Doublet Group distance statistics: 48134

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.010, 0.024, 0.038, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.024 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.013, 0.032, 0.050, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.032 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.010, 0.028, 0.047, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.028 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.014, 0.035, 0.055, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.035 std_dev=0.021
N3	A	0, 0.016, 0.039, 0.062, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.039 std_dev=0.023
C6	A	0, 0.001, 0.025, 0.049, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.025 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.005, 0.032, 0.058, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.032 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.010, 0.039, 0.069, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.039 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.002, 0.040, 0.079, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.040 std_dev=0.039
N6	A	0, 0.005, 0.079, 0.153, 0.200 max_d=0.200 avg_d=0.079 std_dev=0.074
O4'	A	0, 0.049, 0.123, 0.197, 0.194 max_d=0.194 avg_d=0.123 std_dev=0.074
C3'	A	0, 0.075, 0.178, 0.281, 0.249 max_d=0.249 avg_d=0.178 std_dev=0.103
C2'	A	0, 0.053, 0.177, 0.300, 0.295 max_d=0.295 avg_d=0.177 std_dev=0.124
P	B	0, 0.097, 0.262, 0.428, 0.413 max_d=0.413 avg_d=0.262 std_dev=0.166
O3'	A	0, 0.126, 0.300, 0.474, 0.424 max_d=0.424 avg_d=0.300 std_dev=0.174
OP2	B	0, 0.170, 0.403, 0.637, 0.564 max_d=0.564 avg_d=0.403 std_dev=0.234
C4'	A	0, 0.087, 0.369, 0.652, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.369 std_dev=0.283
C1'	B	0, 0.208, 0.493, 0.778, 0.673 max_d=0.673 avg_d=0.493 std_dev=0.285
O5'	B	0, 0.117, 0.450, 0.784, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.450 std_dev=0.334
O2'	A	0, 0.143, 0.502, 0.861, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.502 std_dev=0.359
OP1	B	0, 0.113, 0.502, 0.891, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.502 std_dev=0.389
O4'	B	0, 0.303, 0.750, 1.198, 1.183 max_d=1.183 avg_d=0.750 std_dev=0.447
C4'	B	0, 0.254, 0.733, 1.212, 1.344 max_d=1.344 avg_d=0.733 std_dev=0.479
C3'	B	0, 0.386, 0.941, 1.496, 1.357 max_d=1.357 avg_d=0.941 std_dev=0.555
C5'	A	0, 0.158, 0.756, 1.354, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.756 std_dev=0.598
O5'	A	0, 0.171, 0.781, 1.391, 1.385 max_d=1.385 avg_d=0.781 std_dev=0.610
C2'	B	0, 0.155, 0.835, 1.515, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.835 std_dev=0.680
O3'	B	0, 0.532, 1.258, 1.985, 1.709 max_d=1.709 avg_d=1.258 std_dev=0.727
C5'	B	0, 0.509, 1.258, 2.007, 1.978 max_d=1.978 avg_d=1.258 std_dev=0.749
OP1	A	0, 0.273, 1.080, 1.887, 1.885 max_d=1.885 avg_d=1.080 std_dev=0.807
OP2	A	0, 0.357, 1.165, 1.973, 1.941 max_d=1.941 avg_d=1.165 std_dev=0.808
P	A	0, 0.131, 0.947, 1.762, 1.784 max_d=1.784 avg_d=0.947 std_dev=0.816
N9	B	0, 0.361, 1.238, 2.116, 2.069 max_d=2.069 avg_d=1.238 std_dev=0.877
C8	B	0, 0.407, 1.571, 2.736, 2.695 max_d=2.695 avg_d=1.571 std_dev=1.165
O2'	B	0, 0.111, 1.292, 2.472, 2.493 max_d=2.493 avg_d=1.292 std_dev=1.181
C4	B	0, 0.411, 1.927, 3.442, 3.412 max_d=3.412 avg_d=1.927 std_dev=1.516
N7	B	0, 0.430, 2.163, 3.896, 3.867 max_d=3.867 avg_d=2.163 std_dev=1.733
N3	B	0, 0.415, 2.217, 4.020, 3.993 max_d=3.993 avg_d=2.217 std_dev=1.802
C5	B	0, 0.417, 2.393, 4.369, 4.349 max_d=4.349 avg_d=2.393 std_dev=1.976
C2	B	0, 0.406, 2.954, 5.501, 5.490 max_d=5.490 avg_d=2.954 std_dev=2.547
C6	B	0, 0.395, 3.124, 5.853, 5.848 max_d=5.848 avg_d=3.124 std_dev=2.729
N1	B	0, 0.395, 3.353, 6.312, 6.306 max_d=6.306 avg_d=3.353 std_dev=2.959
N2	B	0, 0.432, 3.433, 6.433, 6.422 max_d=6.422 avg_d=3.433 std_dev=3.001
O6	B	0, 0.364, 3.605, 6.847, 6.850 max_d=6.850 avg_d=3.605 std_dev=3.241

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.03	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.13	0.30	0.10	0.14
C2	0.02	0.00	0.02	0.04	0.00	0.13	0.02	0.30	0.03	0.02	0.01	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.04	0.06	0.15	0.18	0.17	0.06
C2'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.09	0.02	0.10	0.09	0.07	0.01	0.16	0.09	0.04	0.00	0.01	0.02	0.27	0.34	0.14	0.25
C3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.05	0.04	0.05	0.04	0.08	0.04	0.03	0.03	0.01	0.02	0.43	0.44	0.18	0.34
C4	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.12	0.00	0.30	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.09	0.33	0.08	0.13
C4'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.12	0.00	0.14	0.00	0.14	0.13	0.14	0.11	0.13	0.16	0.10	0.05	0.02	0.00	0.01	0.21	0.20	0.01
C5	0.02	0.02	0.09	0.04	0.00	0.14	0.00	0.38	0.02	0.05	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.09	0.07	0.03	0.20	0.40	0.08	0.23
C5'	0.07	0.30	0.02	0.02	0.30	0.00	0.38	0.00	0.39	0.32	0.35	0.24	0.40	0.41	0.24	0.06	0.02	0.01	0.01	0.40	0.22	0.01
C6	0.03	0.03	0.10	0.05	0.02	0.14	0.02	0.39	0.00	0.07	0.01	0.02	0.00	0.05	0.05	0.09	0.08	0.03	0.13	0.35	0.04	0.17
C8	0.01	0.02	0.09	0.04	0.01	0.13	0.05	0.32	0.07	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.10	0.04	0.02	0.38	0.49	0.20	0.36
N1	0.02	0.01	0.07	0.05	0.03	0.14	0.01	0.35	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.03	0.05	0.04	0.06	0.05	0.05	0.25	0.10	0.04
N3	0.02	0.00	0.01	0.04	0.00	0.11	0.02	0.24	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.03	0.04	0.05	0.13	0.21	0.16	0.03
N6	0.06	0.04	0.16	0.08	0.03	0.13	0.05	0.40	0.00	0.12	0.04	0.02	0.00	0.11	0.08	0.15	0.15	0.03	0.21	0.41	0.09	0.25
N7	0.01	0.01	0.09	0.04	0.02	0.16	0.01	0.41	0.05	0.01	0.03	0.03	0.11	0.00	0.02	0.10	0.06	0.04	0.35	0.48	0.18	0.36
N9	0.00	0.02	0.04	0.03	0.02	0.10	0.03	0.24	0.05	0.01	0.05	0.01	0.08	0.02	0.00	0.04	0.02	0.01	0.21	0.39	0.10	0.23
O2'	0.01	0.02	0.00	0.03	0.03	0.05	0.09	0.06	0.09	0.10	0.04	0.03	0.15	0.10	0.04	0.00	0.02	0.08	0.08	0.14	0.09	0.07
O3'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.02	0.07	0.02	0.08	0.04	0.06	0.04	0.15	0.06	0.02	0.02	0.00	0.02	0.46	0.40	0.22	0.36
O4'	0.00	0.06	0.02	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.05	0.05	0.03	0.04	0.01	0.08	0.02	0.00	0.10	0.21	0.18	0.03
O5'	0.13	0.15	0.27	0.43	0.09	0.01	0.20	0.01	0.13	0.38	0.05	0.13	0.21	0.35	0.21	0.08	0.46	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.30	0.18	0.34	0.44	0.33	0.21	0.40	0.40	0.35	0.49	0.25	0.21	0.41	0.48	0.39	0.14	0.40	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.17	0.14	0.18	0.08	0.20	0.08	0.22	0.04	0.20	0.10	0.16	0.09	0.18	0.10	0.09	0.22	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.06	0.25	0.34	0.13	0.01	0.23	0.01	0.17	0.36	0.04	0.03	0.25	0.36	0.23	0.07	0.36	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.09	1.17	0.33	0.37	0.56	0.03	0.39	0.11	0.63	0.20	1.00	1.54	0.99	0.05	0.18	0.73	0.74	0.25	0.09	0.52	0.02	0.11	0.06
C2	0.14	1.94	0.35	0.39	1.04	0.11	1.02	0.12	1.45	0.21	1.88	2.43	1.52	0.53	0.48	0.91	0.80	0.24	0.16	1.45	0.08	0.19	0.11
C2'	0.09	0.76	0.36	0.39	0.27	0.10	0.09	0.13	0.23	0.43	0.56	1.08	0.65	0.34	0.11	0.65	0.68	0.19	0.10	0.10	0.03	0.10	0.05
C3'	0.16	0.95	0.11	0.20	0.46	0.09	0.25	0.19	0.42	0.27	0.76	1.25	0.84	0.18	0.18	0.40	0.49	0.29	0.01	0.28	0.01	0.05	0.01
C4	0.15	1.68	0.30	0.37	0.91	0.09	0.83	0.12	1.17	0.11	1.56	2.09	1.37	0.37	0.41	0.81	0.77	0.26	0.16	1.12	0.09	0.18	0.12
C4'	0.20	1.21	0.14	0.23	0.63	0.10	0.44	0.22	0.67	0.17	1.04	1.56	1.04	0.08	0.27	0.49	0.58	0.34	0.01	0.55	0.02	0.06	0.03
C5	0.14	1.81	0.28	0.37	1.02	0.19	0.97	0.18	1.34	0.21	1.72	2.20	1.48	0.51	0.49	0.79	0.75	0.22	0.23	1.30	0.18	0.24	0.19
C5'	0.43	1.62	0.14	0.14	0.98	0.26	0.82	0.36	1.09	0.19	1.47	1.97	1.40	0.35	0.57	0.26	0.46	0.54	0.06	0.98	0.04	0.10	0.04
C6	0.12	2.03	0.31	0.40	1.12	0.24	1.13	0.22	1.58	0.30	1.99	2.48	1.59	0.65	0.53	0.85	0.77	0.18	0.27	1.59	0.22	0.27	0.22
C8	0.17	1.35	0.19	0.30	0.77	0.10	0.64	0.16	0.89	0.03	1.21	1.65	1.17	0.23	0.36	0.61	0.66	0.28	0.18	0.80	0.14	0.17	0.14
N1	0.12	2.06	0.35	0.41	1.11	0.20	1.14	0.18	1.60	0.28	2.03	2.56	1.59	0.65	0.52	0.91	0.80	0.20	0.23	1.63	0.16	0.25	0.18
N3	0.14	1.75	0.34	0.38	0.93	0.07	0.86	0.11	1.24	0.11	1.65	2.21	1.41	0.39	0.41	0.88	0.79	0.27	0.13	1.20	0.05	0.16	0.09
N6	0.10	2.13	0.32	0.43	1.16	0.35	1.24	0.31	1.74	0.37	2.15	2.58	1.61	0.76	0.54	0.83	0.76	0.16	0.35	1.78	0.32	0.35	0.30
N7	0.17	1.62	0.18	0.31	0.96	0.20	0.88	0.21	1.18	0.19	1.51	1.92	1.37	0.46	0.48	0.64	0.65	0.24	0.23	1.12	0.20	0.22	0.19
N9	0.16	1.41	0.26	0.33	0.76	0.03	0.63	0.12	0.90	0.03	1.26	1.77	1.19	0.20	0.33	0.71	0.72	0.29	0.12	0.82	0.06	0.15	0.09
O2'	0.22	0.52	0.53	0.51	0.13	0.22	0.24	0.26	0.12	0.64	0.31	0.84	0.43	0.58	0.29	0.78	0.74	0.21	0.10	0.22	0.07	0.05	0.03
O3'	0.11	0.58	0.13	0.19	0.20	0.07	0.16	0.13	0.12	0.51	0.36	0.85	0.53	0.49	0.17	0.33	0.38	0.20	0.02	0.18	0.01	0.01	0.01
O4'	0.13	1.29	0.27	0.32	0.63	0.03	0.47	0.14	0.73	0.17	1.12	1.67	1.08	0.06	0.24	0.67	0.70	0.28	0.07	0.63	0.02	0.11	0.03
O5'	0.40	0.82	0.61	0.71	0.15	0.54	0.07	0.50	0.24	0.71	0.65	1.22	0.60	0.54	0.30	0.95	0.97	0.35	0.67	0.13	0.60	0.82	0.67
OP1	0.41	0.92	0.60	0.69	0.22	0.55	0.12	0.47	0.39	0.65	0.80	1.33	0.65	0.46	0.28	0.98	0.99	0.37	0.62	0.31	0.51	0.75	0.58
OP2	0.31	0.89	0.31	0.39	0.35	0.34	0.24	0.28	0.39	0.58	0.74	1.23	0.70	0.46	0.28	0.62	0.62	0.29	0.49	0.29	0.49	0.64	0.48
P	0.37	0.91	0.52	0.62	0.24	0.51	0.13	0.44	0.38	0.63	0.77	1.29	0.66	0.45	0.26	0.87	0.89	0.34	0.61	0.28	0.55	0.77	0.59

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.07	0.16	0.11	0.03	0.00	0.03	0.02	0.01	0.13	0.01	0.25	0.05	0.11
C2	0.11	0.00	0.21	0.13	0.01	0.31	0.01	0.33	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.17	0.18	0.38	0.24	0.01	0.24	0.48	0.27
C2'	0.00	0.21	0.00	0.01	0.11	0.02	0.05	0.04	0.10	0.13	0.16	0.24	0.20	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.08	0.09	0.08	0.21	0.08
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.12	0.00	0.19	0.01	0.19	0.22	0.14	0.19	0.13	0.24	0.12	0.04	0.02	0.01	0.19	0.25	0.10	0.25	0.16
C4	0.04	0.01	0.11	0.12	0.00	0.08	0.01	0.07	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.11	0.18	0.16	0.01	0.44	0.19	0.13
C4'	0.00	0.31	0.02	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.02	0.34	0.17	0.46	0.31	0.29	0.07	0.19	0.04	0.00	0.02	0.11	0.11	0.14	0.03
C5	0.00	0.01	0.05	0.19	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.16	0.05	0.34	0.02	0.76	0.03	0.34
C5'	0.01	0.33	0.04	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.08	0.46	0.16	0.51	0.33	0.43	0.10	0.12	0.06	0.01	0.01	0.21	0.18	0.23	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.19	0.01	0.02	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.10	0.16	0.11	0.29	0.00	0.75	0.06	0.28
C8	0.05	0.02	0.13	0.22	0.02	0.34	0.01	0.46	0.02	0.00	0.01	0.04	0.03	0.00	0.00	0.31	0.19	0.26	0.60	0.05	0.93	0.33	0.62
N1	0.07	0.01	0.16	0.14	0.02	0.17	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.09	0.15	0.27	0.14	0.01	0.47	0.31	0.11
N2	0.16	0.01	0.24	0.19	0.03	0.46	0.01	0.51	0.01	0.04	0.02	0.00	0.04	0.02	0.06	0.25	0.27	0.50	0.42	0.01	0.19	0.68	0.48
N3	0.11	0.01	0.20	0.13	0.01	0.31	0.01	0.33	0.02	0.03	0.02	0.04	0.00	0.02	0.03	0.19	0.17	0.39	0.25	0.02	0.20	0.45	0.27
N7	0.03	0.01	0.07	0.24	0.02	0.29	0.00	0.43	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.29	0.21	0.17	0.61	0.05	1.05	0.33	0.64
N9	0.00	0.03	0.00	0.12	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.06	0.03	0.00	0.00	0.10	0.09	0.01	0.26	0.03	0.51	0.04	0.24
O2'	0.03	0.17	0.00	0.04	0.04	0.19	0.13	0.12	0.10	0.31	0.09	0.25	0.19	0.29	0.10	0.00	0.10	0.15	0.15	0.13	0.09	0.10	0.15
O3'	0.02	0.18	0.06	0.02	0.11	0.04	0.16	0.06	0.16	0.19	0.15	0.27	0.17	0.21	0.09	0.10	0.00	0.02	0.32	0.22	0.21	0.34	0.29
O4'	0.01	0.38	0.00	0.01	0.18	0.00	0.05	0.01	0.11	0.26	0.27	0.50	0.39	0.17	0.01	0.15	0.02	0.00	0.20	0.06	0.28	0.04	0.15
O5'	0.13	0.24	0.08	0.19	0.16	0.02	0.34	0.01	0.29	0.60	0.14	0.42	0.25	0.61	0.26	0.15	0.32	0.20	0.00	0.42	0.01	0.01	0.02
O6	0.01	0.01	0.09	0.25	0.01	0.11	0.02	0.21	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.05	0.03	0.13	0.22	0.06	0.42	0.00	0.97	0.09	0.44
OP1	0.25	0.24	0.08	0.10	0.44	0.11	0.76	0.18	0.75	0.93	0.47	0.19	0.20	1.05	0.51	0.09	0.21	0.28	0.01	0.97	0.00	0.03	0.01
OP2	0.05	0.48	0.21	0.25	0.19	0.14	0.03	0.23	0.06	0.33	0.31	0.68	0.45	0.33	0.04	0.10	0.34	0.04	0.01	0.09	0.03	0.00	0.01
P	0.11	0.27	0.08	0.16	0.13	0.03	0.34	0.02	0.28	0.62	0.11	0.48	0.27	0.64	0.24	0.15	0.29	0.15	0.02	0.44	0.01	0.01	0.00