Doublet Group distance statistics: 48137

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.004, 0.016, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.006, 0.022, 0.038, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.022 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.005, 0.021, 0.037, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.021 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.006, 0.024, 0.041, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.024 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.005, 0.023, 0.041, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.023 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.007, 0.030, 0.052, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.030 std_dev=0.023
C5	A	0, 0.009, 0.032, 0.055, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.032 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.012, 0.048, 0.085, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.048 std_dev=0.037
N7	A	0, 0.018, 0.064, 0.110, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.064 std_dev=0.046
C8	A	0, 0.020, 0.070, 0.119, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.070 std_dev=0.050
C2'	A	0, 0.052, 0.186, 0.319, 0.308 max_d=0.308 avg_d=0.186 std_dev=0.134
O4'	A	0, 0.052, 0.197, 0.343, 0.345 max_d=0.345 avg_d=0.197 std_dev=0.145
O2'	A	0, 0.072, 0.246, 0.421, 0.377 max_d=0.377 avg_d=0.246 std_dev=0.174
C3'	A	0, 0.099, 0.343, 0.587, 0.549 max_d=0.549 avg_d=0.343 std_dev=0.244
C4'	A	0, 0.101, 0.348, 0.596, 0.556 max_d=0.556 avg_d=0.348 std_dev=0.248
OP2	B	0, 0.128, 0.449, 0.771, 0.734 max_d=0.734 avg_d=0.449 std_dev=0.322
P	A	0, 0.136, 0.507, 0.877, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.507 std_dev=0.370
O5'	A	0, 0.138, 0.509, 0.880, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.509 std_dev=0.371
O3'	A	0, 0.154, 0.533, 0.912, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.533 std_dev=0.379
OP1	B	0, 0.163, 0.565, 0.967, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.565 std_dev=0.402
C5'	A	0, 0.180, 0.616, 1.053, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.616 std_dev=0.437
P	B	0, 0.237, 0.836, 1.434, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.836 std_dev=0.598
OP2	A	0, 0.258, 0.950, 1.641, 1.628 max_d=1.628 avg_d=0.950 std_dev=0.692
O3'	B	0, 0.260, 1.022, 1.784, 1.829 max_d=1.829 avg_d=1.022 std_dev=0.762
OP1	A	0, 0.443, 1.514, 2.586, 2.321 max_d=2.321 avg_d=1.514 std_dev=1.072
C3'	B	0, 0.494, 1.750, 3.006, 2.888 max_d=2.888 avg_d=1.750 std_dev=1.256
O5'	B	0, 0.600, 2.054, 3.509, 3.173 max_d=3.173 avg_d=2.054 std_dev=1.455
C5'	B	0, 0.627, 2.151, 3.675, 3.343 max_d=3.343 avg_d=2.151 std_dev=1.524
C4'	B	0, 0.712, 2.464, 4.217, 3.926 max_d=3.926 avg_d=2.464 std_dev=1.753
O2'	B	0, 0.714, 2.477, 4.241, 3.963 max_d=3.963 avg_d=2.477 std_dev=1.763
C2'	B	0, 0.740, 2.559, 4.377, 4.062 max_d=4.062 avg_d=2.559 std_dev=1.819
O4'	B	0, 1.004, 3.457, 5.910, 5.434 max_d=5.434 avg_d=3.457 std_dev=2.453
C1'	B	0, 1.026, 3.532, 6.039, 5.558 max_d=5.558 avg_d=3.532 std_dev=2.507
C8	B	0, 1.243, 4.268, 7.293, 6.650 max_d=6.650 avg_d=4.268 std_dev=3.025
N9	B	0, 1.250, 4.292, 7.334, 6.689 max_d=6.689 avg_d=4.292 std_dev=3.042
N7	B	0, 1.506, 5.163, 8.819, 8.002 max_d=8.002 avg_d=5.163 std_dev=3.657
C4	B	0, 1.621, 5.551, 9.481, 8.575 max_d=8.575 avg_d=5.551 std_dev=3.930
C5	B	0, 1.761, 6.032, 10.302, 9.315 max_d=9.315 avg_d=6.032 std_dev=4.271
N3	B	0, 1.863, 6.374, 10.886, 9.802 max_d=9.802 avg_d=6.374 std_dev=4.512
C6	B	0, 2.189, 7.491, 12.793, 11.523 max_d=11.523 avg_d=7.491 std_dev=5.302
C2	B	0, 2.290, 7.831, 13.372, 11.988 max_d=11.988 avg_d=7.831 std_dev=5.541
O6	B	0, 2.381, 8.147, 13.912, 12.516 max_d=12.516 avg_d=8.147 std_dev=5.766
N1	B	0, 2.439, 8.343, 14.247, 12.796 max_d=12.796 avg_d=8.343 std_dev=5.904
N2	B	0, 2.630, 8.986, 15.341, 13.680 max_d=13.680 avg_d=8.986 std_dev=6.356

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.13	0.12	0.01
C2	0.01	0.00	0.05	0.04	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.06	0.07	0.03	0.02	0.06	0.11	0.03
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.05	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.15	0.14	0.03
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.00	0.05	0.10	0.04	0.03	0.06	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.09	0.05
C4	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.10	0.04
C4'	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.05	0.09	0.03	0.01	0.07	0.08	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.12	0.12	0.03
C5	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.06	0.07	0.07	0.07
C5'	0.02	0.06	0.01	0.00	0.08	0.01	0.13	0.00	0.13	0.15	0.10	0.04	0.15	0.16	0.08	0.04	0.02	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01
C6	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.05	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.03	0.06	0.09	0.07	0.07
C8	0.01	0.02	0.04	0.10	0.01	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.10	0.01	0.06	0.08	0.06	0.07
N1	0.02	0.00	0.04	0.04	0.00	0.03	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.04	0.04	0.05	0.04	0.09	0.06
N3	0.02	0.00	0.05	0.03	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.06	0.06	0.03	0.02	0.09	0.12	0.03
N6	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.04	0.09	0.15	0.05	0.09
N7	0.02	0.03	0.03	0.09	0.01	0.08	0.01	0.16	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.08	0.02	0.08	0.14	0.05	0.09
N9	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.09	0.03
O2'	0.00	0.06	0.00	0.02	0.03	0.04	0.01	0.04	0.03	0.03	0.05	0.06	0.02	0.02	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.25	0.21	0.04
O3'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.10	0.04	0.06	0.05	0.08	0.03	0.04	0.00	0.02	0.01	0.14	0.14	0.08
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.10	0.11	0.01
O5'	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.06	0.00	0.06	0.06	0.05	0.02	0.09	0.08	0.01	0.06	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01
OP1	0.13	0.06	0.15	0.11	0.03	0.12	0.07	0.04	0.09	0.08	0.04	0.09	0.15	0.14	0.03	0.25	0.14	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.11	0.14	0.09	0.10	0.12	0.07	0.07	0.07	0.06	0.09	0.12	0.05	0.05	0.09	0.21	0.14	0.11	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.01	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.07	0.01	0.07	0.07	0.06	0.03	0.09	0.09	0.03	0.04	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.41	2.34	0.33	0.19	1.24	0.14	1.08	0.15	1.55	0.14	2.14	2.99	1.87	0.42	0.60	0.20	0.04	0.36	0.21	1.46	0.08	0.08	0.08
C2	0.47	2.50	0.33	0.18	1.34	0.19	1.21	0.17	1.77	0.23	2.41	3.16	1.95	0.51	0.67	0.21	0.05	0.45	0.21	1.73	0.08	0.05	0.11
C2'	0.18	2.04	0.17	0.02	0.99	0.14	0.85	0.23	1.31	0.05	1.87	2.67	1.60	0.23	0.38	0.11	0.18	0.11	0.06	1.25	0.15	0.15	0.09
C3'	0.05	1.63	0.09	0.13	0.68	0.30	0.52	0.35	0.92	0.30	1.43	2.20	1.26	0.07	0.12	0.19	0.28	0.14	0.19	0.84	0.24	0.22	0.21
C4	0.39	2.35	0.28	0.14	1.21	0.16	1.05	0.16	1.56	0.10	2.19	3.02	1.85	0.36	0.57	0.16	0.06	0.39	0.19	1.48	0.08	0.05	0.08
C4'	0.12	1.74	0.13	0.02	0.82	0.11	0.65	0.17	1.02	0.17	1.53	2.28	1.41	0.08	0.27	0.12	0.17	0.07	0.10	0.93	0.20	0.18	0.17
C5	0.32	2.13	0.19	0.08	1.05	0.14	0.86	0.16	1.34	0.08	1.96	2.77	1.67	0.18	0.44	0.11	0.09	0.35	0.16	1.24	0.10	0.06	0.09
C5'	0.08	1.28	0.11	0.13	0.49	0.20	0.28	0.21	0.59	0.43	1.04	1.75	1.04	0.26	0.04	0.16	0.20	0.10	0.19	0.48	0.29	0.25	0.30
C6	0.33	2.13	0.20	0.08	1.06	0.15	0.88	0.15	1.37	0.09	1.99	2.76	1.67	0.21	0.46	0.12	0.08	0.36	0.16	1.28	0.12	0.07	0.10
C8	0.25	1.97	0.15	0.06	0.94	0.11	0.72	0.15	1.14	0.14	1.74	2.59	1.57	0.07	0.35	0.07	0.10	0.28	0.15	1.02	0.08	0.05	0.06
N1	0.41	2.33	0.27	0.13	1.21	0.17	1.07	0.16	1.60	0.15	2.23	2.97	1.82	0.38	0.58	0.17	0.07	0.41	0.19	1.54	0.11	0.06	0.11
N3	0.47	2.52	0.34	0.19	1.35	0.18	1.22	0.17	1.77	0.23	2.41	3.19	1.97	0.52	0.68	0.21	0.05	0.43	0.22	1.72	0.07	0.05	0.09
N6	0.27	1.91	0.13	0.03	0.90	0.12	0.71	0.12	1.16	0.16	1.76	2.50	1.49	0.08	0.35	0.07	0.10	0.32	0.13	1.05	0.13	0.08	0.10
N7	0.22	1.88	0.11	0.03	0.87	0.12	0.64	0.15	1.06	0.21	1.66	2.48	1.48	0.01	0.30	0.05	0.11	0.28	0.13	0.94	0.10	0.07	0.08
N9	0.36	2.26	0.26	0.14	1.16	0.14	0.98	0.16	1.45	0.04	2.06	2.93	1.80	0.30	0.52	0.15	0.06	0.35	0.19	1.35	0.07	0.06	0.08
O2'	0.27	2.19	0.26	0.08	1.14	0.09	1.03	0.18	1.52	0.11	2.06	2.79	1.72	0.42	0.51	0.17	0.16	0.15	0.10	1.48	0.14	0.14	0.09
O3'	0.22	1.39	0.19	0.26	0.50	0.48	0.38	0.50	0.76	0.40	1.24	1.92	1.03	0.16	0.04	0.34	0.39	0.34	0.32	0.71	0.28	0.27	0.29
O4'	0.42	2.20	0.34	0.23	1.18	0.20	0.98	0.20	1.39	0.10	1.96	2.80	1.81	0.35	0.57	0.22	0.01	0.39	0.27	1.28	0.09	0.10	0.10
O5'	0.16	1.37	0.14	0.11	0.66	0.11	0.44	0.16	0.71	0.23	1.13	1.75	1.19	0.08	0.21	0.11	0.01	0.18	0.14	0.60	0.18	0.12	0.16
OP1	0.10	0.76	0.10	0.05	0.28	0.03	0.13	0.05	0.31	0.38	0.60	1.01	0.64	0.25	0.07	0.17	0.02	0.05	0.17	0.24	0.39	0.23	0.38
OP2	0.04	0.83	0.07	0.03	0.32	0.06	0.17	0.20	0.37	0.30	0.67	1.12	0.69	0.18	0.00	0.15	0.01	0.03	0.13	0.30	0.14	0.14	0.07
P	0.03	0.90	0.05	0.02	0.38	0.04	0.21	0.11	0.41	0.31	0.72	1.18	0.78	0.18	0.03	0.11	0.01	0.03	0.09	0.33	0.18	0.12	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.02	0.06	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.05	0.18	0.07	0.15
C2	0.04	0.00	0.34	0.60	0.01	0.34	0.02	0.47	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.15	0.64	0.09	0.56	0.01	0.39	1.01	0.72
C2'	0.00	0.34	0.00	0.00	0.18	0.01	0.11	0.01	0.18	0.12	0.28	0.39	0.33	0.05	0.03	0.00	0.01	0.01	0.13	0.15	0.25	0.15	0.24
C3'	0.00	0.60	0.00	0.00	0.27	0.01	0.11	0.01	0.23	0.28	0.45	0.75	0.57	0.18	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.17	0.22	0.16	0.24
C4	0.03	0.01	0.18	0.27	0.00	0.14	0.01	0.14	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.27	0.04	0.18	0.03	0.17	0.31	0.14
C4'	0.01	0.34	0.01	0.01	0.14	0.00	0.04	0.01	0.11	0.20	0.24	0.44	0.33	0.16	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.07	0.08	0.05	0.06
C5	0.04	0.02	0.11	0.11	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.09	0.13	0.03	0.18	0.01	0.48	0.11	0.21
C5'	0.03	0.47	0.01	0.01	0.14	0.01	0.08	0.00	0.10	0.35	0.30	0.65	0.44	0.31	0.09	0.04	0.04	0.02	0.01	0.09	0.16	0.08	0.02
C6	0.05	0.01	0.18	0.23	0.03	0.11	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.12	0.27	0.04	0.18	0.00	0.35	0.30	0.16
C8	0.02	0.02	0.12	0.28	0.01	0.20	0.01	0.35	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.26	0.07	0.50	0.02	0.86	0.59	0.72
N1	0.06	0.01	0.28	0.45	0.03	0.24	0.02	0.30	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.02	0.04	0.15	0.49	0.07	0.38	0.01	0.17	0.74	0.48
N2	0.03	0.01	0.39	0.75	0.01	0.44	0.02	0.65	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.15	0.83	0.12	0.78	0.01	0.72	1.42	1.06
N3	0.04	0.00	0.33	0.57	0.01	0.33	0.01	0.44	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.58	0.10	0.51	0.02	0.32	0.83	0.59
N7	0.02	0.01	0.05	0.18	0.00	0.16	0.00	0.31	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.16	0.07	0.46	0.02	0.91	0.50	0.65
N9	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.02	0.03	0.09	0.04	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.17	0.04	0.39	0.13	0.26
O2'	0.00	0.15	0.00	0.01	0.09	0.03	0.09	0.04	0.12	0.02	0.15	0.15	0.13	0.05	0.03	0.00	0.01	0.02	0.05	0.12	0.12	0.11	0.17
O3'	0.00	0.64	0.01	0.01	0.27	0.01	0.13	0.04	0.27	0.26	0.49	0.83	0.58	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.20	0.17	0.15	0.20
O4'	0.01	0.09	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.07	0.07	0.12	0.10	0.07	0.02	0.02	0.00	0.00	0.04	0.04	0.03	0.04	0.02
O5'	0.07	0.56	0.13	0.14	0.18	0.02	0.18	0.01	0.18	0.50	0.38	0.78	0.51	0.46	0.17	0.05	0.10	0.04	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01
O6	0.05	0.01	0.15	0.17	0.03	0.07	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.12	0.20	0.04	0.20	0.00	0.53	0.20	0.19
OP1	0.18	0.39	0.25	0.22	0.17	0.08	0.48	0.16	0.35	0.86	0.17	0.72	0.32	0.91	0.39	0.12	0.17	0.03	0.01	0.53	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	1.01	0.15	0.16	0.31	0.05	0.11	0.08	0.30	0.59	0.74	1.42	0.83	0.50	0.13	0.11	0.15	0.04	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.72	0.24	0.24	0.14	0.06	0.21	0.02	0.16	0.72	0.48	1.06	0.59	0.65	0.26	0.17	0.20	0.02	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00