Doublet Group distance statistics: 48039

back

Distances from reference structure (by RMSD)

4, 21, 8, 6, 2, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.006, 0.009, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.006 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.008, 0.015, 0.022, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.008, 0.015, 0.022, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.007, 0.015, 0.022, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.018, 0.035, 0.053, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.035 std_dev=0.018
N4	A	0, 0.025, 0.053, 0.081, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.053 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.061, 0.123, 0.185, 0.309 max_d=0.309 avg_d=0.123 std_dev=0.062
C2'	A	0, 0.070, 0.136, 0.202, 0.345 max_d=0.345 avg_d=0.136 std_dev=0.066
C3'	A	0, 0.092, 0.165, 0.239, 0.410 max_d=0.410 avg_d=0.165 std_dev=0.073
O3'	A	0, 0.069, 0.147, 0.224, 0.375 max_d=0.375 avg_d=0.147 std_dev=0.077
C4'	A	0, 0.095, 0.174, 0.252, 0.385 max_d=0.385 avg_d=0.174 std_dev=0.079
O2'	A	0, 0.114, 0.222, 0.331, 0.572 max_d=0.572 avg_d=0.222 std_dev=0.109
C5'	A	0, 0.150, 0.281, 0.413, 0.668 max_d=0.668 avg_d=0.281 std_dev=0.131
OP2	B	0, 0.117, 0.257, 0.397, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.257 std_dev=0.140
OP1	B	0, 0.048, 0.189, 0.330, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.189 std_dev=0.141
O5'	A	0, 0.138, 0.280, 0.421, 0.715 max_d=0.715 avg_d=0.280 std_dev=0.141
P	B	0, 0.070, 0.215, 0.359, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.215 std_dev=0.145
O5'	B	0, 0.100, 0.282, 0.464, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.282 std_dev=0.182
C5'	B	0, 0.096, 0.313, 0.530, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.313 std_dev=0.217
C6	B	0, 0.148, 0.392, 0.636, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.392 std_dev=0.244
C4'	B	0, 0.130, 0.379, 0.629, 1.451 max_d=1.451 avg_d=0.379 std_dev=0.250
O4'	B	0, 0.140, 0.397, 0.655, 1.514 max_d=1.514 avg_d=0.397 std_dev=0.257
C5	B	0, 0.150, 0.409, 0.669, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.409 std_dev=0.260
C3'	B	0, 0.152, 0.414, 0.677, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.414 std_dev=0.262
C2'	B	0, 0.163, 0.433, 0.704, 1.492 max_d=1.492 avg_d=0.433 std_dev=0.270
C1'	B	0, 0.160, 0.431, 0.702, 1.562 max_d=1.562 avg_d=0.431 std_dev=0.271
N1	B	0, 0.151, 0.427, 0.704, 1.544 max_d=1.544 avg_d=0.427 std_dev=0.276
O3'	B	0, 0.198, 0.494, 0.791, 1.645 max_d=1.645 avg_d=0.494 std_dev=0.297
O2'	B	0, 0.205, 0.516, 0.826, 1.616 max_d=1.616 avg_d=0.516 std_dev=0.311
C4	B	0, 0.151, 0.468, 0.785, 1.585 max_d=1.585 avg_d=0.468 std_dev=0.317
OP2	A	0, 0.111, 0.440, 0.769, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.440 std_dev=0.329
C2	B	0, 0.150, 0.483, 0.816, 1.735 max_d=1.735 avg_d=0.483 std_dev=0.333
N4	B	0, 0.179, 0.515, 0.852, 1.619 max_d=1.619 avg_d=0.515 std_dev=0.336
P	A	0, 0.117, 0.457, 0.797, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.457 std_dev=0.340
N3	B	0, 0.143, 0.500, 0.858, 1.755 max_d=1.755 avg_d=0.500 std_dev=0.357
O2	B	0, 0.168, 0.533, 0.897, 1.883 max_d=1.883 avg_d=0.533 std_dev=0.364
OP1	A	0, 0.088, 0.623, 1.159, 2.233 max_d=2.233 avg_d=0.623 std_dev=0.535

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.13	0.10	0.07
C2	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.04	0.02	0.07	0.09	0.16	0.14
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.00	0.01	0.01	0.04	0.25	0.12	0.10
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.31	0.13	0.13
C4	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02	0.09	0.16	0.23	0.22
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.14	0.04	0.03
C5	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.10	0.18	0.24	0.23
C5'	0.02	0.03	0.02	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.03	0.04	0.06	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.09	0.13	0.20	0.19
N1	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.07	0.09	0.15	0.14
N3	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02	0.08	0.11	0.20	0.18
N4	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.03	0.02	0.10	0.20	0.26	0.24
O2	0.01	0.00	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.06	0.04	0.06	0.11	0.14	0.11
O2'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.05	0.05	0.09	0.00	0.03	0.01	0.05	0.33	0.16	0.14
O3'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.06	0.03	0.00	0.03	0.04	0.34	0.14	0.14
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.00	0.04	0.07	0.10	0.10
O5'	0.05	0.07	0.04	0.04	0.09	0.01	0.10	0.01	0.09	0.07	0.08	0.10	0.06	0.05	0.04	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.13	0.09	0.25	0.31	0.16	0.14	0.18	0.05	0.13	0.09	0.11	0.20	0.11	0.33	0.34	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.16	0.12	0.13	0.23	0.04	0.24	0.01	0.20	0.15	0.20	0.26	0.14	0.16	0.14	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.14	0.10	0.13	0.22	0.03	0.23	0.01	0.19	0.14	0.18	0.24	0.11	0.14	0.14	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.06	0.07	0.06	0.07	0.06	0.08	0.06	0.07	0.06	0.06	0.08	0.07	0.09	0.09	0.06	0.07	0.06	0.08	0.06
C2	0.07	0.08	0.09	0.08	0.09	0.07	0.10	0.07	0.09	0.08	0.08	0.10	0.08	0.11	0.08	0.07	0.07	0.07	0.09	0.07
C2'	0.07	0.07	0.09	0.08	0.08	0.06	0.09	0.06	0.08	0.07	0.07	0.08	0.08	0.10	0.11	0.06	0.07	0.07	0.08	0.07
C3'	0.06	0.07	0.08	0.08	0.07	0.06	0.08	0.06	0.07	0.06	0.07	0.08	0.07	0.09	0.10	0.06	0.07	0.06	0.08	0.06
C4	0.08	0.08	0.10	0.09	0.09	0.07	0.09	0.07	0.09	0.08	0.08	0.09	0.08	0.12	0.09	0.08	0.07	0.07	0.09	0.07
C4'	0.06	0.06	0.07	0.07	0.07	0.06	0.08	0.07	0.07	0.06	0.06	0.07	0.08	0.09	0.09	0.06	0.07	0.06	0.08	0.06
C5	0.06	0.06	0.08	0.07	0.07	0.06	0.08	0.07	0.07	0.06	0.06	0.07	0.07	0.10	0.08	0.07	0.07	0.06	0.08	0.06
C5'	0.07	0.07	0.08	0.07	0.07	0.07	0.08	0.07	0.07	0.06	0.07	0.07	0.09	0.09	0.10	0.07	0.08	0.06	0.08	0.06
C6	0.05	0.06	0.07	0.06	0.07	0.06	0.08	0.07	0.07	0.06	0.06	0.07	0.06	0.09	0.09	0.07	0.07	0.06	0.08	0.06
N1	0.06	0.06	0.08	0.07	0.08	0.06	0.09	0.06	0.08	0.06	0.07	0.08	0.07	0.10	0.08	0.06	0.07	0.06	0.08	0.06
N3	0.09	0.09	0.11	0.09	0.10	0.08	0.11	0.08	0.10	0.09	0.09	0.11	0.09	0.13	0.09	0.08	0.08	0.08	0.10	0.08
N4	0.10	0.09	0.12	0.11	0.09	0.09	0.10	0.08	0.10	0.09	0.09	0.10	0.10	0.15	0.10	0.09	0.08	0.08	0.09	0.08
O2	0.08	0.09	0.10	0.08	0.11	0.07	0.12	0.08	0.11	0.09	0.10	0.12	0.09	0.12	0.09	0.08	0.08	0.08	0.10	0.08
O2'	0.09	0.09	0.11	0.11	0.10	0.09	0.10	0.08	0.09	0.09	0.09	0.11	0.09	0.12	0.13	0.08	0.09	0.09	0.10	0.09
O3'	0.06	0.07	0.08	0.08	0.08	0.06	0.09	0.06	0.08	0.07	0.07	0.09	0.07	0.10	0.10	0.06	0.07	0.07	0.08	0.07
O4'	0.06	0.06	0.06	0.06	0.07	0.06	0.08	0.08	0.07	0.06	0.06	0.08	0.07	0.08	0.09	0.07	0.08	0.06	0.08	0.06
O5'	0.09	0.09	0.10	0.10	0.10	0.08	0.10	0.09	0.10	0.09	0.09	0.10	0.10	0.12	0.11	0.08	0.10	0.09	0.11	0.09
OP1	0.33	0.33	0.36	0.35	0.33	0.32	0.33	0.30	0.33	0.33	0.33	0.33	0.33	0.38	0.33	0.31	0.30	0.27	0.30	0.28
OP2	0.26	0.26	0.27	0.26	0.28	0.25	0.29	0.27	0.28	0.27	0.26	0.28	0.24	0.27	0.22	0.25	0.28	0.29	0.30	0.29
P	0.23	0.24	0.25	0.23	0.26	0.23	0.27	0.25	0.27	0.25	0.24	0.27	0.22	0.25	0.19	0.23	0.26	0.27	0.29	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.04	0.05	0.05	0.04
C2	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.04	0.03	0.05	0.05	0.07	0.05
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.03	0.06	0.00	0.01	0.00	0.06	0.08	0.09	0.07
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.06	0.06	0.04
C4	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.03	0.02	0.06	0.07	0.10	0.07
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01
C5	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.03	0.02	0.07	0.08	0.10	0.08
C5'	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01
C6	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.03	0.03	0.07	0.07	0.08	0.07
N1	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.05	0.06	0.06	0.05
N3	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.04	0.03	0.06	0.06	0.08	0.06
N4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.03	0.02	0.06	0.08	0.11	0.08
O2	0.02	0.01	0.06	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.05	0.05	0.05	0.06	0.06	0.05
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.06	0.01	0.06	0.03	0.06	0.03	0.07	0.07	0.11	0.00	0.04	0.02	0.07	0.09	0.13	0.10
O3'	0.03	0.04	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.05	0.04	0.00	0.03	0.04	0.06	0.06	0.04
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.03	0.00	0.04	0.05	0.04	0.03
O5'	0.04	0.05	0.06	0.04	0.06	0.01	0.07	0.01	0.07	0.05	0.06	0.06	0.05	0.07	0.04	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.05	0.08	0.06	0.07	0.05	0.08	0.04	0.07	0.06	0.06	0.08	0.06	0.09	0.06	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.05	0.07	0.09	0.06	0.10	0.02	0.10	0.01	0.08	0.06	0.08	0.11	0.06	0.13	0.06	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.04	0.05	0.07	0.04	0.07	0.01	0.08	0.01	0.07	0.05	0.06	0.08	0.05	0.10	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00