Doublet Group distance statistics: 48063

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.003, 0.007, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.003 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.000, 0.007, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.000, 0.028, 0.057, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C1'	A	0, 0.000, 0.034, 0.069, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.034 std_dev=0.034
C6	A	0, 0.000, 0.035, 0.070, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.035 std_dev=0.035
C2	A	0, 0.000, 0.036, 0.071, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.036 std_dev=0.036
C4	A	0, 0.000, 0.037, 0.073, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.037 std_dev=0.037
O2	A	0, 0.000, 0.080, 0.161, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.080 std_dev=0.080
N4	A	0, 0.000, 0.110, 0.221, 0.221 max_d=0.221 avg_d=0.110 std_dev=0.110
O4'	A	0, 0.000, 0.201, 0.403, 0.403 max_d=0.403 avg_d=0.201 std_dev=0.201
C4'	A	0, 0.000, 0.227, 0.454, 0.454 max_d=0.454 avg_d=0.227 std_dev=0.227
C3'	A	0, 0.000, 0.242, 0.485, 0.485 max_d=0.485 avg_d=0.242 std_dev=0.242
O5'	A	0, 0.000, 0.273, 0.545, 0.545 max_d=0.545 avg_d=0.273 std_dev=0.273
OP1	B	0, 0.000, 0.313, 0.627, 0.627 max_d=0.627 avg_d=0.313 std_dev=0.313
C2'	B	0, 0.000, 0.326, 0.652, 0.652 max_d=0.652 avg_d=0.326 std_dev=0.326
O3'	A	0, 0.000, 0.341, 0.682, 0.682 max_d=0.682 avg_d=0.341 std_dev=0.341
C5'	A	0, 0.000, 0.353, 0.707, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.353 std_dev=0.353
C2'	A	0, 0.000, 0.372, 0.744, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.372 std_dev=0.372
P	A	0, 0.000, 0.383, 0.766, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.383 std_dev=0.383
O3'	B	0, 0.000, 0.403, 0.806, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.403 std_dev=0.403
O2'	B	0, 0.000, 0.417, 0.833, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.417 std_dev=0.417
OP2	A	0, 0.000, 0.428, 0.856, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.428 std_dev=0.428
OP1	A	0, 0.000, 0.436, 0.871, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.436 std_dev=0.436
P	B	0, 0.000, 0.456, 0.913, 0.913 max_d=0.913 avg_d=0.456 std_dev=0.456
C3'	B	0, 0.000, 0.460, 0.921, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.460 std_dev=0.460
C5'	B	0, 0.000, 0.482, 0.964, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.482 std_dev=0.482
O5'	B	0, 0.000, 0.490, 0.980, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.490 std_dev=0.490
C1'	B	0, 0.000, 0.492, 0.983, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.492 std_dev=0.492
C4'	B	0, 0.000, 0.529, 1.059, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.529 std_dev=0.529
N1	B	0, 0.000, 0.551, 1.102, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.551 std_dev=0.551
C2	B	0, 0.000, 0.560, 1.120, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.560 std_dev=0.560
O2	B	0, 0.000, 0.592, 1.183, 1.183 max_d=1.183 avg_d=0.592 std_dev=0.592
OP2	B	0, 0.000, 0.615, 1.230, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.615 std_dev=0.615
N3	B	0, 0.000, 0.628, 1.256, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.628 std_dev=0.628
C6	B	0, 0.000, 0.694, 1.387, 1.387 max_d=1.387 avg_d=0.694 std_dev=0.694
C4	B	0, 0.000, 0.748, 1.495, 1.495 max_d=1.495 avg_d=0.748 std_dev=0.748
O4'	B	0, 0.000, 0.759, 1.519, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.759 std_dev=0.759
C5	B	0, 0.000, 0.816, 1.632, 1.632 max_d=1.632 avg_d=0.816 std_dev=0.816
O2'	A	0, 0.000, 0.847, 1.695, 1.695 max_d=1.695 avg_d=0.847 std_dev=0.847
N4	B	0, 0.000, 0.859, 1.718, 1.718 max_d=1.718 avg_d=0.859 std_dev=0.859

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.00	0.09	0.08	0.17	0.10
C2	0.01	0.00	0.00	0.07	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.06	0.04	0.11	0.14	0.24	0.17
C2'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.02	0.18	0.09	0.17	0.07	0.06	0.15	0.09	0.00	0.03	0.00	0.23	0.22	0.36	0.26
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.05	0.02	0.05	0.06	0.07	0.05	0.07	0.01	0.01	0.02	0.05	0.06	0.07	0.06
C4	0.01	0.00	0.13	0.06	0.00	0.00	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.01	0.02	0.11	0.18	0.27	0.19
C4'	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.20	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01
C5	0.01	0.00	0.18	0.05	0.00	0.01	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.31	0.01	0.05	0.10	0.18	0.27	0.19
C5'	0.04	0.09	0.09	0.02	0.09	0.00	0.08	0.00	0.08	0.08	0.10	0.08	0.10	0.10	0.12	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00
C6	0.00	0.00	0.17	0.05	0.00	0.01	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.24	0.00	0.06	0.11	0.15	0.24	0.17
N1	0.00	0.01	0.07	0.06	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.14	0.04	0.00	0.11	0.12	0.21	0.15
N3	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.01	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.04	0.02	0.11	0.17	0.26	0.19
N4	0.01	0.00	0.15	0.05	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.34	0.01	0.03	0.10	0.20	0.28	0.19
O2	0.01	0.00	0.09	0.07	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.08	0.09	0.12	0.13	0.23	0.16
O2'	0.02	0.12	0.00	0.01	0.30	0.20	0.31	0.10	0.24	0.14	0.22	0.34	0.02	0.00	0.05	0.14	0.14	0.12	0.37	0.19
O3'	0.11	0.06	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.12	0.00	0.04	0.04	0.01	0.08	0.05	0.00	0.06	0.10	0.17	0.10	0.13
O4'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.02	0.03	0.09	0.14	0.06	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02
O5'	0.09	0.11	0.23	0.05	0.11	0.01	0.10	0.00	0.11	0.11	0.11	0.10	0.12	0.14	0.10	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.08	0.14	0.22	0.06	0.18	0.01	0.18	0.03	0.15	0.12	0.17	0.20	0.13	0.12	0.17	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.17	0.24	0.36	0.07	0.27	0.03	0.27	0.01	0.24	0.21	0.26	0.28	0.23	0.37	0.10	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.17	0.26	0.06	0.19	0.01	0.19	0.00	0.17	0.15	0.19	0.19	0.16	0.19	0.13	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.10	0.10	0.08	0.03	0.12	0.11	0.18	0.09	0.02	0.06	0.04	0.19	0.31	0.07	0.09	0.08	0.11	0.09	0.02
C2	0.08	0.05	0.03	0.18	0.17	0.24	0.26	0.28	0.24	0.12	0.08	0.19	0.04	0.26	0.16	0.27	0.22	0.04	0.23	0.14
C2'	0.08	0.01	0.03	0.21	0.12	0.28	0.21	0.38	0.20	0.10	0.03	0.12	0.08	0.16	0.21	0.23	0.26	0.10	0.26	0.20
C3'	0.05	0.05	0.04	0.03	0.03	0.07	0.08	0.13	0.06	0.01	0.03	0.04	0.12	0.15	0.05	0.03	0.02	0.17	0.03	0.05
C4	0.08	0.04	0.09	0.16	0.11	0.24	0.18	0.30	0.17	0.09	0.05	0.11	0.02	0.25	0.16	0.30	0.24	0.01	0.25	0.16
C4'	0.05	0.05	0.02	0.04	0.05	0.05	0.10	0.10	0.08	0.00	0.02	0.07	0.13	0.16	0.02	0.01	0.01	0.16	0.03	0.04
C5	0.04	0.00	0.12	0.12	0.05	0.21	0.10	0.27	0.11	0.05	0.01	0.05	0.04	0.24	0.14	0.24	0.17	0.08	0.14	0.08
C5'	0.00	0.00	0.07	0.07	0.09	0.08	0.13	0.13	0.12	0.05	0.03	0.10	0.06	0.02	0.05	0.02	0.05	0.10	0.06	0.00
C6	0.01	0.02	0.10	0.11	0.05	0.18	0.11	0.23	0.10	0.03	0.01	0.06	0.08	0.25	0.13	0.18	0.13	0.11	0.11	0.04
N1	0.02	0.02	0.07	0.14	0.09	0.18	0.17	0.24	0.16	0.05	0.01	0.10	0.09	0.27	0.12	0.19	0.15	0.09	0.15	0.07
N3	0.10	0.06	0.05	0.19	0.17	0.26	0.26	0.30	0.24	0.13	0.09	0.19	0.01	0.25	0.17	0.31	0.25	0.00	0.29	0.18
N4	0.08	0.03	0.11	0.14	0.09	0.24	0.15	0.29	0.15	0.08	0.04	0.09	0.01	0.25	0.15	0.32	0.25	0.05	0.29	0.20
O2	0.10	0.08	0.01	0.20	0.23	0.25	0.32	0.29	0.29	0.16	0.12	0.25	0.03	0.24	0.16	0.28	0.23	0.03	0.26	0.15
O2'	0.08	0.19	0.11	0.12	0.04	0.21	0.10	0.38	0.10	0.06	0.17	0.04	0.32	0.38	0.08	0.13	0.27	0.24	0.34	0.28
O3'	0.12	0.10	0.08	0.06	0.02	0.04	0.07	0.04	0.04	0.05	0.06	0.05	0.18	0.18	0.09	0.08	0.02	0.19	0.05	0.07
O4'	0.12	0.12	0.12	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.05	0.06	0.08	0.03	0.21	0.32	0.02	0.02	0.03	0.21	0.01	0.08
O5'	0.05	0.04	0.03	0.00	0.02	0.04	0.06	0.11	0.05	0.01	0.02	0.03	0.09	0.07	0.01	0.01	0.03	0.10	0.05	0.02
OP1	0.00	0.00	0.08	0.01	0.02	0.05	0.04	0.14	0.04	0.02	0.00	0.02	0.03	0.15	0.01	0.03	0.07	0.04	0.09	0.06
OP2	0.02	0.02	0.04	0.04	0.01	0.02	0.03	0.14	0.03	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.09	0.06	0.14	0.08
P	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.05	0.13	0.04	0.01	0.00	0.03	0.04	0.05	0.00	0.01	0.06	0.01	0.08	0.04

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.08	0.09	0.13	0.08
C2	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.10	0.11	0.19	0.10
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.22	0.31	0.28	0.26
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.05	0.02	0.02	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.13	0.02	0.06
C4	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.01	0.01	0.10	0.11	0.19	0.10
C4'	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01
C5	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.03	0.04	0.09	0.11	0.17	0.10
C5'	0.05	0.08	0.11	0.00	0.11	0.01	0.12	0.00	0.12	0.09	0.09	0.12	0.05	0.05	0.06	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00
C6	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.03	0.05	0.10	0.11	0.16	0.10
N1	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.01	0.10	0.11	0.17	0.10
N3	0.00	0.00	0.03	0.02	0.00	0.00	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.10	0.11	0.20	0.10
N4	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.02	0.02	0.09	0.10	0.19	0.10
O2	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.10	0.11	0.20	0.10
O2'	0.02	0.02	0.00	0.00	0.06	0.06	0.07	0.05	0.07	0.04	0.04	0.06	0.01	0.00	0.09	0.00	0.21	0.32	0.34	0.27
O3'	0.03	0.02	0.06	0.00	0.01	0.02	0.03	0.06	0.03	0.00	0.01	0.02	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.02
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.05	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.00	0.10	0.12	0.10	0.13
O5'	0.08	0.10	0.22	0.04	0.10	0.02	0.09	0.00	0.10	0.10	0.10	0.09	0.10	0.21	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.09	0.11	0.31	0.13	0.11	0.01	0.11	0.06	0.11	0.11	0.11	0.10	0.11	0.32	0.07	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.13	0.19	0.28	0.02	0.19	0.02	0.17	0.01	0.16	0.17	0.20	0.19	0.20	0.34	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.08	0.10	0.26	0.06	0.10	0.01	0.10	0.00	0.10	0.10	0.10	0.10	0.10	0.27	0.02	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00