Doublet Group distance statistics: 43943

back

Distances from reference structure (by RMSD)

56, 76, 27, 9, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	B	0, 0.006, 0.074, 0.141, 0.364 max_d=0.364 avg_d=0.074 std_dev=0.067
N1	A	0, 0.013, 0.089, 0.165, 0.392 max_d=0.392 avg_d=0.089 std_dev=0.076
C1'	B	0, 0.041, 0.121, 0.200, 0.531 max_d=0.531 avg_d=0.121 std_dev=0.079
N9	B	0, 0.024, 0.104, 0.185, 0.558 max_d=0.558 avg_d=0.104 std_dev=0.080
C6	A	0, 0.037, 0.125, 0.213, 0.508 max_d=0.508 avg_d=0.125 std_dev=0.088
C5	B	0, 0.033, 0.126, 0.220, 0.500 max_d=0.500 avg_d=0.126 std_dev=0.094
N3	B	0, 0.047, 0.142, 0.236, 0.449 max_d=0.449 avg_d=0.142 std_dev=0.095
C1'	A	0, 0.039, 0.138, 0.238, 0.473 max_d=0.473 avg_d=0.138 std_dev=0.099
C2	A	0, 0.039, 0.146, 0.254, 0.556 max_d=0.556 avg_d=0.146 std_dev=0.107
C5	A	0, 0.047, 0.157, 0.268, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.157 std_dev=0.110
C6	B	0, 0.052, 0.165, 0.278, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.165 std_dev=0.113
O4'	A	0, 0.040, 0.154, 0.269, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.154 std_dev=0.114
C3'	A	0, 0.051, 0.167, 0.282, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.167 std_dev=0.115
N3	A	0, 0.044, 0.159, 0.275, 0.573 max_d=0.573 avg_d=0.159 std_dev=0.116
C4	A	0, 0.035, 0.153, 0.270, 0.640 max_d=0.640 avg_d=0.153 std_dev=0.118
N1	B	0, 0.062, 0.183, 0.304, 0.603 max_d=0.603 avg_d=0.183 std_dev=0.121
O4'	B	0, 0.040, 0.163, 0.286, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.163 std_dev=0.123
C4'	A	0, 0.056, 0.182, 0.307, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.182 std_dev=0.126
C2	B	0, 0.062, 0.189, 0.315, 0.574 max_d=0.574 avg_d=0.189 std_dev=0.126
C2'	A	0, 0.047, 0.175, 0.303, 0.650 max_d=0.650 avg_d=0.175 std_dev=0.128
O5'	A	0, 0.136, 0.265, 0.393, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.265 std_dev=0.128
C3'	B	0, 0.032, 0.169, 0.307, 0.880 max_d=0.880 avg_d=0.169 std_dev=0.138
C4'	B	0, 0.029, 0.169, 0.308, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.169 std_dev=0.139
C8	B	0, 0.052, 0.194, 0.336, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.194 std_dev=0.142
C5'	A	0, 0.102, 0.247, 0.393, 1.181 max_d=1.181 avg_d=0.247 std_dev=0.146
N7	B	0, 0.056, 0.208, 0.359, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.208 std_dev=0.152
O6	B	0, 0.089, 0.243, 0.398, 0.745 max_d=0.745 avg_d=0.243 std_dev=0.154
C2'	B	0, 0.000, 0.157, 0.314, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.157 std_dev=0.157
O3'	B	0, 0.045, 0.204, 0.362, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.204 std_dev=0.159
O4	A	0, 0.057, 0.218, 0.378, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.218 std_dev=0.160
O2	A	0, 0.064, 0.225, 0.386, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.225 std_dev=0.161
O3'	A	0, 0.067, 0.235, 0.402, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.235 std_dev=0.167
N2	B	0, 0.103, 0.289, 0.475, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.289 std_dev=0.186
O2'	A	0, 0.057, 0.251, 0.445, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.251 std_dev=0.194
C5'	B	0, 0.014, 0.252, 0.490, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.252 std_dev=0.238
P	A	0, 0.182, 0.445, 0.708, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.445 std_dev=0.263
O5'	B	0, 0.095, 0.379, 0.663, 2.010 max_d=2.010 avg_d=0.379 std_dev=0.284
P	B	0, 0.208, 0.500, 0.791, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.500 std_dev=0.292
O2'	B	0, -0.068, 0.240, 0.548, 2.713 max_d=2.713 avg_d=0.240 std_dev=0.308
OP2	A	0, 0.226, 0.585, 0.944, 2.534 max_d=2.534 avg_d=0.585 std_dev=0.359
OP1	A	0, 0.256, 0.618, 0.979, 2.419 max_d=2.419 avg_d=0.618 std_dev=0.362
OP1	B	0, 0.317, 0.810, 1.304, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.810 std_dev=0.494
OP2	B	0, 0.360, 0.948, 1.536, 1.925 max_d=1.925 avg_d=0.948 std_dev=0.588

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.08	0.08	0.14	0.10
C2	0.02	0.00	0.06	0.06	0.05	0.03	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.03	0.13	0.14	0.24	0.17
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.06	0.09	0.00	0.02	0.05	0.01	0.04	0.07	0.09	0.05
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.02	0.07	0.03	0.07	0.08	0.02	0.01	0.06	0.01	0.04	0.09	0.08	0.05
C4	0.04	0.05	0.04	0.05	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.06	0.00	0.05	0.16	0.22	0.32	0.23
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.04	0.05	0.02	0.05	0.00	0.02	0.07	0.05	0.02
C5	0.02	0.02	0.05	0.06	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.03	0.16	0.22	0.31	0.24
C5'	0.03	0.06	0.02	0.02	0.10	0.01	0.11	0.00	0.09	0.06	0.09	0.05	0.05	0.03	0.11	0.02	0.01	0.08	0.04	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.08	0.01	0.04	0.14	0.17	0.24	0.19
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.12	0.13	0.21	0.15
N3	0.02	0.01	0.06	0.07	0.02	0.04	0.02	0.09	0.03	0.02	0.00	0.01	0.06	0.08	0.01	0.03	0.15	0.19	0.30	0.21
O2	0.03	0.01	0.09	0.08	0.03	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.10	0.01	0.06	0.12	0.12	0.22	0.15
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.02	0.06	0.09	0.00	0.05	0.06	0.04	0.05	0.09	0.08	0.05
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.06	0.02	0.08	0.03	0.08	0.03	0.08	0.10	0.05	0.00	0.08	0.02	0.09	0.16	0.13	0.11
O4	0.02	0.01	0.05	0.06	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.04	0.17	0.25	0.35	0.27
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.03	0.06	0.04	0.02	0.04	0.00	0.07	0.09	0.12	0.09
O5'	0.08	0.13	0.04	0.04	0.16	0.02	0.16	0.01	0.14	0.12	0.15	0.12	0.05	0.09	0.17	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.14	0.07	0.09	0.22	0.07	0.22	0.08	0.17	0.13	0.19	0.12	0.09	0.16	0.25	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.24	0.09	0.08	0.32	0.05	0.31	0.04	0.24	0.21	0.30	0.22	0.08	0.13	0.35	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.17	0.05	0.05	0.23	0.02	0.24	0.01	0.19	0.15	0.21	0.15	0.05	0.11	0.27	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.31	0.15	0.13	0.19	0.12	0.21	0.18	0.26	0.18	0.31	0.39	0.24	0.20	0.16	0.29	0.15	0.12	0.13	0.28	0.24	0.25	0.14
C2	0.18	0.33	0.18	0.14	0.22	0.15	0.25	0.20	0.30	0.22	0.34	0.40	0.26	0.24	0.19	0.32	0.14	0.15	0.13	0.33	0.22	0.38	0.17
C2'	0.17	0.33	0.17	0.15	0.21	0.13	0.22	0.17	0.27	0.18	0.32	0.41	0.27	0.20	0.17	0.32	0.17	0.12	0.16	0.29	0.24	0.21	0.13
C3'	0.14	0.30	0.14	0.13	0.18	0.10	0.18	0.15	0.23	0.16	0.28	0.38	0.24	0.17	0.14	0.28	0.16	0.10	0.15	0.25	0.24	0.18	0.12
C4	0.22	0.27	0.22	0.18	0.22	0.18	0.25	0.23	0.28	0.27	0.28	0.33	0.22	0.28	0.23	0.33	0.17	0.19	0.19	0.31	0.25	0.50	0.23
C4'	0.14	0.28	0.13	0.12	0.17	0.11	0.18	0.16	0.22	0.18	0.27	0.37	0.23	0.18	0.14	0.26	0.15	0.11	0.14	0.25	0.26	0.19	0.14
C5	0.23	0.26	0.22	0.19	0.21	0.19	0.24	0.24	0.26	0.27	0.27	0.33	0.22	0.27	0.23	0.32	0.20	0.19	0.18	0.28	0.26	0.45	0.22
C5'	0.15	0.28	0.14	0.15	0.18	0.14	0.20	0.19	0.24	0.21	0.27	0.36	0.23	0.22	0.17	0.24	0.15	0.15	0.16	0.26	0.31	0.20	0.17
C6	0.20	0.27	0.19	0.17	0.20	0.17	0.22	0.22	0.25	0.24	0.28	0.35	0.22	0.24	0.20	0.30	0.18	0.16	0.15	0.28	0.25	0.35	0.18
N1	0.16	0.30	0.16	0.13	0.19	0.13	0.22	0.19	0.26	0.20	0.30	0.38	0.23	0.22	0.17	0.30	0.14	0.13	0.12	0.29	0.23	0.33	0.15
N3	0.20	0.31	0.21	0.16	0.23	0.17	0.26	0.22	0.30	0.25	0.33	0.38	0.25	0.27	0.22	0.33	0.15	0.18	0.17	0.34	0.23	0.47	0.22
O2	0.20	0.36	0.21	0.17	0.25	0.17	0.27	0.21	0.33	0.23	0.37	0.44	0.30	0.26	0.22	0.35	0.18	0.18	0.14	0.36	0.22	0.37	0.17
O2'	0.19	0.35	0.20	0.17	0.24	0.14	0.24	0.16	0.29	0.19	0.34	0.43	0.29	0.21	0.20	0.34	0.21	0.14	0.17	0.31	0.25	0.19	0.13
O3'	0.14	0.29	0.14	0.13	0.17	0.10	0.17	0.14	0.22	0.15	0.27	0.37	0.24	0.16	0.14	0.28	0.17	0.10	0.18	0.23	0.27	0.18	0.14
O4	0.25	0.25	0.26	0.23	0.21	0.21	0.21	0.19	0.22	0.25	0.24	0.33	0.23	0.23	0.23	0.37	0.24	0.21	0.19	0.24	0.23	0.55	0.24
O4'	0.15	0.28	0.14	0.13	0.17	0.13	0.19	0.19	0.23	0.19	0.28	0.37	0.22	0.20	0.16	0.27	0.14	0.13	0.15	0.26	0.28	0.23	0.16
O5'	0.18	0.27	0.16	0.16	0.19	0.16	0.21	0.20	0.24	0.24	0.27	0.34	0.22	0.24	0.19	0.25	0.15	0.17	0.17	0.26	0.30	0.22	0.18
OP1	0.31	0.32	0.29	0.28	0.32	0.29	0.35	0.31	0.36	0.40	0.35	0.35	0.30	0.40	0.34	0.30	0.25	0.32	0.30	0.39	0.42	0.36	0.30
OP2	0.21	0.30	0.19	0.21	0.22	0.20	0.26	0.24	0.29	0.28	0.31	0.36	0.24	0.29	0.23	0.24	0.19	0.20	0.21	0.33	0.30	0.18	0.19
P	0.21	0.28	0.19	0.19	0.22	0.19	0.25	0.21	0.28	0.29	0.29	0.34	0.23	0.29	0.23	0.23	0.16	0.21	0.20	0.31	0.33	0.23	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.08	0.00	0.15	0.02	0.25	0.30	0.14
C2	0.03	0.00	0.08	0.05	0.01	0.10	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.18	0.16	0.13	0.25	0.01	0.17	0.61	0.28
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.07	0.05	0.05	0.07	0.10	0.08	0.05	0.02	0.00	0.02	0.02	0.08	0.06	0.26	0.20	0.07
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.06	0.05	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.12	0.03	0.34	0.13	0.09
C4	0.01	0.01	0.05	0.02	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.11	0.07	0.24	0.01	0.19	0.51	0.24
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.07	0.06	0.09	0.12	0.09	0.05	0.02	0.06	0.02	0.01	0.01	0.07	0.29	0.12	0.07
C5	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.09	0.05	0.28	0.01	0.22	0.56	0.28
C5'	0.03	0.15	0.07	0.02	0.11	0.00	0.13	0.00	0.15	0.12	0.16	0.17	0.13	0.13	0.08	0.04	0.06	0.02	0.01	0.16	0.21	0.16	0.01
C6	0.02	0.00	0.05	0.03	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.11	0.08	0.29	0.00	0.22	0.63	0.31
C8	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.05	0.06	0.29	0.02	0.26	0.44	0.26
N1	0.02	0.00	0.07	0.03	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.14	0.11	0.27	0.01	0.19	0.64	0.30
N2	0.03	0.00	0.10	0.06	0.01	0.12	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.22	0.18	0.15	0.24	0.01	0.18	0.63	0.29
N3	0.03	0.00	0.08	0.05	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.15	0.12	0.22	0.01	0.17	0.53	0.24
N7	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.06	0.04	0.30	0.02	0.26	0.52	0.29
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.08	0.01	0.23	0.02	0.21	0.42	0.21
O2'	0.02	0.18	0.00	0.02	0.10	0.06	0.10	0.04	0.13	0.12	0.16	0.22	0.17	0.11	0.05	0.00	0.06	0.03	0.09	0.13	0.30	0.21	0.08
O3'	0.08	0.16	0.02	0.01	0.11	0.02	0.09	0.06	0.11	0.05	0.14	0.18	0.15	0.06	0.08	0.06	0.00	0.06	0.15	0.10	0.41	0.13	0.11
O4'	0.00	0.13	0.02	0.01	0.07	0.01	0.05	0.02	0.08	0.06	0.11	0.15	0.12	0.04	0.01	0.03	0.06	0.00	0.20	0.07	0.24	0.29	0.18
O5'	0.15	0.25	0.08	0.12	0.24	0.01	0.28	0.01	0.29	0.29	0.27	0.24	0.22	0.30	0.23	0.09	0.15	0.20	0.00	0.31	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.06	0.03	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.13	0.10	0.07	0.31	0.00	0.25	0.65	0.33
OP1	0.25	0.17	0.26	0.34	0.19	0.29	0.22	0.21	0.22	0.26	0.19	0.18	0.17	0.26	0.21	0.30	0.41	0.24	0.02	0.25	0.00	0.01	0.01
OP2	0.30	0.61	0.20	0.13	0.51	0.12	0.56	0.16	0.63	0.44	0.64	0.63	0.53	0.52	0.42	0.21	0.13	0.29	0.02	0.65	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.28	0.07	0.09	0.24	0.07	0.28	0.01	0.31	0.26	0.30	0.29	0.24	0.29	0.21	0.08	0.11	0.18	0.00	0.33	0.01	0.01	0.00