Doublet Group distance statistics: 44136

back

Distances from reference structure (by RMSD)

36, 31, 15, 15, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	B	0, 0.013, 0.088, 0.163, 0.327 max_d=0.327 avg_d=0.088 std_dev=0.075
C4	A	0, 0.007, 0.086, 0.165, 0.324 max_d=0.324 avg_d=0.086 std_dev=0.079
N3	A	0, 0.057, 0.148, 0.239, 0.424 max_d=0.424 avg_d=0.148 std_dev=0.091
N9	A	0, 0.019, 0.112, 0.206, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.112 std_dev=0.093
C5	A	0, 0.022, 0.133, 0.243, 0.544 max_d=0.544 avg_d=0.133 std_dev=0.111
C1'	B	0, 0.025, 0.136, 0.247, 0.509 max_d=0.509 avg_d=0.136 std_dev=0.111
C2	A	0, 0.060, 0.174, 0.288, 0.498 max_d=0.498 avg_d=0.174 std_dev=0.114
C1'	A	0, 0.027, 0.147, 0.267, 0.595 max_d=0.595 avg_d=0.147 std_dev=0.120
N1	A	0, 0.030, 0.162, 0.295, 0.604 max_d=0.604 avg_d=0.162 std_dev=0.133
C6	A	0, 0.040, 0.174, 0.309, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.174 std_dev=0.134
C8	A	0, 0.037, 0.174, 0.310, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.174 std_dev=0.136
C2	B	0, 0.006, 0.155, 0.303, 0.628 max_d=0.628 avg_d=0.155 std_dev=0.148
C6	B	0, 0.017, 0.167, 0.317, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.167 std_dev=0.150
C4	B	0, 0.044, 0.195, 0.345, 0.504 max_d=0.504 avg_d=0.195 std_dev=0.150
N7	A	0, 0.047, 0.199, 0.351, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.199 std_dev=0.152
N2	A	0, 0.096, 0.251, 0.407, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.251 std_dev=0.155
N3	B	0, 0.019, 0.187, 0.356, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.187 std_dev=0.168
C5	B	0, 0.038, 0.210, 0.383, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.210 std_dev=0.172
O6	A	0, 0.074, 0.250, 0.425, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.250 std_dev=0.176
C2'	A	0, 0.029, 0.206, 0.384, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.206 std_dev=0.177
O4'	B	0, 0.018, 0.196, 0.375, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.196 std_dev=0.179
O4'	A	0, 0.011, 0.203, 0.394, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.203 std_dev=0.192
O4	B	0, 0.058, 0.255, 0.451, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.255 std_dev=0.197
O2'	A	0, 0.037, 0.267, 0.496, 1.124 max_d=1.124 avg_d=0.267 std_dev=0.230
C2'	B	0, -0.003, 0.230, 0.462, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.230 std_dev=0.232
O2	B	0, 0.013, 0.248, 0.483, 1.366 max_d=1.366 avg_d=0.248 std_dev=0.235
C4'	B	0, 0.004, 0.248, 0.492, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.248 std_dev=0.244
C3'	B	0, -0.001, 0.261, 0.523, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.261 std_dev=0.262
C4'	A	0, -0.033, 0.247, 0.527, 1.501 max_d=1.501 avg_d=0.247 std_dev=0.280
C5'	A	0, -0.008, 0.300, 0.608, 2.388 max_d=2.388 avg_d=0.300 std_dev=0.308
C5'	B	0, 0.013, 0.329, 0.644, 1.481 max_d=1.481 avg_d=0.329 std_dev=0.316
C3'	A	0, -0.102, 0.270, 0.641, 2.018 max_d=2.018 avg_d=0.270 std_dev=0.371
O3'	B	0, -0.048, 0.405, 0.859, 2.225 max_d=2.225 avg_d=0.405 std_dev=0.453
O5'	A	0, -0.101, 0.360, 0.821, 3.081 max_d=3.081 avg_d=0.360 std_dev=0.461
O2'	B	0, -0.123, 0.360, 0.843, 2.490 max_d=2.490 avg_d=0.360 std_dev=0.483
P	A	0, -0.096, 0.458, 1.012, 3.717 max_d=3.717 avg_d=0.458 std_dev=0.554
O5'	B	0, -0.255, 0.384, 1.023, 3.741 max_d=3.741 avg_d=0.384 std_dev=0.639
O3'	A	0, -0.250, 0.404, 1.058, 3.476 max_d=3.476 avg_d=0.404 std_dev=0.654
OP1	A	0, -0.146, 0.516, 1.178, 4.694 max_d=4.694 avg_d=0.516 std_dev=0.662
P	B	0, -0.467, 0.435, 1.336, 4.830 max_d=4.830 avg_d=0.435 std_dev=0.901
OP2	A	0, -0.265, 0.713, 1.691, 6.150 max_d=6.150 avg_d=0.713 std_dev=0.978
OP2	B	0, -0.545, 0.527, 1.599, 5.924 max_d=5.924 avg_d=0.527 std_dev=1.072
OP1	B	0, -0.653, 0.630, 1.914, 6.853 max_d=6.853 avg_d=0.630 std_dev=1.283

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.04	0.06	0.04	0.01	0.01	0.02	0.13	0.01	0.11	0.02	0.17	0.25	0.16
C2	0.05	0.00	0.12	0.12	0.01	0.06	0.02	0.07	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.22	0.19	0.05	0.17	0.01	0.22	0.33	0.19
C2'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.10	0.06	0.07	0.09	0.13	0.12	0.05	0.02	0.01	0.03	0.01	0.23	0.05	0.21	0.32	0.25
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.10	0.01	0.15	0.02	0.15	0.19	0.14	0.12	0.11	0.20	0.10	0.02	0.01	0.01	0.15	0.10	0.18	0.18	0.11
C4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.16	0.10	0.03	0.19	0.01	0.19	0.36	0.19
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.07	0.11	0.06	0.07	0.05	0.11	0.05	0.15	0.03	0.00	0.02	0.08	0.12	0.14	0.05
C5	0.01	0.02	0.04	0.15	0.01	0.08	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.10	0.03	0.27	0.01	0.20	0.46	0.24
C5'	0.04	0.07	0.10	0.02	0.07	0.01	0.12	0.00	0.12	0.14	0.09	0.06	0.06	0.16	0.07	0.07	0.11	0.01	0.01	0.15	0.12	0.10	0.01
C6	0.02	0.03	0.06	0.15	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.20	0.11	0.03	0.27	0.01	0.21	0.48	0.26
C8	0.02	0.02	0.07	0.19	0.01	0.11	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.11	0.15	0.04	0.30	0.03	0.17	0.47	0.24
N1	0.04	0.01	0.09	0.14	0.02	0.06	0.01	0.09	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.21	0.13	0.04	0.22	0.01	0.22	0.40	0.22
N2	0.06	0.01	0.13	0.12	0.02	0.07	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.20	0.17	0.07	0.13	0.02	0.23	0.28	0.16
N3	0.04	0.01	0.12	0.11	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.19	0.05	0.15	0.01	0.21	0.30	0.18
N7	0.01	0.02	0.05	0.20	0.01	0.11	0.00	0.16	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.15	0.04	0.33	0.03	0.19	0.55	0.29
N9	0.01	0.02	0.02	0.10	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.10	0.07	0.01	0.19	0.02	0.17	0.34	0.18
O2'	0.02	0.22	0.01	0.02	0.16	0.15	0.17	0.07	0.20	0.11	0.21	0.20	0.19	0.14	0.10	0.00	0.05	0.11	0.16	0.07	0.17	0.34	0.21
O3'	0.13	0.19	0.03	0.01	0.10	0.03	0.10	0.11	0.11	0.15	0.13	0.17	0.19	0.15	0.07	0.05	0.00	0.09	0.16	0.12	0.34	0.20	0.18
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.04	0.07	0.05	0.04	0.01	0.11	0.09	0.00	0.09	0.04	0.20	0.26	0.16
O5'	0.11	0.17	0.23	0.15	0.19	0.02	0.27	0.01	0.27	0.30	0.22	0.13	0.15	0.33	0.19	0.16	0.16	0.09	0.00	0.29	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.07	0.12	0.04	0.29	0.00	0.23	0.56	0.30
OP1	0.17	0.22	0.21	0.18	0.19	0.12	0.20	0.12	0.21	0.17	0.22	0.23	0.21	0.19	0.17	0.17	0.34	0.20	0.02	0.23	0.00	0.01	0.01
OP2	0.25	0.33	0.32	0.18	0.36	0.14	0.46	0.10	0.48	0.47	0.40	0.28	0.30	0.55	0.34	0.34	0.20	0.26	0.02	0.56	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.19	0.25	0.11	0.19	0.05	0.24	0.01	0.26	0.24	0.22	0.16	0.18	0.29	0.18	0.21	0.18	0.16	0.01	0.30	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.20	0.18	0.22	0.27	0.20	0.30	0.25	0.27	0.20	0.22	0.19	0.17	0.25	0.27	0.21	0.23	0.15	0.17	0.08
C2	0.26	0.29	0.28	0.26	0.29	0.25	0.28	0.29	0.26	0.26	0.30	0.30	0.34	0.26	0.27	0.27	0.28	0.22	0.49	0.21
C2'	0.19	0.21	0.14	0.22	0.26	0.20	0.29	0.24	0.27	0.21	0.22	0.19	0.13	0.28	0.25	0.23	0.28	0.08	0.24	0.15
C3'	0.17	0.23	0.16	0.11	0.29	0.09	0.30	0.12	0.26	0.21	0.25	0.22	0.13	0.20	0.29	0.17	0.09	0.08	0.06	0.02
C4	0.18	0.23	0.23	0.22	0.28	0.18	0.27	0.22	0.23	0.20	0.26	0.23	0.25	0.24	0.26	0.19	0.23	0.14	0.42	0.16
C4'	0.21	0.21	0.13	0.18	0.27	0.19	0.29	0.19	0.28	0.22	0.22	0.20	0.16	0.27	0.26	0.24	0.11	0.21	0.14	0.09
C5	0.18	0.26	0.25	0.23	0.30	0.17	0.27	0.19	0.23	0.21	0.28	0.26	0.29	0.26	0.27	0.18	0.23	0.20	0.51	0.23
C5'	0.20	0.22	0.17	0.15	0.29	0.17	0.29	0.16	0.26	0.22	0.25	0.22	0.16	0.25	0.29	0.23	0.10	0.31	0.23	0.16
C6	0.22	0.29	0.28	0.23	0.31	0.18	0.28	0.20	0.24	0.24	0.32	0.30	0.35	0.26	0.30	0.20	0.23	0.21	0.55	0.24
C8	0.18	0.24	0.23	0.24	0.29	0.18	0.30	0.20	0.25	0.22	0.26	0.23	0.23	0.30	0.28	0.19	0.25	0.24	0.42	0.25
N1	0.25	0.31	0.29	0.25	0.31	0.22	0.28	0.24	0.25	0.26	0.33	0.32	0.36	0.26	0.29	0.24	0.25	0.20	0.55	0.23
N2	0.32	0.32	0.30	0.29	0.28	0.31	0.29	0.32	0.30	0.31	0.31	0.33	0.32	0.29	0.23	0.33	0.31	0.26	0.36	0.26
N3	0.22	0.25	0.25	0.24	0.27	0.24	0.27	0.28	0.24	0.22	0.26	0.25	0.28	0.25	0.26	0.24	0.27	0.21	0.42	0.18
N7	0.18	0.25	0.25	0.25	0.30	0.18	0.29	0.19	0.24	0.22	0.28	0.25	0.28	0.31	0.28	0.18	0.26	0.28	0.52	0.29
N9	0.17	0.22	0.20	0.21	0.28	0.17	0.29	0.21	0.24	0.20	0.24	0.21	0.20	0.25	0.27	0.18	0.22	0.12	0.34	0.13
O2'	0.19	0.18	0.22	0.26	0.25	0.28	0.27	0.34	0.25	0.19	0.21	0.17	0.19	0.30	0.27	0.26	0.37	0.15	0.26	0.20
O3'	0.24	0.31	0.17	0.17	0.34	0.14	0.33	0.13	0.32	0.28	0.33	0.32	0.17	0.26	0.35	0.24	0.02	0.02	0.03	0.01
O4'	0.20	0.20	0.15	0.20	0.26	0.20	0.29	0.22	0.27	0.21	0.22	0.19	0.16	0.26	0.27	0.23	0.17	0.22	0.09	0.08
O5'	0.20	0.25	0.31	0.16	0.30	0.14	0.28	0.15	0.24	0.22	0.27	0.25	0.28	0.17	0.30	0.17	0.12	0.35	0.26	0.20
O6	0.22	0.30	0.24	0.23	0.32	0.17	0.28	0.17	0.25	0.25	0.33	0.30	0.23	0.27	0.28	0.20	0.18	0.23	0.25	0.17
OP1	0.23	0.23	0.32	0.28	0.28	0.28	0.27	0.30	0.25	0.23	0.25	0.23	0.32	0.38	0.29	0.25	0.28	0.57	0.32	0.35
OP2	0.38	0.42	0.56	0.36	0.47	0.29	0.44	0.29	0.40	0.40	0.44	0.42	0.58	0.31	0.46	0.29	0.25	0.53	0.44	0.35
P	0.23	0.29	0.37	0.20	0.35	0.16	0.33	0.17	0.28	0.26	0.32	0.29	0.35	0.20	0.35	0.19	0.15	0.43	0.29	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.14	0.03	0.01	0.10	0.14	0.14	0.11
C2	0.02	0.00	0.13	0.14	0.04	0.05	0.02	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.01	0.08	0.16	0.23	0.33	0.19
C2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.06	0.01	0.09	0.09	0.12	0.02	0.10	0.22	0.00	0.02	0.06	0.01	0.07	0.20	0.10	0.07
C3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.17	0.01	0.15	0.02	0.12	0.10	0.17	0.16	0.02	0.01	0.18	0.02	0.18	0.32	0.13	0.18
C4	0.04	0.04	0.06	0.17	0.00	0.09	0.01	0.16	0.01	0.03	0.01	0.03	0.17	0.11	0.00	0.05	0.25	0.29	0.55	0.31
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.09	0.00	0.11	0.01	0.10	0.05	0.06	0.07	0.14	0.03	0.09	0.00	0.02	0.13	0.12	0.03
C5	0.03	0.02	0.09	0.15	0.01	0.11	0.00	0.18	0.01	0.02	0.02	0.02	0.23	0.10	0.01	0.06	0.29	0.30	0.57	0.35
C5'	0.04	0.10	0.09	0.02	0.16	0.01	0.18	0.00	0.15	0.09	0.13	0.11	0.07	0.11	0.18	0.02	0.01	0.17	0.19	0.02
C6	0.02	0.01	0.12	0.12	0.01	0.10	0.01	0.15	0.00	0.01	0.03	0.01	0.21	0.08	0.02	0.08	0.26	0.25	0.43	0.29
N1	0.01	0.01	0.02	0.10	0.03	0.05	0.02	0.09	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.06	0.02	0.02	0.17	0.18	0.30	0.18
N3	0.03	0.01	0.10	0.17	0.01	0.06	0.02	0.13	0.03	0.02	0.00	0.01	0.10	0.11	0.01	0.07	0.19	0.26	0.44	0.24
O2	0.03	0.01	0.22	0.16	0.03	0.07	0.02	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.18	0.18	0.02	0.13	0.16	0.27	0.26	0.19
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.17	0.14	0.23	0.07	0.21	0.10	0.10	0.18	0.00	0.05	0.19	0.10	0.12	0.28	0.09	0.12
O3'	0.14	0.11	0.02	0.01	0.11	0.03	0.10	0.11	0.08	0.06	0.11	0.18	0.05	0.00	0.12	0.10	0.25	0.48	0.24	0.29
O4	0.03	0.01	0.06	0.18	0.00	0.09	0.01	0.18	0.02	0.02	0.01	0.02	0.19	0.12	0.00	0.05	0.25	0.32	0.61	0.33
O4'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.05	0.00	0.06	0.02	0.08	0.02	0.07	0.13	0.10	0.10	0.05	0.00	0.12	0.17	0.13	0.14
O5'	0.10	0.16	0.07	0.18	0.25	0.02	0.29	0.01	0.26	0.17	0.19	0.16	0.12	0.25	0.25	0.12	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.14	0.23	0.20	0.32	0.29	0.13	0.30	0.17	0.25	0.18	0.26	0.27	0.28	0.48	0.32	0.17	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.33	0.10	0.13	0.55	0.12	0.57	0.19	0.43	0.30	0.44	0.26	0.09	0.24	0.61	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.19	0.07	0.18	0.31	0.03	0.35	0.02	0.29	0.18	0.24	0.19	0.12	0.29	0.33	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00