Doublet Group distance statistics: 44023

back

Distances from reference structure (by RMSD)

11, 36, 59, 9, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.063, 0.122, 0.180, 0.433 max_d=0.433 avg_d=0.122 std_dev=0.059
N1	B	0, 0.006, 0.070, 0.135, 0.410 max_d=0.410 avg_d=0.070 std_dev=0.065
N1	A	0, 0.065, 0.134, 0.203, 0.439 max_d=0.439 avg_d=0.134 std_dev=0.069
C2	B	0, 0.094, 0.178, 0.261, 0.480 max_d=0.480 avg_d=0.178 std_dev=0.084
C2	A	0, 0.083, 0.174, 0.264, 0.544 max_d=0.544 avg_d=0.174 std_dev=0.091
N9	A	0, 0.101, 0.193, 0.285, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.193 std_dev=0.092
N3	A	0, 0.059, 0.151, 0.243, 0.619 max_d=0.619 avg_d=0.151 std_dev=0.092
C5	A	0, 0.078, 0.171, 0.265, 0.544 max_d=0.544 avg_d=0.171 std_dev=0.094
C6	A	0, 0.071, 0.169, 0.267, 0.480 max_d=0.480 avg_d=0.169 std_dev=0.098
C6	B	0, 0.085, 0.201, 0.318, 0.572 max_d=0.572 avg_d=0.201 std_dev=0.116
C1'	A	0, 0.125, 0.244, 0.363, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.244 std_dev=0.119
C8	A	0, 0.149, 0.280, 0.411, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.280 std_dev=0.131
O4'	B	0, 0.162, 0.296, 0.429, 0.967 max_d=0.967 avg_d=0.296 std_dev=0.133
C1'	B	0, 0.074, 0.210, 0.346, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.210 std_dev=0.136
N3	B	0, 0.127, 0.266, 0.404, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.266 std_dev=0.138
N7	A	0, 0.139, 0.289, 0.439, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.289 std_dev=0.150
O2	B	0, 0.145, 0.311, 0.477, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.311 std_dev=0.166
C5	B	0, 0.135, 0.317, 0.499, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.317 std_dev=0.182
C4	B	0, 0.133, 0.320, 0.508, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.320 std_dev=0.188
N6	A	0, 0.035, 0.225, 0.415, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.225 std_dev=0.190
C4'	B	0, 0.209, 0.438, 0.668, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.438 std_dev=0.230
N4	B	0, 0.215, 0.453, 0.690, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.453 std_dev=0.238
C2'	A	0, 0.102, 0.347, 0.591, 1.766 max_d=1.766 avg_d=0.347 std_dev=0.244
C2'	B	0, 0.073, 0.322, 0.572, 1.490 max_d=1.490 avg_d=0.322 std_dev=0.250
C3'	B	0, 0.154, 0.424, 0.694, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.424 std_dev=0.270
O2'	A	0, 0.157, 0.442, 0.728, 2.341 max_d=2.341 avg_d=0.442 std_dev=0.285
O4'	A	0, 0.039, 0.333, 0.627, 2.390 max_d=2.390 avg_d=0.333 std_dev=0.294
C5'	B	0, 0.249, 0.565, 0.882, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.565 std_dev=0.317
O3'	B	0, 0.182, 0.507, 0.832, 1.957 max_d=1.957 avg_d=0.507 std_dev=0.325
C4'	A	0, -0.010, 0.364, 0.738, 2.848 max_d=2.848 avg_d=0.364 std_dev=0.374
C3'	A	0, 0.011, 0.397, 0.783, 2.836 max_d=2.836 avg_d=0.397 std_dev=0.386
O5'	B	0, 0.207, 0.606, 1.005, 3.031 max_d=3.031 avg_d=0.606 std_dev=0.399
O2'	B	0, -0.010, 0.450, 0.910, 3.311 max_d=3.311 avg_d=0.450 std_dev=0.460
O3'	A	0, 0.017, 0.529, 1.040, 3.995 max_d=3.995 avg_d=0.529 std_dev=0.512
C5'	A	0, -0.188, 0.474, 1.136, 5.338 max_d=5.338 avg_d=0.474 std_dev=0.662
OP1	B	0, 0.316, 1.017, 1.718, 5.694 max_d=5.694 avg_d=1.017 std_dev=0.701
P	B	0, 0.106, 0.818, 1.530, 5.362 max_d=5.362 avg_d=0.818 std_dev=0.712
OP2	B	0, 0.228, 1.078, 1.927, 6.292 max_d=6.292 avg_d=1.078 std_dev=0.850
O5'	A	0, -0.404, 0.502, 1.409, 7.367 max_d=7.367 avg_d=0.502 std_dev=0.906
P	A	0, -0.695, 0.562, 1.820, 10.141 max_d=10.141 avg_d=0.562 std_dev=1.258
OP1	A	0, -0.652, 0.643, 1.938, 10.512 max_d=10.512 avg_d=0.643 std_dev=1.295
OP2	A	0, -0.895, 0.599, 2.092, 11.982 max_d=11.982 avg_d=0.599 std_dev=1.494

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.08	0.08	0.13	0.07
C2	0.02	0.00	0.16	0.13	0.01	0.07	0.03	0.14	0.07	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.17	0.17	0.12	0.19	0.23	0.25	0.20
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.01	0.08	0.08	0.12	0.16	0.08	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.09	0.09	0.16	0.07
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.08	0.00	0.06	0.01	0.09	0.07	0.10	0.11	0.10	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.12	0.09	0.16	0.09
C4	0.01	0.01	0.08	0.08	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.09	0.06	0.15	0.18	0.25	0.18
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.06	0.05	0.06	0.04	0.06	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.10	0.02	0.03
C5	0.01	0.03	0.05	0.06	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.07	0.03	0.22	0.25	0.39	0.28
C5'	0.02	0.14	0.01	0.01	0.09	0.00	0.10	0.00	0.12	0.13	0.11	0.12	0.08	0.12	0.06	0.05	0.03	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.07	0.08	0.09	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.01	0.08	0.11	0.06	0.20	0.25	0.38	0.27
C8	0.01	0.02	0.08	0.07	0.01	0.06	0.00	0.13	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.08	0.08	0.33	0.29	0.49	0.38
N1	0.04	0.02	0.12	0.10	0.04	0.05	0.02	0.11	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.04	0.14	0.14	0.10	0.16	0.21	0.28	0.20
N3	0.02	0.01	0.16	0.11	0.00	0.06	0.01	0.12	0.04	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.15	0.12	0.16	0.19	0.19	0.16
N6	0.01	0.00	0.08	0.10	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.13	0.05	0.26	0.34	0.60	0.41
N7	0.01	0.03	0.05	0.05	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.07	0.04	0.32	0.33	0.55	0.42
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.18	0.16	0.27	0.19
O2'	0.01	0.17	0.00	0.02	0.08	0.04	0.05	0.05	0.08	0.07	0.14	0.16	0.08	0.05	0.02	0.00	0.04	0.03	0.04	0.11	0.07	0.04
O3'	0.02	0.17	0.02	0.01	0.09	0.02	0.07	0.03	0.11	0.08	0.14	0.15	0.13	0.07	0.03	0.04	0.00	0.02	0.13	0.12	0.14	0.08
O4'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.06	0.00	0.03	0.01	0.06	0.08	0.10	0.12	0.05	0.04	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.08	0.06	0.04
O5'	0.08	0.19	0.09	0.12	0.15	0.01	0.22	0.01	0.20	0.33	0.16	0.16	0.26	0.32	0.18	0.04	0.13	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.08	0.23	0.09	0.09	0.18	0.10	0.25	0.07	0.25	0.29	0.21	0.19	0.34	0.33	0.16	0.11	0.12	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.25	0.16	0.16	0.25	0.02	0.39	0.02	0.38	0.49	0.28	0.19	0.60	0.55	0.27	0.07	0.14	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.20	0.07	0.09	0.18	0.03	0.28	0.01	0.27	0.38	0.20	0.16	0.41	0.42	0.19	0.04	0.08	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.26	0.21	0.14	0.16	0.14	0.28	0.25	0.21	0.16	0.25	0.21	0.38	0.40	0.22	0.14	0.40	0.58	0.69	0.56
C2	0.26	0.27	0.32	0.25	0.20	0.20	0.27	0.23	0.24	0.23	0.24	0.22	0.37	0.53	0.31	0.21	0.45	0.71	0.86	0.68
C2'	0.21	0.29	0.18	0.22	0.18	0.21	0.22	0.27	0.20	0.20	0.30	0.15	0.40	0.29	0.22	0.21	0.31	0.47	0.60	0.45
C3'	0.39	0.39	0.34	0.43	0.31	0.41	0.38	0.43	0.38	0.37	0.36	0.15	0.47	0.33	0.37	0.41	0.34	0.41	0.51	0.37
C4	0.18	0.19	0.22	0.17	0.24	0.16	0.35	0.26	0.28	0.17	0.17	0.31	0.30	0.41	0.23	0.17	0.44	0.57	0.81	0.61
C4'	0.26	0.30	0.24	0.32	0.18	0.28	0.28	0.33	0.26	0.23	0.29	0.17	0.42	0.33	0.29	0.27	0.27	0.43	0.43	0.32
C5	0.19	0.16	0.19	0.20	0.37	0.21	0.46	0.31	0.37	0.22	0.20	0.43	0.21	0.35	0.22	0.22	0.46	0.51	0.85	0.60
C5'	0.38	0.31	0.38	0.50	0.32	0.47	0.50	0.54	0.47	0.36	0.25	0.28	0.40	0.35	0.42	0.44	0.42	0.49	0.48	0.39
C6	0.21	0.17	0.21	0.21	0.36	0.21	0.45	0.31	0.37	0.23	0.21	0.41	0.22	0.38	0.24	0.22	0.47	0.53	0.90	0.62
C8	0.22	0.19	0.20	0.22	0.46	0.26	0.54	0.37	0.43	0.27	0.24	0.56	0.19	0.28	0.21	0.28	0.48	0.49	0.80	0.57
N1	0.22	0.21	0.26	0.22	0.23	0.18	0.32	0.24	0.27	0.19	0.19	0.27	0.30	0.47	0.28	0.19	0.44	0.63	0.89	0.65
N3	0.26	0.30	0.31	0.23	0.19	0.19	0.26	0.23	0.23	0.23	0.27	0.22	0.40	0.52	0.30	0.19	0.45	0.68	0.82	0.66
N6	0.21	0.21	0.23	0.27	0.27	0.23	0.28	0.22	0.25	0.21	0.23	0.16	0.23	0.42	0.26	0.22	0.42	0.59	0.84	0.65
N7	0.26	0.24	0.23	0.26	0.50	0.29	0.57	0.39	0.47	0.31	0.31	0.57	0.19	0.29	0.24	0.30	0.49	0.47	0.85	0.59
N9	0.16	0.16	0.18	0.15	0.26	0.17	0.39	0.29	0.30	0.16	0.15	0.37	0.28	0.36	0.20	0.18	0.43	0.54	0.76	0.58
O2'	0.22	0.35	0.23	0.19	0.27	0.17	0.19	0.24	0.17	0.23	0.39	0.30	0.44	0.37	0.24	0.18	0.36	0.58	0.62	0.52
O3'	0.52	0.51	0.46	0.54	0.37	0.54	0.41	0.54	0.46	0.49	0.46	0.17	0.58	0.44	0.48	0.55	0.44	0.45	0.54	0.42
O4'	0.18	0.29	0.20	0.15	0.18	0.13	0.28	0.22	0.19	0.16	0.28	0.28	0.43	0.40	0.23	0.13	0.32	0.52	0.56	0.46
O5'	0.32	0.17	0.32	0.49	0.38	0.50	0.58	0.63	0.52	0.32	0.16	0.45	0.26	0.22	0.38	0.45	0.52	0.50	0.64	0.49
OP1	0.58	0.30	0.57	0.76	0.42	0.81	0.70	0.96	0.72	0.53	0.21	0.39	0.31	0.45	0.63	0.74	0.89	0.81	0.95	0.83
OP2	0.46	0.19	0.48	0.71	0.43	0.75	0.69	0.94	0.67	0.43	0.17	0.49	0.25	0.33	0.61	0.65	0.82	0.76	0.89	0.75
P	0.38	0.15	0.38	0.58	0.36	0.61	0.60	0.78	0.57	0.35	0.13	0.45	0.27	0.28	0.47	0.54	0.68	0.63	0.76	0.62

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.11	0.01	0.15	0.22	0.36	0.13
C2	0.02	0.00	0.06	0.05	0.02	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.09	0.05	0.21	0.33	0.39	0.21
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.09	0.06	0.01	0.05	0.03	0.11	0.00	0.02	0.01	0.26	0.14	0.55	0.25
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.08	0.00	0.11	0.03	0.09	0.05	0.08	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.17	0.19	0.47	0.17
C4	0.02	0.02	0.03	0.08	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.05	0.03	0.29	0.51	0.46	0.36
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.03	0.03	0.05	0.08	0.02	0.00	0.01	0.30	0.27	0.10
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.07	0.04	0.30	0.54	0.47	0.39
C5'	0.04	0.06	0.09	0.03	0.08	0.00	0.09	0.00	0.08	0.06	0.07	0.09	0.06	0.07	0.07	0.01	0.01	0.30	0.22	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.06	0.05	0.29	0.43	0.42	0.33
N1	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.22	0.31	0.39	0.22
N3	0.02	0.00	0.05	0.08	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.07	0.04	0.24	0.41	0.42	0.27
N4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.05	0.03	0.20	0.47	0.39	0.24
O2	0.02	0.00	0.11	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.18	0.16	0.08	0.17	0.29	0.38	0.15
O2'	0.02	0.11	0.00	0.01	0.11	0.08	0.12	0.07	0.12	0.06	0.11	0.05	0.18	0.00	0.03	0.05	0.22	0.27	0.59	0.21
O3'	0.11	0.09	0.02	0.01	0.05	0.02	0.07	0.07	0.06	0.06	0.07	0.05	0.16	0.03	0.00	0.08	0.12	0.39	0.42	0.18
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.04	0.03	0.08	0.05	0.08	0.00	0.10	0.26	0.22	0.08
O5'	0.15	0.21	0.26	0.17	0.29	0.01	0.30	0.01	0.29	0.22	0.24	0.20	0.17	0.22	0.12	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.22	0.33	0.14	0.19	0.51	0.30	0.54	0.30	0.43	0.31	0.41	0.47	0.29	0.27	0.39	0.26	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.36	0.39	0.55	0.47	0.46	0.27	0.47	0.22	0.42	0.39	0.42	0.39	0.38	0.59	0.42	0.22	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.21	0.25	0.17	0.36	0.10	0.39	0.01	0.33	0.22	0.27	0.24	0.15	0.21	0.18	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00