Doublet Group distance statistics: 48125

back

Distances from reference structure (by RMSD)

4, 4, 9, 7, 5, 4, 1, 1, 3, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.007, 0.021, 0.034, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.005, 0.020, 0.034, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.020 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.005, 0.020, 0.035, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.020 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.002, 0.018, 0.035, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.018 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.007, 0.026, 0.044, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.026 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.006, 0.027, 0.048, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.027 std_dev=0.021
N6	A	0, 0.013, 0.035, 0.056, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.035 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.009, 0.033, 0.057, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.033 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.010, 0.041, 0.073, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.041 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.002, 0.095, 0.187, 0.334 max_d=0.334 avg_d=0.095 std_dev=0.093
C2'	A	0, 0.017, 0.119, 0.222, 0.465 max_d=0.465 avg_d=0.119 std_dev=0.102
O2'	A	0, 0.043, 0.185, 0.326, 0.541 max_d=0.541 avg_d=0.185 std_dev=0.141
C3'	A	0, 0.035, 0.192, 0.349, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.192 std_dev=0.157
C4'	A	0, 0.027, 0.187, 0.346, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.187 std_dev=0.159
O3'	A	0, 0.064, 0.304, 0.545, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.304 std_dev=0.241
P	B	0, 0.122, 0.370, 0.618, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.370 std_dev=0.248
C5'	A	0, 0.034, 0.285, 0.537, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.285 std_dev=0.251
OP1	B	0, 0.186, 0.437, 0.689, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.437 std_dev=0.252
C2'	B	0, 0.109, 0.404, 0.699, 1.450 max_d=1.450 avg_d=0.404 std_dev=0.295
N3	B	0, 0.043, 0.343, 0.644, 1.840 max_d=1.840 avg_d=0.343 std_dev=0.301
O5'	A	0, 0.020, 0.331, 0.643, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.331 std_dev=0.311
C4'	B	0, 0.027, 0.353, 0.679, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.353 std_dev=0.326
O4'	B	0, 0.007, 0.333, 0.659, 1.665 max_d=1.665 avg_d=0.333 std_dev=0.326
C1'	B	0, 0.027, 0.357, 0.688, 1.895 max_d=1.895 avg_d=0.357 std_dev=0.330
N2	B	0, 0.051, 0.385, 0.718, 1.985 max_d=1.985 avg_d=0.385 std_dev=0.334
OP1	A	0, 0.049, 0.385, 0.720, 1.603 max_d=1.603 avg_d=0.385 std_dev=0.336
P	A	0, 0.036, 0.378, 0.720, 1.714 max_d=1.714 avg_d=0.378 std_dev=0.342
C2	B	0, 0.024, 0.384, 0.744, 2.244 max_d=2.244 avg_d=0.384 std_dev=0.360
C5'	B	0, 0.033, 0.402, 0.771, 1.404 max_d=1.404 avg_d=0.402 std_dev=0.369
C3'	B	0, 0.055, 0.428, 0.802, 1.603 max_d=1.603 avg_d=0.428 std_dev=0.374
OP2	A	0, 0.060, 0.446, 0.832, 1.997 max_d=1.997 avg_d=0.446 std_dev=0.386
OP2	B	0, 0.066, 0.460, 0.854, 1.694 max_d=1.694 avg_d=0.460 std_dev=0.394
C4	B	0, -0.034, 0.394, 0.821, 2.728 max_d=2.728 avg_d=0.394 std_dev=0.428
N9	B	0, -0.038, 0.403, 0.844, 2.782 max_d=2.782 avg_d=0.403 std_dev=0.441
O2'	B	0, 0.049, 0.504, 0.959, 2.388 max_d=2.388 avg_d=0.504 std_dev=0.455
O5'	B	0, -0.040, 0.472, 0.985, 2.071 max_d=2.071 avg_d=0.472 std_dev=0.513
N1	B	0, -0.062, 0.454, 0.971, 3.339 max_d=3.339 avg_d=0.454 std_dev=0.516
C5	B	0, -0.122, 0.481, 1.084, 3.953 max_d=3.953 avg_d=0.481 std_dev=0.603
C8	B	0, -0.119, 0.501, 1.122, 4.042 max_d=4.042 avg_d=0.501 std_dev=0.621
O3'	B	0, -0.080, 0.568, 1.217, 2.366 max_d=2.366 avg_d=0.568 std_dev=0.648
C6	B	0, -0.143, 0.512, 1.167, 4.302 max_d=4.302 avg_d=0.512 std_dev=0.655
N7	B	0, -0.176, 0.548, 1.271, 4.760 max_d=4.760 avg_d=0.548 std_dev=0.724
O6	B	0, -0.218, 0.602, 1.421, 5.406 max_d=5.406 avg_d=0.602 std_dev=0.820

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.04	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.08	0.06	0.04
C2	0.04	0.00	0.04	0.06	0.02	0.11	0.01	0.18	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.06	0.05	0.11	0.24	0.14	0.22	0.18
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.04	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.10	0.07	0.03
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.06	0.05	0.07	0.08	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.08	0.02
C4	0.02	0.02	0.02	0.04	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.06	0.13	0.05	0.13	0.08
C4'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.08	0.07	0.10	0.10	0.08	0.07	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.10	0.06	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.04	0.13	0.06	0.13	0.08
C5'	0.02	0.18	0.01	0.01	0.11	0.00	0.12	0.00	0.15	0.10	0.17	0.15	0.15	0.11	0.06	0.03	0.03	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.07	0.06	0.18	0.08	0.17	0.11
C8	0.02	0.04	0.05	0.08	0.02	0.07	0.02	0.10	0.03	0.00	0.04	0.02	0.03	0.00	0.00	0.05	0.09	0.03	0.08	0.12	0.09	0.11
N1	0.04	0.00	0.03	0.06	0.02	0.10	0.02	0.17	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.04	0.06	0.10	0.23	0.13	0.22	0.16
N3	0.04	0.00	0.04	0.05	0.00	0.10	0.01	0.15	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.06	0.05	0.11	0.20	0.11	0.18	0.14
N6	0.02	0.02	0.03	0.07	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.09	0.06	0.18	0.09	0.18	0.11
N7	0.02	0.02	0.05	0.08	0.00	0.07	0.01	0.11	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.05	0.11	0.02	0.10	0.10	0.11	0.10
N9	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.06	0.07	0.07	0.05
O2'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.05	0.04	0.06	0.03	0.05	0.02	0.00	0.04	0.04	0.04	0.13	0.08	0.05
O3'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.02	0.07	0.03	0.07	0.09	0.06	0.05	0.09	0.11	0.04	0.04	0.00	0.01	0.04	0.11	0.09	0.04
O4'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.03	0.10	0.11	0.06	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.09	0.06	0.05
O5'	0.04	0.24	0.02	0.01	0.13	0.01	0.13	0.01	0.18	0.08	0.23	0.20	0.18	0.10	0.06	0.04	0.04	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.08	0.14	0.10	0.09	0.05	0.10	0.06	0.05	0.08	0.12	0.13	0.11	0.09	0.10	0.07	0.13	0.11	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.22	0.07	0.08	0.13	0.06	0.13	0.06	0.17	0.09	0.22	0.18	0.18	0.11	0.07	0.08	0.09	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.18	0.03	0.02	0.08	0.02	0.08	0.01	0.11	0.11	0.16	0.14	0.11	0.10	0.05	0.05	0.04	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.32	0.18	0.17	0.13	0.33	0.09	0.44	0.15	0.41	0.55	0.27	0.15	0.18	0.57	0.40	0.34	0.27	0.26	0.18	0.47	0.16	0.20	0.04
C2	0.28	0.20	0.23	0.18	0.32	0.20	0.41	0.26	0.38	0.45	0.29	0.17	0.21	0.48	0.35	0.41	0.37	0.13	0.21	0.43	0.18	0.30	0.07
C2'	0.30	0.16	0.15	0.15	0.30	0.10	0.42	0.12	0.38	0.54	0.24	0.16	0.16	0.55	0.38	0.27	0.29	0.30	0.16	0.45	0.20	0.12	0.07
C3'	0.23	0.15	0.12	0.19	0.29	0.14	0.44	0.15	0.41	0.53	0.27	0.13	0.14	0.58	0.34	0.15	0.30	0.23	0.14	0.51	0.07	0.14	0.01
C4	0.30	0.18	0.20	0.15	0.34	0.17	0.43	0.25	0.39	0.50	0.27	0.14	0.19	0.52	0.39	0.37	0.30	0.14	0.20	0.45	0.16	0.32	0.07
C4'	0.24	0.18	0.12	0.18	0.32	0.14	0.47	0.18	0.46	0.54	0.31	0.13	0.17	0.60	0.36	0.17	0.30	0.22	0.19	0.56	0.05	0.17	0.05
C5	0.28	0.20	0.22	0.17	0.35	0.21	0.43	0.30	0.40	0.47	0.29	0.13	0.21	0.50	0.38	0.35	0.31	0.11	0.21	0.43	0.17	0.39	0.11
C5'	0.19	0.20	0.12	0.20	0.31	0.19	0.48	0.27	0.49	0.51	0.34	0.14	0.17	0.60	0.33	0.10	0.29	0.16	0.28	0.60	0.16	0.28	0.12
C6	0.26	0.22	0.24	0.20	0.34	0.24	0.41	0.32	0.39	0.41	0.30	0.14	0.23	0.45	0.35	0.37	0.36	0.15	0.22	0.41	0.18	0.40	0.12
C8	0.32	0.21	0.17	0.12	0.36	0.13	0.46	0.26	0.41	0.55	0.29	0.16	0.21	0.56	0.42	0.30	0.22	0.20	0.19	0.46	0.15	0.39	0.11
N1	0.26	0.22	0.25	0.20	0.32	0.24	0.39	0.30	0.38	0.41	0.30	0.16	0.22	0.44	0.34	0.39	0.39	0.15	0.22	0.41	0.18	0.35	0.09
N3	0.29	0.19	0.21	0.16	0.33	0.17	0.42	0.24	0.39	0.48	0.28	0.15	0.19	0.51	0.37	0.40	0.33	0.14	0.20	0.44	0.17	0.27	0.06
N6	0.24	0.25	0.26	0.21	0.34	0.26	0.39	0.34	0.38	0.36	0.32	0.16	0.26	0.40	0.32	0.35	0.37	0.19	0.23	0.39	0.19	0.43	0.14
N7	0.29	0.22	0.20	0.15	0.37	0.20	0.46	0.32	0.41	0.52	0.30	0.16	0.23	0.54	0.42	0.30	0.26	0.10	0.20	0.45	0.16	0.44	0.14
N9	0.32	0.18	0.18	0.13	0.34	0.12	0.44	0.22	0.40	0.54	0.28	0.15	0.19	0.55	0.41	0.34	0.26	0.20	0.19	0.46	0.15	0.31	0.06
O2'	0.28	0.15	0.14	0.16	0.28	0.11	0.40	0.14	0.36	0.52	0.23	0.18	0.15	0.53	0.35	0.27	0.31	0.30	0.16	0.43	0.20	0.04	0.09
O3'	0.16	0.12	0.14	0.20	0.24	0.12	0.39	0.08	0.38	0.48	0.23	0.11	0.10	0.53	0.28	0.10	0.32	0.21	0.02	0.48	0.02	0.02	0.00
O4'	0.30	0.20	0.14	0.15	0.35	0.11	0.48	0.17	0.46	0.56	0.32	0.14	0.20	0.61	0.40	0.27	0.28	0.24	0.19	0.55	0.06	0.20	0.02
O5'	0.23	0.25	0.10	0.17	0.35	0.17	0.51	0.26	0.53	0.53	0.39	0.17	0.22	0.63	0.36	0.14	0.28	0.17	0.28	0.65	0.18	0.25	0.12
OP1	0.19	0.24	0.12	0.16	0.33	0.17	0.50	0.26	0.54	0.50	0.39	0.15	0.19	0.61	0.33	0.12	0.25	0.12	0.31	0.68	0.20	0.23	0.12
OP2	0.22	0.32	0.18	0.19	0.39	0.21	0.58	0.30	0.63	0.54	0.49	0.23	0.26	0.67	0.37	0.14	0.26	0.16	0.36	0.78	0.25	0.24	0.15
P	0.20	0.25	0.17	0.21	0.34	0.22	0.52	0.32	0.56	0.51	0.41	0.16	0.21	0.62	0.34	0.13	0.28	0.13	0.33	0.69	0.21	0.28	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.04	0.05	0.02	0.07	0.08	0.07	0.02	0.01	0.02	0.22	0.00	0.10	0.05	0.33	0.26	0.12
C2	0.07	0.00	0.10	0.13	0.01	0.21	0.02	0.21	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.41	0.24	0.11	0.02	0.25	0.35	0.10
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.06	0.02	0.04	0.11	0.06	0.06	0.09	0.10	0.10	0.04	0.02	0.00	0.04	0.02	0.24	0.06	0.31	0.26	0.13
C3'	0.03	0.13	0.01	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.11	0.18	0.11	0.17	0.13	0.18	0.08	0.02	0.01	0.01	0.25	0.14	0.42	0.12	0.14
C4	0.04	0.01	0.06	0.07	0.00	0.07	0.01	0.11	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.27	0.12	0.17	0.03	0.31	0.37	0.20
C4'	0.01	0.21	0.02	0.00	0.07	0.00	0.04	0.00	0.05	0.17	0.14	0.28	0.20	0.14	0.04	0.11	0.04	0.00	0.01	0.05	0.41	0.12	0.11
C5	0.03	0.02	0.04	0.12	0.01	0.04	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.11	0.20	0.05	0.28	0.02	0.38	0.47	0.33
C5'	0.04	0.21	0.11	0.01	0.11	0.00	0.12	0.00	0.12	0.21	0.15	0.29	0.21	0.21	0.08	0.06	0.09	0.01	0.01	0.14	0.26	0.22	0.01
C6	0.05	0.02	0.06	0.11	0.02	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.10	0.26	0.10	0.28	0.01	0.37	0.47	0.32
C8	0.02	0.02	0.06	0.18	0.02	0.17	0.00	0.21	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.22	0.09	0.13	0.35	0.03	0.44	0.52	0.42
N1	0.07	0.01	0.09	0.11	0.03	0.14	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.07	0.35	0.18	0.18	0.01	0.29	0.40	0.20
N2	0.08	0.01	0.10	0.17	0.02	0.28	0.02	0.29	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.14	0.48	0.30	0.13	0.02	0.25	0.36	0.09
N3	0.07	0.01	0.10	0.13	0.01	0.20	0.01	0.21	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.10	0.40	0.24	0.08	0.02	0.26	0.34	0.08
N7	0.02	0.02	0.04	0.18	0.01	0.14	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.21	0.12	0.08	0.38	0.03	0.47	0.58	0.46
N9	0.01	0.02	0.02	0.08	0.01	0.04	0.02	0.08	0.03	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.09	0.17	0.01	0.20	0.04	0.34	0.36	0.23
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.04	0.11	0.11	0.06	0.10	0.22	0.07	0.14	0.10	0.21	0.09	0.00	0.06	0.07	0.23	0.13	0.32	0.23	0.09
O3'	0.22	0.41	0.04	0.01	0.27	0.04	0.20	0.09	0.26	0.09	0.35	0.48	0.40	0.12	0.17	0.06	0.00	0.15	0.18	0.23	0.66	0.13	0.26
O4'	0.00	0.24	0.02	0.01	0.12	0.00	0.05	0.01	0.10	0.13	0.18	0.30	0.24	0.08	0.01	0.07	0.15	0.00	0.21	0.07	0.40	0.26	0.21
O5'	0.10	0.11	0.24	0.25	0.17	0.01	0.28	0.01	0.28	0.35	0.18	0.13	0.08	0.38	0.20	0.23	0.18	0.21	0.00	0.34	0.02	0.01	0.00
O6	0.05	0.02	0.06	0.14	0.03	0.05	0.02	0.14	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.13	0.23	0.07	0.34	0.00	0.43	0.55	0.41
OP1	0.33	0.25	0.31	0.42	0.31	0.41	0.38	0.26	0.37	0.44	0.29	0.25	0.26	0.47	0.34	0.32	0.66	0.40	0.02	0.43	0.00	0.01	0.01
OP2	0.26	0.35	0.26	0.12	0.37	0.12	0.47	0.22	0.47	0.52	0.40	0.36	0.34	0.58	0.36	0.23	0.13	0.26	0.01	0.55	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.10	0.13	0.14	0.20	0.11	0.33	0.01	0.32	0.42	0.20	0.09	0.08	0.46	0.23	0.09	0.26	0.21	0.00	0.41	0.01	0.01	0.00