Doublet Group distance statistics: 48048

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 5, 1, 2, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.007, 0.011, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C1'	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.010 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.007, 0.025, 0.043, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.025 std_dev=0.018
N1	A	0, -0.011, 0.014, 0.038, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.014 std_dev=0.025
N4	A	0, 0.007, 0.037, 0.066, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.037 std_dev=0.030
O4'	A	0, -0.022, 0.074, 0.170, 0.355 max_d=0.355 avg_d=0.074 std_dev=0.096
C2'	A	0, -0.056, 0.102, 0.260, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.102 std_dev=0.158
OP1	B	0, 0.107, 0.307, 0.508, 0.800 max_d=0.800 avg_d=0.307 std_dev=0.201
C4'	A	0, -0.052, 0.172, 0.396, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.172 std_dev=0.224
P	B	0, 0.067, 0.298, 0.529, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.298 std_dev=0.231
O5'	B	0, 0.093, 0.333, 0.572, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.333 std_dev=0.240
C5'	B	0, 0.039, 0.290, 0.541, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.290 std_dev=0.251
O2'	A	0, -0.088, 0.177, 0.441, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.177 std_dev=0.264
C3'	A	0, -0.097, 0.177, 0.451, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.177 std_dev=0.274
OP2	A	0, 0.051, 0.325, 0.600, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.325 std_dev=0.274
OP2	B	0, 0.073, 0.349, 0.625, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.349 std_dev=0.276
P	A	0, 0.035, 0.317, 0.599, 1.185 max_d=1.185 avg_d=0.317 std_dev=0.282
C4'	B	0, 0.031, 0.313, 0.595, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.313 std_dev=0.282
O4'	B	0, 0.045, 0.369, 0.693, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.369 std_dev=0.324
C3'	B	0, -0.007, 0.335, 0.677, 1.315 max_d=1.315 avg_d=0.335 std_dev=0.342
C6	B	0, 0.135, 0.480, 0.825, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.480 std_dev=0.345
OP1	A	0, 0.038, 0.385, 0.733, 1.474 max_d=1.474 avg_d=0.385 std_dev=0.348
C5	B	0, 0.176, 0.535, 0.894, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.535 std_dev=0.359
C1'	B	0, 0.019, 0.393, 0.767, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.393 std_dev=0.374
N1	B	0, 0.045, 0.429, 0.813, 1.503 max_d=1.503 avg_d=0.429 std_dev=0.384
C5'	A	0, -0.119, 0.284, 0.687, 1.580 max_d=1.580 avg_d=0.284 std_dev=0.403
O3'	B	0, -0.065, 0.343, 0.751, 1.544 max_d=1.544 avg_d=0.343 std_dev=0.408
C4	B	0, 0.122, 0.531, 0.940, 1.586 max_d=1.586 avg_d=0.531 std_dev=0.409
C2'	B	0, -0.035, 0.380, 0.795, 1.602 max_d=1.602 avg_d=0.380 std_dev=0.415
O5'	A	0, -0.106, 0.315, 0.736, 1.671 max_d=1.671 avg_d=0.315 std_dev=0.421
C2	B	0, 0.005, 0.437, 0.869, 1.586 max_d=1.586 avg_d=0.437 std_dev=0.432
N4	B	0, 0.148, 0.589, 1.029, 1.684 max_d=1.684 avg_d=0.589 std_dev=0.441
O2	B	0, 0.021, 0.463, 0.904, 1.691 max_d=1.691 avg_d=0.463 std_dev=0.441
N3	B	0, 0.035, 0.483, 0.932, 1.632 max_d=1.632 avg_d=0.483 std_dev=0.448
O2'	B	0, -0.054, 0.398, 0.850, 1.736 max_d=1.736 avg_d=0.398 std_dev=0.452
O3'	A	0, -0.177, 0.276, 0.729, 1.728 max_d=1.728 avg_d=0.276 std_dev=0.453

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.05	0.06	0.17	0.14
C2	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.04	0.02	0.14	0.05	0.20	0.10
C2'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.05	0.01	0.09	0.02	0.09	0.02	0.02	0.06	0.07	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.10	0.09
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.17	0.01	0.22	0.03	0.20	0.09	0.10	0.19	0.04	0.02	0.01	0.01	0.03	0.04	0.08	0.07
C4	0.01	0.01	0.05	0.17	0.00	0.12	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.20	0.02	0.21	0.06	0.22	0.07
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.12	0.00	0.16	0.00	0.15	0.07	0.07	0.15	0.02	0.03	0.03	0.00	0.01	0.03	0.05	0.06
C5	0.01	0.01	0.09	0.22	0.01	0.16	0.00	0.26	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.26	0.02	0.22	0.06	0.22	0.08
C5'	0.03	0.13	0.02	0.03	0.23	0.00	0.26	0.00	0.23	0.14	0.17	0.27	0.08	0.02	0.06	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.20	0.01	0.15	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.07	0.22	0.02	0.18	0.05	0.22	0.09
N1	0.00	0.01	0.02	0.09	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.14	0.04	0.20	0.10
N3	0.01	0.00	0.02	0.10	0.00	0.07	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.17	0.06	0.21	0.08
N4	0.02	0.01	0.06	0.19	0.01	0.15	0.02	0.27	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.23	0.02	0.24	0.08	0.20	0.07
O2	0.03	0.00	0.07	0.04	0.00	0.02	0.01	0.08	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.13	0.08	0.04	0.12	0.06	0.18	0.10
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.03	0.03	0.06	0.02	0.07	0.02	0.06	0.03	0.13	0.00	0.05	0.06	0.04	0.05	0.07	0.06
O3'	0.02	0.04	0.02	0.01	0.20	0.03	0.26	0.06	0.22	0.07	0.10	0.23	0.08	0.05	0.00	0.03	0.07	0.06	0.12	0.05
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.06	0.03	0.00	0.04	0.06	0.18	0.15
O5'	0.05	0.14	0.02	0.03	0.21	0.01	0.22	0.01	0.18	0.14	0.17	0.24	0.12	0.04	0.07	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.06	0.05	0.04	0.04	0.06	0.03	0.06	0.02	0.05	0.04	0.06	0.08	0.06	0.05	0.06	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.20	0.10	0.08	0.22	0.05	0.22	0.04	0.22	0.20	0.21	0.20	0.18	0.07	0.12	0.18	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.10	0.09	0.07	0.07	0.06	0.08	0.01	0.09	0.10	0.08	0.07	0.10	0.06	0.05	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.21	0.15	0.12	0.28	0.17	0.31	0.16	0.29	0.24	0.24	0.30	0.16	0.14	0.10	0.24	0.15	0.12	0.11	0.12
C2	0.13	0.13	0.07	0.08	0.24	0.12	0.27	0.16	0.24	0.17	0.17	0.26	0.07	0.07	0.12	0.19	0.15	0.13	0.13	0.14
C2'	0.12	0.13	0.08	0.09	0.19	0.09	0.21	0.08	0.19	0.15	0.15	0.21	0.09	0.09	0.14	0.14	0.07	0.12	0.06	0.06
C3'	0.08	0.08	0.14	0.21	0.08	0.16	0.09	0.20	0.08	0.07	0.08	0.10	0.11	0.13	0.29	0.07	0.20	0.27	0.22	0.22
C4	0.11	0.13	0.08	0.09	0.24	0.10	0.27	0.14	0.24	0.16	0.18	0.27	0.08	0.11	0.18	0.16	0.14	0.14	0.14	0.15
C4'	0.07	0.07	0.09	0.16	0.11	0.12	0.13	0.16	0.11	0.08	0.09	0.13	0.08	0.09	0.22	0.07	0.15	0.20	0.14	0.15
C5	0.14	0.17	0.08	0.09	0.27	0.11	0.30	0.12	0.26	0.19	0.21	0.29	0.11	0.08	0.16	0.18	0.14	0.12	0.13	0.13
C5'	0.19	0.16	0.25	0.33	0.11	0.30	0.12	0.34	0.13	0.15	0.13	0.11	0.20	0.25	0.41	0.19	0.31	0.32	0.26	0.28
C6	0.17	0.19	0.11	0.10	0.28	0.13	0.30	0.14	0.27	0.22	0.23	0.30	0.13	0.08	0.13	0.21	0.14	0.12	0.12	0.12
N1	0.16	0.16	0.10	0.10	0.26	0.13	0.29	0.15	0.26	0.20	0.20	0.28	0.10	0.08	0.12	0.20	0.15	0.12	0.12	0.13
N3	0.11	0.12	0.07	0.08	0.23	0.11	0.26	0.16	0.23	0.15	0.16	0.25	0.07	0.10	0.16	0.16	0.15	0.14	0.15	0.15
N4	0.10	0.12	0.13	0.13	0.22	0.10	0.25	0.13	0.21	0.14	0.16	0.25	0.11	0.18	0.24	0.13	0.13	0.15	0.15	0.16
O2	0.13	0.13	0.07	0.08	0.23	0.13	0.27	0.17	0.24	0.17	0.17	0.25	0.06	0.08	0.10	0.19	0.16	0.14	0.14	0.14
O2'	0.17	0.17	0.14	0.12	0.21	0.14	0.22	0.11	0.21	0.19	0.18	0.22	0.14	0.16	0.11	0.19	0.09	0.11	0.06	0.06
O3'	0.14	0.13	0.19	0.28	0.11	0.23	0.12	0.29	0.12	0.12	0.12	0.11	0.16	0.17	0.34	0.14	0.32	0.39	0.38	0.36
O4'	0.21	0.22	0.15	0.12	0.29	0.16	0.32	0.15	0.29	0.25	0.25	0.31	0.17	0.14	0.10	0.24	0.16	0.14	0.14	0.14
O5'	0.14	0.12	0.21	0.28	0.07	0.26	0.08	0.30	0.08	0.10	0.10	0.08	0.17	0.21	0.36	0.14	0.25	0.27	0.20	0.22
OP1	0.08	0.12	0.05	0.09	0.16	0.10	0.17	0.14	0.15	0.12	0.14	0.17	0.12	0.04	0.13	0.08	0.11	0.14	0.15	0.12
OP2	0.24	0.27	0.19	0.14	0.33	0.14	0.35	0.14	0.33	0.29	0.30	0.35	0.23	0.18	0.09	0.23	0.18	0.23	0.26	0.24
P	0.07	0.10	0.04	0.07	0.14	0.07	0.16	0.12	0.14	0.11	0.12	0.16	0.09	0.05	0.11	0.07	0.10	0.14	0.12	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.01	0.05	0.06	0.11	0.06
C2	0.02	0.00	0.03	0.05	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.05	0.03	0.09	0.10	0.19	0.13
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.06	0.01	0.02	0.01	0.03	0.08	0.07	0.03
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.08	0.01	0.08	0.01	0.08	0.04	0.06	0.09	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.06	0.04
C4	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.02	0.16	0.20	0.29	0.22
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.02	0.03	0.05	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.07	0.03	0.01
C5	0.01	0.02	0.03	0.08	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.03	0.09	0.02	0.17	0.21	0.28	0.23
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.09	0.00	0.10	0.00	0.09	0.05	0.06	0.10	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.07	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.08	0.02	0.14	0.16	0.21	0.17
N1	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.09	0.10	0.17	0.12
N3	0.02	0.00	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.03	0.13	0.15	0.25	0.18
N4	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.09	0.02	0.17	0.23	0.32	0.25
O2	0.04	0.00	0.06	0.05	0.01	0.04	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.08	0.07	0.06	0.06	0.06	0.16	0.09
O2'	0.03	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.02	0.04	0.03	0.08	0.00	0.03	0.05	0.03	0.11	0.04	0.03
O3'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.08	0.02	0.09	0.03	0.08	0.04	0.07	0.09	0.07	0.03	0.00	0.01	0.04	0.17	0.09	0.09
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.06	0.05	0.01	0.00	0.03	0.05	0.08	0.05
O5'	0.05	0.09	0.03	0.02	0.16	0.01	0.17	0.00	0.14	0.09	0.13	0.17	0.06	0.03	0.04	0.03	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.06	0.10	0.08	0.10	0.20	0.07	0.21	0.07	0.16	0.10	0.15	0.23	0.06	0.11	0.17	0.05	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.19	0.07	0.06	0.29	0.03	0.28	0.01	0.21	0.17	0.25	0.32	0.16	0.04	0.09	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.13	0.03	0.04	0.22	0.01	0.23	0.01	0.17	0.12	0.18	0.25	0.09	0.03	0.09	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00