Doublet Group distance statistics: 48135

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.005, 0.020, 0.036, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.015
C6	A	0, 0.002, 0.018, 0.035, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.004, 0.025, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.025 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.005, 0.026, 0.047, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.026 std_dev=0.021
C5	A	0, 0.003, 0.031, 0.058, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.031 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.006, 0.035, 0.064, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.035 std_dev=0.029
C4	A	0, 0.004, 0.037, 0.070, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.037 std_dev=0.033
N7	A	0, 0.012, 0.064, 0.116, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.064 std_dev=0.052
C8	A	0, 0.013, 0.069, 0.125, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.069 std_dev=0.056
N6	A	0, 0.008, 0.068, 0.128, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.068 std_dev=0.060
O4'	A	0, 0.011, 0.207, 0.402, 0.412 max_d=0.412 avg_d=0.207 std_dev=0.196
C2'	A	0, 0.012, 0.221, 0.429, 0.442 max_d=0.442 avg_d=0.221 std_dev=0.208
O2'	A	0, 0.043, 0.252, 0.462, 0.467 max_d=0.467 avg_d=0.252 std_dev=0.210
O5'	B	0, 0.018, 0.250, 0.482, 0.481 max_d=0.481 avg_d=0.250 std_dev=0.232
C3'	A	0, 0.014, 0.333, 0.651, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.333 std_dev=0.318
C4'	A	0, 0.009, 0.338, 0.667, 0.669 max_d=0.669 avg_d=0.338 std_dev=0.329
O3'	A	0, 0.023, 0.432, 0.841, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.432 std_dev=0.409
P	B	0, 0.021, 0.463, 0.906, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.463 std_dev=0.443
O2'	B	0, 0.015, 0.483, 0.951, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.483 std_dev=0.468
OP1	B	0, 0.016, 0.507, 0.997, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.507 std_dev=0.491
C5'	A	0, 0.013, 0.630, 1.247, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.630 std_dev=0.617
C2'	B	0, 0.015, 0.696, 1.378, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.696 std_dev=0.682
C4'	B	0, 0.013, 0.710, 1.408, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.710 std_dev=0.698
O4'	B	0, 0.012, 0.716, 1.420, 1.430 max_d=1.430 avg_d=0.716 std_dev=0.704
C1'	B	0, 0.010, 0.722, 1.434, 1.434 max_d=1.434 avg_d=0.722 std_dev=0.712
O5'	A	0, 0.036, 0.761, 1.486, 1.491 max_d=1.491 avg_d=0.761 std_dev=0.725
C3'	B	0, 0.018, 0.807, 1.597, 1.614 max_d=1.614 avg_d=0.807 std_dev=0.789
O3'	B	0, 0.026, 0.838, 1.649, 1.672 max_d=1.672 avg_d=0.838 std_dev=0.811
OP2	B	0, 0.029, 0.866, 1.703, 1.728 max_d=1.728 avg_d=0.866 std_dev=0.837
C5'	B	0, 0.009, 0.854, 1.699, 1.726 max_d=1.726 avg_d=0.854 std_dev=0.845
N3	B	0, 0.016, 0.932, 1.848, 1.858 max_d=1.858 avg_d=0.932 std_dev=0.916
N9	B	0, 0.007, 0.938, 1.870, 1.872 max_d=1.872 avg_d=0.938 std_dev=0.932
OP2	A	0, 0.038, 0.977, 1.917, 1.945 max_d=1.945 avg_d=0.977 std_dev=0.940
P	A	0, 0.045, 0.991, 1.937, 1.969 max_d=1.969 avg_d=0.991 std_dev=0.946
N2	B	0, 0.019, 1.026, 2.033, 2.063 max_d=2.063 avg_d=1.026 std_dev=1.007
C4	B	0, 0.003, 1.025, 2.048, 2.051 max_d=2.051 avg_d=1.025 std_dev=1.022
C2	B	0, 0.010, 1.069, 2.129, 2.148 max_d=2.148 avg_d=1.069 std_dev=1.059
C8	B	0, 0.013, 1.116, 2.220, 2.224 max_d=2.224 avg_d=1.116 std_dev=1.103
OP1	A	0, 0.045, 1.187, 2.329, 2.374 max_d=2.374 avg_d=1.187 std_dev=1.142
C5	B	0, 0.011, 1.250, 2.488, 2.497 max_d=2.497 avg_d=1.250 std_dev=1.238
N1	B	0, 0.010, 1.283, 2.557, 2.577 max_d=2.577 avg_d=1.283 std_dev=1.273
N7	B	0, 0.017, 1.310, 2.602, 2.606 max_d=2.606 avg_d=1.310 std_dev=1.292
C6	B	0, 0.015, 1.393, 2.771, 2.795 max_d=2.795 avg_d=1.393 std_dev=1.378
O6	B	0, 0.021, 1.590, 3.159, 3.199 max_d=3.199 avg_d=1.590 std_dev=1.569

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02
C2	0.01	0.00	0.12	0.04	0.01	0.14	0.01	0.29	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.09	0.02	0.12	0.26	0.31	0.34	0.32
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.08	0.05	0.10	0.11	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.07	0.04
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.03	0.10	0.01	0.03	0.05	0.09	0.06	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.08	0.04
C4	0.01	0.01	0.06	0.04	0.00	0.09	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.05	0.06	0.15	0.17	0.21	0.18
C4'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.09	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.13	0.13	0.09	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.08	0.03	0.17	0.20	0.27	0.21
C5'	0.01	0.29	0.01	0.01	0.18	0.00	0.18	0.00	0.22	0.06	0.27	0.25	0.22	0.11	0.08	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.03	0.01	0.10	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.10	0.06	0.05	0.21	0.27	0.33	0.28
C8	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.11	0.05	0.06	0.07	0.15	0.09
N1	0.01	0.00	0.10	0.01	0.01	0.13	0.01	0.27	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.10	0.03	0.09	0.26	0.33	0.38	0.33
N3	0.02	0.00	0.11	0.03	0.00	0.13	0.01	0.25	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.07	0.02	0.12	0.21	0.22	0.23	0.24
N6	0.01	0.02	0.07	0.05	0.01	0.09	0.01	0.22	0.00	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.10	0.07	0.05	0.21	0.28	0.35	0.28
N7	0.03	0.01	0.01	0.09	0.01	0.04	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.06	0.11	0.03	0.11	0.14	0.22	0.15
N9	0.01	0.01	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.07	0.07	0.12	0.09
O2'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.10	0.03	0.10	0.07	0.10	0.06	0.03	0.00	0.06	0.04	0.02	0.06	0.07	0.03
O3'	0.02	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.08	0.02	0.06	0.11	0.03	0.02	0.07	0.11	0.06	0.06	0.00	0.02	0.04	0.06	0.10	0.05
O4'	0.00	0.12	0.01	0.01	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.05	0.09	0.12	0.05	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02
O5'	0.02	0.26	0.03	0.03	0.15	0.01	0.17	0.01	0.21	0.06	0.26	0.21	0.21	0.11	0.07	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.03	0.31	0.05	0.05	0.17	0.03	0.20	0.02	0.27	0.07	0.33	0.22	0.28	0.14	0.07	0.06	0.06	0.03	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.02	0.34	0.07	0.08	0.21	0.02	0.27	0.04	0.33	0.15	0.38	0.23	0.35	0.22	0.12	0.07	0.10	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01
P	0.02	0.32	0.04	0.04	0.18	0.01	0.21	0.01	0.28	0.09	0.33	0.24	0.28	0.15	0.09	0.03	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.11	0.03	0.02	0.09	0.03	0.06	0.04	0.06	0.06	0.08	0.15	0.12	0.04	0.09	0.04	0.05	0.09	0.02	0.03	0.02	0.09	0.03
C2	0.06	0.08	0.04	0.05	0.05	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.12	0.09	0.02	0.06	0.03	0.04	0.06	0.02	0.03	0.03	0.07	0.02
C2'	0.02	0.02	0.06	0.08	0.01	0.05	0.04	0.03	0.04	0.05	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.13	0.11	0.01	0.11	0.06	0.05	0.17	0.14
C3'	0.01	0.06	0.04	0.06	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.10	0.06	0.04	0.02	0.11	0.09	0.02	0.05	0.03	0.03	0.15	0.10
C4	0.11	0.14	0.06	0.06	0.12	0.08	0.10	0.11	0.09	0.10	0.12	0.17	0.14	0.08	0.12	0.02	0.02	0.12	0.04	0.07	0.03	0.02	0.03
C4'	0.08	0.13	0.03	0.02	0.09	0.03	0.06	0.02	0.07	0.05	0.10	0.17	0.13	0.04	0.09	0.04	0.04	0.08	0.08	0.05	0.03	0.11	0.02
C5	0.16	0.20	0.11	0.10	0.18	0.12	0.17	0.17	0.17	0.17	0.18	0.22	0.20	0.16	0.19	0.02	0.06	0.18	0.06	0.15	0.05	0.10	0.09
C5'	0.11	0.18	0.06	0.03	0.14	0.04	0.11	0.03	0.11	0.08	0.15	0.22	0.17	0.07	0.13	0.01	0.03	0.11	0.11	0.09	0.02	0.09	0.01
C6	0.16	0.19	0.12	0.12	0.18	0.14	0.15	0.18	0.15	0.16	0.17	0.22	0.19	0.15	0.18	0.03	0.09	0.17	0.06	0.13	0.06	0.09	0.08
C8	0.20	0.24	0.12	0.10	0.24	0.14	0.24	0.19	0.24	0.25	0.24	0.26	0.24	0.25	0.25	0.01	0.02	0.23	0.08	0.23	0.04	0.19	0.14
N1	0.10	0.13	0.08	0.09	0.11	0.09	0.07	0.12	0.07	0.07	0.10	0.17	0.14	0.06	0.11	0.01	0.08	0.11	0.04	0.04	0.04	0.01	0.03
N3	0.05	0.07	0.03	0.02	0.05	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.04	0.11	0.08	0.02	0.05	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.02	0.09	0.03
N6	0.18	0.22	0.14	0.15	0.21	0.16	0.19	0.21	0.19	0.20	0.21	0.25	0.22	0.19	0.21	0.05	0.11	0.20	0.07	0.18	0.06	0.14	0.10
N7	0.22	0.26	0.14	0.14	0.26	0.17	0.26	0.22	0.26	0.27	0.26	0.28	0.26	0.27	0.26	0.03	0.06	0.24	0.09	0.25	0.06	0.22	0.15
N9	0.13	0.16	0.07	0.05	0.15	0.08	0.13	0.11	0.13	0.13	0.14	0.19	0.16	0.12	0.15	0.02	0.01	0.14	0.04	0.11	0.01	0.03	0.04
O2'	0.04	0.00	0.06	0.07	0.04	0.06	0.08	0.04	0.07	0.10	0.04	0.05	0.01	0.11	0.04	0.11	0.08	0.03	0.12	0.10	0.02	0.21	0.17
O3'	0.04	0.09	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.06	0.14	0.09	0.01	0.04	0.07	0.05	0.05	0.02	0.01	0.04	0.12	0.07
O4'	0.07	0.12	0.02	0.03	0.09	0.02	0.06	0.02	0.06	0.05	0.09	0.15	0.12	0.04	0.09	0.05	0.06	0.07	0.06	0.04	0.01	0.11	0.02
O5'	0.12	0.19	0.08	0.05	0.14	0.06	0.10	0.04	0.12	0.07	0.16	0.24	0.18	0.07	0.13	0.02	0.02	0.11	0.13	0.09	0.06	0.09	0.02
OP1	0.19	0.28	0.15	0.11	0.21	0.11	0.18	0.09	0.20	0.13	0.25	0.34	0.27	0.13	0.19	0.11	0.08	0.16	0.20	0.17	0.10	0.06	0.06
OP2	0.14	0.21	0.10	0.06	0.15	0.07	0.11	0.05	0.12	0.07	0.17	0.27	0.20	0.06	0.14	0.06	0.04	0.12	0.11	0.09	0.03	0.11	0.02
P	0.12	0.20	0.08	0.05	0.15	0.06	0.11	0.03	0.12	0.07	0.17	0.26	0.19	0.06	0.13	0.04	0.02	0.11	0.13	0.09	0.05	0.10	0.02

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.07	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.15	0.01	0.19	0.04	0.09
C2	0.04	0.00	0.07	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.13	0.05	0.02	0.17	0.02	0.20	0.08	0.12
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.10	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.14	0.01	0.01
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.08	0.04	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.02	0.11	0.02	0.03
C4	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.17	0.01	0.18	0.08	0.11
C4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.06	0.00	0.07	0.04	0.06	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.15	0.04	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.15	0.01	0.15	0.06	0.10
C5'	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.07	0.08	0.04	0.04	0.01	0.10	0.03	0.03	0.02	0.00	0.00	0.10	0.17	0.06	0.01
C6	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.03	0.15	0.01	0.14	0.06	0.09
C8	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.06	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.03	0.03	0.00	0.00	0.02	0.03	0.06	0.17	0.01	0.16	0.07	0.11
N1	0.02	0.00	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.11	0.03	0.01	0.16	0.02	0.16	0.07	0.10
N2	0.07	0.00	0.10	0.08	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.19	0.09	0.05	0.18	0.02	0.22	0.10	0.14
N3	0.04	0.01	0.06	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.11	0.04	0.02	0.17	0.02	0.21	0.08	0.12
N7	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.06	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.16	0.01	0.13	0.07	0.10
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.01	0.19	0.08	0.12
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.06	0.03	0.04	0.03	0.07	0.02	0.11	0.19	0.11	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.06	0.06	0.07	0.07	0.07
O3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.09	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.19	0.01	0.05	0.06	0.10
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.06	0.01	0.05	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.00	0.21	0.05	0.22	0.03	0.10
O5'	0.15	0.17	0.02	0.07	0.17	0.01	0.15	0.00	0.15	0.17	0.16	0.18	0.17	0.16	0.18	0.06	0.19	0.21	0.00	0.13	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.05	0.13	0.00	0.11	0.05	0.08
OP1	0.19	0.20	0.14	0.11	0.18	0.15	0.15	0.17	0.14	0.16	0.16	0.22	0.21	0.13	0.19	0.07	0.05	0.22	0.02	0.11	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.08	0.01	0.02	0.08	0.04	0.06	0.06	0.06	0.07	0.07	0.10	0.08	0.07	0.08	0.07	0.06	0.03	0.02	0.05	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.12	0.01	0.03	0.11	0.01	0.10	0.01	0.09	0.11	0.10	0.14	0.12	0.10	0.12	0.07	0.10	0.10	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00