Doublet Group distance statistics: 48100

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 17, 15, 10, 11, 7, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.006, 0.016, 0.027, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.002, 0.014, 0.026, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.014 std_dev=0.012
N6	A	0, 0.011, 0.024, 0.037, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.001, 0.015, 0.028, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.015 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.001, 0.017, 0.033, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.017 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.007, 0.024, 0.041, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.024 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.002, 0.027, 0.051, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.027 std_dev=0.025
P	B	0, 0.143, 0.278, 0.413, 0.645 max_d=0.645 avg_d=0.278 std_dev=0.135
OP1	B	0, 0.095, 0.272, 0.448, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.272 std_dev=0.176
OP2	B	0, 0.157, 0.357, 0.556, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.357 std_dev=0.199
O5'	B	0, 0.090, 0.409, 0.729, 1.479 max_d=1.479 avg_d=0.409 std_dev=0.320
O4'	A	0, -0.358, 0.317, 0.993, 2.178 max_d=2.178 avg_d=0.317 std_dev=0.676
C2'	A	0, -0.348, 0.335, 1.019, 2.213 max_d=2.213 avg_d=0.335 std_dev=0.683
O2'	A	0, -0.297, 0.417, 1.131, 2.488 max_d=2.488 avg_d=0.417 std_dev=0.714
O4'	B	0, -0.157, 0.694, 1.546, 3.955 max_d=3.955 avg_d=0.694 std_dev=0.851
C5'	B	0, -0.288, 0.717, 1.722, 3.775 max_d=3.775 avg_d=0.717 std_dev=1.005
C4'	A	0, -0.524, 0.492, 1.509, 3.255 max_d=3.255 avg_d=0.492 std_dev=1.017
C3'	A	0, -0.567, 0.530, 1.627, 3.523 max_d=3.523 avg_d=0.530 std_dev=1.097
C4'	B	0, -0.297, 0.819, 1.935, 4.473 max_d=4.473 avg_d=0.819 std_dev=1.116
C1'	B	0, -0.382, 0.850, 2.082, 5.623 max_d=5.623 avg_d=0.850 std_dev=1.232
O3'	A	0, -0.783, 0.773, 2.329, 4.991 max_d=4.991 avg_d=0.773 std_dev=1.556
N1	B	0, -0.503, 1.079, 2.660, 6.823 max_d=6.823 avg_d=1.079 std_dev=1.581
C2'	B	0, -0.583, 1.046, 2.675, 6.958 max_d=6.958 avg_d=1.046 std_dev=1.629
C6	B	0, -0.547, 1.117, 2.781, 6.717 max_d=6.717 avg_d=1.117 std_dev=1.664
C3'	B	0, -0.594, 1.072, 2.737, 6.450 max_d=6.450 avg_d=1.072 std_dev=1.665
C5'	A	0, -0.893, 0.815, 2.524, 5.508 max_d=5.508 avg_d=0.815 std_dev=1.709
O2'	B	0, -0.560, 1.151, 2.862, 7.065 max_d=7.065 avg_d=1.151 std_dev=1.711
O2	B	0, -0.577, 1.365, 3.306, 8.556 max_d=8.556 avg_d=1.365 std_dev=1.942
O5'	A	0, -1.037, 0.941, 2.919, 6.730 max_d=6.730 avg_d=0.941 std_dev=1.978
C2	B	0, -0.640, 1.349, 3.337, 8.347 max_d=8.347 avg_d=1.349 std_dev=1.988
C5	B	0, -0.828, 1.378, 3.584, 8.097 max_d=8.097 avg_d=1.378 std_dev=2.206
O3'	B	0, -0.906, 1.313, 3.533, 7.699 max_d=7.699 avg_d=1.313 std_dev=2.219
N3	B	0, -0.882, 1.623, 4.129, 9.770 max_d=9.770 avg_d=1.623 std_dev=2.505
C4	B	0, -1.009, 1.628, 4.265, 9.707 max_d=9.707 avg_d=1.628 std_dev=2.637
P	A	0, -1.463, 1.266, 3.995, 8.808 max_d=8.808 avg_d=1.266 std_dev=2.729
OP1	A	0, -1.461, 1.323, 4.107, 9.003 max_d=9.003 avg_d=1.323 std_dev=2.784
N4	B	0, -1.304, 1.919, 5.142, 11.264 max_d=11.264 avg_d=1.919 std_dev=3.223
OP2	A	0, -1.900, 1.582, 5.065, 11.368 max_d=11.368 avg_d=1.582 std_dev=3.482

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.29	0.22	0.34	0.23
C2	0.02	0.00	0.42	0.28	0.00	0.14	0.00	0.33	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.42	0.42	0.34	0.79	1.14	1.18	0.99
C2'	0.00	0.42	0.00	0.00	0.22	0.01	0.11	0.02	0.20	0.19	0.33	0.41	0.15	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01	0.22	0.27	0.12	0.14
C3'	0.01	0.28	0.00	0.00	0.14	0.00	0.07	0.01	0.13	0.17	0.22	0.26	0.09	0.10	0.03	0.01	0.01	0.01	0.22	0.29	0.12	0.15
C4	0.01	0.00	0.22	0.14	0.00	0.08	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.20	0.19	0.18	0.68	0.97	0.93	0.82
C4'	0.00	0.14	0.01	0.00	0.08	0.00	0.07	0.00	0.10	0.05	0.13	0.12	0.10	0.04	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.32	0.18	0.09
C5	0.01	0.00	0.11	0.07	0.00	0.07	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.11	0.10	0.77	1.29	1.10	1.00
C5'	0.03	0.33	0.02	0.01	0.19	0.00	0.18	0.00	0.25	0.08	0.32	0.28	0.24	0.08	0.07	0.03	0.03	0.01	0.01	0.20	0.20	0.01
C6	0.01	0.00	0.20	0.13	0.00	0.10	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.21	0.18	0.85	1.49	1.30	1.16
C8	0.01	0.01	0.19	0.17	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.20	0.16	0.54	0.88	0.67	0.65
N1	0.02	0.00	0.33	0.22	0.01	0.13	0.00	0.32	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.33	0.35	0.28	0.86	1.40	1.33	1.14
N3	0.02	0.00	0.41	0.26	0.00	0.12	0.00	0.28	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.39	0.37	0.32	0.69	0.90	0.97	0.81
N6	0.01	0.01	0.15	0.09	0.01	0.10	0.01	0.24	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.16	0.13	0.88	1.69	1.41	1.26
N7	0.01	0.01	0.09	0.10	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.12	0.07	0.68	1.26	0.95	0.91
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.53	0.68	0.65	0.58
O2'	0.02	0.42	0.00	0.01	0.20	0.03	0.11	0.03	0.20	0.15	0.33	0.39	0.15	0.07	0.02	0.00	0.04	0.04	0.07	0.41	0.29	0.17
O3'	0.01	0.42	0.01	0.01	0.19	0.02	0.11	0.03	0.21	0.20	0.35	0.37	0.16	0.12	0.03	0.04	0.00	0.01	0.25	0.37	0.47	0.23
O4'	0.00	0.34	0.01	0.01	0.18	0.00	0.10	0.01	0.18	0.16	0.28	0.32	0.13	0.07	0.01	0.04	0.01	0.00	0.21	0.13	0.35	0.12
O5'	0.29	0.79	0.22	0.22	0.68	0.01	0.77	0.01	0.85	0.54	0.86	0.69	0.88	0.68	0.53	0.07	0.25	0.21	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.22	1.14	0.27	0.29	0.97	0.32	1.29	0.20	1.49	0.88	1.40	0.90	1.69	1.26	0.68	0.41	0.37	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.34	1.18	0.12	0.12	0.93	0.18	1.10	0.20	1.30	0.67	1.33	0.97	1.41	0.95	0.65	0.29	0.47	0.35	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.23	0.99	0.14	0.15	0.82	0.09	1.00	0.01	1.16	0.65	1.14	0.81	1.26	0.91	0.58	0.17	0.23	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.56	0.83	0.75	0.77	1.10	0.40	1.08	0.27	0.89	0.76	0.99	1.24	0.74	0.64	0.88	0.34	0.21	0.17	0.14	0.08
C2	0.19	0.29	0.35	0.39	0.39	0.15	0.37	0.10	0.30	0.26	0.35	0.44	0.26	0.30	0.52	0.13	0.09	0.20	0.20	0.09
C2'	0.29	0.41	0.49	0.53	0.64	0.32	0.63	0.23	0.46	0.36	0.53	0.77	0.38	0.53	0.71	0.25	0.35	0.24	0.59	0.40
C3'	0.40	0.60	0.59	0.62	0.82	0.33	0.80	0.21	0.65	0.55	0.72	0.93	0.53	0.56	0.76	0.23	0.13	0.22	0.51	0.15
C4	0.26	0.43	0.41	0.44	0.60	0.17	0.58	0.11	0.47	0.38	0.52	0.68	0.37	0.34	0.55	0.14	0.10	0.19	0.19	0.08
C4'	1.04	1.33	1.20	1.20	1.56	0.83	1.51	0.69	1.35	1.25	1.47	1.67	1.25	1.05	1.25	0.82	0.61	0.68	0.24	0.45
C5	0.14	0.25	0.22	0.25	0.37	0.09	0.36	0.11	0.27	0.22	0.32	0.44	0.22	0.17	0.36	0.15	0.09	0.21	0.22	0.09
C5'	1.48	1.74	1.58	1.56	1.89	1.26	1.83	1.10	1.71	1.66	1.84	1.96	1.68	1.43	1.55	1.29	1.07	1.15	0.51	0.86
C6	0.15	0.15	0.14	0.18	0.19	0.13	0.17	0.15	0.13	0.13	0.17	0.24	0.17	0.13	0.29	0.21	0.10	0.21	0.23	0.11
C8	0.27	0.50	0.36	0.39	0.74	0.14	0.74	0.10	0.58	0.45	0.64	0.85	0.42	0.28	0.47	0.14	0.11	0.19	0.19	0.08
N1	0.13	0.16	0.20	0.24	0.21	0.11	0.20	0.11	0.15	0.14	0.20	0.26	0.17	0.18	0.37	0.18	0.09	0.21	0.22	0.10
N3	0.29	0.44	0.47	0.50	0.59	0.22	0.58	0.14	0.47	0.40	0.53	0.67	0.39	0.40	0.63	0.15	0.11	0.19	0.18	0.08
N6	0.26	0.24	0.18	0.20	0.25	0.24	0.24	0.25	0.21	0.23	0.24	0.28	0.26	0.20	0.25	0.32	0.15	0.22	0.25	0.13
N7	0.14	0.28	0.17	0.21	0.44	0.11	0.43	0.16	0.31	0.24	0.36	0.52	0.23	0.14	0.32	0.15	0.09	0.21	0.23	0.10
N9	0.37	0.60	0.52	0.55	0.83	0.24	0.82	0.15	0.66	0.54	0.73	0.94	0.52	0.43	0.64	0.19	0.14	0.18	0.17	0.07
O2'	0.36	0.50	0.59	0.62	0.77	0.38	0.74	0.25	0.55	0.44	0.64	0.92	0.47	0.63	0.81	0.30	0.38	0.35	0.54	0.42
O3'	0.32	0.45	0.51	0.53	0.66	0.31	0.65	0.17	0.50	0.40	0.56	0.77	0.41	0.57	0.71	0.23	0.26	0.13	0.69	0.30
O4'	1.12	1.44	1.26	1.24	1.70	0.86	1.66	0.72	1.47	1.35	1.60	1.83	1.35	1.08	1.25	0.89	0.72	0.68	0.39	0.55
O5'	1.37	1.61	1.54	1.48	1.65	1.08	1.55	0.79	1.47	1.51	1.68	1.69	1.61	1.42	1.49	1.11	0.79	0.75	0.11	0.43
OP1	1.32	1.55	1.55	1.28	1.37	0.91	1.14	0.51	1.13	1.36	1.54	1.37	1.67	1.56	1.33	0.97	0.45	0.23	0.51	0.19
OP2	1.65	1.81	1.88	1.70	1.64	1.34	1.46	0.93	1.46	1.65	1.79	1.63	1.93	1.93	1.84	1.36	0.88	0.84	0.17	0.44
P	1.52	1.72	1.73	1.57	1.62	1.18	1.46	0.75	1.43	1.58	1.74	1.63	1.80	1.70	1.66	1.22	0.75	0.67	0.20	0.33

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.17	0.11	0.23	0.15
C2	0.01	0.00	0.08	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.08	0.03	0.35	0.20	0.61	0.33
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.06	0.04	0.13	0.00	0.01	0.01	0.19	0.26	0.15	0.16
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.07	0.01	0.10	0.02	0.11	0.05	0.06	0.08	0.09	0.02	0.00	0.01	0.22	0.40	0.11	0.18
C4	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.08	0.02	0.55	0.41	0.99	0.56
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.04	0.06	0.03	0.06	0.02	0.00	0.02	0.16	0.18	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.13	0.04	0.61	0.50	1.02	0.62
C5'	0.01	0.06	0.02	0.02	0.09	0.01	0.10	0.00	0.08	0.05	0.07	0.10	0.05	0.06	0.05	0.01	0.01	0.30	0.28	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.04	0.55	0.42	0.78	0.51
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.37	0.24	0.55	0.33
N3	0.01	0.00	0.06	0.06	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.08	0.03	0.44	0.28	0.82	0.44
N4	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.10	0.03	0.59	0.46	1.12	0.63
O2	0.02	0.00	0.13	0.09	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.14	0.05	0.24	0.12	0.47	0.22
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.04	0.06	0.03	0.06	0.04	0.02	0.08	0.04	0.16	0.00	0.04	0.05	0.07	0.13	0.15	0.07
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.08	0.02	0.13	0.05	0.12	0.05	0.08	0.10	0.14	0.04	0.00	0.01	0.13	0.45	0.27	0.14
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.05	0.05	0.01	0.00	0.07	0.05	0.08	0.07
O5'	0.17	0.35	0.19	0.22	0.55	0.02	0.61	0.01	0.55	0.37	0.44	0.59	0.24	0.07	0.13	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.11	0.20	0.26	0.40	0.41	0.16	0.50	0.30	0.42	0.24	0.28	0.46	0.12	0.13	0.45	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.61	0.15	0.11	0.99	0.18	1.02	0.28	0.78	0.55	0.82	1.12	0.47	0.15	0.27	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.33	0.16	0.18	0.56	0.02	0.62	0.01	0.51	0.33	0.44	0.63	0.22	0.07	0.14	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00