Doublet Group distance statistics: 48041

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 4, 8, 7, 6, 6, 4, 1, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.005, 0.007, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.001, 0.005, 0.008, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.005 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.001, 0.005, 0.009, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.005 std_dev=0.004
C1'	A	0, 0.003, 0.008, 0.014, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.001, 0.006, 0.012, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.007 std_dev=0.006
O2	A	0, 0.004, 0.021, 0.037, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.021 std_dev=0.016
N4	A	0, 0.002, 0.021, 0.039, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.021 std_dev=0.018
O4'	A	0, -0.025, 0.089, 0.203, 0.522 max_d=0.522 avg_d=0.089 std_dev=0.114
C2'	A	0, -0.014, 0.104, 0.223, 0.557 max_d=0.557 avg_d=0.104 std_dev=0.118
O2'	A	0, 0.003, 0.146, 0.290, 0.677 max_d=0.677 avg_d=0.146 std_dev=0.143
OP1	B	0, 0.165, 0.321, 0.476, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.321 std_dev=0.155
C4'	A	0, -0.020, 0.143, 0.307, 0.763 max_d=0.763 avg_d=0.143 std_dev=0.164
C3'	A	0, -0.019, 0.166, 0.350, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.166 std_dev=0.184
P	B	0, 0.220, 0.409, 0.598, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.409 std_dev=0.189
O3'	A	0, -0.024, 0.236, 0.496, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.236 std_dev=0.260
C5'	A	0, -0.041, 0.247, 0.536, 1.351 max_d=1.351 avg_d=0.247 std_dev=0.288
O5'	A	0, -0.026, 0.304, 0.634, 1.574 max_d=1.574 avg_d=0.304 std_dev=0.330
OP2	B	0, 0.190, 0.544, 0.898, 1.809 max_d=1.809 avg_d=0.544 std_dev=0.354
P	A	0, -0.063, 0.422, 0.907, 2.322 max_d=2.322 avg_d=0.422 std_dev=0.485
OP2	A	0, -0.080, 0.471, 1.022, 2.679 max_d=2.679 avg_d=0.471 std_dev=0.551
OP1	A	0, -0.077, 0.488, 1.052, 2.685 max_d=2.685 avg_d=0.488 std_dev=0.565
O5'	B	0, -0.096, 0.575, 1.246, 3.352 max_d=3.352 avg_d=0.575 std_dev=0.671
C5'	B	0, -0.425, 0.689, 1.804, 5.454 max_d=5.454 avg_d=0.689 std_dev=1.115
C4'	B	0, -0.731, 0.905, 2.542, 7.946 max_d=7.946 avg_d=0.905 std_dev=1.637
C5	B	0, -0.498, 1.139, 2.776, 8.108 max_d=8.108 avg_d=1.139 std_dev=1.637
C6	B	0, -0.533, 1.111, 2.756, 8.117 max_d=8.117 avg_d=1.111 std_dev=1.645
O4'	B	0, -0.780, 1.026, 2.833, 8.788 max_d=8.788 avg_d=1.026 std_dev=1.806
C3'	B	0, -0.964, 0.995, 2.954, 9.455 max_d=9.455 avg_d=0.995 std_dev=1.959
C4	B	0, -0.806, 1.196, 3.199, 9.772 max_d=9.772 avg_d=1.196 std_dev=2.003
N4	B	0, -0.787, 1.240, 3.268, 9.920 max_d=9.920 avg_d=1.240 std_dev=2.028
N1	B	0, -0.910, 1.158, 3.226, 10.039 max_d=10.039 avg_d=1.158 std_dev=2.068
C1'	B	0, -1.010, 1.170, 3.350, 10.554 max_d=10.554 avg_d=1.170 std_dev=2.180
C2'	B	0, -1.089, 1.174, 3.437, 10.935 max_d=10.935 avg_d=1.174 std_dev=2.263
O3'	B	0, -1.304, 1.056, 3.415, 11.286 max_d=11.286 avg_d=1.056 std_dev=2.360
N3	B	0, -1.113, 1.277, 3.667, 11.565 max_d=11.565 avg_d=1.277 std_dev=2.390
C2	B	0, -1.192, 1.268, 3.728, 11.875 max_d=11.875 avg_d=1.268 std_dev=2.460
O2'	B	0, -1.477, 1.356, 4.188, 13.606 max_d=13.606 avg_d=1.356 std_dev=2.833
O2	B	0, -1.497, 1.396, 4.289, 13.897 max_d=13.897 avg_d=1.396 std_dev=2.893

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.06	0.09	0.08
C2	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.06	0.02	0.19	0.19	0.26	0.22
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.03	0.03	0.10	0.00	0.01	0.00	0.14	0.11	0.14	0.13
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.08	0.02	0.09	0.03	0.05	0.05	0.10	0.01	0.00	0.01	0.20	0.17	0.12	0.17
C4	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.28	0.32	0.41	0.35
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.02
C5	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.10	0.01	0.30	0.35	0.41	0.37
C5'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.00	0.05	0.03	0.05	0.05	0.06	0.03	0.03	0.01	0.01	0.08	0.18	0.01
C6	0.00	0.00	0.06	0.09	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.10	0.01	0.26	0.27	0.30	0.29
N1	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.18	0.18	0.22	0.20
N3	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.01	0.24	0.26	0.35	0.29
N4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.30	0.37	0.47	0.39
O2	0.01	0.00	0.10	0.10	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.12	0.02	0.15	0.13	0.21	0.17
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.04	0.03	0.08	0.00	0.02	0.03	0.05	0.05	0.07	0.04
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.05	0.01	0.10	0.03	0.10	0.03	0.05	0.06	0.12	0.02	0.00	0.01	0.18	0.17	0.10	0.15
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.05	0.04	0.07	0.03
O5'	0.08	0.19	0.14	0.20	0.28	0.01	0.30	0.01	0.26	0.18	0.24	0.30	0.15	0.05	0.18	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.19	0.11	0.17	0.32	0.03	0.35	0.08	0.27	0.18	0.26	0.37	0.13	0.05	0.17	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.26	0.14	0.12	0.41	0.09	0.41	0.18	0.30	0.22	0.35	0.47	0.21	0.07	0.10	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.22	0.13	0.17	0.35	0.02	0.37	0.01	0.29	0.20	0.29	0.39	0.17	0.04	0.15	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.08	0.46	0.60	0.17	0.30	0.17	0.43	0.12	0.06	0.14	0.23	0.09	0.68	0.85	0.06	0.10	0.08	0.08	0.07
C2	0.25	0.32	0.10	0.25	0.29	0.06	0.25	0.24	0.23	0.27	0.33	0.30	0.36	0.25	0.41	0.31	0.09	0.08	0.08	0.08
C2'	0.17	0.08	0.53	0.64	0.10	0.38	0.11	0.51	0.12	0.11	0.08	0.14	0.11	0.77	0.86	0.10	0.15	0.07	0.07	0.07
C3'	0.45	0.34	0.81	0.89	0.21	0.61	0.22	0.67	0.29	0.35	0.27	0.16	0.41	1.10	1.15	0.34	0.27	0.08	0.08	0.09
C4	0.19	0.22	0.12	0.27	0.19	0.05	0.17	0.22	0.17	0.19	0.22	0.19	0.25	0.25	0.42	0.27	0.08	0.07	0.08	0.07
C4'	0.46	0.35	0.87	0.96	0.17	0.62	0.17	0.64	0.25	0.35	0.26	0.12	0.45	1.16	1.27	0.32	0.24	0.08	0.09	0.08
C5	0.11	0.08	0.44	0.60	0.09	0.29	0.12	0.41	0.11	0.08	0.07	0.11	0.11	0.62	0.84	0.05	0.10	0.08	0.08	0.07
C5'	0.68	0.59	1.10	1.16	0.34	0.79	0.30	0.72	0.40	0.55	0.48	0.26	0.73	1.42	1.52	0.50	0.31	0.09	0.10	0.08
C6	0.17	0.10	0.53	0.69	0.09	0.37	0.12	0.46	0.11	0.11	0.07	0.12	0.15	0.75	0.96	0.07	0.13	0.08	0.08	0.07
N1	0.04	0.11	0.36	0.52	0.18	0.22	0.17	0.38	0.13	0.09	0.16	0.21	0.11	0.56	0.75	0.11	0.07	0.08	0.08	0.07
N3	0.35	0.39	0.08	0.12	0.31	0.14	0.25	0.15	0.26	0.33	0.37	0.30	0.44	0.10	0.24	0.40	0.13	0.08	0.08	0.08
N4	0.32	0.29	0.10	0.10	0.20	0.18	0.18	0.10	0.20	0.27	0.25	0.18	0.35	0.08	0.20	0.38	0.15	0.07	0.08	0.08
O2	0.36	0.44	0.06	0.14	0.38	0.12	0.31	0.19	0.30	0.37	0.44	0.39	0.50	0.14	0.27	0.40	0.12	0.08	0.08	0.08
O2'	0.09	0.09	0.46	0.58	0.18	0.32	0.15	0.47	0.11	0.07	0.15	0.23	0.10	0.70	0.79	0.06	0.12	0.07	0.07	0.07
O3'	0.56	0.45	0.91	0.95	0.30	0.71	0.30	0.75	0.38	0.46	0.37	0.24	0.52	1.22	1.21	0.45	0.32	0.10	0.08	0.11
O4'	0.26	0.16	0.68	0.81	0.09	0.46	0.13	0.52	0.13	0.16	0.09	0.13	0.24	0.93	1.12	0.13	0.15	0.09	0.09	0.08
O5'	1.05	0.92	1.47	1.56	0.62	1.19	0.57	1.11	0.70	0.89	0.78	0.50	1.07	1.80	1.93	0.87	0.66	0.32	0.32	0.36
OP1	1.57	1.45	2.01	2.02	1.05	1.62	0.94	1.42	1.11	1.37	1.28	0.91	1.66	2.42	2.43	1.34	0.94	0.46	0.46	0.53
OP2	1.65	1.53	2.03	2.08	1.17	1.71	1.07	1.51	1.22	1.46	1.38	1.04	1.71	2.41	2.49	1.44	1.04	0.54	0.50	0.60
P	1.45	1.32	1.88	1.93	0.96	1.53	0.86	1.36	1.02	1.26	1.17	0.82	1.52	2.25	2.35	1.23	0.89	0.45	0.46	0.50

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.00	0.07	0.04	0.10	0.08
C2	0.01	0.00	0.06	0.11	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.15	0.07	0.01	0.17	0.12	0.40	0.24
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.09	0.05	0.01	0.04	0.02	0.10	0.00	0.01	0.01	0.09	0.12	0.05	0.07
C3'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.17	0.00	0.18	0.01	0.16	0.10	0.14	0.18	0.09	0.01	0.00	0.01	0.21	0.24	0.04	0.16
C4	0.01	0.00	0.02	0.17	0.00	0.07	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.07	0.02	0.24	0.22	0.66	0.37
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.07	0.04	0.05	0.07	0.04	0.15	0.01	0.00	0.01	0.04	0.16	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.18	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.11	0.02	0.25	0.23	0.67	0.38
C5'	0.03	0.03	0.09	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.07	0.03	0.05	0.07	0.03	0.06	0.11	0.01	0.00	0.16	0.21	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.16	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.09	0.02	0.21	0.18	0.49	0.30
N1	0.00	0.01	0.01	0.10	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.03	0.01	0.16	0.11	0.34	0.21
N3	0.01	0.00	0.04	0.14	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.18	0.05	0.01	0.22	0.17	0.55	0.31
N4	0.01	0.00	0.02	0.18	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.20	0.09	0.02	0.26	0.25	0.76	0.41
O2	0.01	0.00	0.10	0.09	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.14	0.16	0.02	0.15	0.09	0.30	0.18
O2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.18	0.15	0.15	0.06	0.11	0.10	0.18	0.20	0.14	0.00	0.02	0.10	0.16	0.22	0.04	0.14
O3'	0.13	0.07	0.01	0.00	0.07	0.01	0.11	0.11	0.09	0.03	0.05	0.09	0.16	0.02	0.00	0.08	0.24	0.33	0.06	0.21
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.08	0.00	0.04	0.07	0.04	0.04
O5'	0.07	0.17	0.09	0.21	0.24	0.01	0.25	0.00	0.21	0.16	0.22	0.26	0.15	0.16	0.24	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.12	0.12	0.24	0.22	0.04	0.23	0.16	0.18	0.11	0.17	0.25	0.09	0.22	0.33	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.40	0.05	0.04	0.66	0.16	0.67	0.21	0.49	0.34	0.55	0.76	0.30	0.04	0.06	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.24	0.07	0.16	0.37	0.02	0.38	0.01	0.30	0.21	0.31	0.41	0.18	0.14	0.21	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00