Doublet Group distance statistics: 48056

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.011, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.002, 0.007, 0.011, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N4	A	0, 0.006, 0.016, 0.027, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.016 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.009, 0.029, 0.049, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.029 std_dev=0.020
C2'	A	0, 0.028, 0.076, 0.125, 0.141 max_d=0.141 avg_d=0.076 std_dev=0.049
O4'	A	0, 0.021, 0.082, 0.143, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.082 std_dev=0.061
O2'	A	0, 0.000, 0.163, 0.327, 0.476 max_d=0.476 avg_d=0.163 std_dev=0.164
C4'	A	0, 0.014, 0.240, 0.467, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.240 std_dev=0.226
C3'	A	0, -0.033, 0.271, 0.576, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.271 std_dev=0.304
OP2	B	0, 0.043, 0.391, 0.738, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.391 std_dev=0.347
C6	B	0, 0.095, 0.474, 0.853, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.474 std_dev=0.379
C5	B	0, 0.031, 0.447, 0.864, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.447 std_dev=0.417
C5'	A	0, -0.019, 0.410, 0.838, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.410 std_dev=0.428
P	B	0, 0.038, 0.470, 0.903, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.470 std_dev=0.433
O5'	B	0, 0.133, 0.594, 1.055, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.594 std_dev=0.461
N1	B	0, 0.145, 0.633, 1.121, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.633 std_dev=0.488
O4'	B	0, 0.147, 0.646, 1.145, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.646 std_dev=0.499
C5'	B	0, 0.119, 0.626, 1.133, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.626 std_dev=0.507
OP1	B	0, 0.010, 0.539, 1.067, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.539 std_dev=0.529
C4	B	0, 0.082, 0.614, 1.147, 1.429 max_d=1.429 avg_d=0.614 std_dev=0.533
C1'	B	0, 0.164, 0.708, 1.253, 1.223 max_d=1.223 avg_d=0.708 std_dev=0.544
C4'	B	0, 0.145, 0.691, 1.237, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.691 std_dev=0.546
O3'	A	0, -0.117, 0.447, 1.011, 1.543 max_d=1.543 avg_d=0.447 std_dev=0.564
C3'	B	0, 0.151, 0.719, 1.287, 1.329 max_d=1.329 avg_d=0.719 std_dev=0.568
O5'	A	0, -0.009, 0.588, 1.184, 1.669 max_d=1.669 avg_d=0.588 std_dev=0.596
C2	B	0, 0.159, 0.756, 1.354, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.756 std_dev=0.598
C2'	B	0, 0.174, 0.778, 1.382, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.778 std_dev=0.604
N4	B	0, 0.083, 0.690, 1.297, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.690 std_dev=0.607
N3	B	0, 0.139, 0.751, 1.362, 1.537 max_d=1.537 avg_d=0.751 std_dev=0.612
O3'	B	0, 0.156, 0.790, 1.423, 1.491 max_d=1.491 avg_d=0.790 std_dev=0.634
P	A	0, -0.030, 0.614, 1.258, 1.805 max_d=1.805 avg_d=0.614 std_dev=0.644
O2'	B	0, 0.194, 0.871, 1.548, 1.564 max_d=1.564 avg_d=0.871 std_dev=0.677
OP2	A	0, -0.076, 0.610, 1.296, 1.913 max_d=1.913 avg_d=0.610 std_dev=0.686
O2	B	0, 0.191, 0.905, 1.619, 1.546 max_d=1.546 avg_d=0.905 std_dev=0.714
OP1	A	0, 0.014, 0.729, 1.443, 2.002 max_d=2.002 avg_d=0.729 std_dev=0.715

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.18	0.00	0.02	0.05	0.16	0.08
C2	0.02	0.00	0.03	0.10	0.00	0.10	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.06	0.05	0.24	0.21	0.08	0.15
C2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.02	0.02	0.08	0.11	0.06
C3'	0.03	0.10	0.01	0.00	0.07	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.11	0.08	0.16	0.02	0.01	0.00	0.05	0.10	0.06	0.06
C4	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.28	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.15	0.01	0.28	0.21	0.12	0.18
C4'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.10	0.00	0.06	0.00	0.03	0.04	0.11	0.11	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.12	0.06
C5	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.06	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.24	0.03	0.20	0.13	0.03	0.09
C5'	0.04	0.23	0.01	0.02	0.28	0.00	0.23	0.00	0.18	0.16	0.28	0.31	0.21	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.03	0.02
C6	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.26	0.03	0.13	0.07	0.06	0.02
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.17	0.00	0.14	0.11	0.06	0.05
N3	0.01	0.00	0.02	0.11	0.00	0.11	0.01	0.28	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.07	0.03	0.30	0.25	0.15	0.21
N4	0.01	0.00	0.01	0.08	0.00	0.11	0.01	0.31	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.13	0.14	0.01	0.31	0.25	0.18	0.22
O2	0.04	0.00	0.03	0.16	0.01	0.11	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.08	0.10	0.26	0.24	0.10	0.18
O2'	0.00	0.07	0.00	0.02	0.12	0.01	0.12	0.02	0.10	0.07	0.10	0.13	0.05	0.00	0.04	0.01	0.03	0.10	0.10	0.07
O3'	0.18	0.06	0.05	0.01	0.15	0.02	0.24	0.01	0.26	0.17	0.07	0.14	0.08	0.04	0.00	0.07	0.06	0.14	0.09	0.08
O4'	0.00	0.05	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.07	0.00	0.01	0.06	0.19	0.07
O5'	0.02	0.24	0.02	0.05	0.28	0.01	0.20	0.00	0.13	0.14	0.30	0.31	0.26	0.03	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.05	0.21	0.08	0.10	0.21	0.07	0.13	0.04	0.07	0.11	0.25	0.25	0.24	0.10	0.14	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.08	0.11	0.06	0.12	0.12	0.03	0.03	0.06	0.06	0.15	0.18	0.10	0.10	0.09	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.15	0.06	0.06	0.18	0.06	0.09	0.02	0.02	0.05	0.21	0.22	0.18	0.07	0.08	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.20	0.18	0.21	0.23	0.19	0.23	0.21	0.20	0.17	0.23	0.28	0.21	0.17	0.22	0.16	0.23	0.16	0.12	0.17
C2	0.07	0.14	0.08	0.11	0.18	0.11	0.11	0.14	0.08	0.09	0.19	0.26	0.15	0.08	0.13	0.08	0.16	0.09	0.04	0.12
C2'	0.19	0.22	0.21	0.22	0.27	0.22	0.27	0.23	0.24	0.20	0.25	0.32	0.21	0.19	0.23	0.20	0.25	0.13	0.07	0.15
C3'	0.28	0.32	0.29	0.29	0.36	0.28	0.34	0.27	0.31	0.30	0.35	0.41	0.31	0.28	0.29	0.28	0.28	0.14	0.10	0.17
C4	0.04	0.16	0.01	0.05	0.22	0.07	0.15	0.12	0.07	0.10	0.21	0.29	0.16	0.02	0.08	0.02	0.13	0.12	0.07	0.14
C4'	0.19	0.24	0.21	0.21	0.26	0.20	0.22	0.20	0.20	0.20	0.27	0.30	0.25	0.20	0.22	0.18	0.21	0.13	0.12	0.15
C5	0.06	0.16	0.07	0.12	0.21	0.13	0.12	0.18	0.06	0.09	0.21	0.27	0.16	0.06	0.14	0.07	0.20	0.19	0.17	0.21
C5'	0.20	0.27	0.21	0.21	0.26	0.18	0.18	0.19	0.17	0.22	0.30	0.31	0.29	0.21	0.22	0.16	0.17	0.22	0.25	0.19
C6	0.12	0.16	0.14	0.18	0.18	0.17	0.14	0.21	0.13	0.12	0.19	0.22	0.17	0.13	0.19	0.13	0.23	0.19	0.17	0.20
N1	0.12	0.17	0.14	0.17	0.19	0.16	0.16	0.19	0.13	0.13	0.20	0.24	0.17	0.13	0.18	0.12	0.21	0.15	0.11	0.16
N3	0.03	0.14	0.02	0.06	0.20	0.07	0.11	0.11	0.04	0.08	0.19	0.27	0.14	0.02	0.08	0.04	0.12	0.07	0.01	0.10
N4	0.11	0.21	0.08	0.04	0.28	0.04	0.24	0.07	0.17	0.17	0.26	0.33	0.20	0.07	0.04	0.07	0.07	0.08	0.02	0.11
O2	0.07	0.15	0.09	0.11	0.19	0.10	0.13	0.13	0.09	0.09	0.20	0.27	0.15	0.08	0.12	0.08	0.15	0.05	0.01	0.09
O2'	0.29	0.29	0.31	0.33	0.36	0.33	0.40	0.35	0.37	0.30	0.31	0.39	0.26	0.28	0.34	0.32	0.38	0.25	0.16	0.27
O3'	0.60	0.64	0.62	0.60	0.70	0.59	0.68	0.56	0.65	0.63	0.67	0.74	0.63	0.61	0.60	0.59	0.56	0.39	0.31	0.42
O4'	0.17	0.24	0.18	0.18	0.23	0.17	0.16	0.19	0.14	0.18	0.27	0.27	0.27	0.17	0.20	0.14	0.20	0.16	0.14	0.17
O5'	0.19	0.25	0.20	0.20	0.25	0.17	0.17	0.18	0.16	0.20	0.28	0.29	0.27	0.20	0.21	0.15	0.17	0.22	0.24	0.18
OP1	0.25	0.31	0.27	0.25	0.29	0.23	0.23	0.21	0.22	0.26	0.33	0.32	0.35	0.27	0.25	0.22	0.20	0.17	0.17	0.17
OP2	0.24	0.31	0.26	0.24	0.29	0.22	0.22	0.20	0.21	0.25	0.33	0.32	0.34	0.26	0.25	0.21	0.19	0.16	0.15	0.16
P	0.23	0.30	0.25	0.23	0.28	0.22	0.21	0.20	0.21	0.24	0.32	0.31	0.33	0.25	0.24	0.21	0.19	0.17	0.17	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.04
C2	0.03	0.00	0.04	0.06	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.07	0.07	0.12	0.10
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.04	0.05	0.00	0.01	0.00	0.02	0.08	0.05	0.02
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.06	0.04	0.07	0.08	0.06	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.09	0.04
C4	0.02	0.01	0.04	0.08	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.02	0.12	0.16	0.21	0.17
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.04	0.06	0.05	0.02	0.01	0.00	0.00	0.07	0.03	0.00
C5	0.02	0.00	0.03	0.07	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.04	0.13	0.16	0.20	0.17
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.10	0.00	0.11	0.00	0.09	0.05	0.07	0.11	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.02	0.00
C6	0.02	0.01	0.02	0.06	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.04	0.10	0.11	0.14	0.13
N1	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.06	0.05	0.10	0.09
N3	0.02	0.00	0.04	0.07	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.10	0.12	0.17	0.13
N4	0.02	0.01	0.04	0.08	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.10	0.02	0.14	0.20	0.25	0.20
O2	0.05	0.00	0.05	0.06	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.06	0.05	0.06	0.04	0.10	0.09
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.05	0.00	0.01	0.03	0.03	0.07	0.04	0.01
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.09	0.01	0.08	0.01	0.07	0.04	0.07	0.10	0.06	0.01	0.00	0.01	0.04	0.14	0.14	0.08
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.00	0.03	0.04	0.04	0.04
O5'	0.01	0.07	0.02	0.03	0.12	0.00	0.13	0.00	0.10	0.06	0.10	0.14	0.06	0.03	0.04	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.03	0.07	0.08	0.10	0.16	0.07	0.16	0.06	0.11	0.05	0.12	0.20	0.04	0.07	0.14	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.03	0.12	0.05	0.09	0.21	0.03	0.20	0.02	0.14	0.10	0.17	0.25	0.10	0.04	0.14	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.10	0.02	0.04	0.17	0.00	0.17	0.00	0.13	0.09	0.13	0.20	0.09	0.01	0.08	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00