Doublet Group distance statistics: 48075

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 1, 1, 3, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.010, 0.021, 0.031, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.021 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.014, 0.029, 0.045, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.029 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.020, 0.036, 0.053, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.036 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.018, 0.035, 0.052, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.035 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.005, 0.027, 0.049, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.027 std_dev=0.022
N9	A	0, 0.022, 0.049, 0.076, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.049 std_dev=0.027
C2	A	0, 0.005, 0.034, 0.063, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.034 std_dev=0.029
N3	A	0, 0.012, 0.047, 0.082, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.047 std_dev=0.035
N6	A	0, 0.041, 0.078, 0.115, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.078 std_dev=0.037
O4'	A	0, 0.029, 0.067, 0.105, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.067 std_dev=0.038
N7	A	0, 0.058, 0.101, 0.144, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.101 std_dev=0.043
C8	A	0, 0.059, 0.107, 0.156, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.107 std_dev=0.049
C2'	A	0, 0.049, 0.109, 0.168, 0.180 max_d=0.180 avg_d=0.109 std_dev=0.059
C4'	A	0, 0.039, 0.099, 0.158, 0.235 max_d=0.235 avg_d=0.099 std_dev=0.059
C3'	A	0, 0.059, 0.131, 0.202, 0.211 max_d=0.211 avg_d=0.131 std_dev=0.071
C5'	A	0, 0.109, 0.210, 0.311, 0.382 max_d=0.382 avg_d=0.210 std_dev=0.101
O5'	B	0, 0.102, 0.224, 0.347, 0.379 max_d=0.379 avg_d=0.224 std_dev=0.122
O3'	A	0, 0.040, 0.179, 0.318, 0.424 max_d=0.424 avg_d=0.179 std_dev=0.139
P	B	0, 0.075, 0.217, 0.359, 0.418 max_d=0.418 avg_d=0.217 std_dev=0.142
O2'	A	0, 0.159, 0.302, 0.445, 0.465 max_d=0.465 avg_d=0.302 std_dev=0.143
C2'	B	0, 0.230, 0.426, 0.622, 0.582 max_d=0.582 avg_d=0.426 std_dev=0.196
OP2	B	0, 0.115, 0.312, 0.509, 0.590 max_d=0.590 avg_d=0.312 std_dev=0.197
P	A	0, 0.239, 0.444, 0.649, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.444 std_dev=0.205
C1'	B	0, 0.222, 0.440, 0.659, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.440 std_dev=0.218
OP1	B	0, 0.115, 0.336, 0.558, 0.664 max_d=0.664 avg_d=0.336 std_dev=0.221
O5'	A	0, 0.133, 0.359, 0.585, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.359 std_dev=0.226
C3'	B	0, 0.142, 0.392, 0.642, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.392 std_dev=0.250
O4'	B	0, 0.200, 0.450, 0.700, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.450 std_dev=0.250
O2'	B	0, 0.192, 0.477, 0.762, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.477 std_dev=0.285
C4'	B	0, 0.003, 0.303, 0.602, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.303 std_dev=0.300
N9	B	0, 0.337, 0.652, 0.967, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.652 std_dev=0.315
OP1	A	0, 0.327, 0.659, 0.990, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.659 std_dev=0.332
C4	B	0, 0.385, 0.743, 1.102, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.743 std_dev=0.359
N3	B	0, 0.423, 0.785, 1.146, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.785 std_dev=0.362
C8	B	0, 0.449, 0.840, 1.231, 1.220 max_d=1.220 avg_d=0.840 std_dev=0.391
OP2	A	0, 0.339, 0.771, 1.203, 1.516 max_d=1.516 avg_d=0.771 std_dev=0.432
C5	B	0, 0.504, 0.948, 1.392, 1.429 max_d=1.429 avg_d=0.948 std_dev=0.444
C2	B	0, 0.559, 1.012, 1.464, 1.466 max_d=1.466 avg_d=1.012 std_dev=0.453
O3'	B	0, 0.266, 0.734, 1.202, 1.867 max_d=1.867 avg_d=0.734 std_dev=0.468
N7	B	0, 0.537, 1.006, 1.474, 1.428 max_d=1.428 avg_d=1.006 std_dev=0.469
C5'	B	0, -0.004, 0.479, 0.962, 1.859 max_d=1.859 avg_d=0.479 std_dev=0.483
C6	B	0, 0.615, 1.143, 1.671, 1.614 max_d=1.614 avg_d=1.143 std_dev=0.528
N1	B	0, 0.638, 1.168, 1.697, 1.628 max_d=1.628 avg_d=1.168 std_dev=0.530
N6	B	0, 0.747, 1.401, 2.055, 2.093 max_d=2.093 avg_d=1.401 std_dev=0.654

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.05	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.00	0.07	0.13	0.25	0.04
C2	0.05	0.00	0.05	0.05	0.03	0.05	0.02	0.09	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.03	0.06	0.07	0.05	0.04	0.26	0.23	0.26	0.16
C2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.09	0.31	0.08
C3'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.06	0.05	0.06	0.05	0.06	0.06	0.04	0.04	0.01	0.01	0.07	0.10	0.33	0.11
C4	0.02	0.03	0.02	0.05	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.03	0.19	0.15	0.29	0.11
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.04	0.05	0.03	0.02	0.07	0.01	0.01	0.01	0.09	0.19	0.03
C5	0.02	0.02	0.03	0.06	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.03	0.16	0.11	0.33	0.12
C5'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.07	0.01	0.07	0.00	0.09	0.02	0.10	0.08	0.09	0.04	0.03	0.07	0.03	0.02	0.01	0.08	0.12	0.02
C6	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.07	0.04	0.21	0.15	0.32	0.16
C8	0.01	0.05	0.04	0.05	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.00	0.04	0.04	0.05	0.01	0.01	0.06	0.06	0.03	0.04	0.08	0.34	0.08
N1	0.03	0.01	0.03	0.06	0.02	0.05	0.02	0.10	0.01	0.04	0.00	0.02	0.03	0.02	0.04	0.04	0.06	0.04	0.25	0.20	0.29	0.17
N3	0.05	0.01	0.05	0.05	0.02	0.04	0.02	0.08	0.03	0.04	0.02	0.00	0.04	0.02	0.05	0.08	0.04	0.04	0.24	0.21	0.25	0.14
N6	0.02	0.03	0.03	0.06	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.05	0.03	0.04	0.00	0.04	0.03	0.04	0.07	0.04	0.19	0.12	0.34	0.16
N7	0.02	0.03	0.04	0.06	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.00	0.02	0.06	0.07	0.03	0.08	0.06	0.36	0.11
N9	0.01	0.06	0.03	0.04	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.04	0.05	0.03	0.02	0.00	0.02	0.04	0.02	0.10	0.12	0.29	0.06
O2'	0.03	0.07	0.01	0.04	0.02	0.07	0.03	0.07	0.03	0.06	0.04	0.08	0.04	0.06	0.02	0.00	0.07	0.07	0.07	0.11	0.28	0.09
O3'	0.03	0.05	0.03	0.01	0.05	0.01	0.06	0.03	0.07	0.06	0.06	0.04	0.07	0.07	0.04	0.07	0.00	0.02	0.12	0.17	0.38	0.16
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03	0.02	0.07	0.02	0.00	0.07	0.17	0.16	0.03
O5'	0.07	0.26	0.03	0.07	0.19	0.01	0.16	0.01	0.21	0.04	0.25	0.24	0.19	0.08	0.10	0.07	0.12	0.07	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.13	0.23	0.09	0.10	0.15	0.09	0.11	0.08	0.15	0.08	0.20	0.21	0.12	0.06	0.12	0.11	0.17	0.17	0.03	0.00	0.02	0.02
OP2	0.25	0.26	0.31	0.33	0.29	0.19	0.33	0.12	0.32	0.34	0.29	0.25	0.34	0.36	0.29	0.28	0.38	0.16	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.04	0.16	0.08	0.11	0.11	0.03	0.12	0.02	0.16	0.08	0.17	0.14	0.16	0.11	0.06	0.09	0.16	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.20	0.14	0.13	0.05	0.07	0.06	0.16	0.05	0.17	0.14	0.17	0.07	0.15	0.08	0.23	0.31	0.11	0.15	0.07	0.07	0.03
C2	0.17	0.22	0.16	0.13	0.14	0.13	0.14	0.13	0.14	0.23	0.19	0.17	0.15	0.19	0.18	0.22	0.21	0.21	0.13	0.08	0.11	0.07
C2'	0.07	0.23	0.12	0.12	0.08	0.10	0.07	0.23	0.08	0.16	0.16	0.21	0.09	0.15	0.07	0.21	0.35	0.15	0.19	0.11	0.06	0.08
C3'	0.10	0.23	0.15	0.19	0.11	0.09	0.09	0.14	0.10	0.15	0.17	0.22	0.11	0.15	0.09	0.23	0.41	0.14	0.06	0.03	0.07	0.02
C4	0.14	0.19	0.16	0.14	0.10	0.13	0.12	0.13	0.09	0.23	0.15	0.14	0.11	0.19	0.15	0.24	0.26	0.19	0.16	0.09	0.10	0.08
C4'	0.08	0.22	0.14	0.17	0.10	0.07	0.09	0.13	0.09	0.15	0.15	0.20	0.11	0.15	0.08	0.23	0.37	0.12	0.04	0.09	0.19	0.08
C5	0.17	0.18	0.17	0.16	0.12	0.18	0.13	0.18	0.11	0.24	0.15	0.14	0.13	0.20	0.18	0.25	0.23	0.23	0.16	0.12	0.13	0.10
C5'	0.09	0.21	0.16	0.20	0.11	0.10	0.10	0.12	0.10	0.15	0.15	0.20	0.12	0.16	0.10	0.24	0.40	0.11	0.07	0.18	0.29	0.15
C6	0.20	0.20	0.18	0.15	0.16	0.20	0.16	0.21	0.15	0.25	0.19	0.16	0.16	0.21	0.21	0.24	0.18	0.27	0.15	0.12	0.14	0.10
C8	0.11	0.16	0.18	0.20	0.06	0.15	0.10	0.16	0.06	0.22	0.11	0.13	0.10	0.19	0.13	0.27	0.33	0.18	0.19	0.14	0.11	0.11
N1	0.20	0.22	0.18	0.14	0.17	0.18	0.17	0.18	0.16	0.25	0.20	0.18	0.17	0.22	0.21	0.23	0.19	0.26	0.15	0.10	0.13	0.09
N3	0.14	0.20	0.15	0.13	0.11	0.11	0.12	0.11	0.11	0.22	0.17	0.15	0.12	0.18	0.15	0.23	0.25	0.17	0.13	0.07	0.11	0.06
N6	0.21	0.22	0.18	0.15	0.18	0.21	0.18	0.24	0.18	0.24	0.21	0.18	0.19	0.21	0.22	0.25	0.15	0.29	0.14	0.12	0.16	0.11
N7	0.15	0.17	0.18	0.19	0.09	0.21	0.12	0.22	0.09	0.23	0.13	0.13	0.11	0.20	0.16	0.27	0.26	0.24	0.17	0.15	0.15	0.12
N9	0.11	0.17	0.17	0.16	0.06	0.12	0.10	0.13	0.06	0.22	0.11	0.13	0.09	0.19	0.13	0.25	0.31	0.16	0.18	0.10	0.07	0.08
O2'	0.11	0.22	0.10	0.05	0.12	0.19	0.14	0.35	0.13	0.21	0.17	0.20	0.17	0.21	0.13	0.19	0.24	0.22	0.22	0.13	0.08	0.10
O3'	0.16	0.26	0.17	0.21	0.17	0.16	0.14	0.20	0.15	0.16	0.20	0.26	0.16	0.17	0.15	0.22	0.39	0.21	0.02	0.04	0.03	0.01
O4'	0.05	0.20	0.14	0.15	0.06	0.04	0.07	0.12	0.06	0.16	0.14	0.17	0.08	0.15	0.07	0.24	0.34	0.10	0.07	0.06	0.17	0.05
O5'	0.13	0.23	0.16	0.21	0.16	0.15	0.16	0.18	0.16	0.20	0.19	0.22	0.17	0.20	0.15	0.24	0.39	0.16	0.19	0.30	0.40	0.27
OP1	0.07	0.16	0.12	0.18	0.08	0.09	0.11	0.08	0.09	0.17	0.11	0.15	0.15	0.18	0.09	0.24	0.36	0.07	0.16	0.25	0.27	0.21
OP2	0.29	0.27	0.33	0.40	0.28	0.36	0.30	0.37	0.29	0.32	0.27	0.28	0.34	0.33	0.29	0.31	0.57	0.30	0.37	0.33	0.35	0.36
P	0.05	0.14	0.13	0.21	0.06	0.12	0.09	0.13	0.08	0.15	0.09	0.14	0.14	0.17	0.07	0.21	0.40	0.05	0.18	0.22	0.26	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.07	0.10	0.03	0.03	0.01	0.01	0.06	0.01	0.10	0.14	0.15	0.10
C2	0.09	0.00	0.26	0.23	0.02	0.14	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.36	0.34	0.07	0.17	0.19	0.14	0.15
C2'	0.01	0.26	0.00	0.00	0.13	0.02	0.10	0.01	0.14	0.09	0.22	0.25	0.12	0.07	0.05	0.00	0.06	0.01	0.13	0.10	0.20	0.11
C3'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.09	0.01	0.08	0.01	0.11	0.16	0.18	0.22	0.12	0.13	0.04	0.01	0.02	0.02	0.23	0.15	0.27	0.18
C4	0.04	0.02	0.13	0.09	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.19	0.15	0.03	0.12	0.19	0.20	0.14
C4'	0.01	0.14	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.03	0.13	0.08	0.14	0.08	0.12	0.03	0.10	0.04	0.01	0.03	0.05	0.18	0.04
C5	0.02	0.01	0.10	0.08	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.17	0.12	0.05	0.14	0.26	0.28	0.19
C5'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.10	0.19	0.05	0.10	0.18	0.20	0.06	0.09	0.05	0.02	0.01	0.08	0.24	0.02
C6	0.03	0.01	0.14	0.11	0.01	0.03	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.23	0.18	0.05	0.13	0.27	0.27	0.18
C8	0.04	0.02	0.09	0.16	0.01	0.13	0.01	0.19	0.02	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.00	0.07	0.14	0.09	0.17	0.26	0.33	0.22
N1	0.07	0.01	0.22	0.18	0.02	0.08	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.32	0.28	0.04	0.13	0.22	0.19	0.14
N3	0.10	0.01	0.25	0.22	0.00	0.14	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.33	0.30	0.08	0.17	0.18	0.13	0.16
N6	0.03	0.02	0.12	0.12	0.02	0.08	0.03	0.18	0.01	0.06	0.02	0.02	0.00	0.06	0.04	0.21	0.17	0.09	0.17	0.36	0.37	0.26
N7	0.03	0.02	0.07	0.13	0.01	0.12	0.01	0.20	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.09	0.12	0.09	0.18	0.31	0.36	0.25
N9	0.01	0.02	0.05	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.00	0.07	0.06	0.02	0.12	0.19	0.22	0.14
O2'	0.01	0.36	0.00	0.01	0.19	0.10	0.17	0.09	0.23	0.07	0.32	0.33	0.21	0.09	0.07	0.00	0.07	0.06	0.19	0.14	0.27	0.18
O3'	0.06	0.34	0.06	0.02	0.15	0.04	0.12	0.05	0.18	0.14	0.28	0.30	0.17	0.12	0.06	0.07	0.00	0.04	0.44	0.32	0.44	0.38
O4'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.02	0.05	0.09	0.04	0.08	0.09	0.09	0.02	0.06	0.04	0.00	0.18	0.20	0.16	0.16
O5'	0.10	0.17	0.13	0.23	0.12	0.03	0.14	0.01	0.13	0.17	0.13	0.17	0.17	0.18	0.12	0.19	0.44	0.18	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.14	0.19	0.10	0.15	0.19	0.05	0.26	0.08	0.27	0.26	0.22	0.18	0.36	0.31	0.19	0.14	0.32	0.20	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.14	0.20	0.27	0.20	0.18	0.28	0.24	0.27	0.33	0.19	0.13	0.37	0.36	0.22	0.27	0.44	0.16	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.15	0.11	0.18	0.14	0.04	0.19	0.02	0.18	0.22	0.14	0.16	0.26	0.25	0.14	0.18	0.38	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00