Doublet Group distance statistics: 48080

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N7	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.007, 0.025, 0.043, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.025 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.007, 0.025, 0.043, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.025 std_dev=0.018
N6	A	0, 0.009, 0.030, 0.051, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.030 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.009, 0.032, 0.054, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.032 std_dev=0.022
N9	A	0, 0.009, 0.032, 0.055, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.032 std_dev=0.023
C2	A	0, 0.011, 0.037, 0.064, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.037 std_dev=0.027
N3	A	0, 0.012, 0.042, 0.071, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.042 std_dev=0.030
C1'	A	0, 0.014, 0.051, 0.087, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.051 std_dev=0.036
OP2	B	0, 0.076, 0.283, 0.489, 0.488 max_d=0.488 avg_d=0.283 std_dev=0.207
P	B	0, 0.091, 0.350, 0.609, 0.619 max_d=0.619 avg_d=0.350 std_dev=0.259
O3'	A	0, 0.218, 0.747, 1.276, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.747 std_dev=0.529
OP1	B	0, 0.349, 1.337, 2.326, 2.358 max_d=2.358 avg_d=1.337 std_dev=0.988
C3'	A	0, 0.481, 1.643, 2.806, 2.509 max_d=2.509 avg_d=1.643 std_dev=1.162
O5'	B	0, 0.474, 1.639, 2.805, 2.607 max_d=2.607 avg_d=1.639 std_dev=1.165
O4'	A	0, 0.507, 1.733, 2.958, 2.619 max_d=2.619 avg_d=1.733 std_dev=1.225
C2'	A	0, 0.517, 1.764, 3.012, 2.670 max_d=2.670 avg_d=1.764 std_dev=1.248
C4'	A	0, 0.653, 2.230, 3.807, 3.363 max_d=3.363 avg_d=2.230 std_dev=1.577
C5'	B	0, 0.715, 2.464, 4.213, 3.879 max_d=3.879 avg_d=2.464 std_dev=1.749
O2'	A	0, 0.867, 2.960, 5.053, 4.463 max_d=4.463 avg_d=2.960 std_dev=2.093
C4'	B	0, 1.140, 3.906, 6.672, 6.045 max_d=6.045 avg_d=3.906 std_dev=2.766
C5'	A	0, 1.203, 4.107, 7.012, 6.197 max_d=6.197 avg_d=4.107 std_dev=2.904
C3'	B	0, 1.214, 4.155, 7.095, 6.378 max_d=6.378 avg_d=4.155 std_dev=2.940
O4'	B	0, 1.360, 4.656, 7.952, 7.179 max_d=7.179 avg_d=4.656 std_dev=3.296
N7	B	0, 1.383, 4.722, 8.061, 7.095 max_d=7.095 avg_d=4.722 std_dev=3.339
C8	B	0, 1.395, 4.765, 8.134, 7.213 max_d=7.213 avg_d=4.765 std_dev=3.370
O3'	B	0, 1.417, 4.840, 8.264, 7.346 max_d=7.346 avg_d=4.840 std_dev=3.423
C5	B	0, 1.477, 5.044, 8.611, 7.605 max_d=7.605 avg_d=5.044 std_dev=3.567
N9	B	0, 1.496, 5.112, 8.727, 7.761 max_d=7.761 avg_d=5.112 std_dev=3.615
C4	B	0, 1.548, 5.286, 9.025, 7.954 max_d=7.954 avg_d=5.286 std_dev=3.738
C6	B	0, 1.563, 5.339, 9.115, 8.118 max_d=8.118 avg_d=5.339 std_dev=3.776
N6	B	0, 1.567, 5.357, 9.148, 8.200 max_d=8.200 avg_d=5.357 std_dev=3.790
O5'	A	0, 1.588, 5.422, 9.255, 8.147 max_d=8.147 avg_d=5.422 std_dev=3.834
C1'	B	0, 1.595, 5.455, 9.315, 8.356 max_d=8.356 avg_d=5.455 std_dev=3.860
C2'	B	0, 1.598, 5.466, 9.333, 8.384 max_d=8.384 avg_d=5.466 std_dev=3.868
N3	B	0, 1.692, 5.776, 9.860, 8.683 max_d=8.683 avg_d=5.776 std_dev=4.084
N1	B	0, 1.699, 5.804, 9.909, 8.820 max_d=8.820 avg_d=5.804 std_dev=4.105
C2	B	0, 1.749, 5.971, 10.193, 9.009 max_d=9.009 avg_d=5.971 std_dev=4.222
O2'	B	0, 1.996, 6.823, 11.651, 10.445 max_d=10.445 avg_d=6.823 std_dev=4.828
P	A	0, 2.180, 7.443, 12.707, 11.172 max_d=11.172 avg_d=7.443 std_dev=5.263
OP2	A	0, 2.278, 7.780, 13.281, 11.726 max_d=11.726 avg_d=7.780 std_dev=5.501
OP1	A	0, 2.414, 8.242, 14.071, 12.427 max_d=12.427 avg_d=8.242 std_dev=5.828

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.00	0.00	0.00	0.14	0.00	0.10	0.18	0.01	0.06
C2	0.04	0.00	0.30	0.36	0.01	0.34	0.00	0.80	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.08	0.60	1.26	0.88	0.86
C2'	0.00	0.30	0.00	0.00	0.14	0.02	0.04	0.03	0.10	0.19	0.22	0.32	0.05	0.13	0.02	0.00	0.03	0.03	0.05	0.28	0.15	0.04
C3'	0.03	0.36	0.00	0.00	0.18	0.00	0.09	0.01	0.17	0.14	0.29	0.34	0.13	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.13	0.28	0.12	0.08
C4	0.02	0.01	0.14	0.18	0.00	0.20	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.11	0.05	0.23	0.72	0.45	0.38
C4'	0.01	0.34	0.02	0.00	0.20	0.00	0.14	0.01	0.21	0.06	0.30	0.32	0.18	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.02	0.14	0.03	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.09	0.00	0.14	0.00	0.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.13	0.03	0.13	0.65	0.41	0.28
C5'	0.03	0.80	0.03	0.01	0.46	0.01	0.37	0.00	0.53	0.07	0.72	0.72	0.46	0.09	0.16	0.02	0.02	0.01	0.00	0.26	0.13	0.00
C6	0.02	0.00	0.10	0.17	0.00	0.21	0.00	0.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.11	0.05	0.29	0.91	0.62	0.50
C8	0.01	0.01	0.19	0.14	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.20	0.16	0.03	0.26	0.13	0.07	0.22
N1	0.03	0.00	0.22	0.29	0.00	0.30	0.00	0.72	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.09	0.07	0.50	1.19	0.84	0.77
N3	0.04	0.00	0.32	0.34	0.00	0.32	0.00	0.72	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.07	0.08	0.50	1.05	0.71	0.70
N6	0.02	0.00	0.05	0.13	0.00	0.18	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.13	0.04	0.23	0.86	0.59	0.44
N7	0.00	0.01	0.13	0.07	0.00	0.01	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.21	0.16	0.01	0.14	0.30	0.11	0.07
N9	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.13	0.01	0.04	0.34	0.13	0.05
O2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.06	0.01	0.14	0.02	0.12	0.20	0.05	0.05	0.16	0.21	0.10	0.00	0.01	0.02	0.06	0.28	0.15	0.04
O3'	0.14	0.07	0.03	0.01	0.11	0.02	0.13	0.02	0.11	0.16	0.09	0.07	0.13	0.16	0.13	0.01	0.00	0.04	0.15	0.20	0.05	0.11
O4'	0.00	0.08	0.03	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.03	0.07	0.08	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.19	0.10	0.03	0.14
O5'	0.10	0.60	0.05	0.13	0.23	0.02	0.13	0.00	0.29	0.26	0.50	0.50	0.23	0.14	0.04	0.06	0.15	0.19	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.18	1.26	0.28	0.28	0.72	0.14	0.65	0.26	0.91	0.13	1.19	1.05	0.86	0.30	0.34	0.28	0.20	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.01	0.88	0.15	0.12	0.45	0.03	0.41	0.13	0.62	0.07	0.84	0.71	0.59	0.11	0.13	0.15	0.05	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.86	0.04	0.08	0.38	0.02	0.28	0.00	0.50	0.22	0.77	0.70	0.44	0.07	0.05	0.04	0.11	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.27	0.31	0.38	0.10	0.30	0.20	0.22	0.36	0.14	0.37	0.15	0.47	0.09	0.10	0.33	0.48	0.28	0.18	0.31	0.04	0.00
C2	0.10	0.55	0.27	0.14	0.21	0.03	0.10	0.10	0.24	0.20	0.49	0.43	0.17	0.26	0.05	0.36	0.20	0.13	0.08	0.43	0.07	0.02
C2'	0.38	0.34	0.49	0.66	0.09	0.62	0.24	0.62	0.49	0.20	0.50	0.14	0.67	0.09	0.19	0.52	0.80	0.53	0.62	0.20	0.66	0.54
C3'	0.51	0.40	0.77	0.94	0.08	0.79	0.30	0.71	0.61	0.25	0.62	0.14	0.88	0.12	0.26	0.85	1.20	0.60	0.67	0.41	0.64	0.60
C4	0.08	0.43	0.20	0.08	0.23	0.05	0.19	0.11	0.32	0.07	0.43	0.35	0.28	0.06	0.09	0.25	0.12	0.14	0.09	0.41	0.06	0.03
C4'	0.60	0.37	0.95	1.10	0.07	0.85	0.32	0.70	0.66	0.29	0.63	0.11	0.97	0.15	0.31	1.04	1.38	0.63	0.61	0.40	0.41	0.48
C5	0.33	0.48	0.58	0.41	0.37	0.15	0.24	0.01	0.26	0.13	0.39	0.48	0.13	0.06	0.29	0.64	0.47	0.02	0.01	0.46	0.04	0.05
C5'	0.76	0.59	1.19	1.47	0.14	1.22	0.52	1.12	0.99	0.27	0.95	0.20	1.43	0.31	0.33	1.31	1.86	0.86	1.00	0.98	0.81	0.95
C6	0.43	0.59	0.75	0.54	0.41	0.23	0.17	0.03	0.18	0.10	0.40	0.60	0.13	0.04	0.33	0.86	0.66	0.07	0.03	0.49	0.04	0.06
C8	0.19	0.29	0.31	0.19	0.29	0.03	0.31	0.07	0.32	0.25	0.31	0.27	0.31	0.28	0.25	0.31	0.20	0.06	0.06	0.42	0.04	0.04
N1	0.29	0.61	0.56	0.38	0.31	0.13	0.10	0.03	0.17	0.07	0.46	0.55	0.19	0.19	0.19	0.68	0.49	0.02	0.02	0.47	0.05	0.05
N3	0.03	0.47	0.08	0.04	0.17	0.12	0.13	0.15	0.31	0.23	0.48	0.34	0.28	0.22	0.05	0.13	0.05	0.20	0.12	0.39	0.07	0.01
N6	0.64	0.61	1.07	0.79	0.50	0.40	0.19	0.11	0.08	0.23	0.31	0.72	0.23	0.04	0.48	1.24	0.96	0.21	0.09	0.51	0.02	0.08
N7	0.44	0.37	0.70	0.54	0.42	0.24	0.33	0.04	0.27	0.34	0.30	0.43	0.16	0.27	0.43	0.72	0.59	0.11	0.04	0.47	0.03	0.07
N9	0.02	0.33	0.03	0.08	0.19	0.14	0.24	0.15	0.35	0.02	0.38	0.24	0.38	0.10	0.05	0.05	0.12	0.19	0.13	0.38	0.06	0.02
O2'	0.24	0.26	0.28	0.39	0.08	0.39	0.17	0.38	0.34	0.14	0.37	0.13	0.45	0.07	0.12	0.30	0.48	0.37	0.40	0.12	0.47	0.31
O3'	0.50	0.24	0.76	0.83	0.10	0.62	0.15	0.46	0.39	0.32	0.40	0.09	0.60	0.09	0.31	0.85	1.07	0.50	0.42	0.10	0.29	0.26
O4'	0.47	0.23	0.72	0.80	0.08	0.59	0.21	0.42	0.44	0.26	0.40	0.09	0.65	0.11	0.28	0.75	0.95	0.47	0.33	0.03	0.03	0.11
O5'	1.27	0.24	1.79	1.98	0.33	1.64	0.17	1.41	0.66	0.71	0.62	0.27	1.16	0.12	0.81	1.95	2.40	1.28	1.20	1.13	0.77	1.03
OP1	1.29	0.62	1.89	1.97	0.21	1.71	0.45	1.45	1.09	0.57	1.10	0.21	1.66	0.18	0.71	2.28	2.50	1.30	1.10	1.18	0.66	0.97
OP2	0.92	0.76	1.56	1.86	0.26	1.55	0.73	1.41	1.27	0.18	1.22	0.29	1.81	0.52	0.34	1.86	2.57	0.98	1.15	1.55	0.85	1.18
P	1.37	0.41	1.97	2.21	0.26	1.90	0.33	1.67	0.91	0.62	0.87	0.23	1.48	0.13	0.78	2.25	2.83	1.41	1.37	1.50	0.91	1.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.13	0.15	0.11
C2	0.02	0.00	0.25	0.14	0.01	0.14	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.28	0.21	0.27	0.06	0.22	0.31	0.13
C2'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.12	0.01	0.04	0.01	0.10	0.17	0.19	0.25	0.06	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.18	0.08	0.06
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.09	0.00	0.07	0.00	0.09	0.08	0.13	0.13	0.08	0.06	0.04	0.00	0.01	0.02	0.05	0.17	0.20	0.11
C4	0.01	0.01	0.12	0.09	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.10	0.14	0.15	0.29	0.36	0.23
C4'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.06	0.00	0.02	0.00	0.04	0.12	0.10	0.14	0.02	0.09	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.13	0.05	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.07	0.26	0.46	0.53	0.39
C5'	0.03	0.20	0.01	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.03	0.29	0.11	0.19	0.09	0.25	0.09	0.03	0.03	0.01	0.00	0.11	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.09	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.11	0.13	0.21	0.47	0.53	0.36
C8	0.00	0.01	0.17	0.08	0.00	0.12	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.14	0.14	0.42	0.49	0.55	0.49
N1	0.02	0.00	0.19	0.13	0.00	0.10	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.20	0.17	0.21	0.11	0.35	0.42	0.24
N3	0.02	0.00	0.25	0.13	0.00	0.14	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.18	0.27	0.05	0.17	0.25	0.10
N6	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.10	0.08	0.28	0.59	0.64	0.46
N7	0.01	0.01	0.11	0.06	0.00	0.09	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.11	0.07	0.41	0.58	0.66	0.54
N9	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.23	0.29	0.34	0.27
O2'	0.01	0.28	0.00	0.00	0.12	0.03	0.03	0.03	0.09	0.17	0.20	0.27	0.05	0.12	0.02	0.00	0.02	0.04	0.02	0.21	0.15	0.09
O3'	0.01	0.21	0.01	0.01	0.10	0.01	0.07	0.03	0.11	0.14	0.17	0.18	0.10	0.11	0.04	0.02	0.00	0.01	0.15	0.27	0.43	0.26
O4'	0.00	0.27	0.01	0.02	0.14	0.00	0.07	0.01	0.13	0.14	0.21	0.27	0.08	0.07	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.06	0.13	0.07
O5'	0.12	0.06	0.03	0.05	0.15	0.01	0.26	0.00	0.21	0.42	0.11	0.05	0.28	0.41	0.23	0.02	0.15	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.13	0.22	0.18	0.17	0.29	0.13	0.46	0.11	0.47	0.49	0.35	0.17	0.59	0.58	0.29	0.21	0.27	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.31	0.08	0.20	0.36	0.05	0.53	0.01	0.53	0.55	0.42	0.25	0.64	0.66	0.34	0.15	0.43	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.13	0.06	0.11	0.23	0.04	0.39	0.01	0.36	0.49	0.24	0.10	0.46	0.54	0.27	0.09	0.26	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00