Doublet Group distance statistics: 48132

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.018, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N9	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.006, 0.018, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.007, 0.018, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N6	A	0, 0.010, 0.028, 0.046, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.028 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.014, 0.037, 0.060, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.037 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.015, 0.038, 0.061, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.038 std_dev=0.023
O4'	A	0, 0.069, 0.219, 0.368, 0.356 max_d=0.356 avg_d=0.219 std_dev=0.149
C2'	A	0, 0.073, 0.233, 0.394, 0.380 max_d=0.380 avg_d=0.233 std_dev=0.161
O2'	A	0, 0.085, 0.258, 0.431, 0.418 max_d=0.418 avg_d=0.258 std_dev=0.173
C4'	A	0, 0.102, 0.324, 0.546, 0.522 max_d=0.522 avg_d=0.324 std_dev=0.222
C3'	A	0, 0.112, 0.364, 0.616, 0.580 max_d=0.580 avg_d=0.364 std_dev=0.252
OP2	A	0, 0.150, 0.439, 0.728, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.439 std_dev=0.289
OP2	B	0, 0.154, 0.457, 0.759, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.457 std_dev=0.303
OP1	B	0, 0.142, 0.445, 0.748, 0.755 max_d=0.755 avg_d=0.445 std_dev=0.303
P	B	0, 0.163, 0.508, 0.854, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.508 std_dev=0.345
O3'	A	0, 0.157, 0.514, 0.872, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.514 std_dev=0.357
C5'	A	0, 0.178, 0.552, 0.926, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.552 std_dev=0.374
P	A	0, 0.177, 0.570, 0.963, 0.967 max_d=0.967 avg_d=0.570 std_dev=0.393
O5'	A	0, 0.204, 0.624, 1.044, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.624 std_dev=0.420
O3'	B	0, 0.163, 0.603, 1.044, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.603 std_dev=0.441
C5'	B	0, 0.205, 0.678, 1.150, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.678 std_dev=0.472
O5'	B	0, 0.232, 0.709, 1.187, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.709 std_dev=0.478
C3'	B	0, 0.212, 0.725, 1.237, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.725 std_dev=0.513
OP1	A	0, 0.181, 0.695, 1.209, 1.312 max_d=1.312 avg_d=0.695 std_dev=0.514
C4'	B	0, 0.238, 0.783, 1.327, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.783 std_dev=0.544
C8	B	0, 0.288, 0.869, 1.451, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.869 std_dev=0.582
N7	B	0, 0.297, 0.898, 1.499, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.898 std_dev=0.601
C2'	B	0, 0.285, 0.904, 1.523, 1.502 max_d=1.502 avg_d=0.904 std_dev=0.619
O2'	B	0, 0.289, 0.928, 1.567, 1.570 max_d=1.570 avg_d=0.928 std_dev=0.639
O4'	B	0, 0.302, 0.946, 1.589, 1.548 max_d=1.548 avg_d=0.946 std_dev=0.643
N9	B	0, 0.336, 1.028, 1.720, 1.625 max_d=1.625 avg_d=1.028 std_dev=0.692
C1'	B	0, 0.333, 1.025, 1.717, 1.630 max_d=1.630 avg_d=1.025 std_dev=0.692
C5	B	0, 0.365, 1.124, 1.884, 1.753 max_d=1.753 avg_d=1.124 std_dev=0.759
O6	B	0, 0.368, 1.148, 1.928, 1.793 max_d=1.793 avg_d=1.148 std_dev=0.780
C4	B	0, 0.400, 1.241, 2.082, 1.946 max_d=1.946 avg_d=1.241 std_dev=0.841
C6	B	0, 0.398, 1.239, 2.081, 1.928 max_d=1.928 avg_d=1.239 std_dev=0.842
N3	B	0, 0.471, 1.480, 2.489, 2.322 max_d=2.322 avg_d=1.480 std_dev=1.009
N1	B	0, 0.472, 1.486, 2.499, 2.312 max_d=2.312 avg_d=1.486 std_dev=1.013
C2	B	0, 0.505, 1.597, 2.689, 2.495 max_d=2.495 avg_d=1.597 std_dev=1.092
N2	B	0, 0.579, 1.846, 3.112, 2.888 max_d=2.888 avg_d=1.846 std_dev=1.267

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.14	0.09	0.08
C2	0.02	0.00	0.11	0.11	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.14	0.01	0.08	0.14	0.08	0.09
C2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.00	0.06	0.04	0.09	0.11	0.04	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.08	0.12	0.04
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.06	0.09	0.10	0.03	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.13	0.04
C4	0.01	0.00	0.06	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.09	0.17	0.08	0.10
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.04	0.03	0.04	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.07	0.11	0.04
C5	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.02	0.10	0.19	0.07	0.11
C5'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.05	0.01	0.03	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.02	0.09	0.18	0.07	0.11
C8	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.06	0.02	0.12	0.23	0.08	0.14
N1	0.02	0.00	0.09	0.09	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.12	0.02	0.09	0.16	0.08	0.10
N3	0.02	0.00	0.11	0.10	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.09	0.12	0.01	0.08	0.14	0.09	0.08
N6	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.06	0.02	0.09	0.19	0.07	0.11
N7	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02	0.11	0.23	0.08	0.14
N9	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.09	0.18	0.08	0.10
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.04	0.03	0.03	0.03	0.05	0.02	0.08	0.09	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.10	0.13	0.05
O3'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.06	0.01	0.04	0.01	0.07	0.06	0.12	0.12	0.06	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.21	0.11
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.14	0.09	0.09
O5'	0.06	0.08	0.03	0.02	0.09	0.01	0.10	0.01	0.09	0.12	0.09	0.08	0.09	0.11	0.09	0.03	0.03	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.14	0.14	0.08	0.04	0.17	0.07	0.19	0.01	0.18	0.23	0.16	0.14	0.19	0.23	0.18	0.10	0.09	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.08	0.12	0.13	0.08	0.11	0.07	0.06	0.07	0.08	0.08	0.09	0.07	0.08	0.08	0.13	0.21	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.09	0.04	0.04	0.10	0.04	0.11	0.01	0.11	0.14	0.10	0.08	0.11	0.14	0.10	0.05	0.11	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.07	0.02	0.02	0.06	0.10	0.14	0.19	0.18	0.11	0.13	0.04	0.03	0.18	0.03	0.04	0.05	0.13	0.11	0.24	0.06	0.06	0.06
C2	0.05	0.14	0.02	0.03	0.10	0.11	0.17	0.16	0.23	0.10	0.20	0.13	0.09	0.18	0.05	0.05	0.09	0.13	0.11	0.30	0.02	0.11	0.05
C2'	0.07	0.04	0.07	0.06	0.05	0.10	0.12	0.18	0.15	0.11	0.10	0.03	0.03	0.16	0.05	0.08	0.08	0.12	0.13	0.21	0.11	0.10	0.09
C3'	0.10	0.06	0.10	0.10	0.07	0.11	0.12	0.18	0.13	0.13	0.09	0.06	0.07	0.17	0.08	0.11	0.10	0.13	0.15	0.18	0.16	0.16	0.14
C4	0.04	0.13	0.02	0.02	0.10	0.10	0.17	0.16	0.23	0.11	0.19	0.12	0.09	0.19	0.06	0.05	0.09	0.13	0.10	0.30	0.02	0.09	0.04
C4'	0.09	0.06	0.08	0.08	0.07	0.12	0.11	0.21	0.12	0.11	0.08	0.07	0.07	0.15	0.07	0.07	0.06	0.13	0.15	0.17	0.14	0.15	0.13
C5	0.05	0.17	0.04	0.04	0.12	0.09	0.19	0.14	0.25	0.11	0.22	0.16	0.11	0.19	0.07	0.05	0.11	0.13	0.09	0.32	0.02	0.12	0.05
C5'	0.10	0.08	0.09	0.09	0.08	0.13	0.11	0.22	0.11	0.13	0.09	0.09	0.08	0.16	0.09	0.07	0.07	0.14	0.17	0.14	0.17	0.20	0.17
C6	0.05	0.18	0.03	0.04	0.12	0.10	0.19	0.14	0.25	0.10	0.23	0.18	0.12	0.18	0.06	0.05	0.11	0.13	0.10	0.32	0.03	0.14	0.06
C8	0.05	0.14	0.04	0.04	0.11	0.09	0.18	0.15	0.23	0.12	0.20	0.13	0.10	0.20	0.07	0.05	0.11	0.13	0.09	0.30	0.04	0.10	0.05
N1	0.05	0.17	0.03	0.04	0.11	0.11	0.18	0.15	0.24	0.10	0.22	0.16	0.11	0.18	0.06	0.05	0.10	0.13	0.10	0.31	0.04	0.13	0.06
N3	0.04	0.12	0.02	0.02	0.09	0.10	0.17	0.16	0.22	0.11	0.18	0.11	0.08	0.19	0.05	0.05	0.08	0.13	0.10	0.29	0.02	0.09	0.04
N6	0.06	0.19	0.03	0.04	0.12	0.10	0.18	0.13	0.26	0.08	0.24	0.20	0.13	0.17	0.06	0.04	0.11	0.13	0.10	0.33	0.04	0.16	0.07
N7	0.05	0.18	0.05	0.05	0.13	0.09	0.20	0.13	0.26	0.12	0.23	0.17	0.13	0.20	0.08	0.06	0.12	0.12	0.08	0.33	0.02	0.13	0.05
N9	0.05	0.11	0.02	0.02	0.09	0.10	0.16	0.17	0.21	0.11	0.17	0.10	0.07	0.19	0.05	0.04	0.09	0.13	0.10	0.28	0.03	0.08	0.05
O2'	0.07	0.05	0.08	0.07	0.06	0.10	0.12	0.18	0.15	0.11	0.10	0.05	0.04	0.17	0.05	0.09	0.07	0.12	0.13	0.21	0.10	0.10	0.09
O3'	0.14	0.10	0.15	0.15	0.11	0.14	0.14	0.19	0.14	0.15	0.11	0.12	0.11	0.18	0.13	0.16	0.16	0.15	0.17	0.17	0.18	0.18	0.16
O4'	0.05	0.05	0.02	0.03	0.05	0.11	0.13	0.20	0.16	0.11	0.11	0.03	0.02	0.17	0.03	0.03	0.05	0.13	0.10	0.22	0.06	0.07	0.06
O5'	0.07	0.02	0.05	0.07	0.02	0.16	0.09	0.24	0.11	0.10	0.06	0.04	0.03	0.15	0.01	0.05	0.01	0.14	0.11	0.16	0.04	0.07	0.05
OP1	0.18	0.24	0.18	0.08	0.26	0.06	0.33	0.08	0.33	0.35	0.28	0.23	0.22	0.39	0.25	0.17	0.02	0.11	0.17	0.38	0.22	0.21	0.22
OP2	0.08	0.10	0.12	0.03	0.13	0.06	0.20	0.15	0.20	0.23	0.15	0.08	0.08	0.26	0.14	0.15	0.02	0.03	0.03	0.25	0.03	0.10	0.04
P	0.06	0.10	0.09	0.02	0.12	0.05	0.19	0.11	0.19	0.23	0.14	0.09	0.09	0.25	0.13	0.10	0.01	0.02	0.04	0.24	0.09	0.14	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.05	0.07	0.01
C2	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.02	0.05	0.19	0.01	0.19	0.18	0.18
C2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.04	0.08	0.02	0.06	0.05	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.13	0.04
C3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.10	0.13	0.07	0.02	0.02	0.14	0.06	0.01	0.01	0.00	0.07	0.13	0.05	0.16	0.08
C4	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.06	0.01	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.04	0.04	0.16	0.02	0.13	0.16	0.14
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.10	0.09	0.08	0.04	0.04	0.10	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.12	0.01	0.07	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.10	0.03	0.21	0.02	0.17	0.21	0.19
C5'	0.02	0.15	0.01	0.01	0.13	0.00	0.17	0.00	0.19	0.12	0.18	0.14	0.12	0.16	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.22	0.03	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.10	0.02	0.10	0.01	0.19	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.06	0.10	0.04	0.23	0.00	0.23	0.24	0.24
C8	0.02	0.01	0.08	0.13	0.00	0.09	0.00	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.16	0.02	0.15	0.04	0.04	0.16	0.11
N1	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.10	0.04	0.05	0.22	0.01	0.23	0.22	0.22
N2	0.01	0.00	0.06	0.02	0.01	0.04	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.05	0.06	0.18	0.01	0.20	0.17	0.18
N3	0.01	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.03	0.05	0.15	0.02	0.15	0.14	0.14
N7	0.02	0.01	0.07	0.14	0.01	0.10	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.16	0.01	0.20	0.04	0.12	0.22	0.19
N9	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.01	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.11	0.03	0.05	0.12	0.08
O2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.06	0.04	0.04	0.04	0.06	0.06	0.10	0.15	0.12	0.05	0.02	0.00	0.03	0.04	0.05	0.06	0.01	0.15	0.06
O3'	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.10	0.02	0.10	0.16	0.04	0.05	0.03	0.16	0.06	0.03	0.00	0.02	0.08	0.14	0.11	0.22	0.13
O4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.06	0.05	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.06	0.05	0.10	0.03	0.07
O5'	0.02	0.19	0.05	0.07	0.16	0.01	0.21	0.01	0.23	0.15	0.22	0.18	0.15	0.20	0.11	0.05	0.08	0.06	0.00	0.26	0.01	0.01	0.00
O6	0.03	0.01	0.06	0.13	0.02	0.12	0.02	0.22	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.06	0.14	0.05	0.26	0.00	0.27	0.28	0.28
OP1	0.05	0.19	0.01	0.05	0.13	0.01	0.17	0.03	0.23	0.04	0.23	0.20	0.15	0.12	0.05	0.01	0.11	0.10	0.01	0.27	0.00	0.02	0.01
OP2	0.07	0.18	0.13	0.16	0.16	0.07	0.21	0.02	0.24	0.16	0.22	0.17	0.14	0.22	0.12	0.15	0.22	0.03	0.01	0.28	0.02	0.00	0.00
P	0.01	0.18	0.04	0.08	0.14	0.01	0.19	0.01	0.24	0.11	0.22	0.18	0.14	0.19	0.08	0.06	0.13	0.07	0.00	0.28	0.01	0.00	0.00