Doublet Group distance statistics: 48111

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.004, 0.007, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.004 std_dev=0.004
N9	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N3	A	0, 0.000, 0.027, 0.055, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.027
C5	A	0, 0.000, 0.029, 0.057, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.029 std_dev=0.029
C4	A	0, 0.000, 0.030, 0.060, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.030 std_dev=0.030
C2	A	0, 0.000, 0.034, 0.068, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.034 std_dev=0.034
C1'	A	0, 0.000, 0.036, 0.072, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.036 std_dev=0.036
N7	A	0, 0.000, 0.040, 0.079, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.040 std_dev=0.040
N1	A	0, 0.000, 0.040, 0.079, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.040 std_dev=0.040
C8	A	0, 0.000, 0.043, 0.086, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.043 std_dev=0.043
N6	A	0, 0.000, 0.062, 0.125, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.062 std_dev=0.062
O4'	A	0, 0.000, 0.128, 0.256, 0.256 max_d=0.256 avg_d=0.128 std_dev=0.128
P	B	0, 0.000, 0.207, 0.415, 0.415 max_d=0.415 avg_d=0.207 std_dev=0.207
C2'	A	0, 0.000, 0.214, 0.427, 0.427 max_d=0.427 avg_d=0.214 std_dev=0.214
C4'	A	0, 0.000, 0.403, 0.806, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.403 std_dev=0.403
OP1	B	0, 0.000, 0.420, 0.841, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.420 std_dev=0.420
O2'	A	0, 0.000, 0.745, 1.489, 1.489 max_d=1.489 avg_d=0.745 std_dev=0.745
C5'	A	0, 0.000, 0.770, 1.540, 1.540 max_d=1.540 avg_d=0.770 std_dev=0.770
OP2	B	0, 0.000, 0.837, 1.675, 1.675 max_d=1.675 avg_d=0.837 std_dev=0.837
C3'	A	0, 0.000, 0.846, 1.691, 1.691 max_d=1.691 avg_d=0.846 std_dev=0.846
O5'	A	0, 0.000, 1.059, 2.118, 2.118 max_d=2.118 avg_d=1.059 std_dev=1.059
O5'	B	0, 0.000, 1.184, 2.368, 2.368 max_d=2.368 avg_d=1.184 std_dev=1.184
C5'	B	0, 0.000, 1.463, 2.925, 2.925 max_d=2.925 avg_d=1.463 std_dev=1.463
P	A	0, 0.000, 1.529, 3.059, 3.059 max_d=3.059 avg_d=1.529 std_dev=1.529
O3'	A	0, 0.000, 1.545, 3.089, 3.089 max_d=3.089 avg_d=1.545 std_dev=1.545
OP1	A	0, 0.000, 2.059, 4.119, 4.119 max_d=4.119 avg_d=2.059 std_dev=2.059
C5	B	0, 0.000, 2.425, 4.849, 4.849 max_d=4.849 avg_d=2.425 std_dev=2.425
C6	B	0, 0.000, 2.483, 4.965, 4.965 max_d=4.965 avg_d=2.483 std_dev=2.483
C4'	B	0, 0.000, 2.526, 5.052, 5.052 max_d=5.052 avg_d=2.526 std_dev=2.526
O4'	B	0, 0.000, 2.736, 5.472, 5.472 max_d=5.472 avg_d=2.736 std_dev=2.736
OP2	A	0, 0.000, 2.856, 5.711, 5.711 max_d=5.711 avg_d=2.856 std_dev=2.856
C4	B	0, 0.000, 3.243, 6.486, 6.486 max_d=6.486 avg_d=3.243 std_dev=3.243
N4	B	0, 0.000, 3.247, 6.494, 6.494 max_d=6.494 avg_d=3.247 std_dev=3.247
C3'	B	0, 0.000, 3.395, 6.790, 6.790 max_d=6.790 avg_d=3.395 std_dev=3.395
N1	B	0, 0.000, 3.409, 6.819, 6.819 max_d=6.819 avg_d=3.409 std_dev=3.409
C1'	B	0, 0.000, 3.655, 7.310, 7.310 max_d=7.310 avg_d=3.655 std_dev=3.655
O3'	B	0, 0.000, 3.851, 7.701, 7.701 max_d=7.701 avg_d=3.851 std_dev=3.851
N3	B	0, 0.000, 4.113, 8.225, 8.225 max_d=8.225 avg_d=4.113 std_dev=4.113
C2'	B	0, 0.000, 4.217, 8.434, 8.434 max_d=8.434 avg_d=4.217 std_dev=4.217
C2	B	0, 0.000, 4.249, 8.497, 8.497 max_d=8.497 avg_d=4.249 std_dev=4.249
O2'	B	0, 0.000, 4.835, 9.671, 9.671 max_d=9.671 avg_d=4.835 std_dev=4.835
O2	B	0, 0.000, 5.141, 10.283, 10.283 max_d=10.283 avg_d=5.141 std_dev=5.141

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.02	0.05	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.21	0.00	0.19	0.32	0.27	0.21
C2	0.04	0.00	0.09	0.04	0.00	0.00	0.02	0.12	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.39	0.41	0.02	0.43	0.41	1.02	0.54
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.13	0.02	0.07	0.08	0.09	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.61	0.13	0.25
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.08	0.01	0.21	0.01	0.17	0.35	0.04	0.07	0.27	0.34	0.15	0.02	0.00	0.00	0.29	0.80	0.07	0.38
C4	0.02	0.00	0.03	0.08	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.28	0.19	0.02	0.45	0.49	0.93	0.53
C4'	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.11	0.00	0.10	0.15	0.04	0.02	0.16	0.16	0.07	0.17	0.04	0.00	0.00	0.24	0.21	0.02
C5	0.00	0.02	0.00	0.21	0.00	0.11	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.28	0.01	0.02	0.59	0.66	1.27	0.72
C5'	0.03	0.12	0.13	0.01	0.11	0.00	0.18	0.00	0.20	0.13	0.15	0.07	0.26	0.19	0.07	0.03	0.09	0.00	0.00	0.22	0.31	0.01
C6	0.02	0.02	0.02	0.17	0.01	0.10	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.34	0.08	0.02	0.61	0.66	1.40	0.77
C8	0.02	0.02	0.07	0.35	0.01	0.15	0.01	0.13	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.01	0.11	0.24	0.02	0.57	0.72	1.01	0.65
N1	0.05	0.00	0.08	0.04	0.03	0.04	0.01	0.15	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.40	0.28	0.01	0.52	0.52	1.25	0.66
N3	0.04	0.01	0.09	0.07	0.00	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.34	0.43	0.02	0.36	0.35	0.80	0.43
N6	0.01	0.01	0.02	0.27	0.00	0.16	0.02	0.26	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.05	0.02	0.31	0.06	0.04	0.71	0.80	1.65	0.92
N7	0.01	0.03	0.05	0.34	0.01	0.16	0.01	0.19	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.01	0.19	0.22	0.00	0.65	0.81	1.36	0.81
N9	0.00	0.00	0.01	0.15	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.15	0.05	0.00	0.41	0.50	0.73	0.45
O2'	0.00	0.39	0.01	0.02	0.28	0.17	0.28	0.03	0.34	0.11	0.40	0.34	0.31	0.19	0.15	0.00	0.04	0.14	0.26	0.68	0.12	0.30
O3'	0.21	0.41	0.01	0.00	0.19	0.04	0.01	0.09	0.08	0.24	0.28	0.43	0.06	0.22	0.05	0.04	0.00	0.16	0.22	0.88	0.01	0.40
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.00	0.14	0.16	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00
O5'	0.19	0.43	0.19	0.29	0.45	0.00	0.59	0.00	0.61	0.57	0.52	0.36	0.71	0.65	0.41	0.26	0.22	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.32	0.41	0.61	0.80	0.49	0.24	0.66	0.22	0.66	0.72	0.52	0.35	0.80	0.81	0.50	0.68	0.88	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02
OP2	0.27	1.02	0.13	0.07	0.93	0.21	1.27	0.31	1.40	1.01	1.25	0.80	1.65	1.36	0.73	0.12	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00
P	0.21	0.54	0.25	0.38	0.53	0.02	0.72	0.01	0.77	0.65	0.66	0.43	0.92	0.81	0.45	0.30	0.40	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.47	0.37	0.75	0.66	0.19	0.47	0.10	0.09	0.15	0.32	0.31	0.16	0.48	0.96	0.89	0.30	0.56	0.09	0.14	0.12
C2	1.79	1.66	2.27	1.88	1.09	1.47	0.83	0.73	0.99	1.46	1.45	0.96	2.00	2.80	2.16	1.33	0.81	0.02	0.02	0.07
C2'	0.05	0.00	0.30	0.31	0.05	0.10	0.09	0.14	0.09	0.02	0.00	0.04	0.03	0.40	0.55	0.08	0.34	0.06	0.19	0.06
C3'	0.31	0.36	0.14	0.18	0.40	0.31	0.45	0.53	0.45	0.38	0.36	0.39	0.32	0.00	0.01	0.40	0.06	0.28	0.13	0.26
C4	1.32	1.12	1.65	1.40	0.68	1.20	0.50	0.56	0.65	1.01	0.95	0.58	1.36	2.04	1.61	1.05	0.80	0.01	0.00	0.09
C4'	0.01	0.08	0.11	0.01	0.18	0.04	0.23	0.28	0.20	0.11	0.11	0.19	0.03	0.26	0.13	0.08	0.28	0.06	0.09	0.06
C5	1.57	1.31	1.78	1.44	0.77	1.34	0.57	0.66	0.77	1.20	1.10	0.63	1.60	2.19	1.55	1.32	0.83	0.09	0.12	0.06
C5'	0.14	0.03	0.16	0.04	0.09	0.11	0.12	0.09	0.08	0.02	0.02	0.11	0.08	0.32	0.07	0.12	0.46	0.30	0.26	0.30
C6	1.95	1.72	2.18	1.73	1.05	1.55	0.80	0.79	1.02	1.55	1.46	0.89	2.09	2.66	1.84	1.59	0.84	0.11	0.17	0.03
C8	0.88	0.65	1.00	0.79	0.29	0.81	0.17	0.33	0.31	0.60	0.51	0.20	0.84	1.30	0.88	0.77	0.73	0.05	0.06	0.10
N1	2.05	1.89	2.43	1.95	1.21	1.62	0.93	0.83	1.13	1.67	1.64	1.06	2.29	2.97	2.13	1.58	0.85	0.06	0.10	0.06
N3	1.42	1.28	1.89	1.62	0.83	1.26	0.63	0.60	0.76	1.14	1.12	0.74	1.54	2.33	1.93	1.05	0.78	0.02	0.05	0.10
N6	2.08	1.88	2.20	1.68	1.13	1.56	0.84	0.80	1.09	1.68	1.59	0.94	2.29	2.66	1.73	1.71	0.77	0.20	0.30	0.03
N7	1.27	1.01	1.36	1.06	0.52	1.11	0.35	0.53	0.55	0.93	0.81	0.39	1.25	1.71	1.12	1.14	0.79	0.13	0.17	0.06
N9	0.88	0.71	1.14	0.97	0.38	0.85	0.26	0.34	0.37	0.64	0.58	0.31	0.88	1.44	1.16	0.71	0.73	0.03	0.05	0.12
O2'	0.18	0.22	0.49	0.58	0.28	0.24	0.25	0.06	0.20	0.20	0.28	0.32	0.19	0.48	0.88	0.02	0.46	0.15	0.45	0.21
O3'	0.68	0.69	0.53	0.59	0.70	0.74	0.74	0.93	0.76	0.72	0.67	0.67	0.67	0.40	0.41	0.78	0.45	0.59	0.41	0.57
O4'	0.40	0.30	0.57	0.44	0.12	0.34	0.04	0.01	0.09	0.25	0.24	0.09	0.40	0.78	0.59	0.27	0.56	0.18	0.18	0.21
O5'	0.17	0.34	0.11	0.28	0.58	0.21	0.65	0.50	0.55	0.37	0.44	0.64	0.21	0.15	0.20	0.21	0.01	0.27	0.40	0.27
OP1	1.03	1.30	1.09	1.33	1.64	1.08	1.70	1.37	1.55	1.31	1.46	1.74	1.12	0.72	1.30	1.00	0.96	1.22	1.42	1.17
OP2	0.46	0.73	0.39	0.51	1.03	0.39	1.08	0.60	0.93	0.72	0.87	1.11	0.58	0.10	0.38	0.45	0.30	0.40	0.77	0.54
P	0.41	0.65	0.43	0.62	0.93	0.44	0.99	0.70	0.86	0.66	0.78	1.01	0.50	0.13	0.57	0.40	0.28	0.49	0.70	0.49

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.00	0.01	0.21	0.24	0.00	0.14
C2	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.44	0.42	0.26	0.36
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.19	0.27	0.01	0.15
C3'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.06	0.02	0.04	0.07	0.05	0.01	0.00	0.01	0.22	0.35	0.01	0.19
C4	0.02	0.03	0.00	0.06	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.08	0.02	0.58	0.54	0.43	0.51
C4'	0.02	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.01	0.05	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01	0.15	0.24	0.02
C5	0.00	0.02	0.02	0.08	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.09	0.01	0.60	0.56	0.44	0.53
C5'	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.07	0.02	0.05	0.11	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.25	0.35	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.06	0.01	0.55	0.50	0.31	0.45
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.43	0.40	0.20	0.33
N3	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.05	0.02	0.03	0.05	0.03	0.50	0.48	0.35	0.43
N4	0.03	0.05	0.00	0.07	0.01	0.05	0.02	0.11	0.00	0.02	0.05	0.00	0.07	0.03	0.10	0.02	0.59	0.56	0.47	0.53
O2	0.06	0.01	0.07	0.05	0.04	0.08	0.03	0.05	0.03	0.03	0.02	0.07	0.00	0.08	0.04	0.07	0.36	0.37	0.20	0.30
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.03	0.08	0.00	0.00	0.00	0.02	0.10	0.13	0.02
O3'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.06	0.03	0.05	0.10	0.04	0.00	0.00	0.01	0.10	0.30	0.07	0.12
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.07	0.00	0.01	0.00	0.12	0.17	0.14	0.05
O5'	0.21	0.44	0.19	0.22	0.58	0.01	0.60	0.01	0.55	0.43	0.50	0.59	0.36	0.02	0.10	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.24	0.42	0.27	0.35	0.54	0.15	0.56	0.25	0.50	0.40	0.48	0.56	0.37	0.10	0.30	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.00	0.26	0.01	0.01	0.43	0.24	0.44	0.35	0.31	0.20	0.35	0.47	0.20	0.13	0.07	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.36	0.15	0.19	0.51	0.02	0.53	0.01	0.45	0.33	0.43	0.53	0.30	0.02	0.12	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00