Doublet Group distance statistics: 48106

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 2, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.007, 0.019, 0.030, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.010, 0.021, 0.032, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.021 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.008, 0.022, 0.037, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.022 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.007, 0.024, 0.042, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.024 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.007, 0.027, 0.046, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.027 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.014, 0.042, 0.069, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.042 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.012, 0.045, 0.077, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.045 std_dev=0.033
C8	A	0, 0.010, 0.046, 0.082, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.046 std_dev=0.036
O4'	A	0, 0.016, 0.080, 0.143, 0.186 max_d=0.186 avg_d=0.080 std_dev=0.063
C2'	A	0, 0.012, 0.078, 0.144, 0.195 max_d=0.195 avg_d=0.078 std_dev=0.066
O2'	A	0, 0.056, 0.157, 0.257, 0.313 max_d=0.313 avg_d=0.157 std_dev=0.100
C4'	A	0, 0.054, 0.161, 0.268, 0.321 max_d=0.321 avg_d=0.161 std_dev=0.107
C3'	A	0, 0.065, 0.173, 0.282, 0.310 max_d=0.310 avg_d=0.173 std_dev=0.108
C5'	A	0, 0.084, 0.234, 0.384, 0.449 max_d=0.449 avg_d=0.234 std_dev=0.150
O3'	A	0, 0.130, 0.310, 0.491, 0.514 max_d=0.514 avg_d=0.310 std_dev=0.181
O5'	A	0, 0.193, 0.477, 0.761, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.477 std_dev=0.284
O5'	B	0, 0.270, 0.617, 0.964, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.617 std_dev=0.347
C5'	B	0, 0.220, 0.588, 0.957, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.588 std_dev=0.369
P	B	0, 0.319, 0.732, 1.146, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.732 std_dev=0.413
C3'	B	0, 0.151, 0.593, 1.034, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.593 std_dev=0.441
C2'	B	0, 0.180, 0.638, 1.097, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.638 std_dev=0.459
C6	B	0, 0.097, 0.596, 1.095, 1.695 max_d=1.695 avg_d=0.596 std_dev=0.499
OP2	B	0, 0.201, 0.708, 1.215, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.708 std_dev=0.507
N1	B	0, 0.122, 0.634, 1.147, 1.727 max_d=1.727 avg_d=0.634 std_dev=0.513
C4'	B	0, 0.083, 0.597, 1.111, 1.634 max_d=1.634 avg_d=0.597 std_dev=0.514
O3'	B	0, 0.124, 0.645, 1.166, 1.636 max_d=1.636 avg_d=0.645 std_dev=0.521
C2	B	0, 0.171, 0.719, 1.267, 1.827 max_d=1.827 avg_d=0.719 std_dev=0.548
P	A	0, 0.095, 0.645, 1.195, 1.726 max_d=1.726 avg_d=0.645 std_dev=0.550
C5	B	0, 0.107, 0.663, 1.220, 1.896 max_d=1.896 avg_d=0.663 std_dev=0.556
O2	B	0, 0.201, 0.762, 1.323, 1.848 max_d=1.848 avg_d=0.762 std_dev=0.561
C1'	B	0, 0.079, 0.661, 1.242, 1.882 max_d=1.882 avg_d=0.661 std_dev=0.581
OP1	B	0, 0.405, 0.987, 1.569, 1.629 max_d=1.629 avg_d=0.987 std_dev=0.582
N3	B	0, 0.184, 0.803, 1.422, 2.028 max_d=2.028 avg_d=0.803 std_dev=0.619
C4	B	0, 0.154, 0.789, 1.424, 2.111 max_d=2.111 avg_d=0.789 std_dev=0.635
O4'	B	0, -0.013, 0.671, 1.355, 2.179 max_d=2.179 avg_d=0.671 std_dev=0.684
N4	B	0, 0.165, 0.924, 1.682, 2.476 max_d=2.476 avg_d=0.924 std_dev=0.759
OP1	A	0, -0.076, 0.794, 1.663, 2.939 max_d=2.939 avg_d=0.794 std_dev=0.870
O2'	B	0, 0.068, 1.070, 2.073, 2.977 max_d=2.977 avg_d=1.070 std_dev=1.003
OP2	A	0, -0.117, 1.069, 2.256, 3.838 max_d=3.838 avg_d=1.069 std_dev=1.187

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.07	0.83	0.27
C2	0.02	0.00	0.06	0.08	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.10	0.03	0.07	0.14	1.08	0.38
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.03	0.06	0.06	0.06	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.25	0.86	0.34
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.09	0.05	0.09	0.07	0.09	0.07	0.04	0.02	0.00	0.01	0.07	0.29	0.79	0.33
C4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.08	0.01	0.08	0.11	1.06	0.37
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.07	0.02	0.00	0.00	0.08	0.47	0.12
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.10	0.02	0.12	0.14	1.13	0.41
C5'	0.02	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.06	0.04	0.03	0.06	0.06	0.04	0.07	0.03	0.02	0.01	0.27	0.27	0.02
C6	0.01	0.00	0.05	0.09	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.12	0.02	0.12	0.15	1.16	0.43
C8	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.06	0.02	0.13	0.14	1.05	0.38
N1	0.02	0.00	0.06	0.09	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.12	0.02	0.10	0.15	1.14	0.41
N3	0.02	0.00	0.06	0.07	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.08	0.02	0.06	0.12	1.03	0.35
N6	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.14	0.02	0.14	0.17	1.18	0.45
N7	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.02	0.14	0.16	1.11	0.41
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.01	0.08	0.09	1.00	0.34
O2'	0.00	0.08	0.00	0.02	0.05	0.07	0.06	0.07	0.07	0.03	0.08	0.07	0.08	0.04	0.03	0.00	0.03	0.05	0.07	0.23	0.63	0.21
O3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.08	0.02	0.10	0.03	0.12	0.06	0.12	0.08	0.14	0.09	0.04	0.03	0.00	0.02	0.03	0.45	0.51	0.25
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.19	0.62	0.15
O5'	0.04	0.07	0.05	0.07	0.08	0.00	0.12	0.01	0.12	0.13	0.10	0.06	0.14	0.14	0.08	0.07	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.07	0.14	0.25	0.29	0.11	0.08	0.14	0.27	0.15	0.14	0.15	0.12	0.17	0.16	0.09	0.23	0.45	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.83	1.08	0.86	0.79	1.06	0.47	1.13	0.27	1.16	1.05	1.14	1.03	1.18	1.11	1.00	0.63	0.51	0.62	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.27	0.38	0.34	0.33	0.37	0.12	0.41	0.02	0.43	0.38	0.41	0.35	0.45	0.41	0.34	0.21	0.25	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.31	0.23	0.10	0.39	0.24	0.37	0.22	0.31	0.27	0.37	0.43	0.29	0.82	0.28	0.41	0.11	0.62	0.09	0.21
C2	0.11	0.31	0.35	0.15	0.49	0.06	0.41	0.15	0.28	0.20	0.45	0.60	0.27	1.05	0.35	0.26	0.09	0.58	0.15	0.22
C2'	0.21	0.34	0.32	0.13	0.40	0.27	0.37	0.23	0.32	0.29	0.38	0.43	0.32	0.94	0.26	0.47	0.12	0.58	0.14	0.22
C3'	0.28	0.36	0.25	0.14	0.39	0.35	0.37	0.25	0.34	0.33	0.38	0.40	0.34	0.82	0.23	0.54	0.13	0.52	0.19	0.20
C4	0.10	0.30	0.31	0.13	0.45	0.09	0.40	0.16	0.28	0.21	0.41	0.53	0.26	0.97	0.36	0.29	0.08	0.56	0.11	0.21
C4'	0.29	0.32	0.12	0.18	0.34	0.36	0.33	0.24	0.32	0.31	0.33	0.34	0.31	0.55	0.17	0.49	0.17	0.59	0.25	0.24
C5	0.13	0.26	0.33	0.19	0.44	0.04	0.38	0.14	0.25	0.16	0.39	0.54	0.22	0.97	0.41	0.18	0.13	0.49	0.20	0.22
C5'	0.32	0.27	0.08	0.22	0.27	0.37	0.28	0.21	0.29	0.29	0.26	0.26	0.27	0.31	0.12	0.44	0.18	0.53	0.34	0.26
C6	0.18	0.25	0.36	0.22	0.46	0.08	0.38	0.14	0.22	0.12	0.40	0.58	0.21	1.02	0.41	0.13	0.15	0.48	0.25	0.23
C8	0.10	0.26	0.26	0.14	0.39	0.08	0.36	0.17	0.27	0.20	0.34	0.45	0.22	0.84	0.41	0.26	0.10	0.48	0.11	0.19
N1	0.15	0.27	0.37	0.19	0.49	0.05	0.40	0.14	0.24	0.15	0.43	0.61	0.24	1.05	0.38	0.18	0.13	0.53	0.22	0.23
N3	0.11	0.32	0.32	0.11	0.47	0.11	0.41	0.17	0.30	0.23	0.44	0.56	0.29	1.00	0.33	0.32	0.08	0.60	0.09	0.21
N6	0.26	0.20	0.38	0.27	0.45	0.16	0.36	0.15	0.17	0.07	0.38	0.59	0.19	1.00	0.44	0.07	0.18	0.43	0.32	0.25
N7	0.15	0.23	0.30	0.20	0.41	0.07	0.36	0.14	0.23	0.14	0.35	0.49	0.19	0.89	0.44	0.14	0.15	0.43	0.22	0.22
N9	0.12	0.29	0.27	0.11	0.41	0.15	0.38	0.18	0.29	0.24	0.38	0.47	0.26	0.88	0.35	0.33	0.07	0.56	0.06	0.20
O2'	0.24	0.35	0.26	0.13	0.40	0.32	0.37	0.25	0.33	0.31	0.39	0.43	0.34	0.86	0.19	0.50	0.12	0.56	0.13	0.18
O3'	0.39	0.44	0.21	0.20	0.44	0.42	0.42	0.28	0.41	0.42	0.45	0.45	0.45	0.72	0.24	0.64	0.13	0.48	0.22	0.20
O4'	0.22	0.30	0.12	0.13	0.35	0.29	0.35	0.23	0.31	0.28	0.33	0.38	0.28	0.60	0.24	0.41	0.15	0.64	0.16	0.22
O5'	0.26	0.13	0.08	0.14	0.10	0.28	0.13	0.10	0.17	0.18	0.10	0.07	0.13	0.32	0.01	0.36	0.16	0.41	0.42	0.26
OP1	0.12	0.36	0.20	0.20	0.26	0.23	0.11	0.40	0.05	0.15	0.38	0.30	0.51	0.50	0.01	0.11	0.46	0.87	0.58	0.67
OP2	0.43	0.48	0.50	0.26	0.48	0.55	0.42	0.55	0.40	0.43	0.50	0.50	0.50	0.55	0.01	0.52	0.61	0.18	0.54	0.39
P	0.12	0.19	0.22	0.02	0.18	0.11	0.12	0.10	0.09	0.12	0.21	0.20	0.22	0.37	0.00	0.12	0.18	0.19	0.36	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.28	0.00	0.03	0.36	0.07	0.13
C2	0.01	0.00	0.18	0.13	0.01	0.03	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.10	0.19	0.12	0.10	0.34	0.12	0.17
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.02	0.01	0.18	0.19	0.22	0.02	0.12	0.02	0.36	0.00	0.05	0.02	0.09	0.51	0.22	0.28
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.12	0.00	0.09	0.00	0.08	0.08	0.14	0.13	0.16	0.01	0.01	0.02	0.04	0.36	0.16	0.11
C4	0.01	0.01	0.02	0.12	0.00	0.03	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.22	0.11	0.02	0.19	0.47	0.25	0.28
C4'	0.02	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.03	0.03	0.05	0.19	0.02	0.00	0.01	0.22	0.10	0.05
C5	0.01	0.00	0.18	0.09	0.00	0.04	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.37	0.11	0.07	0.21	0.55	0.29	0.32
C5'	0.08	0.17	0.19	0.00	0.21	0.00	0.21	0.00	0.18	0.15	0.20	0.23	0.14	0.02	0.22	0.02	0.01	0.15	0.08	0.02
C6	0.00	0.00	0.22	0.08	0.00	0.04	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.36	0.13	0.11	0.17	0.52	0.23	0.29
N1	0.00	0.00	0.02	0.08	0.01	0.01	0.01	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.18	0.01	0.10	0.41	0.13	0.19
N3	0.01	0.00	0.12	0.14	0.00	0.03	0.00	0.20	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.15	0.09	0.14	0.38	0.17	0.21
N4	0.01	0.01	0.02	0.13	0.00	0.03	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.23	0.10	0.02	0.21	0.49	0.29	0.31
O2	0.02	0.00	0.36	0.16	0.01	0.05	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.38	0.24	0.18	0.06	0.25	0.07	0.10
O2'	0.02	0.10	0.00	0.01	0.22	0.19	0.37	0.02	0.36	0.13	0.07	0.23	0.38	0.00	0.09	0.10	0.19	0.36	0.14	0.11
O3'	0.28	0.19	0.05	0.01	0.11	0.02	0.11	0.22	0.13	0.18	0.15	0.10	0.24	0.09	0.00	0.19	0.39	0.25	0.59	0.39
O4'	0.00	0.12	0.02	0.02	0.02	0.00	0.07	0.02	0.11	0.01	0.09	0.02	0.18	0.10	0.19	0.00	0.02	0.23	0.10	0.04
O5'	0.03	0.10	0.09	0.04	0.19	0.01	0.21	0.01	0.17	0.10	0.14	0.21	0.06	0.19	0.39	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.36	0.34	0.51	0.36	0.47	0.22	0.55	0.15	0.52	0.41	0.38	0.49	0.25	0.36	0.25	0.23	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.12	0.22	0.16	0.25	0.10	0.29	0.08	0.23	0.13	0.17	0.29	0.07	0.14	0.59	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.17	0.28	0.11	0.28	0.05	0.32	0.02	0.29	0.19	0.21	0.31	0.10	0.11	0.39	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00