Doublet Group distance statistics: 48036

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 8, 10, 11, 10, 9, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.005, 0.009, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.005 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.006, 0.010, 0.014, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.018, 0.026, 0.034, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.026 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.026, 0.036, 0.046, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.036 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.027, 0.038, 0.048, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.038 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.021, 0.034, 0.046, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.034 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.023, 0.035, 0.048, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.035 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.050, 0.077, 0.104, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.077 std_dev=0.027
N4	A	0, 0.077, 0.121, 0.166, 0.185 max_d=0.185 avg_d=0.121 std_dev=0.044
C2'	A	0, 0.159, 0.221, 0.284, 0.348 max_d=0.348 avg_d=0.221 std_dev=0.062
O4'	A	0, 0.021, 0.106, 0.191, 0.375 max_d=0.375 avg_d=0.106 std_dev=0.085
C6	B	0, 0.245, 0.363, 0.481, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.363 std_dev=0.118
OP2	B	0, 0.211, 0.349, 0.487, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.349 std_dev=0.138
C4'	A	0, 0.556, 0.696, 0.836, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.696 std_dev=0.140
N1	B	0, 0.219, 0.372, 0.525, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.372 std_dev=0.153
C5	B	0, 0.501, 0.660, 0.819, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.660 std_dev=0.159
P	B	0, 0.419, 0.580, 0.740, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.580 std_dev=0.161
C1'	B	0, 0.206, 0.373, 0.540, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.373 std_dev=0.167
O2'	A	0, 1.021, 1.210, 1.398, 1.463 max_d=1.463 avg_d=1.210 std_dev=0.188
O5'	B	0, 0.285, 0.476, 0.666, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.476 std_dev=0.190
OP1	B	0, 0.690, 0.901, 1.112, 1.278 max_d=1.278 avg_d=0.901 std_dev=0.211
O4'	B	0, 0.378, 0.600, 0.822, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.600 std_dev=0.222
C4	B	0, 0.777, 1.006, 1.235, 1.534 max_d=1.534 avg_d=1.006 std_dev=0.229
C5'	A	0, 0.757, 0.986, 1.215, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.986 std_dev=0.229
C2	B	0, 0.500, 0.730, 0.960, 1.465 max_d=1.465 avg_d=0.730 std_dev=0.230
C3'	A	0, 1.438, 1.701, 1.964, 1.930 max_d=1.930 avg_d=1.701 std_dev=0.263
N3	B	0, 0.786, 1.050, 1.315, 1.791 max_d=1.791 avg_d=1.050 std_dev=0.265
O2'	B	0, 0.771, 1.047, 1.323, 2.088 max_d=2.088 avg_d=1.047 std_dev=0.276
N4	B	0, 1.008, 1.299, 1.589, 1.995 max_d=1.995 avg_d=1.299 std_dev=0.291
C4'	B	0, 0.577, 0.871, 1.165, 1.877 max_d=1.877 avg_d=0.871 std_dev=0.294
O2	B	0, 0.492, 0.788, 1.083, 1.848 max_d=1.848 avg_d=0.788 std_dev=0.295
C2'	B	0, 0.444, 0.741, 1.038, 2.046 max_d=2.046 avg_d=0.741 std_dev=0.297
C5'	B	0, 0.629, 0.953, 1.278, 2.069 max_d=2.069 avg_d=0.953 std_dev=0.325
C3'	B	0, 0.518, 0.858, 1.199, 2.341 max_d=2.341 avg_d=0.858 std_dev=0.340
O3'	B	0, 0.853, 1.287, 1.720, 3.111 max_d=3.111 avg_d=1.287 std_dev=0.433
O3'	A	0, 2.790, 3.281, 3.771, 3.551 max_d=3.551 avg_d=3.281 std_dev=0.491
O5'	A	0, 2.762, 3.283, 3.805, 3.767 max_d=3.767 avg_d=3.283 std_dev=0.522
P	A	0, 3.709, 4.440, 5.172, 5.142 max_d=5.142 avg_d=4.440 std_dev=0.731
OP1	A	0, 4.208, 5.002, 5.797, 5.725 max_d=5.725 avg_d=5.002 std_dev=0.795
OP2	A	0, 4.238, 5.160, 6.083, 6.078 max_d=6.078 avg_d=5.160 std_dev=0.922

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.18	0.28	0.13
C2	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.06	0.03	0.08	0.24	0.33	0.18
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.03	0.04	0.09	0.00	0.02	0.01	0.07	0.27	0.34	0.21
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.02	0.04	0.05	0.02	0.01	0.01	0.05	0.20	0.27	0.15
C4	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.04	0.02	0.15	0.32	0.41	0.25
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.03	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.06	0.14	0.04
C5	0.01	0.01	0.06	0.06	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.05	0.04	0.17	0.33	0.44	0.27
C5'	0.03	0.07	0.02	0.01	0.11	0.00	0.12	0.00	0.11	0.07	0.09	0.12	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.04	0.15	0.30	0.39	0.23
N1	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.09	0.24	0.33	0.18
N3	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.05	0.03	0.11	0.28	0.37	0.21
N4	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.04	0.03	0.16	0.35	0.44	0.28
O2	0.01	0.00	0.09	0.05	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.08	0.06	0.05	0.21	0.29	0.15
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.05	0.02	0.07	0.02	0.07	0.03	0.06	0.06	0.14	0.00	0.05	0.02	0.07	0.32	0.39	0.24
O3'	0.05	0.06	0.02	0.01	0.04	0.02	0.05	0.02	0.05	0.04	0.05	0.04	0.08	0.05	0.00	0.04	0.03	0.15	0.26	0.12
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.06	0.02	0.04	0.00	0.02	0.08	0.18	0.05
O5'	0.04	0.08	0.07	0.05	0.15	0.01	0.17	0.01	0.15	0.09	0.11	0.16	0.05	0.07	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.18	0.24	0.27	0.20	0.32	0.06	0.33	0.03	0.30	0.24	0.28	0.35	0.21	0.32	0.15	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.28	0.33	0.34	0.27	0.41	0.14	0.44	0.07	0.39	0.33	0.37	0.44	0.29	0.39	0.26	0.18	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.18	0.21	0.15	0.25	0.04	0.27	0.01	0.23	0.18	0.21	0.28	0.15	0.24	0.12	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.11	0.11	0.31	0.18	0.19	0.14	0.16	0.10	0.07	0.18	0.23	0.12	0.20	0.34	0.09	0.14	0.13	0.11	0.12
C2	0.08	0.06	0.09	0.24	0.09	0.13	0.10	0.11	0.08	0.06	0.07	0.14	0.08	0.24	0.27	0.07	0.11	0.13	0.12	0.12
C2'	0.07	0.13	0.08	0.25	0.17	0.16	0.14	0.15	0.11	0.09	0.17	0.21	0.14	0.28	0.31	0.08	0.13	0.13	0.13	0.12
C3'	0.09	0.16	0.10	0.25	0.20	0.16	0.16	0.15	0.13	0.11	0.21	0.23	0.17	0.25	0.29	0.09	0.12	0.11	0.12	0.11
C4	0.10	0.09	0.16	0.18	0.08	0.10	0.07	0.09	0.08	0.09	0.08	0.10	0.10	0.29	0.25	0.08	0.10	0.13	0.12	0.11
C4'	0.12	0.25	0.12	0.26	0.27	0.17	0.20	0.15	0.17	0.17	0.30	0.30	0.27	0.23	0.29	0.11	0.12	0.09	0.10	0.09
C5	0.11	0.13	0.17	0.19	0.12	0.12	0.11	0.13	0.09	0.11	0.13	0.13	0.15	0.34	0.28	0.08	0.12	0.13	0.12	0.12
C5'	0.28	0.38	0.21	0.18	0.34	0.15	0.27	0.13	0.26	0.31	0.39	0.34	0.43	0.44	0.23	0.21	0.11	0.12	0.16	0.12
C6	0.09	0.15	0.11	0.24	0.16	0.15	0.13	0.15	0.10	0.10	0.17	0.17	0.16	0.32	0.32	0.08	0.14	0.13	0.11	0.12
N1	0.05	0.10	0.07	0.27	0.15	0.15	0.13	0.14	0.08	0.06	0.14	0.19	0.11	0.25	0.31	0.06	0.13	0.13	0.12	0.12
N3	0.09	0.08	0.12	0.21	0.06	0.10	0.07	0.09	0.08	0.08	0.07	0.09	0.09	0.26	0.25	0.08	0.10	0.12	0.13	0.11
N4	0.13	0.12	0.20	0.15	0.12	0.10	0.11	0.10	0.11	0.12	0.11	0.14	0.12	0.29	0.22	0.11	0.10	0.13	0.13	0.11
O2	0.10	0.09	0.11	0.26	0.11	0.14	0.11	0.11	0.10	0.09	0.09	0.16	0.11	0.21	0.27	0.09	0.11	0.12	0.13	0.12
O2'	0.06	0.11	0.08	0.27	0.14	0.16	0.11	0.15	0.08	0.07	0.15	0.18	0.13	0.25	0.32	0.08	0.15	0.15	0.16	0.15
O3'	0.11	0.13	0.18	0.31	0.17	0.22	0.14	0.18	0.12	0.10	0.18	0.22	0.14	0.14	0.32	0.12	0.15	0.11	0.09	0.11
O4'	0.08	0.22	0.15	0.33	0.27	0.20	0.20	0.19	0.15	0.13	0.30	0.31	0.22	0.17	0.35	0.10	0.16	0.13	0.10	0.13
O5'	0.27	0.35	0.20	0.15	0.32	0.15	0.27	0.14	0.26	0.29	0.36	0.32	0.39	0.43	0.19	0.21	0.14	0.19	0.25	0.19
OP1	0.26	0.33	0.21	0.13	0.36	0.14	0.33	0.15	0.30	0.30	0.36	0.38	0.33	0.40	0.17	0.21	0.21	0.34	0.45	0.34
OP2	0.53	0.56	0.50	0.33	0.54	0.36	0.51	0.35	0.51	0.54	0.56	0.53	0.58	0.72	0.18	0.46	0.41	0.49	0.58	0.51
P	0.32	0.39	0.26	0.15	0.37	0.17	0.33	0.17	0.32	0.34	0.40	0.38	0.41	0.49	0.14	0.25	0.21	0.31	0.39	0.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.11	0.00	0.06	0.12	0.08	0.06
C2	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.13	0.09	0.03	0.05	0.07	0.07	0.05
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.07	0.05	0.02	0.05	0.04	0.09	0.00	0.01	0.01	0.15	0.27	0.25	0.21
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.14	0.00	0.15	0.02	0.14	0.09	0.11	0.15	0.06	0.02	0.01	0.01	0.04	0.16	0.06	0.06
C4	0.01	0.00	0.03	0.14	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.07	0.02	0.09	0.10	0.17	0.13
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.03	0.05	0.03	0.13	0.01	0.00	0.01	0.09	0.02	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.15	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.11	0.02	0.10	0.12	0.18	0.14
C5'	0.03	0.04	0.07	0.02	0.06	0.01	0.07	0.00	0.06	0.03	0.04	0.06	0.04	0.07	0.10	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.14	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.09	0.03	0.07	0.07	0.10	0.09
N1	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.04	0.01	0.05	0.06	0.06	0.05
N3	0.01	0.00	0.05	0.11	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.06	0.03	0.07	0.07	0.12	0.09
N4	0.02	0.01	0.04	0.15	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.09	0.02	0.10	0.14	0.21	0.16
O2	0.02	0.00	0.09	0.06	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.17	0.05	0.05	0.10	0.06	0.04
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.16	0.13	0.15	0.07	0.12	0.10	0.15	0.17	0.12	0.00	0.04	0.08	0.09	0.23	0.28	0.18
O3'	0.11	0.09	0.01	0.01	0.07	0.01	0.11	0.10	0.09	0.04	0.06	0.09	0.17	0.04	0.00	0.08	0.14	0.09	0.11	0.09
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.05	0.08	0.08	0.00	0.04	0.05	0.07	0.05
O5'	0.06	0.05	0.15	0.04	0.09	0.01	0.10	0.01	0.07	0.05	0.07	0.10	0.05	0.09	0.14	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.12	0.07	0.27	0.16	0.10	0.09	0.12	0.05	0.07	0.06	0.07	0.14	0.10	0.23	0.09	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.07	0.25	0.06	0.17	0.02	0.18	0.01	0.10	0.06	0.12	0.21	0.06	0.28	0.11	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.05	0.21	0.06	0.13	0.02	0.14	0.01	0.09	0.05	0.09	0.16	0.04	0.18	0.09	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00