Doublet Group distance statistics: 48042

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 10, 13, 3, 6, 2, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.004, 0.006, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.004 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.001, 0.006, 0.012, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.005, 0.014, 0.024, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.016 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.001, 0.011, 0.022, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.005, 0.015, 0.026, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.015 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.015, 0.043, 0.071, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.043 std_dev=0.028
N4	A	0, 0.015, 0.046, 0.076, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.046 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.020, 0.102, 0.184, 0.362 max_d=0.362 avg_d=0.102 std_dev=0.082
C2'	A	0, 0.018, 0.119, 0.220, 0.490 max_d=0.490 avg_d=0.119 std_dev=0.101
C4'	A	0, 0.028, 0.152, 0.277, 0.712 max_d=0.712 avg_d=0.152 std_dev=0.125
OP2	B	0, 0.118, 0.261, 0.404, 0.647 max_d=0.647 avg_d=0.261 std_dev=0.143
C5'	A	0, 0.067, 0.220, 0.374, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.220 std_dev=0.153
C3'	A	0, -0.021, 0.174, 0.369, 1.195 max_d=1.195 avg_d=0.174 std_dev=0.195
C5	B	0, 0.047, 0.250, 0.453, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.250 std_dev=0.203
N4	B	0, 0.119, 0.327, 0.534, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.327 std_dev=0.207
C4	B	0, 0.083, 0.294, 0.505, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.294 std_dev=0.211
O2'	A	0, -0.053, 0.179, 0.411, 1.376 max_d=1.376 avg_d=0.179 std_dev=0.232
OP1	B	0, 0.098, 0.337, 0.576, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.337 std_dev=0.239
C6	B	0, 0.042, 0.285, 0.528, 1.203 max_d=1.203 avg_d=0.285 std_dev=0.243
P	B	0, 0.049, 0.307, 0.565, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.307 std_dev=0.258
O4'	B	0, 0.150, 0.425, 0.700, 1.514 max_d=1.514 avg_d=0.425 std_dev=0.275
N1	B	0, 0.036, 0.323, 0.611, 1.441 max_d=1.441 avg_d=0.323 std_dev=0.287
N3	B	0, 0.081, 0.387, 0.694, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.387 std_dev=0.306
C2	B	0, 0.058, 0.393, 0.727, 1.539 max_d=1.539 avg_d=0.393 std_dev=0.335
C1'	B	0, 0.040, 0.387, 0.734, 1.738 max_d=1.738 avg_d=0.387 std_dev=0.347
O3'	A	0, -0.184, 0.216, 0.617, 2.578 max_d=2.578 avg_d=0.216 std_dev=0.401
O5'	B	0, -0.028, 0.388, 0.803, 1.958 max_d=1.958 avg_d=0.388 std_dev=0.415
O5'	A	0, -0.118, 0.301, 0.719, 1.936 max_d=1.936 avg_d=0.301 std_dev=0.419
O2	B	0, 0.047, 0.491, 0.934, 1.902 max_d=1.902 avg_d=0.491 std_dev=0.444
C4'	B	0, -0.090, 0.424, 0.938, 2.394 max_d=2.394 avg_d=0.424 std_dev=0.514
C5'	B	0, -0.107, 0.459, 1.025, 2.591 max_d=2.591 avg_d=0.459 std_dev=0.566
OP2	A	0, -0.182, 0.440, 1.061, 3.340 max_d=3.340 avg_d=0.440 std_dev=0.621
P	A	0, -0.238, 0.399, 1.035, 3.033 max_d=3.033 avg_d=0.399 std_dev=0.636
C3'	B	0, -0.229, 0.427, 1.082, 2.885 max_d=2.885 avg_d=0.427 std_dev=0.656
C2'	B	0, -0.215, 0.447, 1.109, 2.965 max_d=2.965 avg_d=0.447 std_dev=0.662
O3'	B	0, -0.266, 0.440, 1.145, 3.041 max_d=3.041 avg_d=0.440 std_dev=0.706
O2'	B	0, -0.237, 0.507, 1.251, 3.349 max_d=3.349 avg_d=0.507 std_dev=0.744
OP1	A	0, -0.336, 0.493, 1.322, 3.918 max_d=3.918 avg_d=0.493 std_dev=0.829

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.12	0.00	0.20	0.11	0.14	0.07
C2	0.02	0.00	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.11	0.04	0.29	0.08	0.16	0.20
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.08	0.06	0.01	0.03	0.03	0.09	0.00	0.02	0.01	0.15	0.31	0.30	0.18
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.10	0.00	0.13	0.02	0.11	0.06	0.07	0.11	0.07	0.01	0.01	0.01	0.09	0.34	0.32	0.23
C4	0.01	0.01	0.03	0.10	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.13	0.03	0.02	0.39	0.23	0.34	0.36
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.03	0.04	0.05	0.10	0.01	0.00	0.01	0.12	0.20	0.05
C5	0.01	0.01	0.05	0.13	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.13	0.07	0.03	0.42	0.28	0.37	0.39
C5'	0.05	0.07	0.08	0.02	0.10	0.00	0.11	0.00	0.09	0.07	0.09	0.11	0.07	0.06	0.08	0.01	0.01	0.16	0.22	0.01
C6	0.00	0.01	0.06	0.11	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.05	0.04	0.39	0.20	0.26	0.31
N1	0.00	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.01	0.30	0.08	0.15	0.19
N3	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.07	0.03	0.34	0.13	0.25	0.28
N4	0.01	0.01	0.03	0.11	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.04	0.02	0.41	0.28	0.40	0.41
O2	0.03	0.00	0.09	0.07	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.19	0.06	0.23	0.12	0.11	0.12
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.13	0.10	0.13	0.06	0.11	0.07	0.12	0.14	0.13	0.00	0.04	0.06	0.10	0.41	0.34	0.23
O3'	0.12	0.11	0.02	0.01	0.03	0.01	0.07	0.08	0.05	0.05	0.07	0.04	0.19	0.04	0.00	0.09	0.16	0.40	0.33	0.26
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.06	0.06	0.09	0.00	0.20	0.12	0.10	0.14
O5'	0.20	0.29	0.15	0.09	0.39	0.01	0.42	0.01	0.39	0.30	0.34	0.41	0.23	0.10	0.16	0.20	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.11	0.08	0.31	0.34	0.23	0.12	0.28	0.16	0.20	0.08	0.13	0.28	0.12	0.41	0.40	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.16	0.30	0.32	0.34	0.20	0.37	0.22	0.26	0.15	0.25	0.40	0.11	0.34	0.33	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.20	0.18	0.23	0.36	0.05	0.39	0.01	0.31	0.19	0.28	0.41	0.12	0.23	0.26	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.21	0.20	0.58	0.14	0.44	0.15	0.43	0.19	0.09	0.27	0.18	0.31	0.33	0.62	0.25	0.36	0.22	0.13	0.23
C2	0.11	0.18	0.11	0.42	0.13	0.30	0.15	0.28	0.16	0.10	0.21	0.16	0.23	0.42	0.44	0.20	0.25	0.18	0.13	0.18
C2'	0.08	0.24	0.14	0.57	0.14	0.45	0.14	0.48	0.16	0.08	0.28	0.17	0.36	0.39	0.67	0.25	0.41	0.25	0.14	0.25
C3'	0.12	0.26	0.28	0.65	0.16	0.53	0.15	0.55	0.20	0.08	0.31	0.21	0.39	0.23	0.75	0.28	0.45	0.33	0.18	0.31
C4	0.18	0.24	0.30	0.22	0.19	0.17	0.10	0.18	0.11	0.18	0.25	0.18	0.28	0.57	0.27	0.13	0.18	0.17	0.14	0.16
C4'	0.15	0.30	0.37	0.69	0.20	0.54	0.14	0.55	0.19	0.12	0.35	0.25	0.43	0.14	0.74	0.29	0.44	0.29	0.15	0.29
C5	0.20	0.31	0.34	0.22	0.21	0.21	0.10	0.26	0.10	0.21	0.31	0.20	0.36	0.65	0.30	0.12	0.26	0.19	0.13	0.19
C5'	0.17	0.35	0.35	0.67	0.24	0.56	0.16	0.60	0.19	0.17	0.39	0.27	0.50	0.19	0.78	0.31	0.47	0.30	0.15	0.30
C6	0.14	0.31	0.19	0.38	0.20	0.32	0.08	0.36	0.10	0.16	0.32	0.20	0.38	0.59	0.44	0.17	0.33	0.21	0.13	0.22
N1	0.09	0.23	0.10	0.47	0.15	0.36	0.12	0.36	0.15	0.09	0.27	0.18	0.30	0.45	0.51	0.21	0.32	0.20	0.13	0.21
N3	0.12	0.18	0.17	0.32	0.14	0.22	0.12	0.20	0.13	0.12	0.20	0.16	0.22	0.48	0.35	0.16	0.19	0.17	0.14	0.16
N4	0.22	0.24	0.39	0.12	0.19	0.12	0.15	0.12	0.17	0.21	0.23	0.18	0.27	0.60	0.18	0.13	0.13	0.16	0.16	0.14
O2	0.14	0.15	0.15	0.47	0.13	0.32	0.19	0.28	0.20	0.13	0.19	0.16	0.19	0.34	0.48	0.22	0.25	0.18	0.14	0.18
O2'	0.08	0.19	0.14	0.53	0.14	0.41	0.14	0.43	0.16	0.08	0.24	0.18	0.28	0.41	0.65	0.22	0.37	0.24	0.19	0.24
O3'	0.17	0.35	0.35	0.67	0.29	0.52	0.15	0.53	0.18	0.17	0.43	0.36	0.47	0.14	0.75	0.28	0.42	0.33	0.15	0.28
O4'	0.16	0.25	0.34	0.67	0.19	0.51	0.14	0.49	0.20	0.11	0.32	0.24	0.37	0.22	0.66	0.29	0.40	0.26	0.15	0.27
O5'	0.33	0.22	0.48	0.91	0.24	0.86	0.42	0.98	0.47	0.30	0.24	0.23	0.35	0.17	1.00	0.59	0.88	0.69	0.55	0.72
OP1	0.58	0.22	0.69	1.12	0.21	1.22	0.41	1.34	0.54	0.42	0.18	0.16	0.21	0.32	1.43	0.90	1.09	0.91	0.55	0.87
OP2	0.34	0.19	0.27	0.79	0.20	0.97	0.39	1.20	0.46	0.29	0.19	0.18	0.29	0.35	0.97	0.71	1.06	0.90	0.60	0.87
P	0.51	0.18	0.57	1.06	0.26	1.14	0.48	1.27	0.58	0.41	0.15	0.21	0.17	0.11	1.29	0.84	1.09	0.86	0.61	0.87

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.00	0.14	0.23	0.23	0.15
C2	0.01	0.00	0.09	0.13	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.13	0.12	0.05	0.13	0.20	0.20	0.13
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.02	0.01	0.06	0.13	0.08	0.01	0.08	0.03	0.16	0.00	0.01	0.01	0.29	0.51	0.52	0.42
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.20	0.00	0.20	0.01	0.17	0.12	0.17	0.22	0.10	0.01	0.00	0.02	0.03	0.30	0.16	0.14
C4	0.01	0.00	0.02	0.20	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.20	0.08	0.03	0.12	0.13	0.13	0.10
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.03	0.03	0.05	0.02	0.18	0.02	0.00	0.01	0.12	0.05	0.03
C5	0.01	0.00	0.06	0.20	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.11	0.04	0.11	0.10	0.09	0.09
C5'	0.06	0.07	0.13	0.01	0.08	0.00	0.08	0.00	0.07	0.07	0.08	0.08	0.07	0.06	0.12	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.17	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.18	0.08	0.05	0.11	0.12	0.11	0.09
N1	0.00	0.01	0.01	0.12	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.07	0.01	0.12	0.18	0.18	0.12
N3	0.01	0.00	0.08	0.17	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.17	0.08	0.05	0.12	0.17	0.17	0.12
N4	0.01	0.01	0.03	0.22	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.22	0.11	0.03	0.11	0.12	0.12	0.11
O2	0.01	0.00	0.16	0.10	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.12	0.23	0.08	0.14	0.24	0.24	0.16
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.20	0.18	0.21	0.06	0.18	0.12	0.17	0.22	0.12	0.00	0.02	0.11	0.21	0.46	0.60	0.38
O3'	0.19	0.12	0.01	0.00	0.08	0.02	0.11	0.12	0.08	0.07	0.08	0.11	0.23	0.02	0.00	0.14	0.13	0.10	0.07	0.05
O4'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.03	0.08	0.11	0.14	0.00	0.03	0.05	0.05	0.06
O5'	0.14	0.13	0.29	0.03	0.12	0.01	0.11	0.01	0.11	0.12	0.12	0.11	0.14	0.21	0.13	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.23	0.20	0.51	0.30	0.13	0.12	0.10	0.04	0.12	0.18	0.17	0.12	0.24	0.46	0.10	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.23	0.20	0.52	0.16	0.13	0.05	0.09	0.01	0.11	0.18	0.17	0.12	0.24	0.60	0.07	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.13	0.42	0.14	0.10	0.03	0.09	0.01	0.09	0.12	0.12	0.11	0.16	0.38	0.05	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00