Doublet Group distance statistics: 48129

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 2, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.001, 0.005, 0.009, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.005 std_dev=0.004
C8	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.012 std_dev=0.006
N9	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.005, 0.012, 0.018, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N7	A	0, 0.006, 0.013, 0.019, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.005, 0.013, 0.020, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.008, 0.019, 0.029, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.001, 0.012, 0.023, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.012 std_dev=0.011
N6	A	0, 0.010, 0.026, 0.042, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.026 std_dev=0.016
C2'	A	0, 0.040, 0.116, 0.191, 0.206 max_d=0.206 avg_d=0.116 std_dev=0.076
O2'	A	0, -0.002, 0.076, 0.154, 0.278 max_d=0.278 avg_d=0.076 std_dev=0.078
O4'	A	0, 0.047, 0.130, 0.213, 0.233 max_d=0.233 avg_d=0.130 std_dev=0.083
C3'	A	0, 0.093, 0.251, 0.408, 0.425 max_d=0.425 avg_d=0.251 std_dev=0.157
C4'	A	0, 0.140, 0.318, 0.495, 0.496 max_d=0.496 avg_d=0.318 std_dev=0.177
O3'	A	0, 0.117, 0.345, 0.572, 0.613 max_d=0.613 avg_d=0.345 std_dev=0.228
C5'	A	0, 0.232, 0.519, 0.806, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.519 std_dev=0.287
C8	B	0, 0.178, 0.493, 0.807, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.493 std_dev=0.315
O5'	A	0, 0.273, 0.612, 0.950, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.612 std_dev=0.339
P	B	0, 0.275, 0.619, 0.963, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.619 std_dev=0.344
N7	B	0, 0.226, 0.579, 0.932, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.579 std_dev=0.353
N9	B	0, 0.150, 0.509, 0.867, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.509 std_dev=0.358
O4'	B	0, 0.233, 0.595, 0.958, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.595 std_dev=0.362
OP2	B	0, 0.114, 0.511, 0.909, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.511 std_dev=0.397
C5'	B	0, 0.367, 0.788, 1.209, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.788 std_dev=0.421
OP1	A	0, 0.318, 0.750, 1.182, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.750 std_dev=0.432
O5'	B	0, 0.361, 0.793, 1.226, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.793 std_dev=0.432
OP1	B	0, 0.387, 0.827, 1.268, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.827 std_dev=0.441
C5	B	0, 0.244, 0.686, 1.127, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.686 std_dev=0.442
C4'	B	0, 0.313, 0.756, 1.199, 1.263 max_d=1.263 avg_d=0.756 std_dev=0.443
C4	B	0, 0.207, 0.659, 1.110, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.659 std_dev=0.451
C1'	B	0, 0.202, 0.659, 1.115, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.659 std_dev=0.456
P	A	0, 0.319, 0.775, 1.232, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.775 std_dev=0.457
C3'	B	0, 0.355, 0.873, 1.392, 1.441 max_d=1.441 avg_d=0.873 std_dev=0.518
C2'	B	0, 0.311, 0.848, 1.385, 1.502 max_d=1.502 avg_d=0.848 std_dev=0.537
OP2	A	0, 0.414, 0.995, 1.575, 1.538 max_d=1.538 avg_d=0.995 std_dev=0.581
O3'	B	0, 0.430, 1.024, 1.619, 1.635 max_d=1.635 avg_d=1.024 std_dev=0.595
N3	B	0, 0.295, 0.891, 1.487, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.891 std_dev=0.596
C6	B	0, 0.347, 0.956, 1.565, 1.500 max_d=1.500 avg_d=0.956 std_dev=0.609
O2'	B	0, 0.389, 1.023, 1.658, 1.794 max_d=1.794 avg_d=1.023 std_dev=0.635
O6	B	0, 0.419, 1.103, 1.787, 1.699 max_d=1.699 avg_d=1.103 std_dev=0.684
C2	B	0, 0.385, 1.111, 1.836, 1.823 max_d=1.823 avg_d=1.111 std_dev=0.726
N1	B	0, 0.400, 1.135, 1.870, 1.818 max_d=1.818 avg_d=1.135 std_dev=0.735
N2	B	0, 0.498, 1.391, 2.284, 2.233 max_d=2.233 avg_d=1.391 std_dev=0.893

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.16	0.08	0.06
C2	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.10	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.08	0.05	0.18	0.12	0.11	0.12
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.03	0.07	0.07	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.04	0.03
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.06	0.05	0.07	0.07	0.06	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.12	0.03	0.02
C4	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.05	0.02	0.10	0.13	0.07	0.04
C4'	0.00	0.10	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.09	0.10	0.07	0.04	0.03	0.06	0.02	0.00	0.01	0.09	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.02	0.09	0.13	0.08	0.04
C5'	0.01	0.17	0.01	0.01	0.11	0.00	0.11	0.00	0.13	0.05	0.16	0.15	0.13	0.08	0.05	0.06	0.02	0.01	0.00	0.07	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.07	0.02	0.12	0.11	0.08	0.06
C8	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.06	0.02	0.04	0.17	0.13	0.07
N1	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.03	0.16	0.11	0.09	0.10
N3	0.02	0.00	0.07	0.07	0.00	0.10	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.07	0.05	0.15	0.11	0.09	0.09
N6	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.08	0.02	0.12	0.11	0.08	0.06
N7	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.07	0.02	0.06	0.15	0.12	0.06
N9	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.04	0.15	0.09	0.05
O2'	0.00	0.06	0.00	0.02	0.04	0.06	0.05	0.06	0.06	0.02	0.07	0.05	0.06	0.03	0.02	0.00	0.02	0.05	0.08	0.13	0.09	0.08
O3'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.07	0.06	0.08	0.07	0.08	0.07	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.08	0.07	0.04
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.16	0.08	0.06
O5'	0.03	0.18	0.02	0.01	0.10	0.01	0.09	0.00	0.12	0.04	0.16	0.15	0.12	0.06	0.04	0.08	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.16	0.12	0.13	0.12	0.13	0.09	0.13	0.07	0.11	0.17	0.11	0.11	0.11	0.15	0.15	0.13	0.08	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.11	0.04	0.03	0.07	0.02	0.08	0.02	0.08	0.13	0.09	0.09	0.08	0.12	0.09	0.09	0.07	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.12	0.03	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.06	0.07	0.10	0.09	0.06	0.06	0.05	0.08	0.04	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.29	0.07	0.14	0.17	0.11	0.24	0.22	0.34	0.05	0.35	0.31	0.20	0.16	0.06	0.08	0.18	0.14	0.08	0.40	0.41	0.31	0.23
C2	0.11	0.44	0.12	0.17	0.26	0.14	0.25	0.26	0.38	0.10	0.47	0.50	0.35	0.09	0.13	0.12	0.17	0.11	0.12	0.39	0.35	0.40	0.27
C2'	0.05	0.33	0.08	0.15	0.21	0.10	0.28	0.20	0.39	0.08	0.39	0.35	0.24	0.21	0.09	0.08	0.19	0.14	0.10	0.47	0.41	0.32	0.23
C3'	0.06	0.33	0.07	0.13	0.18	0.11	0.24	0.20	0.37	0.05	0.39	0.36	0.23	0.14	0.06	0.07	0.16	0.16	0.10	0.44	0.42	0.34	0.25
C4	0.07	0.32	0.07	0.14	0.19	0.12	0.21	0.25	0.31	0.07	0.35	0.35	0.25	0.09	0.08	0.07	0.15	0.11	0.10	0.34	0.36	0.39	0.26
C4'	0.09	0.30	0.08	0.14	0.16	0.11	0.21	0.21	0.33	0.07	0.36	0.35	0.21	0.11	0.07	0.09	0.17	0.16	0.08	0.39	0.41	0.30	0.22
C5	0.07	0.26	0.07	0.12	0.14	0.12	0.14	0.25	0.21	0.11	0.26	0.29	0.20	0.06	0.07	0.08	0.13	0.11	0.12	0.21	0.33	0.41	0.26
C5'	0.14	0.30	0.13	0.15	0.15	0.14	0.17	0.21	0.29	0.14	0.34	0.35	0.21	0.10	0.11	0.14	0.17	0.20	0.08	0.33	0.41	0.32	0.24
C6	0.10	0.31	0.10	0.14	0.18	0.14	0.12	0.26	0.19	0.14	0.29	0.36	0.26	0.12	0.10	0.11	0.14	0.12	0.15	0.14	0.30	0.41	0.27
C8	0.11	0.17	0.09	0.13	0.08	0.12	0.13	0.22	0.20	0.08	0.20	0.18	0.11	0.09	0.05	0.10	0.15	0.16	0.08	0.23	0.36	0.38	0.25
N1	0.13	0.42	0.13	0.17	0.24	0.15	0.19	0.27	0.30	0.12	0.41	0.48	0.34	0.10	0.13	0.13	0.17	0.12	0.15	0.25	0.32	0.41	0.27
N3	0.08	0.41	0.10	0.16	0.24	0.12	0.26	0.25	0.39	0.08	0.44	0.45	0.31	0.11	0.12	0.09	0.17	0.10	0.10	0.42	0.37	0.38	0.26
N6	0.13	0.23	0.12	0.13	0.12	0.16	0.07	0.26	0.05	0.18	0.15	0.29	0.23	0.22	0.10	0.13	0.13	0.15	0.18	0.09	0.27	0.41	0.27
N7	0.10	0.15	0.09	0.11	0.07	0.11	0.09	0.23	0.14	0.14	0.16	0.17	0.10	0.09	0.07	0.10	0.12	0.13	0.11	0.16	0.32	0.40	0.26
N9	0.07	0.26	0.07	0.13	0.15	0.11	0.20	0.23	0.29	0.05	0.30	0.28	0.19	0.11	0.05	0.08	0.16	0.14	0.08	0.33	0.38	0.36	0.24
O2'	0.07	0.35	0.14	0.21	0.25	0.13	0.33	0.22	0.43	0.16	0.42	0.37	0.27	0.28	0.15	0.13	0.26	0.12	0.09	0.50	0.38	0.20	0.17
O3'	0.06	0.32	0.06	0.12	0.17	0.11	0.23	0.19	0.36	0.03	0.39	0.36	0.22	0.13	0.04	0.06	0.16	0.17	0.13	0.45	0.42	0.33	0.25
O4'	0.08	0.30	0.08	0.14	0.17	0.12	0.21	0.23	0.33	0.06	0.36	0.34	0.22	0.12	0.07	0.09	0.17	0.15	0.08	0.38	0.41	0.29	0.22
O5'	0.13	0.28	0.11	0.13	0.13	0.12	0.14	0.21	0.26	0.12	0.31	0.34	0.19	0.07	0.09	0.13	0.15	0.18	0.06	0.30	0.40	0.29	0.21
OP1	0.09	0.42	0.10	0.19	0.23	0.19	0.22	0.35	0.33	0.05	0.42	0.50	0.33	0.08	0.11	0.08	0.20	0.09	0.19	0.34	0.35	0.35	0.23
OP2	0.04	0.38	0.05	0.15	0.20	0.13	0.20	0.29	0.31	0.03	0.39	0.45	0.28	0.06	0.07	0.03	0.17	0.03	0.13	0.33	0.37	0.29	0.20
P	0.05	0.35	0.05	0.13	0.17	0.12	0.17	0.26	0.29	0.06	0.37	0.43	0.26	0.05	0.06	0.06	0.15	0.09	0.10	0.32	0.37	0.30	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.09	0.01	0.21	0.37	0.27
C2	0.03	0.00	0.16	0.11	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.23	0.18	0.04	0.11	0.01	0.22	0.40	0.27
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.09	0.01	0.05	0.02	0.09	0.06	0.13	0.18	0.16	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.08	0.08	0.24	0.15
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.06	0.19	0.08	0.15	0.11	0.16	0.08	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.05	0.15	0.06
C4	0.01	0.01	0.09	0.05	0.00	0.05	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.12	0.05	0.02	0.13	0.01	0.23	0.40	0.27
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.08	0.17	0.05	0.07	0.05	0.16	0.08	0.04	0.02	0.00	0.01	0.10	0.08	0.16	0.12
C5	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.09	0.00	0.25	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.06	0.02	0.18	0.01	0.26	0.41	0.28
C5'	0.04	0.12	0.02	0.01	0.17	0.01	0.25	0.00	0.25	0.32	0.19	0.09	0.10	0.33	0.18	0.04	0.03	0.01	0.01	0.28	0.02	0.06	0.01
C6	0.01	0.00	0.09	0.06	0.01	0.08	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.06	0.02	0.19	0.00	0.27	0.42	0.29
C8	0.01	0.01	0.06	0.19	0.01	0.17	0.01	0.32	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.19	0.03	0.21	0.02	0.25	0.40	0.28
N1	0.02	0.00	0.13	0.08	0.01	0.05	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.12	0.03	0.14	0.01	0.24	0.41	0.28
N2	0.05	0.01	0.18	0.15	0.01	0.07	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.27	0.24	0.05	0.11	0.02	0.21	0.39	0.27
N3	0.03	0.00	0.16	0.11	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.16	0.04	0.10	0.01	0.22	0.39	0.27
N7	0.01	0.01	0.03	0.16	0.01	0.16	0.00	0.33	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.16	0.03	0.24	0.02	0.28	0.41	0.29
N9	0.00	0.01	0.01	0.08	0.00	0.08	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.12	0.02	0.22	0.39	0.27
O2'	0.00	0.23	0.00	0.01	0.12	0.04	0.09	0.04	0.13	0.03	0.19	0.27	0.21	0.02	0.03	0.00	0.02	0.07	0.08	0.12	0.12	0.18	0.11
O3'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.05	0.02	0.06	0.03	0.06	0.19	0.12	0.24	0.16	0.16	0.06	0.02	0.00	0.02	0.12	0.07	0.18	0.14	0.08
O4'	0.00	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.01	0.07	0.02	0.00	0.12	0.03	0.22	0.39	0.29
O5'	0.09	0.11	0.02	0.04	0.13	0.01	0.18	0.01	0.19	0.21	0.14	0.11	0.10	0.24	0.12	0.08	0.12	0.12	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.08	0.08	0.01	0.10	0.01	0.28	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.12	0.07	0.03	0.22	0.00	0.29	0.43	0.30
OP1	0.21	0.22	0.08	0.05	0.23	0.08	0.26	0.02	0.27	0.25	0.24	0.21	0.22	0.28	0.22	0.12	0.18	0.22	0.01	0.29	0.00	0.01	0.01
OP2	0.37	0.40	0.24	0.15	0.40	0.16	0.41	0.06	0.42	0.40	0.41	0.39	0.39	0.41	0.39	0.18	0.14	0.39	0.01	0.43	0.01	0.00	0.00
P	0.27	0.27	0.15	0.06	0.27	0.12	0.28	0.01	0.29	0.28	0.28	0.27	0.27	0.29	0.27	0.11	0.08	0.29	0.01	0.30	0.01	0.00	0.00