Doublet Group distance statistics: 48149

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 2, 6, 2, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.015, 0.024, 0.034, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.024 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.019, 0.029, 0.039, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.029 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.024, 0.037, 0.050, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.037 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.011, 0.024, 0.037, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.024 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.026, 0.040, 0.053, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.040 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.030, 0.045, 0.060, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.045 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.024, 0.041, 0.058, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.041 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.024, 0.044, 0.064, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.044 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.037, 0.058, 0.080, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.058 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.040, 0.063, 0.086, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.063 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.024, 0.066, 0.107, 0.187 max_d=0.187 avg_d=0.066 std_dev=0.041
C2'	A	0, 0.095, 0.157, 0.219, 0.285 max_d=0.285 avg_d=0.157 std_dev=0.062
O4'	A	0, 0.054, 0.129, 0.204, 0.303 max_d=0.303 avg_d=0.129 std_dev=0.075
C4'	A	0, 0.110, 0.209, 0.307, 0.350 max_d=0.350 avg_d=0.209 std_dev=0.099
C3'	A	0, 0.053, 0.155, 0.257, 0.351 max_d=0.351 avg_d=0.155 std_dev=0.102
O2'	A	0, 0.212, 0.328, 0.445, 0.444 max_d=0.444 avg_d=0.328 std_dev=0.116
O3'	A	0, 0.097, 0.233, 0.369, 0.421 max_d=0.421 avg_d=0.233 std_dev=0.136
C5'	A	0, 0.233, 0.421, 0.609, 0.757 max_d=0.757 avg_d=0.421 std_dev=0.188
P	B	0, 0.355, 0.611, 0.868, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.611 std_dev=0.256
P	A	0, 0.198, 0.501, 0.803, 1.322 max_d=1.322 avg_d=0.501 std_dev=0.302
O5'	A	0, 0.351, 0.670, 0.990, 1.310 max_d=1.310 avg_d=0.670 std_dev=0.320
C5'	B	0, 0.538, 0.894, 1.251, 1.375 max_d=1.375 avg_d=0.894 std_dev=0.357
O4'	B	0, 0.529, 0.889, 1.249, 1.359 max_d=1.359 avg_d=0.889 std_dev=0.360
C4'	B	0, 0.328, 0.688, 1.048, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.688 std_dev=0.360
O3'	B	0, 0.258, 0.631, 1.004, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.631 std_dev=0.373
C2'	B	0, 0.404, 0.777, 1.150, 1.322 max_d=1.322 avg_d=0.777 std_dev=0.373
O5'	B	0, 0.791, 1.174, 1.556, 1.506 max_d=1.506 avg_d=1.174 std_dev=0.382
C1'	B	0, 0.431, 0.823, 1.215, 1.344 max_d=1.344 avg_d=0.823 std_dev=0.392
C3'	B	0, 0.267, 0.664, 1.062, 1.138 max_d=1.138 avg_d=0.664 std_dev=0.397
C6	B	0, 0.393, 0.815, 1.236, 1.762 max_d=1.762 avg_d=0.815 std_dev=0.421
N1	B	0, 0.443, 0.864, 1.286, 1.565 max_d=1.565 avg_d=0.864 std_dev=0.421
C5	B	0, 0.443, 0.867, 1.292, 1.867 max_d=1.867 avg_d=0.867 std_dev=0.424
C4	B	0, 0.525, 0.964, 1.403, 1.776 max_d=1.776 avg_d=0.964 std_dev=0.439
O4	B	0, 0.579, 1.025, 1.471, 1.840 max_d=1.840 avg_d=1.025 std_dev=0.446
C2	B	0, 0.603, 1.049, 1.496, 1.642 max_d=1.642 avg_d=1.049 std_dev=0.447
N3	B	0, 0.603, 1.066, 1.528, 1.623 max_d=1.623 avg_d=1.066 std_dev=0.462
OP2	B	0, 0.785, 1.250, 1.716, 1.743 max_d=1.743 avg_d=1.250 std_dev=0.466
O2'	B	0, 0.531, 1.001, 1.472, 1.621 max_d=1.621 avg_d=1.001 std_dev=0.471
OP2	A	0, 0.061, 0.542, 1.023, 2.088 max_d=2.088 avg_d=0.542 std_dev=0.481
O2	B	0, 0.718, 1.217, 1.717, 1.913 max_d=1.913 avg_d=1.217 std_dev=0.499
OP1	B	0, 1.283, 1.836, 2.389, 2.347 max_d=2.347 avg_d=1.836 std_dev=0.553
OP1	A	0, 0.367, 1.055, 1.743, 2.967 max_d=2.967 avg_d=1.055 std_dev=0.688

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.11	0.64	0.14	0.23
C2	0.05	0.00	0.07	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.10	0.07	0.05	0.19	0.63	0.19	0.21
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.05	0.04	0.06	0.07	0.06	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.57	0.15	0.18
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.08	0.05	0.06	0.06	0.07	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.40	0.17	0.10
C4	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.03	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.03	0.02	0.22	0.60	0.21	0.21
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.04	0.04	0.07	0.07	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.47	0.15	0.16
C5	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02	0.30	0.55	0.28	0.22
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.08	0.01	0.12	0.00	0.12	0.14	0.09	0.05	0.15	0.15	0.08	0.03	0.02	0.01	0.01	0.17	0.13	0.02
C6	0.03	0.01	0.05	0.05	0.02	0.05	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.07	0.05	0.03	0.30	0.56	0.30	0.22
C8	0.02	0.02	0.04	0.08	0.01	0.07	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.02	0.05	0.00	0.01	0.03	0.09	0.04	0.32	0.50	0.29	0.22
N1	0.04	0.01	0.06	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02	0.09	0.06	0.04	0.25	0.60	0.25	0.21
N3	0.04	0.01	0.07	0.06	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.10	0.07	0.05	0.17	0.64	0.16	0.21
N6	0.04	0.03	0.06	0.06	0.02	0.07	0.03	0.15	0.01	0.05	0.03	0.03	0.00	0.05	0.04	0.07	0.06	0.05	0.34	0.53	0.37	0.24
N7	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.07	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.08	0.04	0.36	0.49	0.33	0.23
N9	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.22	0.58	0.20	0.21
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.06	0.03	0.05	0.03	0.07	0.03	0.09	0.10	0.07	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.06	0.67	0.23	0.25
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.05	0.09	0.06	0.07	0.06	0.08	0.03	0.03	0.00	0.02	0.14	0.33	0.24	0.08
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.05	0.05	0.04	0.01	0.03	0.02	0.00	0.13	0.62	0.14	0.24
O5'	0.11	0.19	0.03	0.04	0.22	0.02	0.30	0.01	0.30	0.32	0.25	0.17	0.34	0.36	0.22	0.06	0.14	0.13	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.64	0.63	0.57	0.40	0.60	0.47	0.55	0.17	0.56	0.50	0.60	0.64	0.53	0.49	0.58	0.67	0.33	0.62	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.14	0.19	0.15	0.17	0.21	0.15	0.28	0.13	0.30	0.29	0.25	0.16	0.37	0.33	0.20	0.23	0.24	0.14	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.23	0.21	0.18	0.10	0.21	0.16	0.22	0.02	0.22	0.22	0.21	0.21	0.24	0.23	0.21	0.25	0.08	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.34	0.36	0.44	0.30	0.35	0.25	0.35	0.23	0.36	0.36	0.36	0.38	0.51	0.15	0.36	0.25	0.19	0.15	0.16	0.13
C2	0.26	0.31	0.41	0.23	0.34	0.17	0.35	0.15	0.33	0.30	0.33	0.31	0.53	0.11	0.36	0.19	0.15	0.14	0.16	0.11
C2'	0.31	0.33	0.41	0.28	0.33	0.22	0.33	0.21	0.33	0.33	0.33	0.35	0.47	0.11	0.33	0.22	0.16	0.14	0.13	0.09
C3'	0.25	0.27	0.34	0.26	0.26	0.18	0.26	0.22	0.26	0.26	0.26	0.29	0.37	0.07	0.26	0.18	0.15	0.17	0.15	0.11
C4	0.24	0.28	0.38	0.21	0.30	0.16	0.30	0.16	0.29	0.28	0.28	0.28	0.46	0.09	0.31	0.18	0.14	0.15	0.17	0.12
C4'	0.28	0.29	0.35	0.26	0.26	0.21	0.26	0.23	0.27	0.28	0.27	0.32	0.38	0.09	0.26	0.21	0.17	0.17	0.17	0.12
C5	0.18	0.22	0.31	0.16	0.25	0.13	0.26	0.15	0.25	0.22	0.22	0.22	0.36	0.11	0.26	0.19	0.15	0.16	0.18	0.14
C5'	0.23	0.24	0.30	0.26	0.22	0.16	0.21	0.24	0.22	0.23	0.23	0.27	0.32	0.12	0.22	0.16	0.17	0.21	0.22	0.15
C6	0.17	0.21	0.30	0.15	0.25	0.13	0.27	0.15	0.25	0.21	0.22	0.21	0.37	0.12	0.27	0.21	0.16	0.17	0.19	0.14
C8	0.20	0.23	0.30	0.18	0.24	0.16	0.25	0.19	0.24	0.23	0.23	0.25	0.32	0.12	0.25	0.19	0.16	0.15	0.16	0.13
N1	0.20	0.25	0.35	0.18	0.30	0.14	0.31	0.14	0.29	0.25	0.27	0.24	0.45	0.10	0.32	0.19	0.15	0.16	0.17	0.12
N3	0.28	0.33	0.43	0.25	0.35	0.19	0.35	0.16	0.34	0.32	0.34	0.34	0.55	0.11	0.37	0.19	0.15	0.15	0.17	0.11
N6	0.19	0.22	0.26	0.15	0.25	0.16	0.29	0.18	0.27	0.22	0.22	0.23	0.30	0.16	0.27	0.26	0.19	0.19	0.21	0.18
N7	0.17	0.20	0.26	0.16	0.21	0.14	0.23	0.17	0.22	0.20	0.20	0.22	0.28	0.15	0.22	0.20	0.17	0.17	0.19	0.15
N9	0.25	0.28	0.37	0.22	0.29	0.18	0.30	0.18	0.29	0.28	0.28	0.29	0.43	0.09	0.30	0.20	0.16	0.14	0.16	0.11
O2'	0.36	0.40	0.45	0.32	0.39	0.25	0.39	0.22	0.39	0.38	0.40	0.43	0.55	0.19	0.39	0.25	0.17	0.14	0.14	0.10
O3'	0.25	0.26	0.32	0.25	0.25	0.18	0.26	0.23	0.26	0.26	0.26	0.29	0.35	0.09	0.26	0.18	0.17	0.20	0.17	0.14
O4'	0.32	0.34	0.41	0.29	0.30	0.27	0.30	0.25	0.31	0.33	0.32	0.36	0.46	0.15	0.30	0.26	0.22	0.19	0.20	0.17
O5'	0.10	0.10	0.16	0.08	0.08	0.23	0.10	0.38	0.09	0.08	0.09	0.16	0.27	0.01	0.08	0.17	0.40	0.47	0.49	0.45
OP1	0.14	0.17	0.25	0.18	0.28	0.12	0.35	0.32	0.33	0.19	0.20	0.25	0.34	0.01	0.30	0.06	0.23	0.21	0.23	0.20
OP2	0.23	0.25	0.07	0.16	0.19	0.34	0.18	0.43	0.18	0.21	0.22	0.31	0.16	0.01	0.19	0.34	0.47	0.47	0.43	0.45
P	0.12	0.14	0.08	0.01	0.10	0.10	0.11	0.23	0.10	0.09	0.11	0.22	0.16	0.00	0.10	0.09	0.18	0.17	0.16	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.07	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.14	0.03	0.00	0.05	0.15	0.20	0.08
C2	0.02	0.00	0.08	0.03	0.01	0.06	0.02	0.13	0.02	0.01	0.00	0.00	0.12	0.15	0.01	0.09	0.10	0.15	0.20	0.11
C2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.05	0.01	0.09	0.14	0.11	0.02	0.06	0.15	0.00	0.01	0.05	0.01	0.09	0.14	0.25	0.15
C3'	0.02	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.03	0.08	0.01	0.01	0.05	0.02	0.06	0.16	0.24	0.13
C4	0.02	0.01	0.05	0.04	0.00	0.02	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.10	0.00	0.03	0.17	0.21	0.21	0.17
C4'	0.02	0.06	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.04	0.11	0.06	0.03	0.02	0.01	0.02	0.14	0.22	0.11
C5	0.02	0.02	0.09	0.06	0.01	0.05	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.02	0.21	0.09	0.01	0.07	0.26	0.30	0.25	0.25
C5'	0.07	0.13	0.14	0.01	0.19	0.01	0.23	0.00	0.22	0.14	0.16	0.14	0.07	0.14	0.20	0.02	0.01	0.06	0.08	0.02
C6	0.02	0.02	0.11	0.06	0.01	0.06	0.00	0.22	0.00	0.01	0.01	0.03	0.22	0.09	0.01	0.09	0.25	0.28	0.25	0.23
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.11	0.02	0.01	0.11	0.16	0.21	0.12
N3	0.02	0.00	0.06	0.03	0.00	0.04	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.13	0.01	0.07	0.12	0.15	0.20	0.12
O2	0.05	0.00	0.15	0.08	0.01	0.11	0.02	0.14	0.03	0.02	0.01	0.00	0.26	0.21	0.02	0.16	0.17	0.23	0.22	0.17
O2'	0.02	0.12	0.00	0.01	0.11	0.06	0.21	0.07	0.22	0.06	0.08	0.26	0.00	0.05	0.12	0.02	0.04	0.16	0.19	0.08
O3'	0.14	0.15	0.01	0.01	0.10	0.03	0.09	0.14	0.09	0.11	0.13	0.21	0.05	0.00	0.10	0.10	0.11	0.20	0.21	0.12
O4	0.03	0.01	0.05	0.05	0.00	0.02	0.01	0.20	0.01	0.02	0.01	0.02	0.12	0.10	0.00	0.04	0.18	0.22	0.21	0.18
O4'	0.00	0.09	0.01	0.02	0.03	0.01	0.07	0.02	0.09	0.01	0.07	0.16	0.02	0.10	0.04	0.00	0.08	0.15	0.20	0.10
O5'	0.05	0.10	0.09	0.06	0.17	0.02	0.26	0.01	0.25	0.11	0.12	0.17	0.04	0.11	0.18	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.15	0.15	0.14	0.16	0.21	0.14	0.30	0.06	0.28	0.16	0.15	0.23	0.16	0.20	0.22	0.15	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.20	0.20	0.25	0.24	0.21	0.22	0.25	0.08	0.25	0.21	0.20	0.22	0.19	0.21	0.21	0.20	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.08	0.11	0.15	0.13	0.17	0.11	0.25	0.02	0.23	0.12	0.12	0.17	0.08	0.12	0.18	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00