	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.23	0.23	0.14	0.30	0.27	0.45	0.18
N6	0.02	0.02	0.08	0.17	0.01	0.10	0.01	0.23	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.24	0.15	0.07	0.50	0.36	0.60	0.40
N7	0.01	0.01	0.06	0.20	0.01	0.13	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.18	0.17	0.04	0.49	0.30	0.56	0.34
N9	0.00	0.01	0.03	0.11	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.10	0.07	0.02	0.32	0.23	0.46	0.16
O2'	0.02	0.26	0.00	0.02	0.18	0.15	0.19	0.07	0.23	0.15	0.26	0.23	0.24	0.18	0.10	0.00	0.11	0.12	0.15	0.32	0.37	0.12
O3'	0.15	0.23	0.05	0.01	0.13	0.04	0.12	0.12	0.14	0.17	0.18	0.23	0.15	0.17	0.07	0.11	0.00	0.11	0.39	0.47	0.34	0.22
O4'	0.01	0.15	0.01	0.01	0.08	0.00	0.06	0.02	0.09	0.08	0.13	0.14	0.07	0.04	0.02	0.12	0.11	0.00	0.15	0.31	0.51	0.24
O5'	0.15	0.35	0.30	0.41	0.35	0.02	0.44	0.01	0.46	0.44	0.41	0.30	0.50	0.49	0.32	0.15	0.39	0.15	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.28	0.28	0.36	0.41	0.24	0.34	0.28	0.30	0.31	0.25	0.30	0.27	0.36	0.30	0.23	0.32	0.47	0.31	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.43	0.48	0.32	0.33	0.48	0.41	0.53	0.43	0.55	0.52	0.52	0.45	0.60	0.56	0.46	0.37	0.34	0.51	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.24	0.14	0.21	0.21	0.10	0.30	0.02	0.34	0.26	0.31	0.18	0.40	0.34	0.16	0.12	0.22	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00