Doublet Group distance statistics: 48116

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C5	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
C2	A	0, 0.000, 0.029, 0.057, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.029 std_dev=0.029
N7	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
C4	A	0, 0.000, 0.034, 0.069, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.034 std_dev=0.034
C1'	A	0, 0.000, 0.036, 0.071, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.036 std_dev=0.036
N3	A	0, 0.000, 0.039, 0.077, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.039 std_dev=0.039
C8	A	0, 0.000, 0.045, 0.089, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.045 std_dev=0.045
N6	A	0, 0.000, 0.053, 0.107, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.053 std_dev=0.053
N9	A	0, 0.000, 0.055, 0.110, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.055 std_dev=0.055
O4'	B	0, 0.000, 0.074, 0.147, 0.147 max_d=0.147 avg_d=0.074 std_dev=0.074
O4'	A	0, 0.000, 0.094, 0.188, 0.188 max_d=0.188 avg_d=0.094 std_dev=0.094
C3'	A	0, 0.000, 0.114, 0.227, 0.227 max_d=0.227 avg_d=0.114 std_dev=0.114
N1	B	0, 0.000, 0.123, 0.245, 0.245 max_d=0.245 avg_d=0.123 std_dev=0.123
C1'	B	0, 0.000, 0.126, 0.252, 0.252 max_d=0.252 avg_d=0.126 std_dev=0.126
C4'	B	0, 0.000, 0.132, 0.264, 0.264 max_d=0.264 avg_d=0.132 std_dev=0.132
C2'	A	0, 0.000, 0.135, 0.270, 0.270 max_d=0.270 avg_d=0.135 std_dev=0.135
C2	B	0, 0.000, 0.137, 0.275, 0.275 max_d=0.275 avg_d=0.137 std_dev=0.137
C4	B	0, 0.000, 0.142, 0.283, 0.283 max_d=0.283 avg_d=0.142 std_dev=0.142
C4'	A	0, 0.000, 0.152, 0.305, 0.305 max_d=0.305 avg_d=0.152 std_dev=0.152
N4	B	0, 0.000, 0.186, 0.373, 0.373 max_d=0.373 avg_d=0.186 std_dev=0.186
OP1	B	0, 0.000, 0.196, 0.391, 0.391 max_d=0.391 avg_d=0.196 std_dev=0.196
O5'	B	0, 0.000, 0.204, 0.408, 0.408 max_d=0.408 avg_d=0.204 std_dev=0.204
N3	B	0, 0.000, 0.204, 0.409, 0.409 max_d=0.409 avg_d=0.204 std_dev=0.204
P	A	0, 0.000, 0.214, 0.428, 0.428 max_d=0.428 avg_d=0.214 std_dev=0.214
P	B	0, 0.000, 0.223, 0.446, 0.446 max_d=0.446 avg_d=0.223 std_dev=0.223
C3'	B	0, 0.000, 0.223, 0.446, 0.446 max_d=0.446 avg_d=0.223 std_dev=0.223
C2'	B	0, 0.000, 0.229, 0.457, 0.457 max_d=0.457 avg_d=0.229 std_dev=0.229
O3'	A	0, 0.000, 0.229, 0.458, 0.458 max_d=0.458 avg_d=0.229 std_dev=0.229
O2'	A	0, 0.000, 0.236, 0.473, 0.473 max_d=0.473 avg_d=0.236 std_dev=0.236
OP2	B	0, 0.000, 0.268, 0.537, 0.537 max_d=0.537 avg_d=0.268 std_dev=0.268
O2'	B	0, 0.000, 0.270, 0.541, 0.541 max_d=0.541 avg_d=0.270 std_dev=0.270
O2	B	0, 0.000, 0.278, 0.557, 0.557 max_d=0.557 avg_d=0.278 std_dev=0.278
C5	B	0, 0.000, 0.279, 0.559, 0.559 max_d=0.559 avg_d=0.279 std_dev=0.279
C5'	A	0, 0.000, 0.292, 0.583, 0.583 max_d=0.583 avg_d=0.292 std_dev=0.292
C6	B	0, 0.000, 0.304, 0.609, 0.609 max_d=0.609 avg_d=0.304 std_dev=0.304
C5'	B	0, 0.000, 0.307, 0.614, 0.614 max_d=0.614 avg_d=0.307 std_dev=0.307
OP2	A	0, 0.000, 0.318, 0.636, 0.636 max_d=0.636 avg_d=0.318 std_dev=0.318
O3'	B	0, 0.000, 0.322, 0.644, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.322 std_dev=0.322
O5'	A	0, 0.000, 0.597, 1.194, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.597 std_dev=0.597
OP1	A	0, 0.000, 0.683, 1.366, 1.366 max_d=1.366 avg_d=0.683 std_dev=0.683

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.47	0.07	0.13
C2	0.04	0.00	0.09	0.07	0.01	0.01	0.02	0.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.10	0.09	0.04	0.29	0.29	0.19	0.11
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.06	0.00	0.05	0.02	0.07	0.01	0.08	0.09	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.41	0.12	0.12
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.05	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.17	0.34	0.15	0.10
C4	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.03	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.02	0.01	0.13	0.38	0.15	0.10
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.04	0.05	0.02	0.01	0.06	0.06	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.32	0.14	0.05
C5	0.00	0.02	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.02	0.02	0.07	0.33	0.15	0.07
C5'	0.03	0.11	0.02	0.01	0.13	0.00	0.16	0.00	0.16	0.13	0.14	0.09	0.18	0.16	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00	0.22	0.17	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.03	0.01	0.04	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.05	0.01	0.13	0.27	0.17	0.06
C8	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.13	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.06	0.42	0.10	0.08
N1	0.02	0.01	0.08	0.05	0.01	0.02	0.01	0.14	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.08	0.02	0.23	0.25	0.19	0.07
N3	0.05	0.01	0.09	0.06	0.01	0.01	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.09	0.07	0.05	0.26	0.35	0.17	0.13
N6	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02	0.06	0.02	0.18	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.02	0.06	0.05	0.03	0.09	0.23	0.17	0.03
N7	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.16	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.36	0.12	0.06
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.45	0.10	0.12
O2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.07	0.02	0.09	0.09	0.06	0.04	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.37	0.14	0.07
O3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.08	0.07	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.15	0.26	0.20	0.06
O4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.05	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.45	0.04	0.13
O5'	0.01	0.29	0.09	0.17	0.13	0.01	0.07	0.00	0.13	0.06	0.23	0.26	0.09	0.02	0.03	0.00	0.15	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.47	0.29	0.41	0.34	0.38	0.32	0.33	0.22	0.27	0.42	0.25	0.35	0.23	0.36	0.45	0.37	0.26	0.45	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.07	0.19	0.12	0.15	0.15	0.14	0.15	0.17	0.17	0.10	0.19	0.17	0.17	0.12	0.10	0.14	0.20	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.13	0.11	0.12	0.10	0.10	0.05	0.07	0.01	0.06	0.08	0.07	0.13	0.03	0.06	0.12	0.07	0.06	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.02	0.01	0.06	0.12	0.03	0.03	0.05	0.02	0.03	0.00	0.01	0.04	0.02	0.03	0.19	0.06	0.02	0.09	0.06	0.05
C2	0.01	0.03	0.10	0.15	0.07	0.07	0.08	0.06	0.06	0.04	0.05	0.08	0.02	0.06	0.23	0.01	0.07	0.11	0.11	0.09
C2'	0.06	0.08	0.01	0.05	0.01	0.05	0.03	0.11	0.02	0.04	0.06	0.01	0.11	0.01	0.13	0.12	0.06	0.02	0.01	0.01
C3'	0.05	0.07	0.02	0.06	0.01	0.04	0.04	0.10	0.03	0.03	0.05	0.00	0.10	0.00	0.14	0.10	0.05	0.03	0.01	0.00
C4	0.01	0.04	0.09	0.15	0.08	0.07	0.08	0.08	0.05	0.03	0.06	0.09	0.03	0.05	0.21	0.02	0.08	0.12	0.12	0.11
C4'	0.01	0.01	0.07	0.13	0.03	0.03	0.06	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.03	0.05	0.21	0.04	0.02	0.10	0.06	0.05
C5	0.01	0.03	0.07	0.14	0.07	0.07	0.05	0.10	0.02	0.01	0.06	0.08	0.03	0.02	0.20	0.03	0.08	0.12	0.13	0.11
C5'	0.06	0.06	0.14	0.19	0.07	0.10	0.08	0.04	0.08	0.06	0.06	0.07	0.05	0.13	0.28	0.03	0.05	0.10	0.06	0.06
C6	0.02	0.02	0.06	0.13	0.06	0.06	0.04	0.09	0.01	0.01	0.05	0.07	0.02	0.02	0.20	0.04	0.07	0.11	0.13	0.10
C8	0.00	0.05	0.07	0.14	0.08	0.08	0.06	0.13	0.03	0.03	0.07	0.09	0.05	0.03	0.20	0.02	0.10	0.12	0.14	0.13
N1	0.01	0.03	0.08	0.14	0.06	0.06	0.06	0.07	0.03	0.02	0.05	0.08	0.02	0.04	0.21	0.03	0.07	0.11	0.12	0.10
N3	0.03	0.04	0.11	0.16	0.08	0.08	0.10	0.07	0.08	0.05	0.06	0.09	0.03	0.07	0.23	0.00	0.07	0.12	0.11	0.10
N6	0.05	0.01	0.04	0.11	0.03	0.04	0.01	0.08	0.03	0.02	0.03	0.05	0.01	0.01	0.18	0.06	0.06	0.10	0.12	0.09
N7	0.02	0.04	0.06	0.14	0.07	0.07	0.04	0.12	0.01	0.01	0.07	0.09	0.05	0.02	0.19	0.03	0.10	0.12	0.15	0.13
N9	0.01	0.04	0.09	0.15	0.08	0.08	0.08	0.09	0.05	0.04	0.06	0.09	0.03	0.05	0.21	0.01	0.08	0.11	0.11	0.10
O2'	0.11	0.13	0.03	0.00	0.04	0.13	0.03	0.21	0.02	0.08	0.11	0.03	0.18	0.05	0.08	0.18	0.12	0.02	0.01	0.04
O3'	0.09	0.12	0.02	0.00	0.04	0.10	0.03	0.17	0.02	0.06	0.11	0.04	0.18	0.04	0.08	0.14	0.09	0.01	0.02	0.04
O4'	0.04	0.02	0.04	0.11	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.19	0.06	0.01	0.08	0.04	0.04
O5'	0.31	0.29	0.22	0.12	0.25	0.20	0.24	0.15	0.26	0.29	0.27	0.24	0.30	0.26	0.00	0.31	0.14	0.04	0.06	0.06
OP1	0.30	0.35	0.33	0.46	0.38	0.46	0.38	0.55	0.35	0.34	0.37	0.39	0.33	0.24	0.49	0.38	0.52	0.57	0.54	0.55
OP2	0.07	0.10	0.09	0.12	0.09	0.10	0.07	0.07	0.06	0.07	0.11	0.09	0.12	0.08	0.15	0.08	0.05	0.03	0.04	0.03
P	0.03	0.07	0.07	0.16	0.08	0.13	0.07	0.17	0.05	0.05	0.08	0.09	0.07	0.02	0.22	0.06	0.15	0.21	0.18	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01
C2	0.01	0.00	0.11	0.12	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.07	0.15	0.03	0.01	0.02	0.04	0.02
C2'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.09	0.02	0.20	0.00	0.01	0.00	0.04	0.10	0.05	0.06
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.11	0.03	0.19	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.05	0.08
C4	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.04	0.04	0.03	0.04
C4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.02	0.00	0.06	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02
C5	0.00	0.02	0.06	0.08	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.08	0.02	0.10	0.12	0.11	0.09
C5'	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.09	0.04	0.02	0.05	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00
C6	0.00	0.01	0.09	0.12	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.12	0.04	0.10	0.13	0.10	0.09
N1	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.02
N3	0.01	0.00	0.09	0.11	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.15	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01
N4	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.06	0.01	0.04	0.04	0.03	0.04
O2	0.01	0.00	0.20	0.19	0.03	0.06	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.14	0.25	0.05	0.04	0.06	0.07	0.05
O2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.06	0.00	0.06	0.02	0.14	0.00	0.01	0.00	0.02	0.08	0.03	0.04
O3'	0.01	0.15	0.01	0.01	0.05	0.02	0.08	0.03	0.12	0.01	0.15	0.06	0.25	0.01	0.00	0.01	0.04	0.15	0.06	0.09
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.04	0.03	0.05	0.05
O5'	0.01	0.01	0.04	0.04	0.04	0.01	0.10	0.00	0.10	0.03	0.00	0.04	0.04	0.02	0.04	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.03	0.02	0.10	0.12	0.04	0.03	0.12	0.04	0.13	0.05	0.01	0.04	0.06	0.08	0.15	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.00	0.04	0.05	0.05	0.03	0.00	0.11	0.00	0.10	0.01	0.03	0.03	0.07	0.03	0.06	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.01	0.02	0.06	0.08	0.04	0.02	0.09	0.00	0.09	0.02	0.01	0.04	0.05	0.04	0.09	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00