Doublet Group distance statistics: 48127

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.022, 0.038, 0.053, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.038 std_dev=0.016
C6	A	0, 0.048, 0.070, 0.093, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.070 std_dev=0.023
C1'	A	0, 0.057, 0.084, 0.112, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.084 std_dev=0.027
C5	A	0, 0.081, 0.121, 0.160, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.121 std_dev=0.039
N3	A	0, 0.088, 0.129, 0.171, 0.150 max_d=0.150 avg_d=0.129 std_dev=0.041
N1	A	0, 0.096, 0.142, 0.188, 0.172 max_d=0.172 avg_d=0.142 std_dev=0.046
C4	A	0, 0.116, 0.172, 0.227, 0.209 max_d=0.209 avg_d=0.172 std_dev=0.055
N9	A	0, 0.117, 0.178, 0.239, 0.229 max_d=0.229 avg_d=0.178 std_dev=0.061
N6	A	0, 0.138, 0.205, 0.271, 0.244 max_d=0.244 avg_d=0.205 std_dev=0.067
N7	A	0, 0.176, 0.263, 0.350, 0.332 max_d=0.332 avg_d=0.263 std_dev=0.087
O4'	A	0, 0.124, 0.211, 0.298, 0.352 max_d=0.352 avg_d=0.211 std_dev=0.087
C8	A	0, 0.223, 0.332, 0.442, 0.418 max_d=0.418 avg_d=0.332 std_dev=0.109
O5'	A	0, 0.264, 0.400, 0.535, 0.531 max_d=0.531 avg_d=0.400 std_dev=0.135
C4'	A	0, 0.140, 0.277, 0.415, 0.465 max_d=0.465 avg_d=0.277 std_dev=0.137
C3'	A	0, 0.120, 0.267, 0.414, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.267 std_dev=0.147
C5'	A	0, 0.224, 0.406, 0.588, 0.673 max_d=0.673 avg_d=0.406 std_dev=0.182
C2'	A	0, 0.427, 0.639, 0.850, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.639 std_dev=0.212
OP2	A	0, 0.399, 0.624, 0.850, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.624 std_dev=0.225
P	A	0, 0.483, 0.804, 1.125, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.804 std_dev=0.321
P	B	0, 0.189, 0.545, 0.900, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.545 std_dev=0.355
O5'	B	0, 0.284, 0.646, 1.007, 1.355 max_d=1.355 avg_d=0.646 std_dev=0.362
O3'	A	0, 0.621, 0.987, 1.353, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.987 std_dev=0.366
OP2	B	0, 0.363, 0.759, 1.156, 1.370 max_d=1.370 avg_d=0.759 std_dev=0.396
C1'	B	0, 0.632, 1.057, 1.481, 1.541 max_d=1.541 avg_d=1.057 std_dev=0.424
C3'	B	0, 0.778, 1.234, 1.690, 1.738 max_d=1.738 avg_d=1.234 std_dev=0.456
O2'	A	0, 0.972, 1.445, 1.917, 1.799 max_d=1.799 avg_d=1.445 std_dev=0.472
C4'	B	0, 0.818, 1.301, 1.784, 1.870 max_d=1.870 avg_d=1.301 std_dev=0.483
O4'	B	0, 0.784, 1.284, 1.783, 1.976 max_d=1.976 avg_d=1.284 std_dev=0.499
N9	B	0, 0.701, 1.217, 1.734, 1.842 max_d=1.842 avg_d=1.217 std_dev=0.517
C8	B	0, 0.682, 1.200, 1.718, 1.834 max_d=1.834 avg_d=1.200 std_dev=0.518
C5'	B	0, 1.066, 1.631, 2.195, 2.249 max_d=2.249 avg_d=1.631 std_dev=0.564
N7	B	0, 0.761, 1.405, 2.050, 2.235 max_d=2.235 avg_d=1.405 std_dev=0.644
C2'	B	0, 0.947, 1.593, 2.238, 2.474 max_d=2.474 avg_d=1.593 std_dev=0.646
C4	B	0, 0.786, 1.454, 2.123, 2.264 max_d=2.264 avg_d=1.454 std_dev=0.668
OP1	B	0, 0.317, 1.004, 1.692, 1.898 max_d=1.898 avg_d=1.004 std_dev=0.688
OP1	A	0, 0.792, 1.502, 2.212, 2.076 max_d=2.076 avg_d=1.502 std_dev=0.710
C5	B	0, 0.811, 1.560, 2.310, 2.500 max_d=2.500 avg_d=1.560 std_dev=0.750
N3	B	0, 0.841, 1.590, 2.340, 2.438 max_d=2.438 avg_d=1.590 std_dev=0.750
O3'	B	0, 0.997, 1.755, 2.512, 2.548 max_d=2.548 avg_d=1.755 std_dev=0.758
C2	B	0, 0.907, 1.831, 2.755, 2.845 max_d=2.845 avg_d=1.831 std_dev=0.924
C6	B	0, 0.894, 1.838, 2.781, 2.974 max_d=2.974 avg_d=1.838 std_dev=0.944
O2'	B	0, 1.127, 2.102, 3.077, 3.335 max_d=3.335 avg_d=2.102 std_dev=0.975
N1	B	0, 0.924, 1.943, 2.963, 3.102 max_d=3.102 avg_d=1.943 std_dev=1.019
N2	B	0, 0.966, 1.997, 3.029, 3.054 max_d=3.054 avg_d=1.997 std_dev=1.031
O6	B	0, 0.961, 2.015, 3.070, 3.279 max_d=3.279 avg_d=2.015 std_dev=1.054

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.03	0.04	0.05	0.05	0.03	0.01	0.03	0.06	0.00	0.06	0.26	0.18	0.07
C2	0.05	0.00	0.06	0.08	0.02	0.08	0.03	0.08	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.03	0.03	0.13	0.16	0.08	0.13	0.33	0.13	0.12
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.07	0.06	0.07	0.07	0.06	0.05	0.09	0.08	0.04	0.01	0.02	0.02	0.06	0.17	0.19	0.04
C3'	0.02	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.06	0.04	0.07	0.08	0.07	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.24	0.11
C4	0.02	0.02	0.05	0.05	0.00	0.03	0.01	0.09	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.13	0.11	0.04	0.09	0.26	0.12	0.09
C4'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.06	0.08	0.06	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.19	0.21	0.09
C5	0.03	0.03	0.07	0.05	0.01	0.03	0.00	0.12	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.16	0.10	0.04	0.10	0.23	0.10	0.12
C5'	0.04	0.08	0.06	0.02	0.09	0.01	0.12	0.00	0.11	0.15	0.09	0.07	0.13	0.16	0.10	0.05	0.04	0.02	0.01	0.05	0.13	0.01
C6	0.04	0.02	0.07	0.06	0.02	0.04	0.02	0.11	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.17	0.12	0.06	0.12	0.28	0.10	0.15
C8	0.03	0.03	0.07	0.04	0.01	0.05	0.02	0.15	0.03	0.00	0.04	0.02	0.06	0.01	0.01	0.13	0.06	0.05	0.08	0.15	0.11	0.09
N1	0.04	0.01	0.06	0.07	0.03	0.06	0.03	0.09	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.04	0.04	0.16	0.14	0.07	0.13	0.31	0.12	0.14
N3	0.05	0.01	0.05	0.08	0.01	0.08	0.02	0.07	0.03	0.02	0.01	0.00	0.04	0.02	0.02	0.12	0.14	0.08	0.11	0.32	0.14	0.10
N6	0.05	0.03	0.09	0.07	0.03	0.06	0.03	0.13	0.01	0.06	0.03	0.04	0.00	0.06	0.05	0.18	0.12	0.08	0.15	0.30	0.12	0.19
N7	0.03	0.03	0.08	0.05	0.01	0.05	0.01	0.16	0.03	0.01	0.04	0.02	0.06	0.00	0.01	0.15	0.08	0.04	0.10	0.19	0.10	0.12
N9	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.10	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.01	0.00	0.10	0.07	0.01	0.07	0.21	0.13	0.06
O2'	0.03	0.13	0.01	0.01	0.13	0.02	0.16	0.05	0.17	0.13	0.16	0.12	0.18	0.15	0.10	0.00	0.04	0.02	0.04	0.21	0.24	0.07
O3'	0.06	0.16	0.02	0.01	0.11	0.03	0.10	0.04	0.12	0.06	0.14	0.14	0.12	0.08	0.07	0.04	0.00	0.06	0.06	0.23	0.36	0.18
O4'	0.00	0.08	0.02	0.01	0.04	0.00	0.04	0.02	0.06	0.05	0.07	0.08	0.08	0.04	0.01	0.02	0.06	0.00	0.06	0.26	0.17	0.08
O5'	0.06	0.13	0.06	0.02	0.09	0.02	0.10	0.01	0.12	0.08	0.13	0.11	0.15	0.10	0.07	0.04	0.06	0.06	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.26	0.33	0.17	0.16	0.26	0.19	0.23	0.05	0.28	0.15	0.31	0.32	0.30	0.19	0.21	0.21	0.23	0.26	0.03	0.00	0.03	0.02
OP2	0.18	0.13	0.19	0.24	0.12	0.21	0.10	0.13	0.10	0.11	0.12	0.14	0.12	0.10	0.13	0.24	0.36	0.17	0.03	0.03	0.00	0.01
P	0.07	0.12	0.04	0.11	0.09	0.09	0.12	0.01	0.15	0.09	0.14	0.10	0.19	0.12	0.06	0.07	0.18	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.25	0.21	0.07	0.13	0.19	0.14	0.31	0.13	0.27	0.19	0.38	0.19	0.22	0.19	0.50	0.09	0.24	0.31	0.12	0.53	0.35	0.38
C2	0.19	0.25	0.16	0.09	0.15	0.09	0.15	0.18	0.13	0.26	0.18	0.38	0.21	0.23	0.19	0.44	0.18	0.18	0.17	0.12	0.34	0.36	0.27
C2'	0.20	0.23	0.20	0.12	0.09	0.22	0.10	0.34	0.10	0.24	0.18	0.36	0.16	0.18	0.17	0.49	0.22	0.25	0.32	0.10	0.47	0.30	0.35
C3'	0.19	0.27	0.23	0.18	0.08	0.28	0.08	0.38	0.15	0.21	0.23	0.41	0.18	0.13	0.15	0.52	0.32	0.26	0.39	0.14	0.56	0.33	0.41
C4	0.18	0.24	0.14	0.08	0.14	0.09	0.15	0.21	0.12	0.26	0.17	0.36	0.20	0.23	0.18	0.41	0.16	0.18	0.20	0.13	0.39	0.36	0.30
C4'	0.19	0.28	0.24	0.17	0.10	0.28	0.10	0.39	0.14	0.23	0.23	0.42	0.20	0.16	0.16	0.52	0.22	0.27	0.42	0.13	0.65	0.41	0.48
C5	0.18	0.21	0.12	0.12	0.15	0.09	0.17	0.18	0.14	0.27	0.14	0.32	0.19	0.26	0.18	0.35	0.20	0.17	0.16	0.16	0.30	0.36	0.26
C5'	0.20	0.28	0.24	0.16	0.14	0.30	0.13	0.42	0.16	0.23	0.23	0.41	0.23	0.18	0.17	0.54	0.25	0.26	0.47	0.15	0.69	0.45	0.53
C6	0.19	0.21	0.14	0.14	0.16	0.11	0.18	0.16	0.15	0.28	0.14	0.33	0.20	0.27	0.19	0.35	0.23	0.18	0.15	0.18	0.25	0.35	0.23
C8	0.17	0.22	0.10	0.11	0.14	0.09	0.16	0.22	0.14	0.26	0.15	0.33	0.20	0.24	0.18	0.33	0.18	0.17	0.21	0.15	0.38	0.35	0.31
N1	0.19	0.22	0.15	0.12	0.15	0.09	0.16	0.17	0.13	0.27	0.15	0.34	0.20	0.26	0.19	0.39	0.22	0.18	0.15	0.15	0.28	0.36	0.24
N3	0.20	0.26	0.17	0.07	0.15	0.11	0.14	0.21	0.13	0.26	0.20	0.39	0.22	0.22	0.19	0.46	0.15	0.19	0.20	0.12	0.40	0.35	0.30
N6	0.23	0.21	0.19	0.20	0.20	0.17	0.24	0.18	0.21	0.31	0.17	0.31	0.22	0.32	0.23	0.33	0.28	0.22	0.18	0.25	0.22	0.35	0.22
N7	0.17	0.20	0.11	0.13	0.15	0.09	0.18	0.18	0.15	0.27	0.14	0.30	0.19	0.27	0.18	0.29	0.21	0.17	0.16	0.19	0.28	0.35	0.26
N9	0.18	0.24	0.14	0.07	0.13	0.12	0.14	0.25	0.12	0.26	0.17	0.37	0.20	0.22	0.18	0.41	0.13	0.19	0.25	0.12	0.45	0.35	0.34
O2'	0.18	0.24	0.20	0.13	0.07	0.21	0.07	0.33	0.11	0.21	0.20	0.37	0.15	0.15	0.15	0.49	0.23	0.23	0.30	0.11	0.41	0.25	0.31
O3'	0.21	0.33	0.26	0.24	0.14	0.31	0.15	0.40	0.23	0.21	0.31	0.47	0.23	0.15	0.17	0.54	0.37	0.28	0.41	0.23	0.61	0.36	0.44
O4'	0.24	0.26	0.25	0.08	0.17	0.24	0.19	0.34	0.17	0.32	0.21	0.40	0.22	0.27	0.24	0.51	0.06	0.29	0.35	0.17	0.60	0.39	0.42
O5'	0.21	0.28	0.22	0.11	0.16	0.26	0.17	0.33	0.17	0.29	0.22	0.39	0.24	0.25	0.20	0.43	0.03	0.27	0.39	0.17	0.63	0.38	0.43
OP1	0.31	0.49	0.30	0.41	0.38	0.26	0.35	0.35	0.40	0.25	0.44	0.54	0.46	0.27	0.31	0.15	0.02	0.24	0.43	0.39	0.57	0.47	0.46
OP2	0.39	0.42	0.51	0.17	0.38	0.26	0.40	0.21	0.41	0.44	0.41	0.48	0.39	0.43	0.40	0.79	0.04	0.34	0.19	0.42	0.51	0.20	0.27
P	0.08	0.38	0.12	0.08	0.21	0.08	0.18	0.12	0.25	0.13	0.32	0.49	0.34	0.12	0.10	0.32	0.01	0.06	0.21	0.23	0.46	0.22	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.06	0.04	0.02	0.04	0.04	0.05	0.02	0.04	0.07	0.05	0.03	0.01	0.01	0.34	0.01	0.08	0.08	0.14	0.12	0.06
C2	0.05	0.00	0.11	0.16	0.01	0.12	0.02	0.06	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.17	0.66	0.11	0.09	0.04	0.13	0.20	0.05
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.07	0.04	0.06	0.15	0.07	0.05	0.09	0.14	0.10	0.04	0.02	0.01	0.08	0.03	0.22	0.09	0.27	0.19	0.20
C3'	0.06	0.16	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.20	0.09	0.24	0.17	0.18	0.06	0.02	0.02	0.02	0.13	0.11	0.23	0.08	0.14
C4	0.04	0.01	0.07	0.07	0.00	0.03	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.13	0.45	0.05	0.08	0.04	0.11	0.23	0.09
C4'	0.02	0.12	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.04	0.17	0.06	0.17	0.12	0.15	0.05	0.07	0.05	0.01	0.02	0.08	0.11	0.11	0.06
C5	0.04	0.02	0.06	0.09	0.01	0.06	0.00	0.17	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.19	0.34	0.04	0.16	0.04	0.19	0.35	0.21
C5'	0.04	0.06	0.15	0.01	0.08	0.01	0.17	0.00	0.16	0.24	0.11	0.09	0.06	0.27	0.10	0.10	0.08	0.02	0.01	0.21	0.09	0.09	0.02
C6	0.05	0.03	0.07	0.08	0.02	0.04	0.01	0.16	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.04	0.21	0.42	0.06	0.15	0.01	0.18	0.37	0.20
C8	0.02	0.01	0.05	0.20	0.01	0.17	0.02	0.24	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.21	0.09	0.09	0.24	0.08	0.27	0.36	0.27
N1	0.04	0.01	0.09	0.09	0.02	0.06	0.02	0.11	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.17	0.55	0.08	0.09	0.03	0.11	0.29	0.11
N2	0.07	0.01	0.14	0.24	0.02	0.17	0.02	0.09	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.21	0.77	0.14	0.15	0.05	0.21	0.18	0.13
N3	0.05	0.01	0.10	0.17	0.01	0.12	0.02	0.06	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.16	0.64	0.11	0.10	0.04	0.15	0.17	0.07
N7	0.03	0.02	0.04	0.18	0.01	0.15	0.01	0.27	0.04	0.01	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.22	0.15	0.07	0.27	0.08	0.31	0.44	0.32
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.05	0.03	0.10	0.04	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.11	0.28	0.02	0.10	0.07	0.13	0.22	0.11
O2'	0.01	0.17	0.01	0.02	0.13	0.07	0.19	0.10	0.21	0.21	0.17	0.21	0.16	0.22	0.11	0.00	0.04	0.06	0.18	0.24	0.26	0.16	0.16
O3'	0.34	0.66	0.08	0.02	0.45	0.05	0.34	0.08	0.42	0.09	0.55	0.77	0.64	0.15	0.28	0.04	0.00	0.23	0.18	0.37	0.27	0.12	0.12
O4'	0.01	0.11	0.03	0.02	0.05	0.01	0.04	0.02	0.06	0.09	0.08	0.14	0.11	0.07	0.02	0.06	0.23	0.00	0.07	0.07	0.10	0.19	0.09
O5'	0.08	0.09	0.22	0.13	0.08	0.02	0.16	0.01	0.15	0.24	0.09	0.15	0.10	0.27	0.10	0.18	0.18	0.07	0.00	0.21	0.02	0.02	0.01
O6	0.08	0.04	0.09	0.11	0.04	0.08	0.04	0.21	0.01	0.08	0.03	0.05	0.04	0.08	0.07	0.24	0.37	0.07	0.21	0.00	0.26	0.46	0.28
OP1	0.14	0.13	0.27	0.23	0.11	0.11	0.19	0.09	0.18	0.27	0.11	0.21	0.15	0.31	0.13	0.26	0.27	0.10	0.02	0.26	0.00	0.02	0.01
OP2	0.12	0.20	0.19	0.08	0.23	0.11	0.35	0.09	0.37	0.36	0.29	0.18	0.17	0.44	0.22	0.16	0.12	0.19	0.02	0.46	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.05	0.20	0.14	0.09	0.06	0.21	0.02	0.20	0.27	0.11	0.13	0.07	0.32	0.11	0.16	0.12	0.09	0.01	0.28	0.01	0.01	0.00