Doublet Group distance statistics: 48053

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.010, 0.023, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.023 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.010, 0.027, 0.045, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.027 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.012, 0.030, 0.049, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.030 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.005, 0.025, 0.045, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.025 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.013, 0.037, 0.061, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.037 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.009, 0.039, 0.069, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.039 std_dev=0.030
C2	A	0, 0.017, 0.049, 0.082, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.049 std_dev=0.033
O2	A	0, 0.037, 0.102, 0.167, 0.182 max_d=0.182 avg_d=0.102 std_dev=0.065
N4	A	0, 0.017, 0.084, 0.151, 0.189 max_d=0.189 avg_d=0.084 std_dev=0.067
P	B	0, 0.100, 0.320, 0.539, 0.541 max_d=0.541 avg_d=0.320 std_dev=0.219
O4'	A	0, 0.107, 0.398, 0.690, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.398 std_dev=0.291
C2'	A	0, 0.085, 0.381, 0.678, 0.676 max_d=0.676 avg_d=0.381 std_dev=0.296
C4'	B	0, 0.172, 0.528, 0.884, 0.931 max_d=0.931 avg_d=0.528 std_dev=0.356
OP1	B	0, 0.084, 0.452, 0.820, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.452 std_dev=0.368
C3'	A	0, 0.056, 0.436, 0.816, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.436 std_dev=0.380
C3'	B	0, 0.174, 0.584, 0.994, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.584 std_dev=0.410
OP2	B	0, 0.079, 0.493, 0.906, 1.085 max_d=1.085 avg_d=0.493 std_dev=0.414
C4'	A	0, 0.111, 0.533, 0.955, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.533 std_dev=0.422
C5'	B	0, 0.210, 0.659, 1.109, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.659 std_dev=0.449
O5'	B	0, 0.210, 0.709, 1.209, 1.233 max_d=1.233 avg_d=0.709 std_dev=0.499
O2'	A	0, 0.152, 0.672, 1.192, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.672 std_dev=0.520
O4'	B	0, 0.209, 0.777, 1.345, 1.473 max_d=1.473 avg_d=0.777 std_dev=0.568
C5	B	0, 0.228, 0.809, 1.390, 1.504 max_d=1.504 avg_d=0.809 std_dev=0.581
O3'	B	0, 0.180, 0.763, 1.346, 1.329 max_d=1.329 avg_d=0.763 std_dev=0.583
C4	B	0, 0.265, 0.856, 1.446, 1.521 max_d=1.521 avg_d=0.856 std_dev=0.591
C6	B	0, 0.192, 0.792, 1.391, 1.543 max_d=1.543 avg_d=0.792 std_dev=0.600
N4	B	0, 0.300, 0.901, 1.503, 1.542 max_d=1.542 avg_d=0.901 std_dev=0.602
N3	B	0, 0.291, 0.897, 1.502, 1.555 max_d=1.555 avg_d=0.897 std_dev=0.606
O3'	A	0, -0.243, 0.388, 1.019, 1.790 max_d=1.790 avg_d=0.388 std_dev=0.631
C5'	A	0, 0.169, 0.799, 1.430, 1.537 max_d=1.537 avg_d=0.799 std_dev=0.631
N1	B	0, 0.220, 0.852, 1.483, 1.625 max_d=1.625 avg_d=0.852 std_dev=0.632
C2	B	0, 0.281, 0.915, 1.548, 1.633 max_d=1.633 avg_d=0.915 std_dev=0.634
O5'	A	0, 0.141, 0.801, 1.461, 1.639 max_d=1.639 avg_d=0.801 std_dev=0.660
C2'	B	0, 0.204, 0.872, 1.540, 1.667 max_d=1.667 avg_d=0.872 std_dev=0.668
C1'	B	0, 0.219, 0.905, 1.592, 1.753 max_d=1.753 avg_d=0.905 std_dev=0.686
O2	B	0, 0.335, 1.022, 1.709, 1.761 max_d=1.761 avg_d=1.022 std_dev=0.687
P	A	0, 0.230, 1.136, 2.041, 2.250 max_d=2.250 avg_d=1.136 std_dev=0.906
O2'	B	0, 0.259, 1.173, 2.087, 2.223 max_d=2.223 avg_d=1.173 std_dev=0.914
OP1	A	0, 0.270, 1.310, 2.350, 2.589 max_d=2.589 avg_d=1.310 std_dev=1.040
OP2	A	0, 0.312, 1.412, 2.513, 2.718 max_d=2.718 avg_d=1.412 std_dev=1.100

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.06	0.03	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.25	0.01	0.11	0.12	0.11	0.09
C2	0.02	0.00	0.02	0.05	0.01	0.14	0.02	0.21	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.12	0.31	0.16	0.18	0.05	0.18	0.13
C2'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.03	0.03	0.16	0.02	0.00	0.03	0.05	0.03	0.00	0.06	0.02	0.28	0.23	0.25	0.24
C3'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.09	0.00	0.16	0.01	0.16	0.04	0.03	0.11	0.16	0.02	0.01	0.01	0.03	0.16	0.07	0.06
C4	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.13	0.15	0.02	0.06	0.17	0.12	0.09
C4'	0.01	0.14	0.03	0.00	0.04	0.00	0.14	0.00	0.17	0.02	0.10	0.05	0.28	0.06	0.02	0.01	0.01	0.09	0.07	0.02
C5	0.03	0.02	0.03	0.16	0.01	0.14	0.00	0.16	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.20	0.05	0.12	0.20	0.31	0.30	0.24
C5'	0.06	0.21	0.16	0.01	0.04	0.00	0.16	0.00	0.18	0.07	0.17	0.04	0.36	0.09	0.15	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01
C6	0.03	0.01	0.02	0.16	0.01	0.17	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.22	0.04	0.15	0.22	0.29	0.27	0.23
N1	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.08	0.20	0.01	0.10	0.12	0.10	0.08
N3	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.10	0.02	0.17	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.13	0.27	0.11	0.12	0.04	0.11	0.07
N4	0.02	0.01	0.05	0.11	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.15	0.14	0.04	0.06	0.19	0.14	0.11
O2	0.07	0.00	0.03	0.16	0.01	0.28	0.02	0.36	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.21	0.44	0.32	0.30	0.13	0.34	0.25
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.13	0.06	0.20	0.09	0.22	0.08	0.13	0.15	0.21	0.00	0.05	0.03	0.29	0.35	0.29	0.30
O3'	0.25	0.31	0.06	0.01	0.15	0.02	0.05	0.15	0.04	0.20	0.27	0.14	0.44	0.05	0.00	0.18	0.13	0.31	0.29	0.29
O4'	0.01	0.16	0.02	0.01	0.02	0.01	0.12	0.01	0.15	0.01	0.11	0.04	0.32	0.03	0.18	0.00	0.03	0.11	0.03	0.04
O5'	0.11	0.18	0.28	0.03	0.06	0.01	0.20	0.01	0.22	0.10	0.12	0.06	0.30	0.29	0.13	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.12	0.05	0.23	0.16	0.17	0.09	0.31	0.01	0.29	0.12	0.04	0.19	0.13	0.35	0.31	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.18	0.25	0.07	0.12	0.07	0.30	0.07	0.27	0.10	0.11	0.14	0.34	0.29	0.29	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.13	0.24	0.06	0.09	0.02	0.24	0.01	0.23	0.08	0.07	0.11	0.25	0.30	0.29	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.20	0.21	0.17	0.14	0.16	0.15	0.27	0.19	0.22	0.16	0.11	0.22	0.29	0.18	0.24	0.43	0.29	0.24	0.24
C2	0.22	0.17	0.18	0.16	0.14	0.14	0.15	0.29	0.16	0.17	0.14	0.15	0.19	0.27	0.15	0.20	0.42	0.23	0.20	0.21
C2'	0.26	0.20	0.21	0.18	0.17	0.17	0.18	0.24	0.20	0.22	0.18	0.16	0.22	0.28	0.18	0.25	0.42	0.32	0.29	0.25
C3'	0.23	0.15	0.16	0.11	0.07	0.10	0.09	0.20	0.14	0.17	0.11	0.03	0.18	0.26	0.14	0.20	0.41	0.27	0.14	0.19
C4	0.20	0.16	0.17	0.19	0.11	0.15	0.11	0.25	0.13	0.16	0.14	0.11	0.19	0.22	0.21	0.21	0.42	0.21	0.19	0.20
C4'	0.25	0.17	0.19	0.17	0.12	0.15	0.15	0.29	0.20	0.20	0.14	0.08	0.19	0.27	0.17	0.21	0.38	0.33	0.23	0.24
C5	0.26	0.22	0.19	0.20	0.16	0.17	0.16	0.22	0.19	0.22	0.20	0.14	0.24	0.24	0.24	0.27	0.42	0.29	0.25	0.25
C5'	0.24	0.17	0.20	0.21	0.14	0.18	0.18	0.32	0.22	0.21	0.14	0.10	0.17	0.26	0.21	0.21	0.35	0.41	0.28	0.27
C6	0.29	0.24	0.21	0.19	0.18	0.17	0.18	0.23	0.21	0.25	0.21	0.15	0.26	0.27	0.22	0.29	0.43	0.31	0.27	0.26
N1	0.26	0.21	0.21	0.17	0.14	0.16	0.15	0.25	0.18	0.22	0.17	0.12	0.23	0.28	0.18	0.25	0.43	0.28	0.24	0.24
N3	0.19	0.15	0.17	0.16	0.14	0.14	0.15	0.29	0.15	0.15	0.13	0.15	0.17	0.24	0.16	0.18	0.42	0.20	0.18	0.18
N4	0.16	0.13	0.15	0.20	0.09	0.14	0.08	0.23	0.09	0.12	0.11	0.09	0.16	0.19	0.24	0.18	0.43	0.15	0.15	0.16
O2	0.21	0.17	0.19	0.14	0.16	0.13	0.18	0.30	0.17	0.18	0.16	0.18	0.19	0.29	0.12	0.18	0.42	0.22	0.19	0.20
O2'	0.30	0.27	0.27	0.27	0.26	0.25	0.28	0.32	0.28	0.28	0.25	0.27	0.28	0.34	0.26	0.30	0.46	0.41	0.42	0.35
O3'	0.36	0.28	0.37	0.36	0.18	0.34	0.20	0.41	0.26	0.30	0.22	0.13	0.32	0.46	0.38	0.34	0.43	0.31	0.27	0.28
O4'	0.25	0.18	0.20	0.17	0.13	0.15	0.15	0.30	0.20	0.21	0.15	0.09	0.20	0.28	0.18	0.21	0.39	0.31	0.23	0.25
O5'	0.23	0.15	0.17	0.17	0.09	0.15	0.13	0.25	0.18	0.18	0.11	0.04	0.15	0.24	0.19	0.21	0.34	0.42	0.25	0.24
OP1	0.19	0.09	0.11	0.12	0.07	0.12	0.05	0.14	0.08	0.12	0.08	0.12	0.11	0.19	0.16	0.20	0.29	0.42	0.22	0.14
OP2	0.29	0.21	0.23	0.20	0.18	0.20	0.23	0.24	0.27	0.25	0.18	0.14	0.20	0.29	0.21	0.27	0.35	0.56	0.31	0.32
P	0.21	0.12	0.15	0.15	0.06	0.13	0.09	0.20	0.15	0.16	0.08	0.04	0.13	0.22	0.18	0.20	0.31	0.43	0.24	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.15	0.05	0.46	0.16
C2	0.01	0.00	0.09	0.14	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.15	0.01	0.30	0.04	0.37	0.07
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.09	0.02	0.10	0.02	0.07	0.06	0.16	0.01	0.01	0.00	0.22	0.20	0.32	0.02
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.09	0.01	0.12	0.03	0.14	0.04	0.14	0.11	0.21	0.02	0.01	0.01	0.29	0.34	0.23	0.12
C4	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.12	0.02	0.45	0.05	0.21	0.06
C4'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.07	0.02	0.08	0.06	0.10	0.04	0.03	0.00	0.01	0.13	0.41	0.10
C5	0.02	0.01	0.09	0.12	0.01	0.05	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.15	0.03	0.49	0.07	0.20	0.09
C5'	0.01	0.12	0.02	0.03	0.09	0.00	0.04	0.00	0.05	0.05	0.14	0.11	0.14	0.04	0.05	0.01	0.01	0.21	0.37	0.01
C6	0.02	0.01	0.10	0.14	0.01	0.07	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.16	0.03	0.44	0.07	0.33	0.04
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.31	0.04	0.40	0.08
N3	0.01	0.01	0.07	0.14	0.00	0.08	0.01	0.14	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.17	0.01	0.37	0.04	0.29	0.03
N4	0.02	0.01	0.06	0.11	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.15	0.02	0.48	0.06	0.12	0.11
O2	0.02	0.00	0.16	0.21	0.01	0.10	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.24	0.03	0.24	0.04	0.40	0.09
O2'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.04	0.06	0.04	0.06	0.02	0.04	0.03	0.10	0.00	0.04	0.03	0.09	0.18	0.36	0.08
O3'	0.01	0.15	0.01	0.01	0.12	0.03	0.15	0.05	0.16	0.04	0.17	0.15	0.24	0.04	0.00	0.02	0.25	0.45	0.15	0.18
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.00	0.13	0.11	0.54	0.25
O5'	0.15	0.30	0.22	0.29	0.45	0.01	0.49	0.01	0.44	0.31	0.37	0.48	0.24	0.09	0.25	0.13	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.05	0.04	0.20	0.34	0.05	0.13	0.07	0.21	0.07	0.04	0.04	0.06	0.04	0.18	0.45	0.11	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.46	0.37	0.32	0.23	0.21	0.41	0.20	0.37	0.33	0.40	0.29	0.12	0.40	0.36	0.15	0.54	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.16	0.07	0.02	0.12	0.06	0.10	0.09	0.01	0.04	0.08	0.03	0.11	0.09	0.08	0.18	0.25	0.01	0.01	0.01	0.00