Doublet Group distance statistics: 48112

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.000, 0.018, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N6	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.000, 0.022, 0.044, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C1'	A	0, 0.000, 0.023, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.000, 0.028, 0.055, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.000, 0.032, 0.064, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.032 std_dev=0.032
P	B	0, 0.000, 0.302, 0.604, 0.604 max_d=0.604 avg_d=0.302 std_dev=0.302
C2'	A	0, 0.000, 0.354, 0.709, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.354 std_dev=0.354
O4'	A	0, 0.000, 0.476, 0.951, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.476 std_dev=0.476
C4'	A	0, 0.000, 0.564, 1.128, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.564 std_dev=0.564
OP1	B	0, 0.000, 0.656, 1.312, 1.312 max_d=1.312 avg_d=0.656 std_dev=0.656
O2'	A	0, 0.000, 0.665, 1.330, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.665 std_dev=0.665
O5'	B	0, 0.000, 0.687, 1.374, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.687 std_dev=0.687
C3'	A	0, 0.000, 0.688, 1.376, 1.376 max_d=1.376 avg_d=0.688 std_dev=0.688
C5'	B	0, 0.000, 0.760, 1.520, 1.520 max_d=1.520 avg_d=0.760 std_dev=0.760
OP2	B	0, 0.000, 0.788, 1.576, 1.576 max_d=1.576 avg_d=0.788 std_dev=0.788
O4'	B	0, 0.000, 0.788, 1.576, 1.576 max_d=1.576 avg_d=0.788 std_dev=0.788
C4'	B	0, 0.000, 0.929, 1.859, 1.859 max_d=1.859 avg_d=0.929 std_dev=0.929
O5'	A	0, 0.000, 1.016, 2.033, 2.033 max_d=2.033 avg_d=1.016 std_dev=1.016
O3'	A	0, 0.000, 1.111, 2.223, 2.223 max_d=2.223 avg_d=1.111 std_dev=1.111
C1'	B	0, 0.000, 1.139, 2.279, 2.279 max_d=2.279 avg_d=1.139 std_dev=1.139
N1	B	0, 0.000, 1.156, 2.311, 2.311 max_d=2.311 avg_d=1.156 std_dev=1.156
C6	B	0, 0.000, 1.254, 2.508, 2.508 max_d=2.508 avg_d=1.254 std_dev=1.254
C3'	B	0, 0.000, 1.298, 2.595, 2.595 max_d=2.595 avg_d=1.298 std_dev=1.298
C5'	A	0, 0.000, 1.417, 2.834, 2.834 max_d=2.834 avg_d=1.417 std_dev=1.417
O3'	B	0, 0.000, 1.679, 3.359, 3.359 max_d=3.359 avg_d=1.679 std_dev=1.679
C2	B	0, 0.000, 1.681, 3.362, 3.362 max_d=3.362 avg_d=1.681 std_dev=1.681
C2'	B	0, 0.000, 1.737, 3.473, 3.473 max_d=3.473 avg_d=1.737 std_dev=1.737
OP1	A	0, 0.000, 1.759, 3.518, 3.518 max_d=3.518 avg_d=1.759 std_dev=1.759
C5	B	0, 0.000, 1.926, 3.853, 3.853 max_d=3.853 avg_d=1.926 std_dev=1.926
P	A	0, 0.000, 1.993, 3.985, 3.985 max_d=3.985 avg_d=1.993 std_dev=1.993
O2	B	0, 0.000, 2.039, 4.079, 4.079 max_d=4.079 avg_d=2.039 std_dev=2.039
N3	B	0, 0.000, 2.065, 4.130, 4.130 max_d=4.130 avg_d=2.065 std_dev=2.065
C4	B	0, 0.000, 2.218, 4.436, 4.436 max_d=4.436 avg_d=2.218 std_dev=2.218
O2'	B	0, 0.000, 2.313, 4.626, 4.626 max_d=4.626 avg_d=2.313 std_dev=2.313
OP2	A	0, 0.000, 2.636, 5.272, 5.272 max_d=5.272 avg_d=2.636 std_dev=2.636
N4	B	0, 0.000, 2.877, 5.755, 5.755 max_d=5.755 avg_d=2.877 std_dev=2.877

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.02	0.21	0.00	0.18	0.17	0.31	0.24
C2	0.03	0.00	0.10	0.04	0.01	0.18	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.30	0.42	0.22	0.45	0.46	0.92	0.72
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.07	0.00	0.05	0.15	0.07	0.02	0.09	0.10	0.05	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.18	0.20	0.12	0.12
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.05	0.15	0.00	0.04	0.08	0.13	0.06	0.02	0.01	0.03	0.30	0.40	0.08	0.21
C4	0.02	0.01	0.07	0.02	0.00	0.09	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.23	0.27	0.11	0.35	0.27	0.78	0.52
C4'	0.02	0.18	0.00	0.00	0.09	0.00	0.04	0.01	0.08	0.08	0.14	0.18	0.05	0.05	0.01	0.21	0.03	0.01	0.02	0.17	0.14	0.03
C5	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.24	0.17	0.05	0.32	0.17	0.91	0.50
C5'	0.05	0.25	0.15	0.01	0.06	0.01	0.04	0.00	0.03	0.28	0.16	0.23	0.02	0.22	0.09	0.05	0.20	0.01	0.00	0.29	0.19	0.01
C6	0.02	0.00	0.07	0.05	0.00	0.08	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.29	0.23	0.09	0.37	0.24	1.02	0.61
C8	0.00	0.01	0.02	0.15	0.00	0.08	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.02	0.11	0.17	0.04	0.65	0.23
N1	0.02	0.00	0.09	0.00	0.00	0.14	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.31	0.35	0.17	0.43	0.38	1.02	0.70
N3	0.03	0.00	0.10	0.04	0.00	0.18	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.26	0.41	0.22	0.42	0.43	0.78	0.64
N6	0.02	0.00	0.05	0.08	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.28	0.18	0.06	0.35	0.17	1.09	0.59
N7	0.00	0.01	0.01	0.13	0.00	0.05	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.18	0.02	0.06	0.22	0.01	0.83	0.33
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.01	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.15	0.00	0.25	0.14	0.60	0.35
O2'	0.02	0.30	0.00	0.02	0.23	0.21	0.24	0.05	0.29	0.11	0.31	0.26	0.28	0.18	0.13	0.00	0.07	0.11	0.28	0.35	0.12	0.21
O3'	0.21	0.42	0.01	0.01	0.27	0.03	0.17	0.20	0.23	0.02	0.35	0.41	0.18	0.02	0.15	0.07	0.00	0.13	0.30	0.52	0.01	0.24
O4'	0.00	0.22	0.01	0.03	0.11	0.01	0.05	0.01	0.09	0.11	0.17	0.22	0.06	0.06	0.00	0.11	0.13	0.00	0.12	0.14	0.24	0.22
O5'	0.18	0.45	0.18	0.30	0.35	0.02	0.32	0.00	0.37	0.17	0.43	0.42	0.35	0.22	0.25	0.28	0.30	0.12	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.17	0.46	0.20	0.40	0.27	0.17	0.17	0.29	0.24	0.04	0.38	0.43	0.17	0.01	0.14	0.35	0.52	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.31	0.92	0.12	0.08	0.78	0.14	0.91	0.19	1.02	0.65	1.02	0.78	1.09	0.83	0.60	0.12	0.01	0.24	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.24	0.72	0.12	0.21	0.52	0.03	0.50	0.01	0.61	0.23	0.70	0.64	0.59	0.33	0.35	0.21	0.24	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.04	0.03	0.26	0.17	0.26	0.14	0.37	0.46	0.32	0.14	0.11	0.30	0.12	0.45	0.48	0.27	0.04	0.19	0.18	0.17
C2	0.24	0.43	0.73	0.58	0.25	0.03	0.06	0.41	0.03	0.24	0.41	0.25	0.61	0.91	0.95	0.19	0.01	0.16	0.10	0.21
C2'	0.08	0.09	0.16	0.09	0.28	0.15	0.37	0.42	0.32	0.17	0.16	0.32	0.03	0.32	0.36	0.26	0.13	0.36	0.20	0.22
C3'	0.16	0.21	0.10	0.03	0.46	0.19	0.56	0.46	0.47	0.29	0.31	0.53	0.06	0.30	0.32	0.33	0.18	0.40	0.08	0.30
C4	0.13	0.20	0.55	0.45	0.03	0.03	0.19	0.43	0.16	0.05	0.13	0.06	0.37	0.77	0.85	0.20	0.01	0.15	0.10	0.20
C4'	0.07	0.02	0.31	0.25	0.24	0.05	0.33	0.21	0.24	0.05	0.09	0.31	0.17	0.52	0.50	0.09	0.21	0.16	0.44	0.13
C5	0.22	0.24	0.68	0.58	0.03	0.09	0.19	0.35	0.14	0.10	0.15	0.07	0.43	0.95	1.00	0.14	0.07	0.09	0.04	0.20
C5'	0.41	0.31	0.63	0.59	0.05	0.44	0.03	0.23	0.08	0.26	0.20	0.04	0.46	0.82	0.82	0.29	0.67	0.71	0.88	0.62
C6	0.34	0.42	0.87	0.72	0.16	0.14	0.02	0.30	0.00	0.25	0.35	0.13	0.62	1.17	1.13	0.09	0.07	0.08	0.01	0.20
C8	0.05	0.04	0.38	0.32	0.33	0.04	0.45	0.35	0.36	0.12	0.15	0.40	0.15	0.64	0.68	0.17	0.07	0.10	0.07	0.18
N1	0.33	0.51	0.87	0.69	0.29	0.05	0.09	0.35	0.08	0.30	0.47	0.29	0.71	1.10	1.08	0.13	0.03	0.12	0.05	0.21
N3	0.15	0.30	0.59	0.47	0.10	0.07	0.07	0.45	0.07	0.13	0.26	0.10	0.46	0.77	0.84	0.22	0.02	0.17	0.13	0.21
N6	0.46	0.50	1.02	0.83	0.20	0.26	0.01	0.19	0.05	0.33	0.41	0.16	0.74	1.41	1.17	0.00	0.11	0.04	0.06	0.19
N7	0.16	0.07	0.55	0.50	0.24	0.16	0.37	0.29	0.28	0.03	0.05	0.30	0.27	0.84	0.89	0.10	0.13	0.05	0.01	0.19
N9	0.04	0.03	0.38	0.30	0.21	0.05	0.34	0.43	0.28	0.08	0.05	0.26	0.20	0.61	0.67	0.22	0.00	0.16	0.12	0.19
O2'	0.09	0.16	0.30	0.23	0.04	0.05	0.05	0.29	0.04	0.07	0.13	0.03	0.24	0.39	0.45	0.11	0.06	0.36	0.36	0.13
O3'	0.14	0.19	0.11	0.00	0.48	0.22	0.59	0.52	0.49	0.28	0.30	0.56	0.02	0.34	0.28	0.33	0.30	0.60	0.10	0.45
O4'	0.10	0.06	0.38	0.30	0.21	0.05	0.32	0.25	0.24	0.03	0.04	0.28	0.23	0.61	0.60	0.10	0.22	0.16	0.37	0.09
O5'	0.04	0.20	0.20	0.14	0.56	0.01	0.65	0.24	0.49	0.25	0.36	0.68	0.01	0.47	0.42	0.17	0.21	0.27	0.27	0.10
OP1	0.34	0.14	0.52	0.45	0.27	0.39	0.35	0.16	0.16	0.10	0.05	0.42	0.35	0.81	0.67	0.25	0.66	0.77	0.61	0.57
OP2	0.60	0.82	0.29	0.27	1.20	0.42	1.25	0.60	1.07	0.84	1.01	1.34	0.64	0.03	0.08	0.69	0.22	0.01	0.14	0.29
P	0.02	0.20	0.22	0.20	0.55	0.09	0.61	0.11	0.45	0.23	0.36	0.67	0.02	0.47	0.48	0.11	0.36	0.54	0.44	0.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.28	0.29	0.29	0.29
C2	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.53	0.56	0.70	0.58
C2'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.26	0.27	0.18	0.24
C3'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.28	0.32	0.04	0.22
C4	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.75	0.89	1.04	0.87
C4'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.16	0.01
C5	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.79	0.93	1.05	0.91
C5'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.22	0.34	0.00
C6	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.70	0.76	0.80	0.75
N1	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.53	0.55	0.61	0.56
N3	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.64	0.73	0.90	0.74
N4	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.80	0.99	1.17	0.96
O2	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.40	0.41	0.56	0.44
O2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01
O3'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.10	0.16	0.19	0.04
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.16	0.20	0.12	0.18
O5'	0.28	0.53	0.26	0.28	0.75	0.01	0.79	0.00	0.70	0.53	0.64	0.80	0.40	0.02	0.10	0.16	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.29	0.56	0.27	0.32	0.89	0.11	0.93	0.22	0.76	0.55	0.73	0.99	0.41	0.01	0.16	0.20	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.29	0.70	0.18	0.04	1.04	0.16	1.05	0.34	0.80	0.61	0.90	1.17	0.56	0.02	0.19	0.12	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.29	0.58	0.24	0.22	0.87	0.01	0.91	0.00	0.75	0.56	0.74	0.96	0.44	0.01	0.04	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00