Doublet Group distance statistics: 48138

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, -0.001, 0.009, 0.018, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.009 std_dev=0.010
C6	A	0, -0.002, 0.008, 0.018, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.008 std_dev=0.010
N9	A	0, -0.001, 0.011, 0.022, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.011 std_dev=0.012
N7	A	0, -0.001, 0.011, 0.022, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.011 std_dev=0.012
N1	A	0, -0.001, 0.011, 0.023, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.011 std_dev=0.012
C8	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C4	A	0, -0.003, 0.011, 0.025, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.011 std_dev=0.014
C2	A	0, -0.001, 0.013, 0.027, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.013 std_dev=0.014
N3	A	0, -0.003, 0.015, 0.033, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.015 std_dev=0.018
N6	A	0, -0.001, 0.019, 0.038, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C1'	A	0, -0.004, 0.022, 0.049, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.022 std_dev=0.027
C2'	A	0, -0.045, 0.143, 0.331, 0.409 max_d=0.409 avg_d=0.143 std_dev=0.188
O2'	A	0, -0.043, 0.146, 0.334, 0.412 max_d=0.412 avg_d=0.146 std_dev=0.189
O4'	A	0, -0.064, 0.172, 0.408, 0.506 max_d=0.506 avg_d=0.172 std_dev=0.236
C4'	A	0, -0.091, 0.246, 0.582, 0.722 max_d=0.722 avg_d=0.246 std_dev=0.337
C3'	A	0, -0.091, 0.252, 0.595, 0.737 max_d=0.737 avg_d=0.252 std_dev=0.343
O3'	A	0, -0.130, 0.342, 0.815, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.342 std_dev=0.473
P	B	0, -0.153, 0.425, 1.003, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.425 std_dev=0.578
OP1	B	0, -0.150, 0.432, 1.015, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.432 std_dev=0.583
C5'	A	0, -0.161, 0.424, 1.009, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.424 std_dev=0.585
O5'	B	0, -0.163, 0.438, 1.039, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.438 std_dev=0.601
C5'	B	0, -0.176, 0.461, 1.099, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.461 std_dev=0.637
OP2	B	0, -0.150, 0.495, 1.139, 1.405 max_d=1.405 avg_d=0.495 std_dev=0.645
O3'	B	0, -0.188, 0.523, 1.234, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.523 std_dev=0.711
C3'	B	0, -0.222, 0.598, 1.417, 1.757 max_d=1.757 avg_d=0.598 std_dev=0.819
C4'	B	0, -0.233, 0.614, 1.461, 1.811 max_d=1.811 avg_d=0.614 std_dev=0.847
C2'	B	0, -0.285, 0.739, 1.762, 2.186 max_d=2.186 avg_d=0.739 std_dev=1.024
O2'	B	0, -0.292, 0.786, 1.865, 2.312 max_d=2.312 avg_d=0.786 std_dev=1.079
C8	B	0, -0.307, 0.784, 1.875, 2.327 max_d=2.327 avg_d=0.784 std_dev=1.091
O4'	B	0, -0.305, 0.819, 1.944, 2.409 max_d=2.409 avg_d=0.819 std_dev=1.124
C1'	B	0, -0.350, 0.887, 2.124, 2.636 max_d=2.636 avg_d=0.887 std_dev=1.237
O5'	A	0, -0.370, 0.925, 2.221, 2.758 max_d=2.758 avg_d=0.925 std_dev=1.296
N9	B	0, -0.372, 0.933, 2.239, 2.779 max_d=2.779 avg_d=0.933 std_dev=1.306
N7	B	0, -0.370, 0.945, 2.261, 2.805 max_d=2.805 avg_d=0.945 std_dev=1.316
C5	B	0, -0.489, 1.233, 2.955, 3.668 max_d=3.668 avg_d=1.233 std_dev=1.722
C4	B	0, -0.497, 1.240, 2.976, 3.695 max_d=3.695 avg_d=1.240 std_dev=1.736
N3	B	0, -0.621, 1.539, 3.699, 4.594 max_d=4.594 avg_d=1.539 std_dev=2.160
C6	B	0, -0.620, 1.564, 3.748, 4.653 max_d=4.653 avg_d=1.564 std_dev=2.184
P	A	0, -0.646, 1.603, 3.851, 4.782 max_d=4.782 avg_d=1.603 std_dev=2.248
O6	B	0, -0.643, 1.646, 3.934, 4.882 max_d=4.882 avg_d=1.646 std_dev=2.289
C2	B	0, -0.738, 1.843, 4.424, 5.493 max_d=5.493 avg_d=1.843 std_dev=2.581
N1	B	0, -0.743, 1.852, 4.447, 5.522 max_d=5.522 avg_d=1.852 std_dev=2.595
OP1	A	0, -0.750, 1.863, 4.475, 5.558 max_d=5.558 avg_d=1.863 std_dev=2.613
OP2	A	0, -0.817, 2.025, 4.867, 6.044 max_d=6.044 avg_d=2.025 std_dev=2.842
N2	B	0, -0.871, 2.191, 5.252, 6.520 max_d=6.520 avg_d=2.191 std_dev=3.061

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.21	0.25	0.27
C2	0.04	0.00	0.05	0.02	0.00	0.11	0.00	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.15	0.20	0.41	0.53	0.45
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.16	0.04	0.01	0.11
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.02	0.03	0.02	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.27	0.19	0.24	0.12
C4	0.03	0.00	0.02	0.03	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.08	0.01	0.10	0.11	0.13
C4'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.06	0.00	0.03	0.00	0.05	0.04	0.08	0.11	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.17	0.18	0.22
C5	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.04	0.19	0.23	0.34	0.23
C5'	0.00	0.15	0.00	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.05	0.10	0.11	0.15	0.01	0.08	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.05	0.01	0.02
C6	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.07	0.10	0.15	0.22	0.14
C8	0.01	0.00	0.07	0.05	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.08	0.06	0.49	0.54	0.74	0.56
N1	0.04	0.00	0.03	0.02	0.01	0.08	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.11	0.07	0.16	0.20	0.18
N3	0.05	0.00	0.04	0.03	0.00	0.11	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.15	0.20	0.44	0.56	0.50
N6	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.21	0.37	0.53	0.37
N7	0.02	0.00	0.04	0.04	0.01	0.02	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.03	0.45	0.61	0.88	0.64
N9	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.16	0.06	0.09	0.03
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.06	0.04	0.06	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.30	0.26	0.36
O3'	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.03	0.02	0.08	0.01	0.01	0.02	0.07	0.04	0.01	0.00	0.00	0.32	0.31	0.37	0.22
O4'	0.00	0.15	0.01	0.01	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.06	0.11	0.15	0.05	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.36	0.47	0.45
O5'	0.02	0.20	0.16	0.27	0.01	0.00	0.19	0.00	0.10	0.49	0.07	0.20	0.21	0.45	0.16	0.03	0.32	0.15	0.00	0.00	0.02	0.00
OP1	0.21	0.41	0.04	0.19	0.10	0.17	0.23	0.05	0.15	0.54	0.16	0.44	0.37	0.61	0.06	0.30	0.31	0.36	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.25	0.53	0.01	0.24	0.11	0.18	0.34	0.01	0.22	0.74	0.20	0.56	0.53	0.88	0.09	0.26	0.37	0.47	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.27	0.45	0.11	0.12	0.13	0.22	0.23	0.02	0.14	0.56	0.18	0.50	0.37	0.64	0.03	0.36	0.22	0.45	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.22	1.39	0.05	0.10	1.00	0.29	1.09	0.38	1.35	0.46	1.48	1.47	1.15	0.77	0.58	0.19	0.28	0.03	0.16	1.38	0.02	0.15	0.09
C2	0.12	1.99	0.05	0.08	1.16	0.36	1.36	0.39	1.88	0.52	2.19	2.23	1.43	0.94	0.58	0.25	0.20	0.20	0.12	2.00	0.05	0.14	0.08
C2'	0.37	1.25	0.16	0.03	0.99	0.20	1.01	0.36	1.17	0.52	1.28	1.29	1.10	0.74	0.67	0.05	0.23	0.14	0.15	1.16	0.06	0.12	0.10
C3'	0.29	0.97	0.18	0.06	0.77	0.06	0.82	0.18	0.95	0.43	1.02	1.01	0.85	0.62	0.53	0.01	0.10	0.12	0.05	0.95	0.01	0.09	0.04
C4	0.00	1.61	0.06	0.17	1.02	0.43	1.23	0.44	1.67	0.42	1.83	1.68	1.18	0.85	0.46	0.35	0.28	0.31	0.18	1.76	0.07	0.17	0.11
C4'	0.31	1.10	0.18	0.06	0.82	0.03	0.88	0.13	1.07	0.43	1.16	1.17	0.94	0.65	0.54	0.00	0.11	0.15	0.01	1.09	0.10	0.05	0.02
C5	0.25	1.30	0.22	0.28	0.73	0.54	1.08	0.49	1.60	0.26	1.68	1.32	0.82	0.74	0.21	0.50	0.34	0.53	0.22	1.80	0.10	0.19	0.14
C5'	0.24	0.97	0.18	0.10	0.71	0.00	0.79	0.04	0.97	0.37	1.05	1.04	0.81	0.58	0.45	0.01	0.03	0.10	0.05	1.02	0.18	0.01	0.08
C6	0.26	1.40	0.21	0.25	0.72	0.53	1.09	0.47	1.69	0.28	1.85	1.46	0.82	0.75	0.21	0.50	0.30	0.52	0.19	1.95	0.08	0.16	0.11
C8	0.31	0.90	0.29	0.36	0.54	0.59	0.83	0.54	1.17	0.13	1.16	0.90	0.58	0.58	0.10	0.52	0.42	0.59	0.30	1.33	0.13	0.26	0.20
N1	0.07	1.76	0.08	0.16	0.95	0.44	1.24	0.43	1.83	0.41	2.10	1.95	1.15	0.86	0.39	0.38	0.24	0.36	0.14	2.02	0.06	0.14	0.09
N3	0.19	1.93	0.08	0.07	1.21	0.33	1.36	0.39	1.81	0.54	2.07	2.11	1.47	0.94	0.63	0.21	0.21	0.13	0.13	1.88	0.05	0.15	0.09
N6	0.42	0.99	0.32	0.31	0.44	0.59	0.85	0.49	1.48	0.15	1.54	1.01	0.45	0.61	0.01	0.60	0.33	0.64	0.20	1.87	0.09	0.15	0.12
N7	0.45	0.81	0.36	0.39	0.40	0.63	0.79	0.55	1.25	0.06	1.19	0.79	0.42	0.54	0.04	0.60	0.42	0.69	0.29	1.51	0.13	0.23	0.18
N9	0.02	1.34	0.10	0.21	0.90	0.44	1.09	0.47	1.43	0.37	1.52	1.38	1.02	0.76	0.42	0.35	0.33	0.32	0.21	1.50	0.08	0.20	0.14
O2'	0.56	1.31	0.26	0.04	1.02	0.03	0.98	0.28	1.14	0.53	1.29	1.41	1.19	0.70	0.74	0.09	0.22	0.43	0.12	1.10	0.04	0.10	0.08
O3'	0.36	0.76	0.26	0.15	0.63	0.12	0.62	0.00	0.69	0.37	0.76	0.80	0.70	0.46	0.48	0.14	0.02	0.27	0.02	0.66	0.00	0.03	0.01
O4'	0.24	1.29	0.10	0.03	0.91	0.17	1.01	0.25	1.26	0.43	1.38	1.38	1.05	0.72	0.54	0.12	0.20	0.04	0.08	1.31	0.06	0.11	0.03
O5'	0.51	1.36	0.49	0.44	1.12	0.24	1.31	0.22	1.53	0.85	1.53	1.38	1.15	1.15	0.83	0.24	0.32	0.30	0.45	1.66	0.59	0.55	0.51
OP1	0.57	1.44	0.57	0.56	1.22	0.31	1.48	0.33	1.73	1.05	1.67	1.43	1.21	1.39	0.94	0.25	0.43	0.35	0.65	1.93	1.00	0.90	0.77
OP2	0.60	1.72	0.64	0.63	1.46	0.27	1.85	0.30	2.20	1.27	2.08	1.68	1.40	1.75	1.10	0.25	0.51	0.31	0.71	2.52	0.97	1.02	0.81
P	0.43	1.47	0.41	0.38	1.20	0.11	1.50	0.12	1.80	0.97	1.74	1.46	1.18	1.37	0.86	0.07	0.24	0.18	0.47	2.04	0.77	0.75	0.60

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.02	0.10	0.07
C2	0.02	0.00	0.12	0.14	0.00	0.01	0.01	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.17	0.11	0.12	0.01	0.08	0.22	0.28
C2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.06	0.03	0.02	0.00	0.04	0.08	0.09	0.15	0.12	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.07	0.03	0.03	0.02	0.09
C3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.10	0.01	0.09	0.00	0.11	0.01	0.14	0.15	0.12	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.04	0.11	0.01	0.01	0.04
C4	0.00	0.00	0.06	0.10	0.00	0.00	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.10	0.04	0.10	0.01	0.04	0.17	0.22
C4'	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.06	0.03	0.00	0.00	0.02	0.05	0.17	0.01
C5	0.00	0.01	0.02	0.09	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.01	0.09	0.00	0.01	0.26	0.22
C5'	0.03	0.11	0.00	0.00	0.08	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.09	0.12	0.10	0.02	0.05	0.06	0.07	0.01	0.01	0.06	0.11	0.13	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.11	0.01	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.14	0.02	0.09	0.00	0.01	0.32	0.25
C8	0.02	0.00	0.08	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.02	0.12	0.05	0.00	0.08	0.10	0.10
N1	0.01	0.00	0.09	0.14	0.00	0.00	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.17	0.07	0.11	0.01	0.04	0.29	0.28
N2	0.03	0.00	0.15	0.15	0.00	0.03	0.01	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.20	0.14	0.13	0.01	0.11	0.22	0.29
N3	0.02	0.00	0.12	0.12	0.00	0.02	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.15	0.11	0.12	0.01	0.09	0.16	0.25
N7	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.08	0.06	0.01	0.09	0.25	0.15
N9	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.02	0.08	0.00	0.01	0.06	0.15
O2'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.04	0.06	0.01	0.06	0.02	0.04	0.05	0.10	0.08	0.03	0.00	0.00	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.00
O3'	0.01	0.17	0.02	0.00	0.10	0.03	0.10	0.07	0.14	0.02	0.17	0.20	0.15	0.03	0.03	0.06	0.00	0.02	0.03	0.14	0.04	0.01	0.02
O4'	0.00	0.11	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.07	0.14	0.11	0.08	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.28	0.02
O5'	0.05	0.12	0.07	0.04	0.10	0.00	0.09	0.01	0.09	0.05	0.11	0.13	0.12	0.06	0.08	0.01	0.03	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00
O6	0.00	0.01	0.03	0.11	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.01	0.07	0.00	0.05	0.36	0.24
OP1	0.02	0.08	0.03	0.01	0.04	0.05	0.01	0.11	0.01	0.08	0.04	0.11	0.09	0.09	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.22	0.02	0.01	0.17	0.17	0.26	0.13	0.32	0.10	0.29	0.22	0.16	0.25	0.06	0.11	0.01	0.28	0.01	0.36	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.28	0.09	0.04	0.22	0.01	0.22	0.01	0.25	0.10	0.28	0.29	0.25	0.15	0.15	0.00	0.02	0.02	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00