Doublet Group distance statistics: 48130

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.015, 0.025, 0.035, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.025 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.023, 0.038, 0.053, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.038 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.016, 0.032, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.032 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.026, 0.043, 0.060, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.043 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.028, 0.050, 0.072, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.050 std_dev=0.022
N3	A	0, 0.034, 0.057, 0.080, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.057 std_dev=0.023
C4	A	0, 0.038, 0.063, 0.088, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.063 std_dev=0.025
N6	A	0, 0.037, 0.064, 0.091, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.064 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.044, 0.073, 0.101, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.073 std_dev=0.029
N7	A	0, 0.042, 0.070, 0.099, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.070 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.062, 0.102, 0.141, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.102 std_dev=0.039
C2'	A	0, -0.022, 0.170, 0.362, 0.654 max_d=0.654 avg_d=0.170 std_dev=0.192
O4'	A	0, 0.102, 0.320, 0.539, 0.817 max_d=0.817 avg_d=0.320 std_dev=0.219
C3'	A	0, 0.018, 0.238, 0.458, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.238 std_dev=0.220
OP1	A	0, 0.377, 0.660, 0.942, 0.934 max_d=0.934 avg_d=0.660 std_dev=0.282
O2'	A	0, 0.075, 0.377, 0.679, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.377 std_dev=0.302
C4'	A	0, 0.458, 0.785, 1.112, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.785 std_dev=0.327
P	A	0, 0.603, 1.024, 1.445, 1.380 max_d=1.380 avg_d=1.024 std_dev=0.421
OP2	B	0, 0.342, 0.779, 1.217, 1.195 max_d=1.195 avg_d=0.779 std_dev=0.437
O3'	A	0, 0.698, 1.173, 1.649, 1.444 max_d=1.444 avg_d=1.173 std_dev=0.475
P	B	0, 0.387, 0.868, 1.349, 1.398 max_d=1.398 avg_d=0.868 std_dev=0.481
O5'	A	0, 0.747, 1.254, 1.761, 1.648 max_d=1.648 avg_d=1.254 std_dev=0.507
OP1	B	0, 0.475, 1.025, 1.576, 1.798 max_d=1.798 avg_d=1.025 std_dev=0.551
OP2	A	0, 0.897, 1.498, 2.099, 1.953 max_d=1.953 avg_d=1.498 std_dev=0.601
C5'	B	0, 0.664, 1.284, 1.905, 1.885 max_d=1.885 avg_d=1.284 std_dev=0.621
O5'	B	0, 0.831, 1.500, 2.168, 2.122 max_d=2.122 avg_d=1.500 std_dev=0.669
C5'	A	0, 1.073, 1.772, 2.470, 2.397 max_d=2.397 avg_d=1.772 std_dev=0.698
O3'	B	0, 1.020, 1.788, 2.557, 2.423 max_d=2.423 avg_d=1.788 std_dev=0.768
C4'	B	0, 0.736, 1.534, 2.332, 2.139 max_d=2.139 avg_d=1.534 std_dev=0.798
O4'	B	0, 0.827, 1.630, 2.432, 2.328 max_d=2.328 avg_d=1.630 std_dev=0.802
C3'	B	0, 1.012, 2.005, 2.997, 2.794 max_d=2.794 avg_d=2.005 std_dev=0.993
C8	B	0, 0.784, 1.800, 2.816, 2.661 max_d=2.661 avg_d=1.800 std_dev=1.016
N9	B	0, 0.879, 1.971, 3.063, 2.927 max_d=2.927 avg_d=1.971 std_dev=1.092
C1'	B	0, 0.963, 2.057, 3.151, 2.994 max_d=2.994 avg_d=2.057 std_dev=1.094
N7	B	0, 0.798, 1.903, 3.009, 2.864 max_d=2.864 avg_d=1.903 std_dev=1.106
C4	B	0, 0.962, 2.171, 3.380, 3.274 max_d=3.274 avg_d=2.171 std_dev=1.209
C5	B	0, 0.924, 2.144, 3.364, 3.250 max_d=3.250 avg_d=2.144 std_dev=1.220
C2'	B	0, 1.047, 2.283, 3.520, 3.229 max_d=3.229 avg_d=2.283 std_dev=1.237
N3	B	0, 1.083, 2.371, 3.659, 3.589 max_d=3.589 avg_d=2.371 std_dev=1.288
C6	B	0, 1.061, 2.391, 3.722, 3.630 max_d=3.630 avg_d=2.391 std_dev=1.330
C2	B	0, 1.173, 2.549, 3.926, 3.898 max_d=3.898 avg_d=2.549 std_dev=1.376
O6	B	0, 1.114, 2.495, 3.876, 3.775 max_d=3.775 avg_d=2.495 std_dev=1.381
N1	B	0, 1.170, 2.570, 3.970, 3.926 max_d=3.926 avg_d=2.570 std_dev=1.400
N2	B	0, 1.295, 2.754, 4.212, 4.232 max_d=4.232 avg_d=2.754 std_dev=1.458
O2'	B	0, 1.246, 2.765, 4.284, 3.958 max_d=3.958 avg_d=2.765 std_dev=1.519

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.19	0.00	0.07	0.08	0.24	0.10
C2	0.03	0.00	0.04	0.11	0.02	0.16	0.02	0.26	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.08	0.27	0.16	0.21	0.14	0.27	0.17
C2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.13	0.04	0.02	0.04	0.04	0.05	0.03	0.01	0.00	0.05	0.01	0.20	0.21	0.38	0.25
C3'	0.02	0.11	0.01	0.00	0.05	0.00	0.03	0.02	0.05	0.05	0.08	0.10	0.05	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.15	0.28	0.18
C4	0.02	0.02	0.02	0.05	0.00	0.07	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.21	0.08	0.12	0.12	0.27	0.15
C4'	0.01	0.16	0.02	0.00	0.07	0.00	0.05	0.01	0.09	0.07	0.13	0.15	0.08	0.05	0.01	0.04	0.03	0.01	0.02	0.03	0.18	0.04
C5	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.05	0.00	0.17	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.19	0.04	0.13	0.15	0.27	0.17
C5'	0.06	0.26	0.13	0.02	0.17	0.01	0.17	0.00	0.21	0.12	0.24	0.23	0.21	0.14	0.11	0.09	0.08	0.01	0.00	0.04	0.17	0.01
C6	0.03	0.01	0.04	0.05	0.01	0.09	0.01	0.21	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.22	0.08	0.17	0.17	0.27	0.19
C8	0.02	0.03	0.02	0.05	0.01	0.07	0.02	0.12	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.01	0.12	0.11	0.06	0.13	0.13	0.25	0.16
N1	0.03	0.01	0.04	0.08	0.01	0.13	0.01	0.24	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.06	0.25	0.12	0.20	0.16	0.27	0.19
N3	0.03	0.00	0.04	0.10	0.01	0.15	0.01	0.23	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.08	0.27	0.16	0.17	0.12	0.27	0.15
N6	0.04	0.01	0.05	0.05	0.02	0.08	0.02	0.21	0.00	0.04	0.02	0.01	0.00	0.05	0.04	0.07	0.21	0.07	0.19	0.20	0.29	0.22
N7	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.05	0.01	0.14	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.00	0.02	0.09	0.13	0.04	0.13	0.15	0.26	0.18
N9	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.00	0.04	0.17	0.01	0.09	0.10	0.25	0.13
O2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.04	0.05	0.09	0.04	0.12	0.06	0.08	0.07	0.09	0.04	0.00	0.02	0.02	0.20	0.19	0.42	0.24
O3'	0.19	0.27	0.05	0.01	0.21	0.03	0.19	0.08	0.22	0.11	0.25	0.27	0.21	0.13	0.17	0.02	0.00	0.16	0.21	0.24	0.28	0.21
O4'	0.00	0.16	0.01	0.01	0.08	0.01	0.04	0.01	0.08	0.06	0.12	0.16	0.07	0.04	0.01	0.02	0.16	0.00	0.04	0.07	0.21	0.10
O5'	0.07	0.21	0.20	0.17	0.12	0.02	0.13	0.00	0.17	0.13	0.20	0.17	0.19	0.13	0.09	0.20	0.21	0.04	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.08	0.14	0.21	0.15	0.12	0.03	0.15	0.04	0.17	0.13	0.16	0.12	0.20	0.15	0.10	0.19	0.24	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.27	0.38	0.28	0.27	0.18	0.27	0.17	0.27	0.25	0.27	0.27	0.29	0.26	0.25	0.42	0.28	0.21	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.17	0.25	0.18	0.15	0.04	0.17	0.01	0.19	0.16	0.19	0.15	0.22	0.18	0.13	0.24	0.21	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.15	0.34	0.32	0.15	0.27	0.12	0.23	0.12	0.12	0.13	0.16	0.16	0.11	0.15	0.32	0.29	0.17	0.12	0.12	0.09	0.05	0.03
C2	0.13	0.12	0.17	0.21	0.11	0.17	0.11	0.13	0.11	0.12	0.10	0.13	0.12	0.12	0.11	0.14	0.24	0.13	0.11	0.13	0.20	0.13	0.13
C2'	0.23	0.22	0.35	0.28	0.22	0.26	0.21	0.24	0.22	0.20	0.23	0.22	0.22	0.20	0.21	0.35	0.22	0.21	0.17	0.23	0.08	0.11	0.12
C3'	0.19	0.15	0.29	0.24	0.16	0.22	0.17	0.21	0.17	0.18	0.16	0.15	0.15	0.19	0.17	0.31	0.20	0.21	0.16	0.19	0.16	0.18	0.15
C4	0.11	0.10	0.20	0.22	0.08	0.17	0.07	0.13	0.06	0.08	0.07	0.11	0.11	0.08	0.08	0.14	0.22	0.12	0.09	0.07	0.21	0.12	0.13
C4'	0.17	0.17	0.23	0.19	0.18	0.18	0.21	0.16	0.22	0.21	0.19	0.15	0.16	0.24	0.18	0.22	0.17	0.20	0.13	0.25	0.18	0.24	0.17
C5	0.14	0.11	0.15	0.17	0.10	0.15	0.09	0.14	0.08	0.11	0.09	0.13	0.12	0.10	0.11	0.14	0.20	0.14	0.15	0.08	0.28	0.18	0.20
C5'	0.25	0.26	0.28	0.23	0.27	0.23	0.30	0.23	0.31	0.30	0.28	0.24	0.25	0.33	0.27	0.27	0.20	0.26	0.20	0.34	0.25	0.32	0.24
C6	0.19	0.14	0.16	0.19	0.14	0.17	0.13	0.16	0.12	0.15	0.12	0.15	0.15	0.14	0.15	0.23	0.23	0.17	0.18	0.12	0.29	0.19	0.21
C8	0.12	0.14	0.20	0.19	0.11	0.17	0.09	0.13	0.10	0.07	0.12	0.15	0.14	0.07	0.10	0.15	0.19	0.13	0.09	0.09	0.28	0.15	0.16
N1	0.18	0.14	0.16	0.20	0.14	0.17	0.14	0.15	0.14	0.15	0.13	0.16	0.15	0.15	0.15	0.20	0.24	0.16	0.15	0.15	0.25	0.17	0.18
N3	0.11	0.09	0.21	0.24	0.08	0.18	0.08	0.14	0.08	0.08	0.07	0.11	0.10	0.09	0.08	0.15	0.25	0.12	0.08	0.09	0.17	0.10	0.09
N6	0.24	0.16	0.21	0.21	0.17	0.21	0.15	0.20	0.14	0.18	0.14	0.17	0.18	0.16	0.19	0.33	0.26	0.20	0.21	0.13	0.31	0.21	0.24
N7	0.13	0.12	0.14	0.15	0.10	0.14	0.09	0.14	0.09	0.10	0.10	0.13	0.12	0.09	0.10	0.13	0.17	0.13	0.17	0.08	0.33	0.21	0.24
N9	0.13	0.12	0.25	0.25	0.11	0.21	0.08	0.16	0.08	0.07	0.10	0.14	0.13	0.07	0.10	0.20	0.23	0.13	0.08	0.07	0.19	0.09	0.09
O2'	0.56	0.55	0.70	0.60	0.56	0.56	0.56	0.54	0.57	0.56	0.56	0.54	0.54	0.56	0.55	0.71	0.49	0.49	0.51	0.57	0.42	0.44	0.48
O3'	0.30	0.22	0.45	0.43	0.22	0.38	0.21	0.34	0.20	0.21	0.20	0.22	0.23	0.21	0.23	0.50	0.40	0.27	0.24	0.22	0.17	0.17	0.18
O4'	0.13	0.14	0.20	0.19	0.14	0.16	0.19	0.13	0.20	0.18	0.17	0.12	0.12	0.22	0.14	0.17	0.19	0.17	0.08	0.23	0.18	0.22	0.16
O5'	0.19	0.18	0.30	0.26	0.18	0.24	0.18	0.25	0.19	0.18	0.18	0.18	0.18	0.19	0.17	0.31	0.24	0.21	0.19	0.20	0.22	0.17	0.17
OP1	0.15	0.13	0.31	0.28	0.13	0.25	0.14	0.27	0.15	0.14	0.14	0.13	0.13	0.16	0.13	0.35	0.27	0.16	0.20	0.18	0.19	0.14	0.17
OP2	0.19	0.13	0.35	0.33	0.14	0.30	0.12	0.35	0.12	0.14	0.11	0.14	0.14	0.13	0.15	0.37	0.33	0.18	0.28	0.13	0.24	0.18	0.25
P	0.12	0.08	0.30	0.27	0.08	0.24	0.07	0.28	0.08	0.08	0.07	0.10	0.09	0.09	0.08	0.32	0.26	0.13	0.19	0.11	0.16	0.08	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.04	0.08	0.05	0.02	0.01	0.03	0.14	0.01	0.06	0.02	0.05	0.08	0.04
C2	0.06	0.00	0.16	0.08	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.27	0.09	0.07	0.11	0.02	0.04	0.13	0.04
C2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.07	0.02	0.02	0.11	0.04	0.10	0.10	0.21	0.16	0.07	0.01	0.01	0.03	0.02	0.17	0.03	0.23	0.14	0.17
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.06	0.06	0.12	0.08	0.06	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.15	0.05	0.04
C4	0.02	0.01	0.07	0.04	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.10	0.04	0.11	0.01	0.04	0.12	0.04
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.04	0.03	0.07	0.04	0.04	0.02	0.06	0.04	0.01	0.01	0.04	0.07	0.06	0.03
C5	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.02	0.13	0.01	0.07	0.14	0.07
C5'	0.03	0.08	0.11	0.01	0.08	0.00	0.10	0.00	0.11	0.09	0.10	0.09	0.07	0.11	0.07	0.06	0.04	0.02	0.01	0.13	0.07	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.03	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.03	0.14	0.00	0.08	0.16	0.08
C8	0.02	0.02	0.10	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.17	0.12	0.06	0.12	0.02	0.06	0.12	0.06
N1	0.04	0.01	0.10	0.06	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.17	0.09	0.05	0.13	0.01	0.06	0.15	0.06
N2	0.08	0.00	0.21	0.12	0.02	0.07	0.02	0.09	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.36	0.10	0.09	0.10	0.03	0.04	0.12	0.04
N3	0.05	0.01	0.16	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.27	0.10	0.07	0.09	0.02	0.04	0.11	0.04
N7	0.02	0.01	0.07	0.06	0.01	0.04	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.15	0.12	0.04	0.14	0.02	0.09	0.15	0.08
N9	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.04	0.11	0.01	0.09	0.02	0.04	0.11	0.04
O2'	0.03	0.27	0.01	0.01	0.11	0.06	0.06	0.06	0.07	0.17	0.17	0.36	0.27	0.15	0.04	0.00	0.04	0.05	0.19	0.07	0.29	0.23	0.21
O3'	0.14	0.09	0.03	0.01	0.10	0.04	0.11	0.04	0.10	0.12	0.09	0.10	0.10	0.12	0.11	0.04	0.00	0.14	0.03	0.11	0.15	0.08	0.05
O4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.03	0.06	0.05	0.09	0.07	0.04	0.01	0.05	0.14	0.00	0.05	0.03	0.10	0.19	0.15
O5'	0.06	0.11	0.17	0.02	0.11	0.01	0.13	0.01	0.14	0.12	0.13	0.10	0.09	0.14	0.09	0.19	0.03	0.05	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.07	0.11	0.03	0.16	0.00	0.12	0.19	0.11
OP1	0.05	0.04	0.23	0.15	0.04	0.07	0.07	0.07	0.08	0.06	0.06	0.04	0.04	0.09	0.04	0.29	0.15	0.10	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.13	0.14	0.05	0.12	0.06	0.14	0.02	0.16	0.12	0.15	0.12	0.11	0.15	0.11	0.23	0.08	0.19	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.04	0.17	0.04	0.04	0.03	0.07	0.01	0.08	0.06	0.06	0.04	0.04	0.08	0.04	0.21	0.05	0.15	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00