Doublet Group distance statistics: 48126

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 8, 7, 3, 0, 2, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.001, 0.010, 0.018, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.010 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.001, 0.011, 0.021, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C1'	A	0, -0.001, 0.012, 0.025, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.012 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.000, 0.014, 0.029, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.009, 0.026, 0.044, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.026 std_dev=0.017
C4	A	0, -0.006, 0.015, 0.037, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.015 std_dev=0.022
O4'	A	0, 0.032, 0.057, 0.082, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.057 std_dev=0.025
N9	A	0, -0.007, 0.020, 0.047, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.020 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.001, 0.031, 0.062, 0.141 max_d=0.141 avg_d=0.031 std_dev=0.030
N6	A	0, -0.007, 0.033, 0.073, 0.167 max_d=0.167 avg_d=0.033 std_dev=0.040
C2'	A	0, 0.020, 0.060, 0.101, 0.164 max_d=0.164 avg_d=0.060 std_dev=0.041
C4'	A	0, 0.051, 0.093, 0.135, 0.188 max_d=0.188 avg_d=0.093 std_dev=0.042
C3'	A	0, 0.039, 0.095, 0.152, 0.246 max_d=0.246 avg_d=0.095 std_dev=0.056
O2'	A	0, 0.040, 0.104, 0.169, 0.270 max_d=0.270 avg_d=0.104 std_dev=0.064
C5'	A	0, 0.086, 0.154, 0.222, 0.283 max_d=0.283 avg_d=0.154 std_dev=0.068
O3'	A	0, 0.106, 0.201, 0.295, 0.406 max_d=0.406 avg_d=0.201 std_dev=0.094
P	B	0, 0.183, 0.310, 0.436, 0.534 max_d=0.534 avg_d=0.310 std_dev=0.126
N3	B	0, 0.178, 0.310, 0.442, 0.564 max_d=0.564 avg_d=0.310 std_dev=0.132
C3'	B	0, 0.157, 0.303, 0.449, 0.609 max_d=0.609 avg_d=0.303 std_dev=0.146
C4	B	0, 0.173, 0.325, 0.478, 0.694 max_d=0.694 avg_d=0.325 std_dev=0.152
C2	B	0, 0.193, 0.372, 0.551, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.372 std_dev=0.179
N9	B	0, 0.133, 0.328, 0.522, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.328 std_dev=0.195
OP2	A	0, 0.105, 0.307, 0.510, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.307 std_dev=0.203
C1'	B	0, 0.077, 0.286, 0.495, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.286 std_dev=0.209
P	A	0, 0.049, 0.259, 0.469, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.259 std_dev=0.210
C4'	B	0, 0.069, 0.283, 0.496, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.283 std_dev=0.213
N2	B	0, 0.191, 0.423, 0.656, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.423 std_dev=0.233
C5	B	0, 0.162, 0.399, 0.636, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.399 std_dev=0.237
O4'	B	0, 0.036, 0.282, 0.527, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.282 std_dev=0.246
N1	B	0, 0.184, 0.432, 0.680, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.432 std_dev=0.248
OP2	B	0, 0.133, 0.384, 0.636, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.384 std_dev=0.251
OP1	A	0, 0.026, 0.294, 0.561, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.294 std_dev=0.268
C8	B	0, 0.141, 0.413, 0.686, 1.219 max_d=1.219 avg_d=0.413 std_dev=0.272
C6	B	0, 0.153, 0.445, 0.736, 1.308 max_d=1.308 avg_d=0.445 std_dev=0.292
OP1	B	0, 0.122, 0.414, 0.707, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.414 std_dev=0.293
N7	B	0, 0.151, 0.452, 0.752, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.452 std_dev=0.301
O5'	A	0, -0.083, 0.256, 0.594, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.256 std_dev=0.338
C5'	B	0, 0.050, 0.393, 0.735, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.393 std_dev=0.342
O5'	B	0, 0.050, 0.421, 0.793, 1.523 max_d=1.523 avg_d=0.421 std_dev=0.371
C2'	B	0, 0.067, 0.441, 0.816, 1.619 max_d=1.619 avg_d=0.441 std_dev=0.375
O6	B	0, 0.138, 0.526, 0.914, 1.710 max_d=1.710 avg_d=0.526 std_dev=0.388
O3'	B	0, 0.015, 0.430, 0.844, 1.570 max_d=1.570 avg_d=0.430 std_dev=0.414
O2'	B	0, -0.128, 0.650, 1.427, 3.180 max_d=3.180 avg_d=0.650 std_dev=0.778

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.13	0.25	0.06	0.11
C2	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.08	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.22	0.29	0.15	0.20
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.02	0.02	0.05	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.21	0.04	0.07
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.05	0.04	0.03	0.07	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01	0.11	0.18	0.04	0.06
C4	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.24	0.27	0.11	0.17
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.16	0.03	0.02
C5	0.01	0.02	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.31	0.27	0.13	0.19
C5'	0.03	0.08	0.01	0.01	0.09	0.00	0.09	0.00	0.09	0.08	0.09	0.08	0.09	0.09	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.15	0.04	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.07	0.02	0.31	0.27	0.16	0.21
C8	0.03	0.03	0.04	0.05	0.01	0.03	0.02	0.08	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.00	0.01	0.04	0.06	0.04	0.29	0.25	0.08	0.15
N1	0.02	0.00	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.09	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.05	0.03	0.27	0.29	0.16	0.21
N3	0.03	0.00	0.02	0.03	0.01	0.04	0.00	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.19	0.28	0.12	0.17
N6	0.01	0.02	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.04	0.02	0.02	0.00	0.04	0.02	0.04	0.10	0.03	0.35	0.27	0.18	0.23
N7	0.01	0.02	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.09	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.08	0.03	0.33	0.25	0.11	0.18
N9	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.22	0.26	0.08	0.14
O2'	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.00	0.03	0.03	0.04	0.21	0.03	0.06
O3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.07	0.06	0.05	0.03	0.10	0.08	0.04	0.03	0.00	0.01	0.06	0.13	0.07	0.03
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.08	0.24	0.06	0.09
O5'	0.13	0.22	0.10	0.11	0.24	0.01	0.31	0.01	0.31	0.29	0.27	0.19	0.35	0.33	0.22	0.04	0.06	0.08	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.25	0.29	0.21	0.18	0.27	0.16	0.27	0.15	0.27	0.25	0.29	0.28	0.27	0.25	0.26	0.21	0.13	0.24	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.15	0.04	0.04	0.11	0.03	0.13	0.04	0.16	0.08	0.16	0.12	0.18	0.11	0.08	0.03	0.07	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.20	0.07	0.06	0.17	0.02	0.19	0.01	0.21	0.15	0.21	0.17	0.23	0.18	0.14	0.06	0.03	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.14	0.19	0.08	0.11	0.08	0.10	0.20	0.09	0.17	0.12	0.20	0.12	0.14	0.15	0.57	0.06	0.10	0.12	0.09	0.11	0.18	0.03
C2	0.14	0.16	0.22	0.09	0.07	0.18	0.11	0.33	0.17	0.08	0.20	0.22	0.08	0.09	0.08	0.69	0.23	0.14	0.20	0.19	0.16	0.29	0.08
C2'	0.22	0.12	0.18	0.08	0.13	0.09	0.15	0.14	0.12	0.24	0.11	0.18	0.12	0.21	0.19	0.50	0.11	0.17	0.07	0.14	0.14	0.11	0.03
C3'	0.16	0.11	0.08	0.10	0.11	0.05	0.14	0.15	0.12	0.19	0.10	0.15	0.10	0.19	0.15	0.32	0.11	0.16	0.11	0.14	0.05	0.11	0.01
C4	0.15	0.15	0.18	0.11	0.06	0.17	0.06	0.32	0.10	0.07	0.15	0.21	0.10	0.05	0.08	0.61	0.19	0.08	0.18	0.11	0.14	0.30	0.08
C4'	0.16	0.13	0.09	0.10	0.10	0.05	0.11	0.18	0.10	0.15	0.11	0.17	0.12	0.14	0.13	0.36	0.11	0.13	0.14	0.11	0.03	0.11	0.02
C5	0.12	0.14	0.13	0.13	0.05	0.21	0.07	0.38	0.11	0.05	0.14	0.18	0.09	0.06	0.05	0.53	0.26	0.13	0.24	0.12	0.18	0.32	0.11
C5'	0.15	0.17	0.15	0.15	0.13	0.10	0.11	0.25	0.12	0.11	0.15	0.21	0.17	0.10	0.12	0.27	0.07	0.13	0.18	0.12	0.11	0.14	0.04
C6	0.10	0.13	0.14	0.13	0.08	0.23	0.13	0.39	0.17	0.10	0.18	0.17	0.07	0.13	0.07	0.55	0.30	0.19	0.26	0.19	0.21	0.32	0.12
C8	0.16	0.14	0.12	0.13	0.11	0.17	0.09	0.36	0.10	0.11	0.13	0.18	0.13	0.09	0.11	0.44	0.17	0.05	0.21	0.10	0.15	0.33	0.10
N1	0.12	0.16	0.19	0.11	0.09	0.21	0.14	0.36	0.19	0.10	0.21	0.20	0.08	0.13	0.08	0.63	0.28	0.18	0.24	0.22	0.19	0.31	0.11
N3	0.16	0.16	0.22	0.10	0.05	0.15	0.07	0.30	0.13	0.07	0.17	0.23	0.09	0.05	0.08	0.68	0.18	0.09	0.16	0.14	0.13	0.28	0.07
N6	0.10	0.12	0.11	0.15	0.12	0.26	0.17	0.42	0.20	0.16	0.18	0.12	0.07	0.19	0.12	0.47	0.34	0.24	0.31	0.23	0.25	0.32	0.16
N7	0.12	0.13	0.08	0.15	0.07	0.22	0.06	0.40	0.09	0.05	0.12	0.16	0.11	0.05	0.06	0.41	0.25	0.11	0.26	0.08	0.19	0.34	0.13
N9	0.18	0.14	0.17	0.11	0.09	0.13	0.08	0.30	0.09	0.12	0.13	0.20	0.12	0.09	0.12	0.55	0.13	0.05	0.15	0.09	0.11	0.28	0.07
O2'	0.24	0.14	0.22	0.10	0.15	0.13	0.17	0.14	0.13	0.26	0.12	0.20	0.13	0.24	0.21	0.53	0.20	0.19	0.08	0.15	0.15	0.04	0.05
O3'	0.12	0.08	0.09	0.12	0.09	0.07	0.14	0.06	0.13	0.19	0.08	0.13	0.08	0.20	0.13	0.16	0.19	0.17	0.02	0.16	0.02	0.02	0.00
O4'	0.19	0.12	0.13	0.08	0.10	0.06	0.10	0.20	0.09	0.16	0.11	0.18	0.11	0.13	0.14	0.49	0.07	0.10	0.16	0.09	0.04	0.15	0.02
O5'	0.30	0.27	0.17	0.23	0.31	0.23	0.34	0.28	0.34	0.33	0.31	0.24	0.27	0.35	0.31	0.37	0.25	0.29	0.42	0.37	0.10	0.10	0.11
OP1	0.23	0.18	0.11	0.19	0.19	0.18	0.19	0.27	0.19	0.19	0.18	0.17	0.19	0.19	0.20	0.36	0.24	0.21	0.39	0.20	0.13	0.10	0.11
OP2	0.15	0.17	0.17	0.15	0.14	0.08	0.14	0.25	0.18	0.11	0.18	0.18	0.16	0.13	0.12	0.22	0.08	0.13	0.25	0.20	0.28	0.17	0.10
P	0.18	0.16	0.06	0.14	0.16	0.11	0.17	0.26	0.19	0.15	0.17	0.15	0.16	0.17	0.16	0.30	0.14	0.15	0.33	0.21	0.16	0.14	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.03	0.03	0.01	0.02	0.04	0.04	0.02	0.06	0.06	0.06	0.00	0.00	0.02	0.25	0.00	0.08	0.04	0.29	0.22	0.05
C2	0.06	0.00	0.10	0.12	0.01	0.20	0.02	0.21	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.19	0.47	0.21	0.11	0.02	0.21	0.29	0.05
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.05	0.02	0.02	0.14	0.04	0.09	0.08	0.13	0.10	0.06	0.02	0.00	0.05	0.02	0.26	0.03	0.25	0.42	0.20
C3'	0.03	0.12	0.01	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.06	0.19	0.07	0.18	0.12	0.17	0.07	0.02	0.01	0.01	0.27	0.09	0.34	0.28	0.17
C4	0.03	0.01	0.05	0.04	0.00	0.07	0.00	0.12	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.30	0.10	0.15	0.02	0.28	0.22	0.07
C4'	0.01	0.20	0.02	0.00	0.07	0.00	0.03	0.00	0.04	0.15	0.13	0.27	0.19	0.12	0.03	0.12	0.02	0.00	0.01	0.03	0.37	0.18	0.09
C5	0.02	0.02	0.02	0.08	0.00	0.03	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.11	0.21	0.04	0.24	0.02	0.33	0.15	0.14
C5'	0.04	0.21	0.14	0.01	0.12	0.00	0.12	0.00	0.13	0.18	0.16	0.28	0.20	0.19	0.08	0.05	0.14	0.01	0.01	0.15	0.30	0.27	0.01
C6	0.04	0.02	0.04	0.06	0.02	0.04	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.09	0.27	0.08	0.25	0.01	0.32	0.16	0.14
C8	0.02	0.01	0.09	0.19	0.01	0.15	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.27	0.02	0.10	0.24	0.02	0.37	0.12	0.18
N1	0.06	0.01	0.08	0.07	0.02	0.13	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.39	0.16	0.18	0.01	0.25	0.23	0.07
N2	0.06	0.01	0.13	0.18	0.01	0.27	0.02	0.28	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.27	0.56	0.26	0.07	0.02	0.16	0.35	0.09
N3	0.06	0.01	0.10	0.12	0.01	0.19	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.19	0.46	0.21	0.08	0.02	0.20	0.30	0.05
N7	0.00	0.02	0.06	0.17	0.01	0.12	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.25	0.06	0.06	0.29	0.02	0.38	0.10	0.20
N9	0.00	0.01	0.02	0.07	0.01	0.03	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.10	0.18	0.01	0.15	0.03	0.31	0.20	0.10
O2'	0.02	0.19	0.00	0.02	0.05	0.12	0.11	0.05	0.09	0.27	0.10	0.27	0.19	0.25	0.10	0.00	0.07	0.09	0.20	0.13	0.24	0.29	0.08
O3'	0.25	0.47	0.05	0.01	0.30	0.02	0.21	0.14	0.27	0.02	0.39	0.56	0.46	0.06	0.18	0.07	0.00	0.16	0.15	0.23	0.60	0.13	0.21
O4'	0.00	0.21	0.02	0.01	0.10	0.00	0.04	0.01	0.08	0.10	0.16	0.26	0.21	0.06	0.01	0.09	0.16	0.00	0.22	0.05	0.38	0.17	0.16
O5'	0.08	0.11	0.26	0.27	0.15	0.01	0.24	0.01	0.25	0.24	0.18	0.07	0.08	0.29	0.15	0.20	0.15	0.22	0.00	0.31	0.02	0.01	0.00
O6	0.04	0.02	0.03	0.09	0.02	0.03	0.02	0.15	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.13	0.23	0.05	0.31	0.00	0.36	0.11	0.19
OP1	0.29	0.21	0.25	0.34	0.28	0.37	0.33	0.30	0.32	0.37	0.25	0.16	0.20	0.38	0.31	0.24	0.60	0.38	0.02	0.36	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.29	0.42	0.28	0.22	0.18	0.15	0.27	0.16	0.12	0.23	0.35	0.30	0.10	0.20	0.29	0.13	0.17	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.05	0.20	0.17	0.07	0.09	0.14	0.01	0.14	0.18	0.07	0.09	0.05	0.20	0.10	0.08	0.21	0.16	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00