Doublet Group distance statistics: 48055

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.006, 0.009, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.004, 0.009, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.009 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.002, 0.008, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.006, 0.014, 0.021, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.015 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.019, 0.040, 0.061, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.040 std_dev=0.021
N4	A	0, 0.009, 0.031, 0.053, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.031 std_dev=0.022
O4'	A	0, 0.002, 0.140, 0.279, 0.379 max_d=0.379 avg_d=0.140 std_dev=0.139
C2'	A	0, 0.033, 0.188, 0.343, 0.436 max_d=0.436 avg_d=0.188 std_dev=0.155
C3'	A	0, 0.051, 0.222, 0.393, 0.469 max_d=0.469 avg_d=0.222 std_dev=0.171
C4'	A	0, -0.010, 0.172, 0.355, 0.509 max_d=0.509 avg_d=0.172 std_dev=0.183
O3'	A	0, 0.028, 0.238, 0.448, 0.603 max_d=0.603 avg_d=0.238 std_dev=0.210
OP1	B	0, 0.192, 0.412, 0.632, 0.570 max_d=0.570 avg_d=0.412 std_dev=0.220
O2'	A	0, 0.066, 0.311, 0.557, 0.691 max_d=0.691 avg_d=0.311 std_dev=0.246
OP2	B	0, 0.251, 0.508, 0.765, 0.668 max_d=0.668 avg_d=0.508 std_dev=0.257
P	B	0, 0.219, 0.492, 0.765, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.492 std_dev=0.273
C5'	A	0, 0.009, 0.319, 0.628, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.319 std_dev=0.310
O5'	B	0, 0.176, 0.522, 0.868, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.522 std_dev=0.346
O5'	A	0, -0.005, 0.349, 0.703, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.349 std_dev=0.354
OP1	A	0, -0.005, 0.435, 0.875, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.435 std_dev=0.440
P	A	0, -0.002, 0.504, 1.011, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.504 std_dev=0.507
C5'	B	0, 0.107, 0.628, 1.149, 1.586 max_d=1.586 avg_d=0.628 std_dev=0.521
OP2	A	0, 0.063, 0.711, 1.359, 1.776 max_d=1.776 avg_d=0.711 std_dev=0.648
C4'	B	0, 0.030, 0.770, 1.509, 2.172 max_d=2.172 avg_d=0.770 std_dev=0.740
C3'	B	0, -0.039, 0.760, 1.558, 2.299 max_d=2.299 avg_d=0.760 std_dev=0.798
O4'	B	0, -0.007, 0.839, 1.685, 2.453 max_d=2.453 avg_d=0.839 std_dev=0.846
C2'	B	0, -0.106, 0.782, 1.669, 2.505 max_d=2.505 avg_d=0.782 std_dev=0.887
C6	B	0, -0.221, 0.745, 1.712, 2.644 max_d=2.644 avg_d=0.745 std_dev=0.966
C1'	B	0, -0.081, 0.885, 1.851, 2.741 max_d=2.741 avg_d=0.885 std_dev=0.966
N1	B	0, -0.118, 0.882, 1.883, 2.804 max_d=2.804 avg_d=0.882 std_dev=1.000
O3'	B	0, -0.015, 0.994, 2.002, 2.899 max_d=2.899 avg_d=0.994 std_dev=1.008
C5	B	0, -0.229, 0.800, 1.828, 2.802 max_d=2.802 avg_d=0.800 std_dev=1.029
C2	B	0, -0.044, 1.055, 2.154, 3.079 max_d=3.079 avg_d=1.055 std_dev=1.099
O2'	B	0, -0.137, 0.978, 2.092, 3.107 max_d=3.107 avg_d=0.978 std_dev=1.115
C4	B	0, -0.140, 0.992, 2.123, 3.125 max_d=3.125 avg_d=0.992 std_dev=1.132
O2	B	0, 0.038, 1.173, 2.309, 3.177 max_d=3.177 avg_d=1.173 std_dev=1.135
N3	B	0, -0.057, 1.108, 2.272, 3.241 max_d=3.241 avg_d=1.108 std_dev=1.165
N4	B	0, -0.116, 1.094, 2.304, 3.350 max_d=3.350 avg_d=1.094 std_dev=1.210

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.10	0.00	0.04	0.03	0.12	0.04
C2	0.02	0.00	0.06	0.04	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.13	0.01	0.06	0.07	0.17	0.08
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.03	0.05	0.01	0.05	0.02	0.12	0.00	0.07	0.00	0.06	0.06	0.11	0.08
C3'	0.02	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.04	0.03	0.08	0.01	0.01	0.01	0.07	0.06	0.09	0.08
C4	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.09	0.01	0.05	0.06	0.26	0.09
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.02	0.04	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.02	0.07	0.05	0.31	0.10
C5'	0.03	0.06	0.03	0.02	0.07	0.01	0.08	0.00	0.07	0.06	0.06	0.07	0.06	0.02	0.04	0.02	0.01	0.05	0.02	0.02
C6	0.00	0.01	0.05	0.03	0.01	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.03	0.07	0.03	0.27	0.09
N1	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.01	0.04	0.04	0.18	0.06
N3	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.12	0.01	0.06	0.07	0.21	0.08
N4	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.02	0.06	0.07	0.28	0.10
O2	0.03	0.00	0.12	0.08	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.18	0.01	0.08	0.08	0.15	0.09
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.05	0.02	0.06	0.03	0.14	0.00	0.11	0.01	0.07	0.07	0.13	0.09
O3'	0.10	0.13	0.07	0.01	0.09	0.04	0.07	0.04	0.07	0.10	0.12	0.09	0.18	0.11	0.00	0.09	0.03	0.08	0.05	0.03
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.00	0.02	0.07	0.08	0.03
O5'	0.04	0.06	0.06	0.07	0.05	0.02	0.07	0.01	0.07	0.04	0.06	0.06	0.08	0.07	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.03	0.07	0.06	0.06	0.06	0.04	0.05	0.05	0.03	0.04	0.07	0.07	0.08	0.07	0.08	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.17	0.11	0.09	0.26	0.02	0.31	0.02	0.27	0.18	0.21	0.28	0.15	0.13	0.05	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.08	0.08	0.08	0.09	0.02	0.10	0.02	0.09	0.06	0.08	0.10	0.09	0.09	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.09	0.07	0.10	0.17	0.17	0.14	0.18	0.10	0.07	0.14	0.22	0.08	0.12	0.14	0.15	0.17	0.13	0.15	0.14
C2	0.06	0.11	0.08	0.08	0.19	0.15	0.17	0.16	0.10	0.08	0.16	0.24	0.09	0.15	0.12	0.12	0.15	0.14	0.14	0.14
C2'	0.05	0.10	0.07	0.07	0.16	0.14	0.11	0.16	0.06	0.06	0.15	0.23	0.10	0.15	0.09	0.13	0.15	0.13	0.13	0.12
C3'	0.07	0.16	0.11	0.07	0.21	0.12	0.15	0.13	0.09	0.10	0.21	0.28	0.16	0.20	0.08	0.11	0.11	0.11	0.10	0.09
C4	0.08	0.07	0.07	0.11	0.15	0.17	0.15	0.17	0.10	0.07	0.11	0.19	0.05	0.09	0.16	0.14	0.17	0.14	0.16	0.16
C4'	0.05	0.10	0.06	0.07	0.17	0.15	0.13	0.15	0.08	0.05	0.16	0.24	0.10	0.13	0.11	0.13	0.13	0.11	0.13	0.11
C5	0.13	0.08	0.11	0.16	0.14	0.20	0.17	0.20	0.14	0.10	0.11	0.17	0.06	0.10	0.20	0.18	0.20	0.15	0.18	0.16
C5'	0.05	0.10	0.05	0.07	0.16	0.14	0.12	0.14	0.06	0.04	0.15	0.23	0.11	0.11	0.11	0.13	0.12	0.12	0.14	0.11
C6	0.12	0.07	0.10	0.15	0.14	0.20	0.16	0.20	0.13	0.09	0.10	0.18	0.04	0.10	0.19	0.18	0.19	0.14	0.17	0.16
N1	0.08	0.08	0.07	0.10	0.16	0.17	0.14	0.18	0.10	0.06	0.13	0.21	0.06	0.11	0.15	0.15	0.17	0.14	0.15	0.15
N3	0.05	0.09	0.07	0.08	0.18	0.14	0.16	0.15	0.10	0.07	0.14	0.23	0.07	0.14	0.13	0.12	0.15	0.14	0.15	0.15
N4	0.09	0.08	0.07	0.11	0.15	0.16	0.15	0.16	0.11	0.08	0.11	0.18	0.07	0.09	0.16	0.13	0.17	0.15	0.16	0.16
O2	0.07	0.14	0.12	0.08	0.22	0.14	0.19	0.15	0.13	0.11	0.19	0.28	0.12	0.20	0.11	0.11	0.14	0.14	0.14	0.14
O2'	0.06	0.10	0.07	0.08	0.16	0.16	0.11	0.18	0.06	0.06	0.15	0.23	0.09	0.15	0.10	0.14	0.17	0.15	0.15	0.15
O3'	0.05	0.10	0.07	0.06	0.15	0.13	0.09	0.14	0.05	0.06	0.14	0.21	0.10	0.16	0.08	0.12	0.11	0.10	0.09	0.08
O4'	0.11	0.09	0.09	0.12	0.18	0.19	0.18	0.18	0.14	0.09	0.14	0.23	0.08	0.13	0.17	0.17	0.17	0.13	0.15	0.15
O5'	0.04	0.12	0.06	0.05	0.19	0.12	0.14	0.13	0.08	0.07	0.18	0.26	0.12	0.13	0.08	0.11	0.12	0.11	0.11	0.09
OP1	0.07	0.10	0.08	0.10	0.08	0.13	0.06	0.11	0.05	0.05	0.12	0.14	0.13	0.08	0.11	0.12	0.10	0.10	0.13	0.08
OP2	0.07	0.14	0.08	0.16	0.26	0.22	0.15	0.28	0.04	0.05	0.23	0.37	0.13	0.09	0.15	0.17	0.30	0.33	0.31	0.31
P	0.04	0.11	0.04	0.07	0.18	0.13	0.13	0.14	0.06	0.05	0.16	0.25	0.11	0.10	0.09	0.11	0.13	0.13	0.14	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.06	0.06	0.03
C2	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.03	0.05	0.02	0.04	0.11	0.05
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.07	0.02	0.08	0.02	0.03	0.04	0.09	0.00	0.03	0.01	0.05	0.07	0.11	0.06
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.06	0.09	0.06	0.05
C4	0.00	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01	0.05	0.07	0.14	0.09
C4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.04	0.00	0.02	0.06	0.03	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.03	0.05	0.07	0.09	0.15	0.11
C5'	0.02	0.04	0.02	0.02	0.05	0.01	0.06	0.00	0.07	0.03	0.04	0.05	0.06	0.02	0.05	0.02	0.00	0.03	0.04	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.04	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.12	0.03	0.06	0.07	0.08	0.13	0.10
N1	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.05	0.10	0.05
N3	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.03	0.03	0.03	0.05	0.13	0.07
N4	0.00	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.03	0.02	0.05	0.07	0.15	0.10
O2	0.02	0.00	0.09	0.03	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.19	0.05	0.10	0.02	0.02	0.10	0.04
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.04	0.01	0.11	0.02	0.12	0.02	0.05	0.05	0.19	0.00	0.07	0.01	0.06	0.08	0.14	0.07
O3'	0.02	0.03	0.03	0.00	0.02	0.04	0.03	0.05	0.03	0.02	0.03	0.03	0.05	0.07	0.00	0.03	0.08	0.13	0.07	0.10
O4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.02	0.06	0.00	0.03	0.02	0.10	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02
O5'	0.03	0.02	0.05	0.06	0.05	0.02	0.07	0.00	0.07	0.04	0.03	0.05	0.02	0.06	0.08	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.06	0.04	0.07	0.09	0.07	0.06	0.09	0.03	0.08	0.05	0.05	0.07	0.02	0.08	0.13	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.11	0.11	0.06	0.14	0.03	0.15	0.04	0.13	0.10	0.13	0.15	0.10	0.14	0.07	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.05	0.06	0.05	0.09	0.03	0.11	0.01	0.10	0.05	0.07	0.10	0.04	0.07	0.10	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00