Doublet Group distance statistics: 44154

back

Distances from reference structure (by RMSD)

45, 11, 13, 52, 0, 10, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	B	0, 0.020, 0.068, 0.116, 0.200 max_d=0.200 avg_d=0.068 std_dev=0.048
C5	B	0, 0.045, 0.111, 0.177, 0.381 max_d=0.381 avg_d=0.111 std_dev=0.066
N1	A	0, 0.054, 0.133, 0.213, 0.283 max_d=0.283 avg_d=0.133 std_dev=0.080
N3	B	0, 0.060, 0.148, 0.237, 0.356 max_d=0.356 avg_d=0.148 std_dev=0.088
N1	B	0, 0.051, 0.146, 0.240, 0.524 max_d=0.524 avg_d=0.146 std_dev=0.095
C6	B	0, 0.026, 0.122, 0.218, 0.473 max_d=0.473 avg_d=0.122 std_dev=0.096
N9	B	0, 0.019, 0.127, 0.234, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.127 std_dev=0.108
C2	B	0, 0.074, 0.185, 0.295, 0.509 max_d=0.509 avg_d=0.185 std_dev=0.110
N7	B	0, 0.103, 0.225, 0.347, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.225 std_dev=0.122
C8	B	0, 0.087, 0.220, 0.352, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.220 std_dev=0.132
N6	B	0, 0.008, 0.156, 0.303, 0.597 max_d=0.597 avg_d=0.156 std_dev=0.147
C6	A	0, 0.066, 0.223, 0.380, 0.582 max_d=0.582 avg_d=0.223 std_dev=0.157
N3	A	0, 0.006, 0.178, 0.350, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.178 std_dev=0.172
C2'	B	0, 0.081, 0.265, 0.448, 0.702 max_d=0.702 avg_d=0.265 std_dev=0.183
C2	A	0, 0.082, 0.266, 0.450, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.266 std_dev=0.184
C1'	B	0, -0.041, 0.147, 0.335, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.147 std_dev=0.188
C4	A	0, 0.076, 0.315, 0.555, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.315 std_dev=0.240
O4'	B	0, 0.026, 0.276, 0.527, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.276 std_dev=0.251
C3'	B	0, 0.108, 0.362, 0.615, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.362 std_dev=0.254
O4'	A	0, 0.041, 0.301, 0.562, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.301 std_dev=0.260
C1'	A	0, 0.109, 0.373, 0.636, 0.881 max_d=0.881 avg_d=0.373 std_dev=0.264
O2'	B	0, 0.104, 0.369, 0.634, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.369 std_dev=0.265
C4'	B	0, 0.079, 0.353, 0.627, 1.144 max_d=1.144 avg_d=0.353 std_dev=0.274
C5	A	0, 0.134, 0.413, 0.691, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.413 std_dev=0.278
N4	A	0, 0.139, 0.433, 0.726, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.433 std_dev=0.294
C4'	A	0, 0.165, 0.470, 0.776, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.470 std_dev=0.306
O3'	B	0, 0.144, 0.484, 0.824, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.484 std_dev=0.340
O2	A	0, 0.181, 0.549, 0.917, 1.290 max_d=1.290 avg_d=0.549 std_dev=0.368
C5'	B	0, 0.130, 0.531, 0.931, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.531 std_dev=0.401
C5'	A	0, 0.110, 0.519, 0.929, 1.873 max_d=1.873 avg_d=0.519 std_dev=0.410
C2'	A	0, 0.196, 0.655, 1.115, 1.235 max_d=1.235 avg_d=0.655 std_dev=0.459
P	B	0, 0.192, 0.654, 1.116, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.654 std_dev=0.462
OP1	B	0, 0.232, 0.694, 1.157, 1.697 max_d=1.697 avg_d=0.694 std_dev=0.462
C3'	A	0, 0.197, 0.662, 1.127, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.662 std_dev=0.465
O5'	B	0, 0.172, 0.637, 1.102, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.637 std_dev=0.465
OP2	B	0, 0.225, 0.693, 1.162, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.693 std_dev=0.468
O2'	A	0, 0.276, 0.945, 1.613, 1.970 max_d=1.970 avg_d=0.945 std_dev=0.669
O3'	A	0, 0.286, 0.997, 1.708, 1.978 max_d=1.978 avg_d=0.997 std_dev=0.711
O5'	A	0, 0.261, 1.227, 2.193, 2.401 max_d=2.401 avg_d=1.227 std_dev=0.966
P	A	0, 0.345, 2.025, 3.705, 4.134 max_d=4.134 avg_d=2.025 std_dev=1.680
OP1	A	0, 0.355, 2.133, 3.911, 4.531 max_d=4.531 avg_d=2.133 std_dev=1.778
OP2	A	0, 0.363, 3.293, 6.222, 6.733 max_d=6.733 avg_d=3.293 std_dev=2.929

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.23	0.11	0.16	0.21
C2	0.02	0.00	0.05	0.08	0.05	0.04	0.02	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.02	0.52	0.39	0.90	0.67
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.05	0.04	0.09	0.00	0.01	0.01	0.32	0.31	0.19	0.18
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.08	0.05	0.08	0.09	0.10	0.01	0.01	0.01	0.41	0.56	0.17	0.24
C4	0.04	0.05	0.05	0.09	0.00	0.09	0.01	0.17	0.02	0.04	0.02	0.00	0.03	0.05	0.10	0.05	0.77	0.76	1.79	1.16
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.08	0.05	0.06	0.07	0.05	0.04	0.02	0.00	0.01	0.17	0.58	0.12
C5	0.02	0.02	0.05	0.09	0.01	0.09	0.00	0.17	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.11	0.04	0.82	0.85	1.91	1.25
C5'	0.03	0.10	0.01	0.01	0.17	0.01	0.17	0.00	0.15	0.10	0.13	0.13	0.08	0.04	0.03	0.01	0.01	0.42	0.39	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.08	0.02	0.08	0.00	0.15	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.09	0.04	0.72	0.66	1.40	0.99
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.04	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.51	0.39	0.82	0.64
N3	0.01	0.01	0.05	0.08	0.02	0.06	0.02	0.13	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.05	0.09	0.02	0.65	0.57	1.36	0.93
N4	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.11	0.02	0.86	0.94	2.18	1.38
O2	0.03	0.01	0.09	0.10	0.03	0.05	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.09	0.11	0.03	0.39	0.22	0.52	0.45
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.05	0.04	0.03	0.04	0.03	0.02	0.05	0.03	0.09	0.00	0.03	0.04	0.08	0.13	0.74	0.19
O3'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.10	0.02	0.11	0.03	0.09	0.05	0.09	0.11	0.11	0.03	0.00	0.02	0.32	0.61	0.59	0.09
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.00	0.09	0.11	0.21	0.08
O5'	0.23	0.52	0.32	0.41	0.77	0.01	0.82	0.01	0.72	0.51	0.65	0.86	0.39	0.08	0.32	0.09	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.11	0.39	0.31	0.56	0.76	0.17	0.85	0.42	0.66	0.39	0.57	0.94	0.22	0.13	0.61	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.90	0.19	0.17	1.79	0.58	1.91	0.39	1.40	0.82	1.36	2.18	0.52	0.74	0.59	0.21	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.21	0.67	0.18	0.24	1.16	0.12	1.25	0.01	0.99	0.64	0.93	1.38	0.45	0.19	0.09	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.25	0.27	0.30	0.20	0.23	0.21	0.24	0.22	0.17	0.23	0.22	0.12	0.19	0.18	0.27	0.36	0.17	0.19	0.33	0.16	0.20
C2	0.32	0.24	0.41	0.46	0.23	0.42	0.18	0.43	0.17	0.21	0.19	0.25	0.11	0.17	0.25	0.46	0.57	0.33	0.34	0.46	0.25	0.32
C2'	0.17	0.14	0.14	0.16	0.14	0.21	0.14	0.25	0.16	0.15	0.15	0.14	0.13	0.15	0.15	0.17	0.20	0.22	0.20	0.40	0.14	0.22
C3'	0.40	0.35	0.32	0.29	0.38	0.39	0.38	0.41	0.39	0.40	0.38	0.37	0.17	0.39	0.39	0.34	0.27	0.44	0.36	0.51	0.33	0.40
C4	0.37	0.17	0.41	0.47	0.21	0.49	0.15	0.52	0.15	0.22	0.14	0.22	0.11	0.16	0.26	0.50	0.59	0.44	0.39	0.51	0.21	0.36
C4'	0.21	0.31	0.16	0.11	0.27	0.18	0.31	0.23	0.35	0.26	0.34	0.28	0.18	0.30	0.24	0.14	0.10	0.24	0.20	0.37	0.19	0.24
C5	0.32	0.14	0.33	0.39	0.19	0.44	0.18	0.49	0.20	0.22	0.17	0.18	0.13	0.19	0.24	0.41	0.50	0.42	0.37	0.52	0.19	0.36
C5'	0.34	0.44	0.24	0.17	0.41	0.28	0.45	0.31	0.51	0.39	0.49	0.41	0.22	0.44	0.38	0.23	0.11	0.37	0.27	0.41	0.26	0.31
C6	0.23	0.13	0.25	0.31	0.13	0.35	0.15	0.40	0.19	0.17	0.17	0.13	0.13	0.16	0.17	0.31	0.42	0.32	0.30	0.47	0.16	0.31
N1	0.21	0.16	0.29	0.34	0.13	0.32	0.13	0.35	0.14	0.13	0.14	0.15	0.12	0.12	0.15	0.33	0.44	0.25	0.27	0.43	0.17	0.27
N3	0.38	0.23	0.46	0.51	0.25	0.50	0.18	0.51	0.16	0.23	0.18	0.27	0.11	0.17	0.29	0.53	0.63	0.41	0.40	0.51	0.25	0.36
N4	0.13	0.12	0.19	0.26	0.13	0.13	0.16	0.12	0.17	0.16	0.16	0.12	0.11	0.17	0.13	0.18	0.39	0.18	0.12	0.19	0.13	0.12
O2	0.37	0.34	0.47	0.51	0.32	0.44	0.28	0.42	0.27	0.29	0.29	0.34	0.11	0.26	0.33	0.51	0.60	0.35	0.36	0.43	0.33	0.35
O2'	0.17	0.26	0.16	0.13	0.23	0.12	0.25	0.12	0.26	0.23	0.25	0.22	0.12	0.26	0.21	0.14	0.12	0.15	0.13	0.27	0.13	0.14
O3'	0.64	0.56	0.59	0.55	0.61	0.61	0.59	0.60	0.57	0.62	0.56	0.60	0.18	0.60	0.62	0.60	0.52	0.65	0.56	0.65	0.56	0.59
O4'	0.17	0.32	0.26	0.27	0.25	0.18	0.27	0.19	0.31	0.20	0.32	0.27	0.16	0.25	0.20	0.24	0.33	0.14	0.15	0.32	0.11	0.17
O5'	0.30	0.53	0.22	0.15	0.44	0.27	0.51	0.35	0.63	0.36	0.63	0.46	0.21	0.45	0.35	0.21	0.13	0.32	0.26	0.52	0.20	0.35
OP1	0.47	0.65	0.44	0.36	0.55	0.43	0.57	0.47	0.68	0.46	0.70	0.59	0.35	0.50	0.48	0.43	0.34	0.49	0.37	0.54	0.33	0.44
OP2	1.66	2.35	1.64	1.39	2.10	1.22	2.22	0.99	2.48	1.80	2.51	2.18	0.28	2.04	1.84	1.58	1.27	1.41	1.09	0.66	1.04	0.82
P	0.77	1.21	0.72	0.56	1.05	0.52	1.14	0.45	1.32	0.87	1.33	1.10	0.25	1.02	0.89	0.69	0.47	0.66	0.45	0.46	0.41	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.05	0.09	0.11	0.07
C2	0.03	0.00	0.06	0.05	0.01	0.03	0.04	0.04	0.07	0.03	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.09	0.07	0.03	0.11	0.14	0.18	0.13
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.06	0.06	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.07	0.16	0.09	0.06
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.06	0.06	0.05	0.03	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.08	0.19	0.08	0.08
C4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.04	0.02	0.11	0.13	0.17	0.13
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.05	0.03	0.03	0.03	0.05	0.02	0.05	0.02	0.00	0.01	0.10	0.08	0.02
C5	0.01	0.04	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.02	0.15	0.16	0.20	0.16
C5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.07	0.07	0.05	0.04	0.07	0.08	0.04	0.05	0.03	0.01	0.01	0.08	0.09	0.01
C6	0.03	0.07	0.04	0.05	0.02	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.02	0.07	0.06	0.03	0.15	0.18	0.22	0.17
C8	0.01	0.03	0.03	0.06	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.07	0.02	0.15	0.15	0.18	0.15
N1	0.03	0.02	0.06	0.06	0.03	0.03	0.01	0.05	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.08	0.03	0.13	0.15	0.20	0.15
N3	0.03	0.00	0.06	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.06	0.03	0.09	0.12	0.16	0.11
N6	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.04	0.02	0.09	0.17	0.27	0.19
N7	0.01	0.03	0.03	0.06	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.07	0.02	0.17	0.18	0.22	0.18
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.11	0.12	0.15	0.11
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.07	0.02	0.08	0.08	0.05	0.02	0.02	0.00	0.03	0.04	0.04	0.15	0.08	0.04
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.04	0.02	0.06	0.03	0.06	0.07	0.08	0.06	0.04	0.07	0.04	0.03	0.00	0.02	0.08	0.25	0.11	0.10
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.05	0.05	0.12	0.08
O5'	0.05	0.11	0.07	0.08	0.11	0.01	0.15	0.01	0.15	0.15	0.13	0.09	0.09	0.17	0.11	0.04	0.08	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.09	0.14	0.16	0.19	0.13	0.10	0.16	0.08	0.18	0.15	0.15	0.12	0.17	0.18	0.12	0.15	0.25	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.18	0.09	0.08	0.17	0.08	0.20	0.09	0.22	0.18	0.20	0.16	0.27	0.22	0.15	0.08	0.11	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.13	0.06	0.08	0.13	0.02	0.16	0.01	0.17	0.15	0.15	0.11	0.19	0.18	0.11	0.04	0.10	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00