Doublet Group distance statistics: 48043

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 10, 10, 1, 2, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.008, 0.015, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.004, 0.012, 0.019, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.009, 0.018, 0.027, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.018 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.006, 0.018, 0.031, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.020 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.022, 0.052, 0.081, 0.145 max_d=0.145 avg_d=0.052 std_dev=0.030
N4	A	0, 0.026, 0.060, 0.094, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.060 std_dev=0.034
O4'	A	0, 0.050, 0.097, 0.145, 0.234 max_d=0.234 avg_d=0.097 std_dev=0.048
C2'	A	0, 0.000, 0.089, 0.179, 0.436 max_d=0.436 avg_d=0.089 std_dev=0.090
C4'	A	0, 0.112, 0.232, 0.352, 0.606 max_d=0.606 avg_d=0.232 std_dev=0.120
C3'	A	0, 0.084, 0.214, 0.344, 0.678 max_d=0.678 avg_d=0.214 std_dev=0.130
O2'	A	0, 0.110, 0.256, 0.403, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.256 std_dev=0.146
O5'	B	0, 0.174, 0.327, 0.480, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.327 std_dev=0.153
P	B	0, 0.149, 0.304, 0.460, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.304 std_dev=0.156
C4'	B	0, 0.142, 0.300, 0.457, 0.881 max_d=0.881 avg_d=0.300 std_dev=0.157
O4'	B	0, 0.169, 0.349, 0.529, 0.796 max_d=0.796 avg_d=0.349 std_dev=0.180
OP1	B	0, 0.152, 0.334, 0.517, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.334 std_dev=0.183
OP2	B	0, 0.175, 0.364, 0.552, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.364 std_dev=0.188
C5'	B	0, 0.093, 0.282, 0.472, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.282 std_dev=0.190
C3'	B	0, 0.138, 0.328, 0.519, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.328 std_dev=0.190
OP2	A	0, 0.284, 0.476, 0.669, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.476 std_dev=0.192
P	A	0, 0.232, 0.425, 0.618, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.425 std_dev=0.193
C5'	A	0, 0.166, 0.366, 0.565, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.366 std_dev=0.200
OP1	A	0, 0.252, 0.462, 0.672, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.462 std_dev=0.210
O2'	B	0, 0.244, 0.456, 0.668, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.456 std_dev=0.212
O3'	B	0, 0.144, 0.360, 0.576, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.360 std_dev=0.216
C1'	B	0, 0.190, 0.409, 0.627, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.409 std_dev=0.218
C2'	B	0, 0.154, 0.373, 0.592, 1.079 max_d=1.079 avg_d=0.373 std_dev=0.219
O3'	A	0, 0.075, 0.312, 0.550, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.312 std_dev=0.238
O5'	A	0, 0.141, 0.417, 0.693, 1.597 max_d=1.597 avg_d=0.417 std_dev=0.276
N1	B	0, 0.173, 0.482, 0.792, 1.560 max_d=1.560 avg_d=0.482 std_dev=0.310
C6	B	0, 0.171, 0.490, 0.810, 1.536 max_d=1.536 avg_d=0.490 std_dev=0.319
C5	B	0, 0.141, 0.592, 1.043, 2.170 max_d=2.170 avg_d=0.592 std_dev=0.451
C2	B	0, 0.133, 0.590, 1.046, 2.284 max_d=2.284 avg_d=0.590 std_dev=0.457
O2	B	0, 0.101, 0.624, 1.147, 2.519 max_d=2.519 avg_d=0.624 std_dev=0.523
C4	B	0, 0.107, 0.671, 1.236, 2.794 max_d=2.794 avg_d=0.671 std_dev=0.564
N3	B	0, 0.101, 0.675, 1.249, 2.875 max_d=2.875 avg_d=0.675 std_dev=0.574
N4	B	0, 0.056, 0.767, 1.478, 3.442 max_d=3.442 avg_d=0.767 std_dev=0.711

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.07	0.04	0.12	0.08
C2	0.02	0.00	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.04	0.03	0.14	0.05	0.14	0.06
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.02	0.04	0.08	0.00	0.02	0.01	0.04	0.04	0.08	0.06
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.08	0.00	0.11	0.02	0.10	0.04	0.05	0.09	0.07	0.02	0.00	0.01	0.03	0.05	0.06	0.03
C4	0.02	0.01	0.04	0.08	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.09	0.02	0.21	0.09	0.17	0.10
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.08	0.03	0.03	0.08	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.04	0.05	0.04
C5	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.09	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.13	0.02	0.22	0.09	0.18	0.11
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.14	0.00	0.16	0.00	0.13	0.07	0.09	0.16	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.08	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.02	0.19	0.07	0.16	0.09
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.14	0.04	0.14	0.07
N3	0.02	0.00	0.02	0.05	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.05	0.02	0.17	0.07	0.15	0.07
N4	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.03	0.23	0.11	0.19	0.12
O2	0.04	0.01	0.08	0.07	0.01	0.04	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.10	0.04	0.10	0.05	0.13	0.06
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.02	0.05	0.04	0.10	0.00	0.04	0.03	0.05	0.07	0.08	0.09
O3'	0.02	0.04	0.02	0.00	0.09	0.02	0.13	0.03	0.11	0.03	0.05	0.11	0.10	0.04	0.00	0.02	0.05	0.07	0.09	0.04
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.00	0.07	0.04	0.13	0.09
O5'	0.07	0.14	0.04	0.03	0.21	0.01	0.22	0.01	0.19	0.14	0.17	0.23	0.10	0.05	0.05	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.05	0.04	0.05	0.09	0.04	0.09	0.05	0.07	0.04	0.07	0.11	0.05	0.07	0.07	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.14	0.08	0.06	0.17	0.05	0.18	0.04	0.16	0.14	0.15	0.19	0.13	0.08	0.09	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.06	0.06	0.03	0.10	0.04	0.11	0.01	0.09	0.07	0.07	0.12	0.06	0.09	0.04	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.14	0.14	0.17	0.20	0.14	0.23	0.14	0.20	0.15	0.16	0.22	0.14	0.16	0.22	0.16	0.15	0.15	0.13	0.13
C2	0.11	0.11	0.14	0.16	0.18	0.12	0.24	0.12	0.21	0.13	0.13	0.21	0.14	0.17	0.23	0.13	0.13	0.13	0.12	0.13
C2'	0.11	0.12	0.13	0.16	0.19	0.13	0.22	0.12	0.19	0.13	0.14	0.22	0.12	0.15	0.22	0.13	0.13	0.14	0.09	0.10
C3'	0.09	0.10	0.12	0.15	0.18	0.12	0.20	0.13	0.16	0.11	0.13	0.22	0.10	0.15	0.22	0.10	0.11	0.14	0.07	0.08
C4	0.11	0.13	0.11	0.13	0.23	0.11	0.28	0.13	0.24	0.16	0.17	0.26	0.13	0.13	0.20	0.14	0.12	0.13	0.13	0.13
C4'	0.09	0.10	0.13	0.17	0.15	0.14	0.17	0.15	0.13	0.10	0.12	0.18	0.11	0.16	0.24	0.10	0.12	0.15	0.08	0.10
C5	0.14	0.16	0.12	0.14	0.26	0.12	0.30	0.12	0.26	0.18	0.20	0.29	0.13	0.11	0.19	0.16	0.14	0.15	0.13	0.13
C5'	0.11	0.09	0.16	0.20	0.14	0.18	0.14	0.20	0.12	0.09	0.11	0.17	0.11	0.20	0.26	0.11	0.14	0.19	0.13	0.14
C6	0.14	0.16	0.13	0.15	0.25	0.13	0.28	0.14	0.25	0.18	0.20	0.28	0.13	0.13	0.20	0.17	0.15	0.16	0.13	0.14
N1	0.12	0.13	0.13	0.16	0.21	0.13	0.25	0.13	0.22	0.15	0.15	0.23	0.12	0.15	0.22	0.15	0.14	0.14	0.12	0.13
N3	0.10	0.12	0.13	0.15	0.20	0.11	0.25	0.12	0.22	0.13	0.14	0.22	0.15	0.16	0.22	0.13	0.12	0.14	0.13	0.13
N4	0.12	0.15	0.11	0.12	0.25	0.11	0.31	0.16	0.26	0.17	0.19	0.29	0.15	0.12	0.19	0.16	0.14	0.17	0.16	0.17
O2	0.11	0.12	0.16	0.17	0.16	0.12	0.22	0.12	0.19	0.12	0.12	0.18	0.17	0.19	0.24	0.13	0.12	0.14	0.13	0.13
O2'	0.14	0.15	0.16	0.18	0.20	0.15	0.22	0.14	0.19	0.16	0.16	0.22	0.16	0.18	0.24	0.16	0.14	0.14	0.10	0.11
O3'	0.08	0.09	0.12	0.16	0.17	0.13	0.19	0.14	0.15	0.10	0.12	0.21	0.10	0.16	0.23	0.09	0.12	0.15	0.10	0.10
O4'	0.12	0.14	0.14	0.17	0.19	0.15	0.21	0.16	0.18	0.14	0.16	0.22	0.13	0.16	0.23	0.14	0.15	0.16	0.13	0.14
O5'	0.19	0.14	0.25	0.29	0.10	0.28	0.10	0.30	0.13	0.15	0.11	0.10	0.19	0.28	0.35	0.19	0.23	0.27	0.21	0.22
OP1	0.09	0.12	0.10	0.14	0.16	0.15	0.15	0.19	0.13	0.10	0.15	0.18	0.13	0.14	0.18	0.11	0.12	0.16	0.11	0.12
OP2	0.18	0.26	0.15	0.11	0.30	0.10	0.28	0.11	0.23	0.23	0.30	0.34	0.26	0.17	0.09	0.17	0.15	0.12	0.10	0.10
P	0.09	0.11	0.11	0.13	0.14	0.13	0.12	0.17	0.10	0.09	0.13	0.16	0.13	0.15	0.17	0.09	0.11	0.15	0.10	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.01	0.00	0.07	0.07	0.10	0.07
C2	0.03	0.00	0.06	0.06	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.06	0.02	0.12	0.13	0.19	0.15
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.06	0.04	0.12	0.00	0.01	0.00	0.03	0.05	0.07	0.04
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.10	0.05	0.06	0.09	0.11	0.02	0.00	0.01	0.04	0.06	0.06	0.04
C4	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.08	0.02	0.21	0.25	0.31	0.26
C4'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.08	0.03	0.03	0.06	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01
C5	0.01	0.02	0.04	0.10	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.11	0.03	0.24	0.28	0.33	0.28
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.12	0.00	0.15	0.00	0.13	0.06	0.07	0.13	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.08	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.10	0.03	0.21	0.22	0.24	0.22
N1	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.13	0.13	0.18	0.14
N3	0.02	0.01	0.06	0.06	0.00	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.01	0.16	0.18	0.25	0.20
N4	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.10	0.02	0.23	0.29	0.36	0.29
O2	0.05	0.01	0.12	0.11	0.01	0.08	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.13	0.13	0.05	0.09	0.08	0.16	0.11
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.07	0.05	0.13	0.00	0.05	0.03	0.03	0.05	0.06	0.03
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.08	0.01	0.11	0.02	0.10	0.04	0.07	0.10	0.13	0.05	0.00	0.01	0.07	0.07	0.06	0.05
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.00	0.07	0.07	0.08	0.06
O5'	0.07	0.12	0.03	0.04	0.21	0.01	0.24	0.01	0.21	0.13	0.16	0.23	0.09	0.03	0.07	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.07	0.13	0.05	0.06	0.25	0.05	0.28	0.06	0.22	0.13	0.18	0.29	0.08	0.05	0.07	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.19	0.07	0.06	0.31	0.02	0.33	0.01	0.24	0.18	0.25	0.36	0.16	0.06	0.06	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.15	0.04	0.04	0.26	0.01	0.28	0.01	0.22	0.14	0.20	0.29	0.11	0.03	0.05	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00