Doublet Group distance statistics: 48078

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.020 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.004, 0.021, 0.039, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.021 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.002, 0.021, 0.041, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.021 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.006, 0.025, 0.045, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.025 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.009, 0.033, 0.057, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.033 std_dev=0.024
N6	A	0, 0.014, 0.040, 0.067, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.040 std_dev=0.027
C1'	A	0, 0.007, 0.036, 0.066, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.036 std_dev=0.030
N9	A	0, 0.007, 0.039, 0.070, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.039 std_dev=0.031
N7	A	0, 0.014, 0.045, 0.076, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.045 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.011, 0.053, 0.095, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.053 std_dev=0.042
O4'	A	0, 0.123, 0.428, 0.732, 0.756 max_d=0.756 avg_d=0.428 std_dev=0.305
P	B	0, 0.143, 0.458, 0.774, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.458 std_dev=0.316
OP2	B	0, 0.071, 0.394, 0.716, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.394 std_dev=0.323
C2'	A	0, 0.103, 0.430, 0.757, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.430 std_dev=0.327
C4'	A	0, 0.182, 0.680, 1.178, 1.265 max_d=1.265 avg_d=0.680 std_dev=0.498
C3'	A	0, 0.180, 0.695, 1.211, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.695 std_dev=0.515
OP1	B	0, 0.266, 0.805, 1.344, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.805 std_dev=0.539
O2'	A	0, 0.060, 0.663, 1.267, 1.702 max_d=1.702 avg_d=0.663 std_dev=0.604
P	A	0, 0.266, 0.880, 1.494, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.880 std_dev=0.614
C5'	B	0, 0.208, 0.851, 1.494, 1.531 max_d=1.531 avg_d=0.851 std_dev=0.643
O5'	B	0, 0.210, 0.908, 1.605, 1.885 max_d=1.885 avg_d=0.908 std_dev=0.697
O5'	A	0, -0.086, 0.619, 1.324, 2.092 max_d=2.092 avg_d=0.619 std_dev=0.705
C3'	B	0, 0.253, 0.972, 1.690, 1.877 max_d=1.877 avg_d=0.972 std_dev=0.718
C4'	B	0, 0.277, 1.024, 1.770, 1.871 max_d=1.871 avg_d=1.024 std_dev=0.747
O3'	A	0, 0.254, 1.005, 1.755, 1.877 max_d=1.877 avg_d=1.005 std_dev=0.750
C5'	A	0, 0.301, 1.076, 1.850, 2.018 max_d=2.018 avg_d=1.076 std_dev=0.774
C2'	B	0, 0.332, 1.125, 1.917, 2.065 max_d=2.065 avg_d=1.125 std_dev=0.793
O2'	B	0, 0.366, 1.178, 1.990, 2.149 max_d=2.149 avg_d=1.178 std_dev=0.812
OP2	A	0, 0.273, 1.103, 1.933, 2.139 max_d=2.139 avg_d=1.103 std_dev=0.830
O4'	B	0, 0.320, 1.175, 2.031, 2.156 max_d=2.156 avg_d=1.175 std_dev=0.856
O3'	B	0, 0.336, 1.192, 2.049, 2.048 max_d=2.048 avg_d=1.192 std_dev=0.857
C1'	B	0, 0.343, 1.204, 2.065, 2.224 max_d=2.224 avg_d=1.204 std_dev=0.861
OP1	A	0, 0.382, 1.251, 2.121, 2.245 max_d=2.245 avg_d=1.251 std_dev=0.869
N9	B	0, 0.345, 1.250, 2.156, 2.376 max_d=2.376 avg_d=1.250 std_dev=0.905
C8	B	0, 0.299, 1.249, 2.199, 2.582 max_d=2.582 avg_d=1.249 std_dev=0.950
C4	B	0, 0.389, 1.368, 2.348, 2.473 max_d=2.473 avg_d=1.368 std_dev=0.979
N7	B	0, 0.308, 1.324, 2.341, 2.763 max_d=2.763 avg_d=1.324 std_dev=1.017
C5	B	0, 0.374, 1.395, 2.417, 2.691 max_d=2.691 avg_d=1.395 std_dev=1.021
N3	B	0, 0.406, 1.443, 2.481, 2.521 max_d=2.521 avg_d=1.443 std_dev=1.037
C6	B	0, 0.410, 1.503, 2.596, 2.822 max_d=2.822 avg_d=1.503 std_dev=1.093
C2	B	0, 0.426, 1.548, 2.669, 2.786 max_d=2.786 avg_d=1.548 std_dev=1.121
N1	B	0, 0.443, 1.581, 2.719, 2.731 max_d=2.731 avg_d=1.581 std_dev=1.138
N6	B	0, 0.394, 1.540, 2.686, 3.048 max_d=3.048 avg_d=1.540 std_dev=1.146

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.03	0.01	0.04	0.04	0.04	0.03	0.05	0.05	0.04	0.05	0.01	0.01	0.16	0.00	0.20	0.15	0.44	0.15
C2	0.05	0.00	0.25	0.18	0.01	0.13	0.01	0.25	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.24	0.16	0.22	0.14	0.38	0.30	0.06
C2'	0.00	0.25	0.00	0.01	0.14	0.02	0.09	0.12	0.13	0.17	0.20	0.24	0.11	0.14	0.03	0.00	0.04	0.01	0.16	0.22	0.35	0.14
C3'	0.02	0.18	0.01	0.00	0.18	0.01	0.24	0.02	0.24	0.26	0.22	0.15	0.27	0.27	0.17	0.01	0.01	0.02	0.29	0.30	0.29	0.17
C4	0.03	0.01	0.14	0.18	0.00	0.07	0.01	0.17	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.16	0.07	0.12	0.19	0.31	0.33	0.05
C4'	0.01	0.13	0.02	0.01	0.07	0.00	0.11	0.01	0.09	0.21	0.09	0.13	0.12	0.19	0.09	0.23	0.02	0.00	0.01	0.21	0.45	0.14
C5	0.04	0.01	0.09	0.24	0.01	0.11	0.00	0.19	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.25	0.10	0.04	0.25	0.37	0.29	0.09
C5'	0.04	0.25	0.12	0.02	0.17	0.01	0.19	0.00	0.20	0.22	0.22	0.23	0.22	0.24	0.11	0.11	0.16	0.01	0.01	0.34	0.29	0.03
C6	0.04	0.01	0.13	0.24	0.01	0.09	0.01	0.20	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.24	0.12	0.08	0.23	0.40	0.27	0.08
C8	0.03	0.02	0.17	0.26	0.02	0.21	0.02	0.22	0.03	0.00	0.03	0.02	0.05	0.01	0.01	0.34	0.18	0.15	0.33	0.34	0.31	0.17
N1	0.05	0.00	0.20	0.22	0.02	0.09	0.02	0.22	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.22	0.13	0.16	0.17	0.41	0.29	0.07
N3	0.05	0.01	0.24	0.15	0.01	0.13	0.01	0.23	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.23	0.17	0.23	0.14	0.33	0.33	0.03
N6	0.04	0.02	0.11	0.27	0.03	0.12	0.03	0.22	0.01	0.05	0.02	0.02	0.00	0.05	0.04	0.29	0.16	0.06	0.29	0.43	0.26	0.11
N7	0.05	0.01	0.14	0.27	0.01	0.19	0.01	0.24	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.00	0.04	0.36	0.19	0.09	0.34	0.39	0.27	0.16
N9	0.01	0.02	0.03	0.17	0.01	0.09	0.02	0.11	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.04	0.00	0.16	0.02	0.02	0.23	0.26	0.36	0.11
O2'	0.01	0.24	0.00	0.01	0.16	0.23	0.25	0.11	0.24	0.34	0.22	0.23	0.29	0.36	0.16	0.00	0.10	0.17	0.11	0.33	0.69	0.32
O3'	0.16	0.16	0.04	0.01	0.07	0.02	0.10	0.16	0.12	0.18	0.13	0.17	0.16	0.19	0.02	0.10	0.00	0.10	0.37	0.32	0.51	0.28
O4'	0.00	0.22	0.01	0.02	0.12	0.00	0.04	0.01	0.08	0.15	0.16	0.23	0.06	0.09	0.02	0.17	0.10	0.00	0.36	0.18	0.53	0.26
O5'	0.20	0.14	0.16	0.29	0.19	0.01	0.25	0.01	0.23	0.33	0.17	0.14	0.29	0.34	0.23	0.11	0.37	0.36	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.15	0.38	0.22	0.30	0.31	0.21	0.37	0.34	0.40	0.34	0.41	0.33	0.43	0.39	0.26	0.33	0.32	0.18	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.44	0.30	0.35	0.29	0.33	0.45	0.29	0.29	0.27	0.31	0.29	0.33	0.26	0.27	0.36	0.69	0.51	0.53	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.15	0.06	0.14	0.17	0.05	0.14	0.09	0.03	0.08	0.17	0.07	0.03	0.11	0.16	0.11	0.32	0.28	0.26	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.22	0.26	0.24	0.23	0.21	0.23	0.22	0.23	0.24	0.22	0.22	0.24	0.24	0.23	0.28	0.33	0.22	0.30	0.13	0.13	0.17
C2	0.12	0.14	0.13	0.13	0.13	0.11	0.13	0.05	0.13	0.13	0.13	0.13	0.14	0.13	0.13	0.16	0.44	0.11	0.14	0.33	0.12	0.13
C2'	0.38	0.28	0.32	0.29	0.36	0.49	0.40	0.64	0.38	0.46	0.32	0.30	0.40	0.45	0.40	0.33	0.43	0.49	0.68	0.48	0.42	0.48
C3'	0.25	0.21	0.22	0.16	0.25	0.30	0.26	0.39	0.25	0.29	0.22	0.21	0.27	0.28	0.26	0.29	0.26	0.30	0.42	0.32	0.26	0.23
C4	0.15	0.16	0.18	0.17	0.16	0.13	0.16	0.08	0.16	0.16	0.16	0.16	0.17	0.16	0.16	0.19	0.40	0.13	0.15	0.27	0.12	0.13
C4'	0.19	0.20	0.21	0.26	0.20	0.16	0.20	0.19	0.20	0.20	0.19	0.20	0.21	0.20	0.20	0.19	0.19	0.17	0.29	0.28	0.36	0.29
C5	0.16	0.16	0.19	0.18	0.16	0.14	0.15	0.06	0.15	0.15	0.16	0.16	0.16	0.15	0.16	0.18	0.40	0.13	0.05	0.35	0.13	0.15
C5'	0.25	0.28	0.21	0.30	0.25	0.24	0.24	0.27	0.24	0.23	0.26	0.28	0.25	0.22	0.24	0.19	0.28	0.25	0.34	0.40	0.50	0.41
C6	0.13	0.14	0.16	0.15	0.13	0.13	0.12	0.08	0.13	0.12	0.13	0.14	0.13	0.12	0.13	0.15	0.42	0.12	0.03	0.42	0.15	0.17
C8	0.21	0.21	0.26	0.25	0.20	0.16	0.20	0.07	0.20	0.20	0.20	0.21	0.20	0.20	0.21	0.26	0.37	0.16	0.09	0.22	0.11	0.13
N1	0.11	0.12	0.12	0.13	0.11	0.10	0.11	0.04	0.11	0.11	0.12	0.12	0.12	0.11	0.11	0.13	0.44	0.09	0.06	0.40	0.14	0.15
N3	0.14	0.15	0.15	0.14	0.15	0.14	0.15	0.10	0.15	0.15	0.15	0.15	0.16	0.15	0.15	0.18	0.42	0.14	0.19	0.27	0.12	0.13
N6	0.16	0.16	0.18	0.16	0.15	0.17	0.14	0.16	0.14	0.13	0.15	0.17	0.13	0.13	0.15	0.15	0.41	0.16	0.10	0.50	0.17	0.21
N7	0.21	0.21	0.25	0.23	0.20	0.18	0.19	0.10	0.19	0.19	0.20	0.21	0.18	0.19	0.20	0.24	0.38	0.17	0.03	0.34	0.14	0.16
N9	0.18	0.19	0.23	0.21	0.19	0.15	0.19	0.11	0.19	0.19	0.19	0.19	0.19	0.19	0.19	0.24	0.37	0.16	0.18	0.19	0.11	0.13
O2'	0.28	0.19	0.22	0.22	0.26	0.44	0.29	0.66	0.27	0.36	0.21	0.21	0.30	0.35	0.30	0.21	0.22	0.43	0.73	0.65	0.57	0.57
O3'	0.27	0.24	0.25	0.34	0.27	0.32	0.28	0.40	0.27	0.29	0.25	0.26	0.29	0.29	0.28	0.18	0.24	0.28	0.45	0.50	0.37	0.36
O4'	0.32	0.34	0.37	0.38	0.34	0.25	0.34	0.19	0.34	0.32	0.34	0.34	0.34	0.33	0.33	0.34	0.31	0.28	0.15	0.37	0.35	0.35
O5'	0.11	0.05	0.19	0.29	0.10	0.19	0.14	0.27	0.11	0.18	0.07	0.05	0.15	0.18	0.13	0.21	0.03	0.13	0.42	0.37	0.47	0.40
OP1	0.22	0.42	0.20	0.19	0.33	0.09	0.30	0.24	0.35	0.19	0.40	0.40	0.33	0.23	0.26	0.34	0.02	0.11	0.43	0.26	0.39	0.28
OP2	0.68	0.59	0.60	0.32	0.64	0.63	0.63	0.55	0.61	0.63	0.59	0.61	0.60	0.63	0.65	0.63	0.02	0.71	0.46	0.33	0.17	0.22
P	0.14	0.17	0.15	0.02	0.15	0.19	0.14	0.17	0.15	0.13	0.16	0.17	0.14	0.13	0.14	0.23	0.01	0.17	0.32	0.03	0.17	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.22	0.01	0.03	0.08	0.18	0.15
C2	0.02	0.00	0.08	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.10	0.37	0.03	0.05	0.12	0.16	0.10
C2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.02	0.03	0.14	0.04	0.06	0.06	0.08	0.05	0.05	0.02	0.01	0.06	0.03	0.07	0.19	0.26	0.25
C3'	0.03	0.04	0.01	0.00	0.03	0.01	0.07	0.02	0.05	0.12	0.02	0.05	0.08	0.12	0.05	0.04	0.01	0.02	0.08	0.16	0.22	0.21
C4	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.26	0.03	0.05	0.13	0.15	0.13
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.04	0.05	0.04	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.05	0.16	0.13
C5	0.02	0.01	0.03	0.07	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.08	0.19	0.03	0.06	0.19	0.14	0.14
C5'	0.06	0.04	0.14	0.02	0.07	0.02	0.09	0.00	0.08	0.13	0.06	0.04	0.10	0.12	0.08	0.07	0.16	0.02	0.01	0.09	0.03	0.03
C6	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.23	0.03	0.06	0.18	0.13	0.13
C8	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.04	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.15	0.06	0.02	0.09	0.25	0.15	0.18
N1	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.31	0.03	0.05	0.14	0.14	0.11
N3	0.02	0.00	0.08	0.05	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.37	0.03	0.05	0.10	0.17	0.11
N6	0.04	0.02	0.05	0.08	0.01	0.05	0.02	0.10	0.00	0.05	0.02	0.01	0.00	0.05	0.04	0.09	0.20	0.06	0.09	0.23	0.14	0.15
N7	0.02	0.01	0.05	0.12	0.01	0.04	0.00	0.12	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.01	0.14	0.08	0.02	0.09	0.26	0.15	0.18
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.02	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.17	0.01	0.05	0.15	0.15	0.15
O2'	0.02	0.10	0.01	0.04	0.04	0.06	0.08	0.07	0.06	0.15	0.05	0.10	0.09	0.14	0.07	0.00	0.11	0.03	0.09	0.22	0.24	0.25
O3'	0.22	0.37	0.06	0.01	0.26	0.02	0.19	0.16	0.23	0.06	0.31	0.37	0.20	0.08	0.17	0.11	0.00	0.12	0.33	0.31	0.26	0.33
O4'	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.06	0.02	0.01	0.03	0.12	0.00	0.05	0.13	0.12	0.08
O5'	0.03	0.05	0.07	0.08	0.05	0.03	0.06	0.01	0.06	0.09	0.05	0.05	0.09	0.09	0.05	0.09	0.33	0.05	0.00	0.02	0.02	0.02
OP1	0.08	0.12	0.19	0.16	0.13	0.05	0.19	0.09	0.18	0.25	0.14	0.10	0.23	0.26	0.15	0.22	0.31	0.13	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.18	0.16	0.26	0.22	0.15	0.16	0.14	0.03	0.13	0.15	0.14	0.17	0.14	0.15	0.15	0.24	0.26	0.12	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.15	0.10	0.25	0.21	0.13	0.13	0.14	0.03	0.13	0.18	0.11	0.11	0.15	0.18	0.15	0.25	0.33	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00