Doublet Group distance statistics: 48065

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.000, 0.015, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.000, 0.015, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C6	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
O2	A	0, 0.000, 0.039, 0.078, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.039 std_dev=0.039
N4	A	0, 0.000, 0.058, 0.115, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.058 std_dev=0.058
C2'	A	0, 0.000, 0.124, 0.248, 0.248 max_d=0.248 avg_d=0.124 std_dev=0.124
O4'	A	0, 0.000, 0.207, 0.414, 0.414 max_d=0.414 avg_d=0.207 std_dev=0.207
O2'	A	0, 0.000, 0.214, 0.428, 0.428 max_d=0.428 avg_d=0.214 std_dev=0.214
C4'	A	0, 0.000, 0.419, 0.839, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.419 std_dev=0.419
C3'	A	0, 0.000, 0.435, 0.870, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.435 std_dev=0.435
P	B	0, 0.000, 0.524, 1.047, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.524 std_dev=0.524
C5'	A	0, 0.000, 0.543, 1.086, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.543 std_dev=0.543
OP2	B	0, 0.000, 0.543, 1.087, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.543 std_dev=0.543
OP2	A	0, 0.000, 0.595, 1.189, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.595 std_dev=0.595
O5'	A	0, 0.000, 0.595, 1.190, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.595 std_dev=0.595
P	A	0, 0.000, 0.677, 1.355, 1.355 max_d=1.355 avg_d=0.677 std_dev=0.677
O3'	A	0, 0.000, 0.712, 1.425, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.712 std_dev=0.712
OP1	A	0, 0.000, 0.864, 1.729, 1.729 max_d=1.729 avg_d=0.864 std_dev=0.864
O5'	B	0, 0.000, 0.984, 1.967, 1.967 max_d=1.967 avg_d=0.984 std_dev=0.984
OP1	B	0, 0.000, 1.027, 2.055, 2.055 max_d=2.055 avg_d=1.027 std_dev=1.027
C5'	B	0, 0.000, 1.595, 3.191, 3.191 max_d=3.191 avg_d=1.595 std_dev=1.595
C3'	B	0, 0.000, 1.714, 3.429, 3.429 max_d=3.429 avg_d=1.714 std_dev=1.714
C6	B	0, 0.000, 1.801, 3.601, 3.601 max_d=3.601 avg_d=1.801 std_dev=1.801
C4'	B	0, 0.000, 1.889, 3.778, 3.778 max_d=3.778 avg_d=1.889 std_dev=1.889
O4'	B	0, 0.000, 1.952, 3.903, 3.903 max_d=3.903 avg_d=1.952 std_dev=1.952
C5	B	0, 0.000, 2.048, 4.096, 4.096 max_d=4.096 avg_d=2.048 std_dev=2.048
N1	B	0, 0.000, 2.229, 4.457, 4.457 max_d=4.457 avg_d=2.229 std_dev=2.229
C2'	B	0, 0.000, 2.231, 4.461, 4.461 max_d=4.461 avg_d=2.231 std_dev=2.231
C1'	B	0, 0.000, 2.237, 4.475, 4.475 max_d=4.475 avg_d=2.237 std_dev=2.237
O3'	B	0, 0.000, 2.505, 5.010, 5.010 max_d=5.010 avg_d=2.505 std_dev=2.505
C4	B	0, 0.000, 2.668, 5.337, 5.337 max_d=5.337 avg_d=2.668 std_dev=2.668
C2	B	0, 0.000, 2.799, 5.599, 5.599 max_d=5.599 avg_d=2.799 std_dev=2.799
N3	B	0, 0.000, 2.975, 5.949, 5.949 max_d=5.949 avg_d=2.975 std_dev=2.975
N4	B	0, 0.000, 3.048, 6.096, 6.096 max_d=6.096 avg_d=3.048 std_dev=3.048
O2'	B	0, 0.000, 3.144, 6.289, 6.289 max_d=6.289 avg_d=3.144 std_dev=3.144
O2	B	0, 0.000, 3.228, 6.456, 6.456 max_d=6.456 avg_d=3.228 std_dev=3.228

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.07	0.04
C2	0.01	0.00	0.06	0.17	0.00	0.08	0.01	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.20	0.00	0.05	0.08	0.15	0.10
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.06	0.06	0.06	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.07	0.04
C3'	0.02	0.17	0.00	0.00	0.20	0.00	0.16	0.01	0.11	0.11	0.20	0.22	0.14	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.03
C4	0.00	0.00	0.05	0.20	0.00	0.10	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.26	0.01	0.08	0.16	0.20	0.15
C4'	0.00	0.08	0.02	0.00	0.10	0.00	0.09	0.01	0.06	0.05	0.10	0.12	0.05	0.12	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.16	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.20	0.01	0.08	0.14	0.18	0.15
C5'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.13	0.01	0.10	0.00	0.06	0.05	0.12	0.15	0.07	0.12	0.03	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.01	0.11	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.01	0.05	0.09	0.14	0.11
N1	0.00	0.00	0.03	0.11	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.13	0.00	0.04	0.06	0.12	0.09
N3	0.01	0.00	0.06	0.20	0.00	0.10	0.01	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.26	0.00	0.07	0.13	0.19	0.13
N4	0.00	0.00	0.06	0.22	0.00	0.12	0.01	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.30	0.01	0.09	0.20	0.23	0.18
O2	0.02	0.00	0.06	0.14	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.13	0.18	0.01	0.03	0.05	0.13	0.08
O2'	0.00	0.09	0.01	0.03	0.05	0.12	0.02	0.12	0.00	0.03	0.08	0.06	0.13	0.00	0.03	0.09	0.13	0.10	0.14	0.14
O3'	0.02	0.20	0.03	0.01	0.26	0.01	0.20	0.03	0.14	0.13	0.26	0.30	0.18	0.03	0.00	0.01	0.01	0.05	0.11	0.03
O4'	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.03
O5'	0.00	0.05	0.02	0.01	0.08	0.00	0.08	0.00	0.05	0.04	0.07	0.09	0.03	0.13	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.00	0.08	0.02	0.03	0.16	0.03	0.14	0.03	0.09	0.06	0.13	0.20	0.05	0.10	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.15	0.07	0.09	0.20	0.05	0.18	0.03	0.14	0.12	0.19	0.23	0.13	0.14	0.11	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.10	0.04	0.03	0.15	0.02	0.15	0.01	0.11	0.09	0.13	0.18	0.08	0.14	0.03	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.04	0.36	0.16	0.38	0.73	0.52	0.60	0.59	0.32	0.21	0.60	0.97	0.27	0.10	0.82	0.37	0.35	0.72	0.13	0.36
C2	0.18	0.57	0.39	0.18	0.89	0.30	0.75	0.39	0.48	0.41	0.79	1.12	0.50	0.39	0.55	0.16	0.22	0.69	0.09	0.35
C2'	0.02	0.46	0.21	0.31	0.87	0.45	0.73	0.51	0.42	0.30	0.73	1.14	0.36	0.11	0.74	0.30	0.27	0.70	0.21	0.31
C3'	0.05	0.47	0.22	0.25	0.90	0.38	0.80	0.41	0.49	0.33	0.74	1.17	0.34	0.05	0.70	0.24	0.15	0.54	0.43	0.13
C4	0.12	0.43	0.36	0.18	0.68	0.30	0.58	0.39	0.37	0.30	0.60	0.85	0.37	0.36	0.52	0.20	0.24	0.67	0.08	0.35
C4'	0.13	0.26	0.04	0.43	0.68	0.56	0.59	0.58	0.30	0.14	0.51	0.93	0.13	0.13	0.91	0.41	0.30	0.61	0.33	0.21
C5	0.10	0.19	0.13	0.37	0.47	0.52	0.40	0.59	0.18	0.09	0.37	0.64	0.12	0.09	0.76	0.41	0.38	0.73	0.12	0.37
C5'	0.24	0.12	0.09	0.50	0.55	0.63	0.49	0.62	0.21	0.02	0.36	0.78	0.03	0.31	1.00	0.49	0.31	0.54	0.40	0.15
C6	0.14	0.20	0.08	0.42	0.52	0.57	0.43	0.64	0.19	0.08	0.40	0.72	0.11	0.02	0.85	0.45	0.40	0.73	0.13	0.37
N1	0.00	0.38	0.21	0.33	0.71	0.47	0.59	0.55	0.33	0.23	0.60	0.94	0.29	0.17	0.74	0.33	0.33	0.72	0.12	0.36
N3	0.25	0.61	0.47	0.10	0.90	0.21	0.76	0.30	0.51	0.46	0.81	1.09	0.55	0.49	0.43	0.09	0.17	0.65	0.07	0.33
N4	0.22	0.47	0.47	0.06	0.66	0.17	0.58	0.25	0.40	0.36	0.60	0.78	0.43	0.49	0.36	0.09	0.15	0.57	0.04	0.32
O2	0.27	0.70	0.47	0.12	1.04	0.23	0.87	0.33	0.58	0.52	0.94	1.29	0.64	0.49	0.48	0.08	0.18	0.67	0.08	0.33
O2'	0.01	0.43	0.18	0.35	0.82	0.48	0.67	0.55	0.37	0.26	0.69	1.09	0.33	0.11	0.78	0.34	0.33	0.74	0.10	0.38
O3'	0.14	0.59	0.29	0.16	1.05	0.27	0.94	0.29	0.62	0.45	0.87	1.32	0.45	0.09	0.61	0.13	0.03	0.45	0.56	0.01
O4'	0.18	0.20	0.01	0.49	0.58	0.63	0.48	0.67	0.20	0.07	0.44	0.81	0.09	0.09	0.97	0.48	0.41	0.70	0.17	0.33
O5'	0.36	0.03	0.21	0.61	0.38	0.73	0.34	0.72	0.07	0.11	0.20	0.60	0.17	0.41	1.14	0.60	0.40	0.54	0.33	0.18
OP1	0.43	0.15	0.31	0.60	0.28	0.72	0.28	0.65	0.03	0.18	0.08	0.49	0.32	0.60	1.16	0.61	0.30	0.30	0.51	0.02
OP2	0.42	0.14	0.28	0.61	0.26	0.75	0.26	0.70	0.02	0.19	0.07	0.45	0.30	0.53	1.16	0.63	0.34	0.35	0.48	0.02
P	0.41	0.13	0.28	0.63	0.28	0.75	0.27	0.71	0.02	0.18	0.09	0.49	0.29	0.52	1.18	0.62	0.36	0.38	0.43	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.18	0.00	0.12	0.22	0.02	0.09
C2	0.02	0.00	0.10	0.18	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.12	0.02	0.03	0.08	0.19	0.04	0.04
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.14	0.09	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.00	0.01	0.33	0.56	0.30	0.39
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.24	0.00	0.22	0.01	0.18	0.16	0.22	0.25	0.15	0.02	0.00	0.02	0.03	0.25	0.03	0.12
C4	0.02	0.01	0.01	0.24	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.22	0.12	0.00	0.06	0.14	0.07	0.01
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.25	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.07	0.22	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.23	0.15	0.03	0.05	0.10	0.08	0.01
C5'	0.07	0.07	0.14	0.01	0.10	0.00	0.11	0.00	0.10	0.08	0.09	0.11	0.05	0.10	0.15	0.01	0.00	0.12	0.06	0.00
C6	0.00	0.00	0.09	0.18	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.19	0.09	0.04	0.06	0.12	0.06	0.01
N1	0.01	0.00	0.01	0.16	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.13	0.01	0.00	0.08	0.17	0.04	0.04
N3	0.02	0.01	0.08	0.22	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.06	0.02	0.07	0.18	0.05	0.03
N4	0.02	0.02	0.01	0.25	0.00	0.04	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.24	0.15	0.00	0.06	0.13	0.07	0.00
O2	0.03	0.00	0.19	0.15	0.02	0.04	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.09	0.04	0.08	0.21	0.03	0.05
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.22	0.25	0.23	0.10	0.19	0.13	0.17	0.24	0.02	0.00	0.01	0.15	0.21	0.52	0.28	0.31
O3'	0.18	0.02	0.00	0.00	0.12	0.01	0.15	0.15	0.09	0.01	0.06	0.15	0.09	0.01	0.00	0.14	0.14	0.03	0.19	0.08
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.15	0.14	0.00	0.05	0.04	0.14	0.11
O5'	0.12	0.08	0.33	0.03	0.06	0.01	0.05	0.00	0.06	0.08	0.07	0.06	0.08	0.21	0.14	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.22	0.19	0.56	0.25	0.14	0.02	0.10	0.12	0.12	0.17	0.18	0.13	0.21	0.52	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.02	0.04	0.30	0.03	0.07	0.02	0.08	0.06	0.06	0.04	0.05	0.07	0.03	0.28	0.19	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.04	0.39	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.00	0.05	0.31	0.08	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00