Doublet Group distance statistics: 48084

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.009, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N7	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C6	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.000, 0.022, 0.044, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.022
N3	A	0, 0.000, 0.031, 0.061, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.031 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.000, 0.033, 0.066, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.033 std_dev=0.033
C2	A	0, 0.000, 0.034, 0.068, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.034 std_dev=0.034
C1'	A	0, 0.000, 0.037, 0.074, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.037 std_dev=0.037
N6	A	0, 0.000, 0.037, 0.074, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.037 std_dev=0.037
N9	A	0, 0.000, 0.038, 0.076, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.038 std_dev=0.038
C2'	A	0, 0.000, 0.068, 0.137, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.068 std_dev=0.068
O2'	A	0, 0.000, 0.070, 0.140, 0.140 max_d=0.140 avg_d=0.070 std_dev=0.070
C4'	A	0, 0.000, 0.159, 0.317, 0.317 max_d=0.317 avg_d=0.159 std_dev=0.159
C3'	A	0, 0.000, 0.180, 0.361, 0.361 max_d=0.361 avg_d=0.180 std_dev=0.180
P	A	0, 0.000, 0.202, 0.403, 0.403 max_d=0.403 avg_d=0.202 std_dev=0.202
C5'	A	0, 0.000, 0.211, 0.422, 0.422 max_d=0.422 avg_d=0.211 std_dev=0.211
OP2	A	0, 0.000, 0.224, 0.448, 0.448 max_d=0.448 avg_d=0.224 std_dev=0.224
O3'	A	0, 0.000, 0.247, 0.494, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.247 std_dev=0.247
OP2	B	0, 0.000, 0.320, 0.640, 0.640 max_d=0.640 avg_d=0.320 std_dev=0.320
O5'	A	0, 0.000, 0.336, 0.672, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.336 std_dev=0.336
OP1	A	0, 0.000, 0.339, 0.678, 0.678 max_d=0.678 avg_d=0.339 std_dev=0.339
P	B	0, 0.000, 0.412, 0.825, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.412 std_dev=0.412
C8	B	0, 0.000, 0.426, 0.852, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.426 std_dev=0.426
O5'	B	0, 0.000, 0.470, 0.941, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.470 std_dev=0.470
O4'	B	0, 0.000, 0.477, 0.954, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.477 std_dev=0.477
C4'	B	0, 0.000, 0.503, 1.006, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.503 std_dev=0.503
N7	B	0, 0.000, 0.504, 1.008, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.504 std_dev=0.504
OP1	B	0, 0.000, 0.505, 1.010, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.505 std_dev=0.505
C3'	B	0, 0.000, 0.507, 1.014, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.507 std_dev=0.507
O3'	B	0, 0.000, 0.511, 1.022, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.511 std_dev=0.511
C1'	B	0, 0.000, 0.514, 1.029, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.514 std_dev=0.514
N9	B	0, 0.000, 0.517, 1.034, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.517 std_dev=0.517
C2'	B	0, 0.000, 0.526, 1.052, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.526 std_dev=0.526
O2'	B	0, 0.000, 0.530, 1.059, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.530 std_dev=0.530
C5'	B	0, 0.000, 0.549, 1.099, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.549 std_dev=0.549
C5	B	0, 0.000, 0.638, 1.277, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.638 std_dev=0.638
C4	B	0, 0.000, 0.640, 1.279, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.640 std_dev=0.640
N3	B	0, 0.000, 0.755, 1.510, 1.510 max_d=1.510 avg_d=0.755 std_dev=0.755
C6	B	0, 0.000, 0.784, 1.568, 1.568 max_d=1.568 avg_d=0.784 std_dev=0.784
N6	B	0, 0.000, 0.825, 1.649, 1.649 max_d=1.649 avg_d=0.825 std_dev=0.825
C2	B	0, 0.000, 0.881, 1.763, 1.763 max_d=1.763 avg_d=0.881 std_dev=0.881
N1	B	0, 0.000, 0.896, 1.792, 1.792 max_d=1.792 avg_d=0.896 std_dev=0.896

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.04	0.05	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.17	0.14	0.08
C2	0.05	0.00	0.06	0.08	0.03	0.05	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.03	0.08	0.03	0.18	0.02	0.13	0.01
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.04	0.06	0.05	0.07	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.19	0.12	0.09
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.10	0.10	0.09	0.06	0.12	0.11	0.05	0.00	0.01	0.01	0.05	0.15	0.08	0.06
C4	0.02	0.03	0.03	0.06	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.14	0.10	0.14	0.03
C4'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.07	0.08	0.06	0.04	0.09	0.08	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.06	0.04
C5	0.03	0.02	0.05	0.10	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.10	0.02	0.19	0.06	0.12	0.01
C5'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.09	0.09	0.08	0.04	0.12	0.10	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.01
C6	0.04	0.00	0.06	0.10	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.11	0.03	0.21	0.00	0.11	0.03
C8	0.01	0.03	0.04	0.10	0.00	0.08	0.01	0.09	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.11	0.02	0.14	0.14	0.11	0.03
N1	0.04	0.00	0.06	0.09	0.03	0.06	0.02	0.08	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.09	0.03	0.20	0.01	0.11	0.03
N3	0.04	0.00	0.05	0.06	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.03	0.06	0.02	0.14	0.08	0.15	0.03
N6	0.05	0.00	0.07	0.12	0.02	0.09	0.02	0.12	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.03	0.04	0.04	0.14	0.04	0.24	0.05	0.08	0.07
N7	0.02	0.02	0.04	0.11	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.12	0.02	0.18	0.09	0.11	0.00
N9	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.04	0.03	0.04	0.04	0.00	0.04	0.04	0.04	0.01	0.00	0.00	0.06	0.00	0.10	0.15	0.14	0.06
O2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.17	0.08	0.06
O3'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.11	0.11	0.09	0.06	0.14	0.12	0.06	0.00	0.00	0.01	0.08	0.12	0.04	0.04
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.15	0.13	0.08
O5'	0.03	0.18	0.03	0.05	0.14	0.01	0.19	0.00	0.21	0.14	0.20	0.14	0.24	0.18	0.10	0.02	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.17	0.02	0.19	0.15	0.10	0.10	0.06	0.04	0.00	0.14	0.01	0.08	0.05	0.09	0.15	0.17	0.12	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.13	0.12	0.08	0.14	0.06	0.12	0.02	0.11	0.11	0.11	0.15	0.08	0.11	0.14	0.08	0.04	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.01	0.09	0.06	0.03	0.04	0.01	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.07	0.00	0.06	0.06	0.04	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.04	0.05	0.02	0.05	0.05	0.02	0.07	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.02	0.08	0.07	0.02	0.11	0.07	0.11	0.03	0.07
C2	0.02	0.12	0.07	0.10	0.08	0.09	0.11	0.09	0.15	0.06	0.15	0.09	0.18	0.10	0.05	0.05	0.14	0.01	0.08	0.09	0.08	0.09
C2'	0.11	0.06	0.07	0.04	0.07	0.06	0.04	0.09	0.03	0.06	0.04	0.08	0.00	0.03	0.09	0.08	0.01	0.11	0.09	0.15	0.03	0.09
C3'	0.06	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.06	0.02	0.01	0.00	0.04	0.06	0.04	0.03	0.03	0.05	0.07	0.05	0.13	0.00	0.06
C4	0.03	0.05	0.02	0.05	0.02	0.03	0.04	0.03	0.07	0.00	0.07	0.02	0.10	0.04	0.01	0.00	0.09	0.04	0.02	0.02	0.04	0.02
C4'	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.06	0.03	0.02	0.01	0.03	0.07	0.05	0.02	0.02	0.06	0.07	0.06	0.12	0.01	0.06
C5	0.01	0.08	0.06	0.09	0.05	0.08	0.07	0.09	0.10	0.03	0.10	0.06	0.13	0.06	0.02	0.04	0.14	0.00	0.07	0.09	0.09	0.08
C5'	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.05	0.06	0.05	0.03	0.02	0.10	0.08	0.00	0.00	0.07	0.05	0.05	0.11	0.02	0.05
C6	0.05	0.15	0.10	0.13	0.11	0.12	0.13	0.14	0.16	0.08	0.17	0.11	0.19	0.11	0.07	0.09	0.18	0.04	0.12	0.14	0.12	0.13
C8	0.06	0.00	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.09	0.07	0.01	0.02	0.04	0.01
N1	0.05	0.15	0.10	0.13	0.11	0.11	0.14	0.13	0.18	0.08	0.18	0.12	0.21	0.12	0.07	0.08	0.17	0.04	0.11	0.13	0.11	0.12
N3	0.02	0.07	0.03	0.06	0.03	0.04	0.06	0.04	0.09	0.02	0.09	0.03	0.12	0.05	0.00	0.01	0.10	0.03	0.03	0.03	0.05	0.04
N6	0.11	0.20	0.15	0.19	0.16	0.18	0.18	0.21	0.22	0.12	0.22	0.17	0.24	0.16	0.12	0.14	0.23	0.09	0.18	0.20	0.16	0.19
N7	0.01	0.06	0.05	0.08	0.03	0.07	0.05	0.08	0.07	0.01	0.07	0.03	0.09	0.04	0.00	0.04	0.13	0.02	0.06	0.07	0.09	0.07
N9	0.07	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.05	0.00	0.05	0.04	0.06	0.08	0.03	0.05	0.00	0.03
O2'	0.13	0.09	0.08	0.05	0.09	0.07	0.07	0.10	0.06	0.08	0.07	0.10	0.03	0.06	0.11	0.09	0.00	0.13	0.11	0.18	0.03	0.11
O3'	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.05	0.03	0.03	0.00	0.03	0.06	0.06	0.01	0.01	0.06	0.04	0.04	0.13	0.02	0.05
O4'	0.10	0.04	0.05	0.03	0.05	0.05	0.02	0.08	0.00	0.04	0.02	0.07	0.03	0.00	0.07	0.06	0.02	0.11	0.08	0.12	0.05	0.09
O5'	0.07	0.03	0.04	0.02	0.01	0.06	0.04	0.09	0.05	0.04	0.02	0.05	0.10	0.08	0.03	0.06	0.00	0.10	0.08	0.12	0.06	0.07
OP1	0.14	0.08	0.07	0.06	0.08	0.13	0.02	0.17	0.01	0.03	0.04	0.11	0.04	0.01	0.09	0.08	0.01	0.19	0.20	0.25	0.24	0.22
OP2	0.10	0.07	0.03	0.03	0.07	0.08	0.03	0.13	0.02	0.03	0.04	0.09	0.02	0.00	0.07	0.02	0.03	0.14	0.15	0.21	0.16	0.17
P	0.08	0.04	0.02	0.02	0.03	0.06	0.01	0.11	0.02	0.01	0.01	0.06	0.06	0.05	0.04	0.03	0.03	0.12	0.12	0.17	0.13	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.04	0.05	0.05
C2	0.01	0.00	0.09	0.05	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.09	0.03	0.03	0.06	0.01	0.03
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.02	0.01	0.01	0.04	0.06	0.08	0.09	0.03	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.02	0.03
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.10	0.03	0.05	0.02	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00
C4	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.02	0.02	0.02	0.04	0.00	0.02
C4'	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.02	0.07	0.00	0.02	0.04	0.07	0.02	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01
C5	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.02	0.05	0.07	0.02	0.05
C5'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.10	0.12	0.07	0.03	0.12	0.14	0.05	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00
C6	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.08	0.01	0.02	0.06	0.09	0.03	0.06
C8	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.00	0.03	0.03	0.01	0.02
N1	0.02	0.01	0.08	0.03	0.01	0.00	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.12	0.06	0.02	0.05	0.09	0.02	0.06
N3	0.01	0.01	0.09	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.12	0.08	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01
N6	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01	0.02	0.08	0.12	0.06	0.09
N7	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.02	0.06	0.07	0.04	0.06
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01
O2'	0.02	0.13	0.01	0.01	0.07	0.04	0.04	0.04	0.08	0.04	0.12	0.12	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.08	0.03	0.06
O3'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.11	0.06	0.08	0.01	0.09	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.03	0.05	0.05
O5'	0.04	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.06	0.03	0.05	0.01	0.08	0.06	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01
OP1	0.04	0.06	0.04	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.09	0.03	0.09	0.03	0.12	0.07	0.00	0.08	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.05	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.04	0.02	0.03	0.03	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01
P	0.05	0.03	0.03	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.06	0.02	0.06	0.01	0.09	0.06	0.01	0.06	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00